بررسی پلی مورفیسم های ژنهای COL4A4(rs2228557),COL4A3(rs55703767), TIMP-1(rs4898), TIMP-1(rs6609533 در بیماران مبتلا به کراتوکونوس(قوز قرنیه) ومقایسه آن با افراد سالم.

Evaluation of polymorphisms of COL4A4(rs2228557), COL4A3(rs55703767), TIMP1(rs4898), TIMP-1(rs6609533) genes in patients with keratoconus and compare with healthy individual


چاپ صفحه
پژوهان
صفحه نخست سامانه
مجری و همکاران
مجری و همکاران
اطلاعات تفضیلی
اطلاعات تفضیلی
دانلود
دانلود
علوم پزشکی زاهدان
علوم پزشکی زاهدان

مجریان: رامین سراوانی

کلمات کلیدی:

اطلاعات کلی طرح
hide/show

کد طرح 6077
عنوان فارسی طرح بررسی پلی مورفیسم های ژنهای COL4A4(rs2228557),COL4A3(rs55703767), TIMP-1(rs4898), TIMP-1(rs6609533 در بیماران مبتلا به کراتوکونوس(قوز قرنیه) ومقایسه آن با افراد سالم.
عنوان لاتین طرح Evaluation of polymorphisms of COL4A4(rs2228557), COL4A3(rs55703767), TIMP1(rs4898), TIMP-1(rs6609533) genes in patients with keratoconus and compare with healthy individual
نوع طرح
محل اجرای طرح مدیریت توسعه فناوری سلامت
رسته مطالعاتی بنیادی- کاربردی
دانشکده/مرکز دانشکده پزشکی زاهدان
زمان اجرا -روز

اطلاعات مجری و همکاران
hide/show

نام و نام‌خانوادگی سمت در طرح نوع همکاری درجه‌تحصیلی پست الکترونیک
داود یاریهمکاردانشجوکارشناسی ارشدDavidyari.85@gmail.com
رامین سراوانیاستاد راهنمای اول پایان نامه دانشجویی دکترای تخصصی saravaniramin@yahoo.com
محمد حسین ولیدادمشاور فوق تخصصmhovalidad@gmail.com
غلامرضا بهاریمشاوراستاد مشاوردکترای تخصصی r_b_1333@yahoo.com

اطلاعات تفضیلی
hide/show

عنوان متن
خلاصه طرح به فارسی بررسی پلی مورفیسم های ژنهای COL4A4(rs2228557),COL4A3(rs55703767), TIMP-1(rs4898), TIMP-1(rs6609533 در بیماران مبتلا به کراتوکونوس(قوز قرنیه) ومقایسه آن با افراد سالم.
خلاصه طرح به لاتینEvaluation of polymorphisms of COL4A4(rs2228557), COL4A3(rs55703767), TIMP1(rs4898), TIMP-1(rs6609533) genes in patients with keratoconus and compare with healthy individual
محل اول بکارگیری نتایج تحقیق
بيان مسئله تحقيق/اهمیت پژوهشکراتوکونوس(KC)یک عارضه غیرالتهابی و دوطرفه(bilateral) قرنیه است که برای اولین بار در سال 1854 با جزئیات به عنوان یک بیماری توصیف شدکه همراه با پیشروندگی در گشادشدگی و برآمدگی قرنیه ایجادمی گردد(1),(2, 3).

کراتوکونوس یک بیماری به نسبت شایع است، با فراوانی حدود 50 در 100000 که درواقع در این بیماری قسمت مرکزی یا پارا سنترال (paracentral) قرنیه بطور پیشرونده نازک شده و به دنبال آن، قرنیه دچاربرآمدگی (balging) می شود (4),(5, 6) بطوری که قرنیه شکل مخروط (cone) به خود می گیرد.به علت برآمدگی قرنیه فرد دچار نزدیک بینی و آستیگماتیسم نا منظم می شود (4),(5),.

کراتوکونوس معمولا در طی دهه دوم زندگی و در سن بلوغ آغاز می شود و در طی دهه چهارم زندگی به صورت تثبیت شده در می آید. کراتوکونوس در هر دو جنس مذکر و مونث ایجاد می شود گرچه به وضوح مشخص نشده که در کدام جنس از شیوع بیشتری برخوردار است . در طی مطالعات مختلف هم تفاوت و هم عدم تفاوت میزان شیوع مختلف وابسته به جنسیت اثبات شده است. (4),(5),(6)

نشانه های ظاهری بیماری وابسته به میزان شدت بیماری است و عموما برای فرد بیمار قابل تشخیص نیست. نشانه های نخست بیماری با کاهش دید همراه است. در حالات خفیف بیماری که قسمت اعظم بیماران را شامل می شود، دید فرد بیمار را می توان با عینک اصلاح کرد. در مواردی که نتوان از عینک استفاده کرد مانند آستیگماتیسم نا منظم،می توان از لنزهای تماسی سخت استفاده نمود(7).



کراتوکونوس را به عنوان یک بیماری چند علتی(multifactorial)می شناسند که در بروز آن هر دو فاکتورهای محیطی و ژنتیکی رادخیل می دانند(8).

علی رغم مطالعات گسترده ای که در طی دهه های اخیر انجام گرفته، علت و مکانیسم بیماری به طور کامل مشخص نشده است .نظریه های مختلف مکانیسم های بیو شیمیایی و ژنتیکی را ارایه کرده اند،اما بر اساس مطالعات حاصل از تکنیک توپوگرافی قرنیه حداقل در 6 تا 8 درصد از موارد مشاهده شده رابطه فامیلی و ژنتیکی مشخص شده است(9).

برای اثبات ریشه ژنتیکی این بیماری بررسی بر روی دوقلوهای همسان که به این بیماری مبتلا بودند نشان داد که سطح پیشرفت مشابهی دارند که خود تاکید کننده ریشه ژنتیکی این بیماری است(10, 11).



علاوه بر این مطالعات حاصل از آنالیز ژنتیکی، نیز نقش ژنتیک را در این بیماری اثبات کرده است . بر اساس این مطالعات، محققