چاپ صفحه |  صفحه نخست سامانه |  مجری و همکاران |  اطلاعات تفضیلی |  دانلود | علوم پزشکی زاهدان |
| کد طرح | 5664 |
| عنوان فارسی طرح | بررسی پلی مورفیسم ژنهای miR-146a (rs 2910164)و miR-499 (rs 3746444) و196a2(rs185070757)-miR و(miR-196a2(rs11614913وحذف 40bp ژن MDM2 درزنان مبتلا به سرطان سینه در مقایسه با زنان سالم |
| عنوان لاتین طرح | Evaluation of genetic polymorphisms of miR-146a( rs2910164), miR-499( rs3746444), miRNA-196a2 (rs185070757),miRNA-196a2 rs(11614913) genes and insertion/ deletion of MDM2 gene, in patients with breast cancer and compare with healthy women |
| نوع طرح | |
| محل اجرای طرح | زاهدان |
| رسته مطالعاتی | مورد شاهدی |
| دانشکده/مرکز | دانشکده پزشکی زاهدان |
| زمان اجرا -روز |
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح | نوع همکاری | درجهتحصیلی | پست الکترونیک |
|---|---|---|---|---|
| محسن عمرانی | همکار | mohsen_omrani@yahoo.com | ||
| محمد هاشمی | مجری | دکترا - PHD | mhd.hashemi@gmail.com |
| عنوان | متن |
|---|---|
| خلاصه طرح به فارسی | بررسی پلی مورفیسم ژنهای miR-146a (rs 2910164)و miR-499 (rs 3746444) و196a2(rs185070757)-miR و(miR-196a2(rs11614913وحذف 40bp ژن MDM2 درزنان مبتلا به سرطان سینه در مقایسه با زنان سالم |
| خلاصه طرح به لاتین | Evaluation of genetic polymorphisms of miR-146a( rs2910164), miR-499( rs3746444), miRNA-196a2 (rs185070757),miRNA-196a2 rs(11614913) genes and insertion/ deletion of MDM2 gene, in patients with breast cancer and compare with healthy women |
| محل اول بکارگیری نتایج تحقیق | |
| بيان مسئله تحقيق/اهمیت پژوهش | سرطان سینه یکی از سرطانهای شایع است که ازدلایل مهم مرگ ومیر درزنان می باشد و پس از سرطان پوست شایعترین سرطان در میان زنان میباشد.طبق محاسبات انستیتو ملی سرطان ایالات متحده آمریکا، از هر هشت زن یک نفر در زندگی خود مبتلا به سرطان سینه میشود.وهنوزدرمورد علت این بیماری اطلاعات ناچیزی در دسترس است. سرطان سینه : تکثیر بدخیم آن دسته از سلول های اپیتلیال است که مجاری یا لوبول های پستان را می پوشانند . در سال 2007 حدود 185510 مورد سرطان مهاجم سینه و 40910 مرگ در ایالات متحده روی داد. بدخیمی های با منشا اپیتلیال پستان ، شایعترین علت سرطان در زنان ( به جز سرطان پوست ) است که حدود 3/1 همه سرطان های زنان را تشکیل می دهد. ریسک فاکتورهایی ازقبیل قاعدگی زودرس، یائسگی باتاخیر، نازایی یا سن زیاد درهنگام اولین زایش ،استفاده از درمان جایگزینی هورمون با استروژن،سابقه فامیلی سرطان سینه ممکن است مسئول 3/1 دیگر موارد ایجاد کننده سرطان سینه می باشند. با بهبود وضعیت درمان و تشخیص زودرس ، مرگ و میر ناشی از سرطان سینه در ایالات متحده به صورت قابل توجهی در حال کاهش است (1). در حدود 40 درصد موارد سرطان سینه انسان ، موتاسیون p53 ، به صورت یک نقص اکتسابی وجود دارد . موتاسیون های اکتسابی در PTEN در حدود 10 درصد موارد رخ می دهد. مستعدبودن ارثی، ازقبیل موتاسیون های ژن های BRCA1 وBRCA2 در5درصد موارد دیده می شود. اما در برخی از موارد سرطان سینه ، دیده شده که بیان mRNA مربوط به ژن BRCA-1 کاهش یافته و پروتئین BRCA-1 در سلول، در محلی غیر طبیعی قرار گرفته است. در موارد اسپورادیک سرطان سینه انسان ، هتروزیگوت بودن BRCA-1 و BRCA-2 از بین رفته ، که این موضوع بر غیر فعال شدن تومور ساپرسور ها اشاره دارد.SNP(single nucleotide polymorphism)ها که به عنوان تنوع ژنتیکی ،به عنوان تعیین کننده تنوع فنوتیپی بین افراد میباشند به نظر میرسد که در حساسیت افراد به سرطان ها وپیشرفت بیماری در آنها دخیل است(2). میکروآران آها(miRNAs/miR) یک کلاس از RNA های تک رشته کوچک غیر کد کننده هستند که بطور طبیعی شکل میگیرند و با mRNA هدف خود در نقاطی مکمل میگردند و سبب کاهش بازدهی و ثبات ترجمه میشوند . مطالعات بیوانفورماتیک نشان میدهد که یک میکروآران آ به تنهایی میتواند به بیش از 200 ژن هدف متصل شود و یک سوم ژنهای انسانی را از جمله ژنهای مرتبط با سرطان را تنظیم کند . میکروآران آها برای اولین بار در سال 1993 توسط آقای ای و همکاران در انگل کانورابدیتیس کشف شدند. آنها طولی در حدود 22 نوکلئوتید دارند و عمدتا از نسخه های رونویسی به شکل سنجاق سر ایجاد میگردند. میکروآران آها به شدت در طول تکامل در فرم های گوناگون حیات از خزه دریایی تا انسان حفظ شده اند. در گزارش اخیر از بانک توالی میکروآران آ، 940 میکروآران آ متفاوت در انسان لیست شده است اما تخمین زده میشود که ژنوم انسان تقریبا 1000 میکروآران آ را کد می کند. میکروآران آها نقشهای پراهمیتی در کنترل بسیاری از فرایندهای بیولوژیک از جمله رشد، تمایز و تکثیر سلولها همچنین خونسازی، رگ زایی و آپاپتوز ایفا میکنند(3). میکروآران آها بعنوان سرطانزا و سرکوبگر سرطان: یک ارتباط قوی بین میکروآران آها و سرطانهای انسانی اخیرا مورد توجه قرار گرفته است به این دلیل که ثابت شده است میکروآران آها هم بعنوان سرطانزا و هم سرکوبگر سرطان عمل می کنند . اولین میکروآران آهای سرکوبگر سرطان که کشف شده اند miR-15/16 هستند. این میکروآران آها یا حذف شده یا اینکه میزانشان در اکثر (68%) لوکمیاهای مزمن سلولهای B دچار کاهش می شود. هدف miR-15/16 ها mRNA سازنده پروتئین آنکوژن ضد آپاپتوزی Bcl-2 میباشد. کاهش بیان miR-15/16 منجر به افزایش بیان پروتئین محرک سرطان و سرانجام مهار ورود سلولهای سرطانی به فاز آپاپتوز میگردد. بنابراین miR-15 و miR-16واکنشگرهای آنتی سنس Bcl-2 هستند که میتوانند برای درمان تومورهایی که بیش از حد Bcl-2 را بیان میکنند مورد استفاده قرار گیرند. یک میکروآران آ سرکوبگر سرطان دیگر let-7 میباشد. علت ارتباط بین کاهش بیان let-7 در سرطان ریه و درمان ضعیف این سرطان، افزایش بیان پروتئین سرطانزای Ras میباشد(4). مطالعات نشان داده است که کاهش بیان یا عدم بیان میکروآران آهای دارای مشخصه ضد سرطانی نقش مهمی در سرطانزایی ایفا میکند.تعداد بسیاری از میکروآران آها که توسط ژنوم کد میشوند وجود دارد. بعنوان مثال miR-143 وmiR-145 در سرطان کولون دیده میشوند، miR-145 در سرطان سینه، miR-29b در سرطان خون، miR-127 در سرطان مثانه و لنفومای بورکیت مشاهده گردیده اند(5). در مقایسه با میکروآران آهای سرکوبگر سرطان، افزایش بیان میکروآران آهای سرطانزا، رشد تومور را تحریک and cancer risk. Transcription. 2011 Sep-Oct;2(5):207-10. 24. Knappskog S, Lonning PE. MDM2 promoter SNP285 and SNP309; phylogeny and impact on cancer risk. Oncotarget. 2011 Mar;2(3):251-8. 25. Dong D, Gao X, Zhu Z, Yu Q, Bian S, Gao Y. A 40-bp insertion/deletion polymorphism in the constitutive promoter of MDM2 confers risk for hepatocellular carcinoma in a Chinese population. Gene. 2012 Apr 10;497(1):66-70. 26. Duan R, Pak C, Jin P. Single nucleotide polymorphism associated with mature miR-125a alters the processing of pri-miRNA. Hum Mol Genet. 2007 May 1;16(9):1124-31. 27. Lian H, Wang L, Zhang J. Increased risk of breast cancer associated with CC genotype of Has-miR-146a Rs2910164 polymorphism in Europeans. PLoS One. 2012;7(2):e31615. 28. Garcia AI, Cox DG, Barjhoux L, Verny-Pierre C, Barnes D, Antoniou AC, et al. The rs2910164:G>C SNP in the MIR146A gene is not associated with breast cancer risk in BRCA1 and BRCA2 mutation carriers. Hum Mutat. 2011 May 17. 29. Xiang Y, Fan S, Cao J, Huang S, Zhang LP. Association of the microRNA-499 variants with susceptibility to hepatocellular carcinoma in a Chinese population. Mol Biol Rep. 2012 Jun;39(6):7019-23. 30. Hishida A, Matsuo K, Goto Y, Naito M, Wakai K, Tajima K, et al. Combined effect of miR-146a rs2910164 G/C polymorphism and Toll-like receptor 4 +3725 G/C polymorphism on the risk of severe gastric atrophy in Japanese. Dig Dis Sci. 2011 Apr;56(4):1131-7. 31. Akkiz H, Bayram S, Bekar A, Akgollu E, Uskudar O, Sandikci M. No association of pre-microRNA-146a rs2910164 polymorphism and risk of hepatocellular carcinoma development in Turkish population: a case-control study. Gene. 2011 Oct 15;486(1-2):104-9. 32. Xu J, Hu Z, Xu Z, Gu H, Yi L, Cao H, et al. Functional variant in microRNA-196a2 contributes to the susceptibility of congenital heart disease in a Chinese population. Hum Mutat. 2009 Aug;30(8):1231-6. 33. Xu W, Xu J, Liu S, Chen B, Wang X, Li Y, et al. Effects of common polymorphisms rs11614913 in miR-196a2 and rs2910164 in miR-146a on cancer susceptibility: a meta-analysis. PLoS One. 2011;6(5):e20471. 34. Wang F, Ma YL, Zhang P, Yang JJ, Chen HQ, Liu ZH, et al. A genetic variant in microRNA-196a2 is associated with increased cancer risk: a meta-analysis. Mol Biol Rep. 2012 Jan;39(1):269-75. 35. Chen MH, Qi CX, Saha MN, Chang H. p53 nuclear expression correlates with hemizygous TP53 deletion and predicts an adverse outcome for patients with relapsed/refractory multiple myeloma treated with lenalidomide. Am J Clin Pathol. 2012 میکند. گروه ژنی miR-17-92، بعنوان اولین میکروآران آ سرطانزا ی شناخته شده، سبب افزایش رشد لنفومای سلولهای B میگردد(6). افزایش بیان گروه miR-17-92 تحت تاثیر بیان c-myc سبب رشد تومور میشود. افزایش دیگر میکروآران آهای سرطانزا از جمله miR-21 سبب تکثیر سلولهای سرطانی در انواع گوناگون سرطان از جمله ریه، سینه، پروستات، لوکمیا، کولون و سر و گردن میگردد. دیگر میکروآران آهای سرطانزا که افزایش بیان را از خود نشان میدهندmiR-221 در گلیوبلاستوما و لوکمیا، miR-222 در لوکمیا و تیروئید میباشند. تعداد میکروآران آهای شناخته شده درگیر در تشدید سرطان هنوز بطور چشمگیری رو به افزایش است(5,4). میکروآران آهای دخیل در رگزایی: در تحقیقات اخیر، میکروآران آهای رگزا و ضد رگزایی شناخته شده اند. یک گروه بسیار مهم و دارای فعالیت در تشدید رگزایی تومور گروه miR-17-92 میباشند. (7). بجز این میکروآران آها، miR-15 و miR-16میزان بیان VEGFرا تحت تاثیر قرار میدهند، در صورتیکه miR-221/miR-222 ژنهای eNOS و c-kit را متاثر کرده و از اینرو خود را بعنوان ضد رگزا معرفی میکند(8). پلی مورفیسمهاوموتاسیونها در میکروآران آها: پلی مورفیسمها از جمله مکانیسمهای مهم هستند که توانایی کاهش یا افزایش میزان بیان میکروآران آها را دارند. پلیمورفیسم ویا موتاسیون میکروآران آها به سه کلاس دسته بندی میشوند(5). پلی مورفیسم ویا موتاسیون در بیوسنتز میکروآران آها: مجموعه ای از پروتئینها در ساخت میکروآران آها دخیل هستند از جمله RNA Pol II, Drosha, Pasha/DGCR8, EXP5,Dicer, Argonaute, RISC and TRBP/PACT. پلی مورفیسم ویا موتاسیون در پری-پره میکروآران آ سبب اختلال در مسیر تنظیمی پس ترجمه ای با واسطه میکروآران آ میگردد(9). گوتوین و همکاران نشان دادند که در سلولهای لنفوما، پلی مورفیسم در بخش ساقه-حلقه پیش ساز miR-K5 ویروسی سبب مهار شناسایی میکروآران آ توسط آنزیم دورسا شده و در نهایت سبب مهار ساخت میکروآران آ بالغ گردیده است(10). یکی از فاکتورهای پایه ای که در کاهش یا عدم بیان میکروآران آ ایفای نقش میکند غیبت آنزیم دایسر است که نقش مهمی در تومورزایی دارد. موتاسیون در بخش 3´UTR از miR-16 سبب اختلال در ساختار پیش میکروآران آ در برخی بیماران لوکمیای مزمن شده و با مهار تولید میکروآران آ بالغ منجر به کاهش بیان این میکروآران آ میگردد(11). پلی مورفیسم ویا موتاسیون در مناطق هدف میکروآران آ: جهت عملکرد صحیح میکروآران آها، ژنهای mRNA هدف باید به مناطق 3´UTR متصل شوند. میشرا و همکاران اثبات کردند که miR-24 در اتصال به منطقه 3´UTR ژن DHFR(Dihydrofolate reductase) ناتوان است که بدلیل یک پلیمورفیسم در این ناحیه است. مشخص گردید که این پلی مورفیسم سبب افزایش بیان DHFR و افزایش نیمه عمر mRNA هدف و همچنین سبب افزایش مقاومت به متوتروکسات گردیده است(12). همچنین گزارش شد که پلی مورفیسم C/T در منطقه 3´UTR از ESR-1 سبب افزایش در ظرفیت اتصالی miR-453 شد، هنگامی که آلل C حضور داشت کاهش در ظرفیت اتصالی و هنگامی که آلل T وجود داشت که این وضعیت سبب تشدید سرطان سینه میگردد. از طرف دیگر، پلی مورفیسمهای منطقه 3´UTR از RAS سبب مهار اتصال let-7 شده و منجر به وخیمتر شدن سرطان سلولهای فلسی سر و گردن و همچنین سرطان ریه گردیده است(13). پلی مورفیسم ویا موتاسیون در توالی میکروآران آ بالغ: گزارش گردیده که پلی مورفیسم C/T در miR-30c بالغ میتواند در انتخاب mRNA هدف آن و همچنین در اختصاصیت اتصال mRNA تغییر ایجاد کند.یازوفسکی و همکاران ذکر کردند که نه تنها میکروآران آ بالغ بلکه رشته رونده نیز در انتخاب mRNA هدف مهم هستند و اینکه پلی مورفیسم ویا موتاسیون در این رشته میزان هدفها را بیشتر می کند. بهترین مثال واضح ، وجود یک رابطه بین پلی مورفیسم C/G در miR-146a و استعداد ابتلا به سرطان تیروئید و سینه میباشد(11). میکروآران آها در متا ستاز و تهاجم سرطانی: ثابت شده است که هایپرمتیلاسیون میکروآران آهای سرکوبگر تومور از جمله miR-148a, miR-34b/c, miR-9-1, miR-9-2 miR-9-3 در تشدید متاستاز سرطانهای انسانی دخیل است. پروتئین مرگ سلولی برنامه ریزی شده 4 PDCD4))، یکی از سرکوبگرهای سرطان است که در سرطان کولون بوسیله miR-21 مورد تنظیم منفی قرار می گیرد و تروپومیوزین 1(TPM1) دارای نقشهایی نه تنها در رشد تومور میباشد بلکه در هجوم و متاستاز بوسیله هدفگیری ژنهای سرکوبگر سرطان و متاستاز سرطان سینه نیز فعالیت دارد. آقای بافا و همکاران یک مجموعه 32 تایی میکروآران آهای مرتبط با متاستاز در سرطانهای ریه، کولون، مثانه و سینه شناسایی کردند که 15 تای آنها بیانشان زیاد و 17 عدد از آنها دچار کاهش بیان شدند. از طرفی دیگر، miR-335 ، متاستاز و مهاجرت سلولهای سرطانی را از طریق هدفگیری فاکتور رونویسی (SOX4) و پروتئین تناسین C ماتریکس خارج سلولی ((TN-C مهار میکند. (15,14). تغییر در سطح بیان میکروآران آها: فاکتورهای رونویسی نقش مهمی در تنطیم بیوسنتز میکروآران آها ایفا میکنند. فاکتور رونویسی آنکوژن myc نه تنها منجر به فعالسازی بسیاری از میکروآران آها بطور مستقیم یا غیر مستقیم میگردد بلکه سبب مهار آنها در سطح ترجمه نیز میشود. به عنوان مثال myc گروه میکروآران آهای miR-17-92 پیش-سرطانزا را فعال کرده ، اما بطور همزمان بیان میکروآران آهای سرکوبگر سرطان از قبیل let-7, miR-15a را مهار کرده که نتیجتا منجر به تشدید سرطان میگردد. از طرفی دیگر، پروتئین p53 سبب القای miR-34 در پاسخ به آسیب DNA و استرسهای آنکوژنیک میگردد. بیان miR-34، اثرات p53 را تقلید کرده و منجر به مهار چرخه سلولی و در نهایت آپاپتوز میگردد. بعلاوه، بیان miR-223 در تمایز گرانولوسیتها بوسیله فاکتورهای رونویسی NFI-A و C/EBPaکنترل میشود. این دو فاکتور در اتصال به پروموتور miR-223 به رقابت میپردازند. اگر NFI-A در این رقابت پیروز شود، بیان miR-223 کاهش و اگر C/EBPa برنده باشد بیان افزایش مییابد(16,17). P53 سیکل سلول،رونوشت برداری از ژن،ترمیم DNA وآپوپتوز را کنترل میکند.در واقع هر عاملی از جمله جهش که باعث غیر فعال شدن P53 شود باعث میشود سلول آسیب دیده از فرایند آپوپتوز بگذرد و باعث ایجاد تومور شود.از اینرو غیر فعال شدن P53 یک واقعه کلیدی در تومور زائی است(35). P53یک مهار کننده سرطان میباشد که فعالیت آن در بسیاری از سرطانها جهش در خود ژن P53 یا انحرافی در پروتیین های عمل کننده در مسیر p53از قبیل MDM2 میباشد.The murine double minute (MDM2) که پروتئین MDM2 باوزن مولکولی(90-kD) را میسازد همراه با دو ژن دیگر(MDM1,MDM3) برای اولین بار در موش کشف شدند(18).بعدها ژن مشابه با آنچه در موش وجود داشت در انسان نیز کشف شد که به ان HDM2هم گفته میشود. MDM2نقش مهمی به عنوان تنظیم کننده منفی p53دارد.هدف MDM2 تومورساپرسورp53 میباشد. MDM2به عنوان سرکوبگر فعالیت پروتئین p53 شناخته میشود.MDM2 این توانایی را ازطریق اتصال وایجاد ممانعت در ناحیه N terminal دومین p53 و همچنین از طریق فعالیت E3 ubiquitin ligase انجام میدهد(18).بدین طریق که رزیدوهای لیزین ناحیه C terminal مورد فعالیت یوبی کوئتیناسیون قرار گرفته در نتیجه پروتئین p53 توسط پروتئوزومها تجزیه میشود.ژن MDM2 شامل دو پروموتور اصلی است:P1که در ناحیه بالادست اگزون 1 قرار دارد و پروموتور انترونی P2 که بین اگزون 1 و اگزون 2 واقع شده است.P1 مسئول تنظیم سطوح بیان MDM2 در موقعیتهای نرمال است.این پروموتور دارای جایگاه اتصال برای PTEN است که بیان MDM2 را سرکوب میکند.پروموتور P2 به عنوان پروموتور قابل القا و تنظیمی بیان سطح MDM2 در شرایط استرس سلولی برسی وتائید شده است که دارای محرکهای فراوانی از جمله P53 وSP 1 و گیرنده استروژن می باشند(19,18). وقتی عوملی مثل آسیب DNA باعث تحریک MDM2 میشود،این پروتئین با اتصال به ناحیه N terminalژن P53 از ترجمه و فعال شدن آن ممانعت میکند.MDM2 در بسیاری از سرطانها مانند سرطان سینه،لنفوم غیر هوجکینی،لوسمی،سرطان رحم،سرطان مری و سارکوما بیش از حد بیان میشود و باعث افت در مقدار پروتئین p53در صدمات سلولی میگردد.در حالت معمولی مقدار پروتئین p53 در آسیبهای سلولی منجمله سرطانها افزایش چشمگیری دارد.که در صورت بروز جهش در MDM2 کاهش می یابد.همچنین در تومورهایی با جهش هوموزیگوت P53 باکاهش MDM2 که نشان دهنده ممانعت از برهمکنش MDM2بر P53 است میتواند باعث تثبیت جهش P53 وپیشرفت به سمت متاستاز میشود(20). همچنین مطالعات نشان داده که MDM2 پروتئین رتینوبلاستوم (pRB) را هم غیر فعال میکند(21).اینکار را از طریق اتصال و غیر فعال کردن E2F1 انجام میدهد.از این گذشته MDM2 در تعامل با E2F1 است و آنرا تحریک میکند.E2F1 یک فاکتور رونویسی با عملکردهای پیچیده است که به همراه فاکتور رتینو بلاستوم قادر به جلو بردن چرخه سلولی از طریق القای ژنهای کد کننده مانند:دی ان آ پلی مراز و ساکلین E و نیز به جلو بردن آپاپتوز از طریق القای ژنهای کد کننده مانند:کاسپاز ها و APAF1 (22,23). به همین دلایل MDM2 به عنوان تنظیم کننده کلیدی برای P53 و مسیرهای عملکردی RB عمل می کند.MDM2 را به عنوان یک ژن ویژه که به طور بلقوه تعادل بین فرایندهای سلولی مانند رشد سلولی و تقسیم سلولی و آپاپتوز را مدیریت می کند،مطرح میشود. بنابر این هرگونه جهش یا پلی مورفیسم در ساختار ژن MDM2 رخ دهد می تواند به عنوان عامل مهمی در سزطان زائی مطرح شود(24). 40 bp Deletion/Insertion MDM2: این پلی Feb;137(2):208-12. مورفسیم 40جفت بازی در موقعیت 1518- واقع شده است که شامل یک موتیف شناخته شده TATA است که در ارتباط با سرطان سینه و سرطان ریه برسی شده است.هیو وهمکارنش درسال 2006 رابطه معناداری بین سرطاند کبد و ریه و این جهش پیدا کردند(25). 18 bp rs 68140816 Deletion/Insertion TP53و256 bp rs72080481:تا کنون در مورد این جایگاه ها هیچگونه مطالعه ای صورت نگرفته اما با توجه به اهمیت موقعیت آنها برای اولین بار تاثیر آنهارا در سرطان سینه بررسی می کنیم. miR-146a rs2910164 G>C:جایگاه آن بر روی کروموزوم 5q33.3 قرار دارد.مطالعات نشان داده که در سرطان سینه و سرطان رحم فامیلی حد اقل یک کپی از جهش آلل C در زنان جوان مبتلا به سرطان های فوق صرفه نظر از جهش در موقعیت BRCA1/2 مشاهده شده است)27,26).مطالعات نشان داده که این میکرو آر ان آ در پاسخهای ایمنی ذاتی از طریق تنظیم منفی TRAF6 و IRAK1 از طریق تغییرات پس از رونویسی دخالت دارد(28). در تحقیقات آساهی هیشیدا و همکارانش رابطه معنا داری بین این پلی مورفیسم و سرطان معده یافت شد.حکمت آکیز و همکارانش رابطه بین این پلی مورفیسم تک بازی و خطر ابتلا به سرطان کبد را نشان دادند(29,30). miR-499 rs3746444 T>C: یک جابجایی باز سیتوزین با تیمین بر روی کروموزوم 20بوده که در این میکرو آر ان آ شناسائی شده است یوزینگ و همکارانش در تحقیقاتشان نشان دادند که بین این پلی مورفیسم و سرطان کبد ارتباط وجود دارد(31). :miRNA-196a2 rs11614913 C>Tاین پلی مورفیسم درکروموزوم 12، موقعیت 3' میکرو آر ان ا بالغ قرار دارد.مطالعات نشان داده که SNP های واقع شده بر روی پره میکرو آر ان آ هامثل hsamiR-196a2 میتواند بیان میکرو آر ان آ را تحت تاثیر قرار دهد.برسی ها بر روی این پلی مورفیسم ارتباط این جهش و بیماری های مختلف از جمله انواع سرطانهامانند سرطان سینه و کولون مشاهده شده است(31). مطالعات نشان داده رابطه معنا داری بین سرطان سینه در زنان چینی و هندی با این جهش وجود دارد در حالی که در زنان اروپایی ارتباط معنا داری یافت نشده است(32).فنگ وانگ وهمکارانش در سال 2011 نشان دادند که این SNP و سرطان سینه ارتباط وجود دارد(33). :miRNA-196a2 rs185070757 T>Gاین موتاسیون برروی کروموزوم12، موقعیت 3' میکرو آر ان آ قرار دارد و برای اولین بارتاثیر آن در سرطان سینه مورد بررسی قرار خواهد گرفت. |
| مشکل جاری که سیاست گزار با آن مواجه است کدام است؟ | |
| روش های موجود کدامها هستند؟ | |
| پیشنهاد اول نحوه کاربرد | |
| محل دوم بکارگیری نتایج تحقیق | |
| سوالات و / یا فرضیات پژوهش | توزیع فراوانی پلی مورفیسم ژنmiR-146a rs2910164 در خانمهای مبتلا به سرطان سینه و خانمهای سالم متفاوت است.
توزیع فراوانی پلی مورفیسم ژن miR-499 rs3746444 در خانمهای مبتلا به سرطان سینه و خانمهای سالم متفاوت است. توزیع فراوانی پلی مورفیسم ژن miRNA-196a2 rs11614913 در خانمهای مبتلا به سرطان سینه و خانمهای سالم متفاوت است. توزیع فراوانی پلی مورفیسم ژن miRNA-196a2 rs185070575 در خانمهای مبتلا به سرطان سینه و خانمهای سالم متفاوت است. توزیع فراوانی حذف ژنی، ژن 40 bp MDM2در خانمهای مبتلا به سرطان سینه و خانمهای سالم متفاوت است. |
| هدف کلی طرح | تعیین توزیع فراوانی پلی مورفیسم ژنهای miR-146a (rs 2910164)وmiR-499 (rs 3746444) و196a2(rs185070757)-miR و(miR-196a2(rs11614913 وحذف ژنی، ژنMDM2 وحذف18bp) و256bp )ژن TP53 درزنان مبتلا به سرطان سینه در مقایسه با زنان سالم |
| منافع و مضرات روشهای موجود کدامند؟ | |
| چرا پیام تحقیق شما حلال مشکل جاری است؟ | |
| اهداف اختصاصی | تعیین توزیع فراوانی پلی مورفیسم ژن miR-146a rs2910164 در خانمهای مبتلا به سرطان سینه و خانمهای سالم
تعیین توزیع فراوانی پلی مورفیسم ژن miR-499 rs3746444 در خانمهای مبتلا به سرطان سینه و خانمهای سالم تعیین توزیع فراوانی پلی مورفیسم ژن miRNA-196a2 rs11614913در خانمهای مبتلا به سرطان سینه و خانمهای سالم تعیین توزیع فراوانی پلی مورفیسم ژن miRNA-196a2 rs185070757درخانمهای مبتلا به سرطان سینه و خانمهای سالم تعیین توزیع حذف ژ نی،ژن 40 bp MDM2در خانمهای مبتلا به سرطان سینه و خانمهای سالم |
| پیشنهاد دوم نحوه کاربرد | |
| محل سوم بکارگیری نتایج تحقیق | |
| سازمانها، مراکز و موسسات و سایر بهره برداران بالقوه دستاوردهای طرح | |
| پیام تحقیق شما چه منافعی از نظر هزینه، کارایی و بهره وری برای مدیر دارد؟ | |
| برای اجرای راه حل پیشنهادی شما چه موانع و حمایتهایی وجود دارند؟ | |
| تعریف واژه های تخصصی | |
| پیشنهاد سوم نحوه کاربرد | |
| محل چهارم بکارگیری نتایج تحقیق | |
| نوع مطالعه | موردی – شاهدی (case –contorol) |
| جامعه مورد مطالعه(معرفی مشارکت کنندگان)/ محیط پژوهش(معیارهای ورود و خروج ذکر شوند) | ازکلیه بیماران مبتلا به سرطان پستان نمونه گیری شده است و موارد جدیدی که تشخیص داده شده و مراجعه می کنندنیز اضافه میشود.نمونه های مورد از خانم های سالم که مبتلا به سرطان پستان نبوده و بیماری سیستمیک شناخته شده ای ندارند. |
| پیشنهاد چهارم نحوه کاربرد | |
| حجم نمونه و روش محاسبه آن | برای بررسی پلی مورفیسم و حذف ژنی٬از خانم های مبتلا به سرطان سینه در زاهدان که هم اکنون تحت درمان می باشند به تعداد150 نفر که قبلا خون گرفته شده است. گروه شاهد از نمونه های خون خانم های سالم که در طرح بررسی شیوع سندروم متابولیک وارد مطالعه شده اند استفاده می شود ( حداقل 220 نفر ). |
| روش نمونه گیری(نحوه تخصیص تصادفی و همسانسازی در صورت لزوم ذکر شود) | |
| روش و ابزار جمع آوري داده ها / صحت و استحکام داده ها (پرسشنامه یا فرم اطلاعاتی ضمیمه شود) | |
| روش اجرای طرح(با جزئیات بطور کامل شرح داده شود) | برای بررسی پلی مورفیسم و حذف ژنی نمونه خون در 20- درجه سانتیگراد نگهداری میشود. DNA نمونه خون افراد گروه شاهد و مورد به روش salting out تخلیص میشود. پرایمرهای اختصاصی جهت تعیین پلی مورفیسم ژنی به روش ARMS-PCR طراحی می شود. در مرحله بعد شرایط PCR برای تعیین این پلی مورفیسم ها بهینه می شود و سپس پلی مورفیسم ها ی ژنی ذکر شده در نمونه ها با این تکنیک آنالیز می شوند.درنهایت نتیجه کار رابا الکتروفورزمشخص می کنیم. برای بررسی حذف ازPCR والکتروفورز استفاده می کنیم. برای صحت عملکرد روش از سکانس ژنومی استفاده میشود. |
| روش تجزیه، تحليل و توصیف دادهها (نمونهاي از جدول توخالي ضميمه شود و روش هاي آماري مورد استفاده به طور كامل توضيح داده شود)(کیفی و کمی) | پس از گردآوری اطلاعات لازم، یافته ها در نرم افزار آماری SPSS وارد گشته و داده ها با استفاده از آزمون های آماری χ2 و تی تست مستقل مورد تجزیه و تحلیل قرار خواهند گرفت. |
| ملاحظات اخلاقی | با رضایت کامل از بیماران نمونه گیری می شود و تعهد می شود نام ومشخصات بیماران در هیچ گزارشی قید نشود. انجام آزمایشات هیچ گونه هزینه ای برای بیمار نخواهد داشت(باتوجه به کد های اخلاقی شماره های 1، 2،20،17) |
| محدودیتهای اجرائی طرح و پیش بینی جهت حل آنها | - عدم همکاری بیمار -مشکل تهیه مواد وامکان طولانی شدن زمان دریافت آنها |
| کلمات کلیدی | سرطان سینه، پلیمرفیسم ، حذف ژنی،MDM2،TP 53,miRNA |
| فهرست منابع و مراجع | 1. Even-Sapir E, Inbar M. PET in women with high risk for breast or ovarian cancer. Lancet Oncol. 2010 Sep;11(9):899-905. 2. Fishman A. The effects of parity, breastfeeding, and infertility treatment on the risk of hereditary breast and ovarian cancer: a review. Int J Gynecol Cancer. 2010 Oct;20(11 Suppl 2):S31-3. 3. Yu Z, Baserga R, Chen L, Wang C, Lisanti MP, Pestell RG. microRNA, cell cycle, and human breast cancer. Am J Pathol. 2010 Mar;176(3):1058-64. 4. Sotiropoulou G, Pampalakis G, Lianidou E, Mourelatos Z. Emerging roles of microRNAs as molecular switches in the integrated circuit of the cancer cell. RNA. 2009 Aug;15(8):1443-61. 5. Duan R, Pak C, Jin P. Single nucleotide polymorphism associated with mature miR-125a alters the processing of pri-miRNA. Hum Mol Genet. 2007 May 1;16(9):1124-31. 6. Ahmed FE. Role of miRNA in carcinogenesis and biomarker selection: a methodological view. Expert Rev Mol Diagn. 2007 Sep;7(5):569-603. 7. Nikolic I, Plate KH, Schmidt MH. EGFL7 meets miRNA-126: an angiogenesis alliance. J Angiogenes Res. 2010;2(1):9. 8. Roy S, Sen CK. miRNA in wound inflammation and angiogenesis. Microcirculation. 2012 Apr;19(3):224-32. 9. Gao Y, He Y, Ding J, Wu K, Hu B, Liu Y, et al. An insertion/deletion polymorphism at miRNA-122-binding site in the interleukin-1alpha 3' untranslated region confers risk for hepatocellular carcinoma. Carcinogenesis. 2009 Dec;30(12):2064-9. 10. Tsutsumi A, Kawamata T, Izumi N, Seitz H, Tomari Y. Recognition of the pre-miRNA structure by Drosophila Dicer-1. Nat Struct Mol Biol. 2011 Oct;18(10):1153-8. 11. Cifuentes D, Xue H, Taylor DW, Patnode H, Mishima Y, Cheloufi S, et al. A novel miRNA processing pathway independent of Dicer requires Argonaute2 catalytic activity. Science. 2010 Jun 25;328(5986):1694-8. 12. Mueller C, Tang Q, Gruntman A, Blomenkamp K, Teckman J, Song L, et al. Sustained miRNA-mediated knockdown of mutant AAT with simultaneous augmentation of wild-type AAT has minimal effect on global liver miRNA profiles. Mol Ther. 2012 Mar;20(3):590-600. 13. Tchatchou S, Jung A, Hemminki K, Sutter C, Wappenschmidt B, Bugert P, et al. A variant affecting a putative miRNA target site in estrogen receptor (ESR) 1 is associated with breast cancer risk in premenopausal women. Carcinogenesis. 2009 Jan;30(1):59-64. 14. Zhu R, Yang Y, Tian Y, Bai J, Zhang X, Li X, et al. Ascl2 knockdown results in tumor growth arrest by miRNA-302b-related inhibition of colon cancer progenitor cells. PLoS One. 2012;7(2):e32170. 15. Xie L, Qian XP, Liu BR. [Novel tumor markers-circulating miRNA]. Zhonghua Zhong Liu Za Zhi. 2011 Sep;33(9):641-2. 16. Cheng AM, Byrom MW, Shelton J, Ford LP. Antisense inhibition of human miRNAs and indications for an involvement of miRNA in cell growth and apoptosis. Nucleic Acids Res. 2005;33(4):1290-7. 17. Cha YH, Kim NH, Park C, Lee I, Kim HS, Yook JI. MiRNA-34 intrinsically links p53 tumor suppressor and Wnt signaling. Cell Cycle. 2012 Apr 1;11(7):1273-81. 18. Fakharzadeh SS, Trusko SP, George DL: Tumorigenic potential associated with enhanced expression of a gene that is amplified in a mouse tumor cell line. EMBO J 1991, 10(6) :1565-9. 19. Olivier M, Hussain SP, Caron de Fromentel C, Hainaut P, Harris CC Tp53 mutation spectra and load: a tool for generating hypotheses on the etiology of cancer. IARC Sci Publ 2004;157:247–70. 20. Momand J, Zambetti GP, Olson DC, George D, Levine AJ. The mdm2 oncogene product forms a complex with the p53 protein and inhibit p53-mediated transactivation. Cell 1992;69:1237–45. 21. Oliner JD, Pietenpol JA, Thiagalingam S, Gyuris J, Kinzler KW Vogelstein B. Oncoprotein MDM2 conceals the activation domain tumour suppressor p53. Nature 1993;362:857–60. 22. Polager S, Ginsberg D. p53 and E2f: partners in life and death. Nat Rev Cancer 2009;738-748. 23. Knappskog S, Lonning PE. Effects of the MDM2 promoter SNP285 and SNP309 on Sp1 transcription factor binding |
| معرفی پژوهش/ اهداف پژوهش (عین عبارت هدف پروپوزال را کپی نکنید. بلکه با جملاتی که برای مردم قابل فهم باشد (برای سواد حدود پنجم ابتدایی )هدف را برای شرکت کنندگان توضیح دهید.) در تمام این متن در صورتیکه شرکت کننده کودک یا فرد فاقد ظرفیت تصمیم گیری است باید مواردیکه منظور از "من"، فرد شرکت کننده بوده است به "کودک" یا "فرد تحت سرپرستی من" اصلاح شود و مواردیکه منظور از "من"، رضایت دهنده است به من به عنوان "ولی" یا "قیم قانونی" اصلاح شود. | |
| خون گیری (آیا طرح شما نیاز به خونگیری دارد یا خیر) | |
| نحوه همکاری/ مزایا ی طرح (در این بخش برای شرکت کنندگان به زبان ساده توضیح دهید که: چه مداخله ای بر روی آنها صورت میگیرد. چه اقدامات پاراکلینیکی بر روی آنها انجام میشود. چه نمونه ای و با چه حجمی از آنها میگیرید در این مدت چند نوبت مراجعه باید داشته باشند و به چه فواصلی چه اقداماتی را در پیگیری آنها انجام میدهید. (حتی میتوانید سود بالقوه ای که شرکت کنندگان میتوانند از شرکت در این پژوهش ببرند بنویسید. این سود میتواند شرح احتمال درمان یا تشخیص بهتر بیماریشان، دریافت خدمات سلامت رایگان و یا پرداخت مشوق مالی در ازای جبران همکاریشان باشد) | |
| عوارض جانبی (منظور عوارض و میزان احتمال بروز آنها در این مطالعه است) | |
| جبران عوارض احتمالی (برای آنکه شرکت کننده بتواند ارزیابی مناسبی از سود و زیان شرکت در پژوهش شما داشته باشد لازم است بتواند سود و زیان مداخلات معمول و مداخلات این پژوهش را مقایسه کند. به عنوان مثال میزان موفقیت و میزان عوارض هریک را مقایسه کند.) - او باید بداند كه اگر در حين و بعد از انجام پژوهش هم هر مشكلي اعم از جسمي و روحي به علت شرکت در اين پژوهش برایش پيش آمد درمان عوارض، و هزينههاي آن و غرامت مربوطه بر عهده مجري خواهد بود. | |
| هزینه های مربوط به انجام طرح تحقیقاتی (تمام مداخلات پژوهشی باید برای بیمار رایگان باشد و بیمار بداند شامل چه مواردی هستند. ) | |
| روش های جایگزین در صورت عدم تمایل به شرکت در مطالعه چه روش های درمانی برای بیمار ارائه خواهد شد | |
| محرمانه بودن بیمار باید بداندکه دست اندر كاران اين پژوهش، كليه اطلاعات مربوط به او را نزد خود به صورت محرمانه نگهداشته و فقط اجازه دارند نتايج كلي و گروهي اين پژوهش را بدون ذکر نام و مشخصات بیمار منتشر كنند. و كميته اخلاق در پژوهش با هدف نظارت بر رعایت حقوق وی ميتواند به اطلاعات ایشان دسترسي داشته باشد. | |
| پاسخگویی به پرسش ها در این بخش نام و اطلاعات دسترسی فردی از عوامل پژوهش را که بتواند اطلاعات صحیح و کافی در اختیار شرکت کنندگان قرار دهند و در مورد عوارض و نگرانیها راهنمایی لازم را ارائه دهند ذکر شود | |
| حق نپذیرفتن یا انصراف بیمار باید بداند که شرکت اودر اين پژوهش کاملاً داوطلبانه است و مجبور به شرکت در اين پژوهش نيست و در صورت عدم شرکت از مراقبتهاي معمول تشخيصي و درماني محروم نخواهد شد او باید بداند كه حتي پس از موافقت با شركت در پژوهش ميتواند هر وقت كه بخواهد، پس از اطلاع به مجري، از پژوهش خارج شود و خروج اواز پژوهش باعث محرومیت از دریافت خدمات درمانی معمول برای اونخواهد شد. | |
| رضایت او باید بداند که اگر اشکال يا اعتراضي نسبت به دست اندركاران يا روند پژوهش دارد مي تواند با كميته اخلاق در پژوهش دانشگاه تماس گرفته و مشکل خود را به صورت شفاهي يا كتبي مطرح نمايد. در انتهای فرم قید گردد : اينجانب موارد فوقالذکر را خواندم و فهميدم و بر اساس آن رضايت آگاهانه خود را براي شركت در اين پژوهش اعلام ميکنم. اينجانب ……………… خود را ملزم به اجراي تعهدات مربوط به مجري در مفاد فوق دانسته و متعهد ميگردم در تأمين حقوق و ايمني شركت كننده در اين پژوهش تلاش نمايم | |
| پرسشنامه یا فرم اطلاعاتی |
| نام فایل | تاریخ درج فایل | اندازه فایل | دانلود |
|---|---|---|---|
| فــرم تحویل پروپزال.jpeg | 1391/04/21 | 1021777 | دانلود |
| فرم انتخاب عنوان پایان نامه (جهت ثبت اولیه).jpeg | 1391/04/21 | 666914 | دانلود |
| مراحل تصویب پایان نامه.jpeg | 1391/04/21 | 604765 | دانلود |
| فرم رضایت آگاهانه.doc | 1391/04/21 | 90624 | دانلود |
| پروپوزال نهایی.doc | 1391/09/08 | 331776 | دانلود |
| 91.8.24.doc | 1391/09/08 | 83456 | دانلود |
| 5664.jpg | 1392/04/04 | 1122649 | دانلود |
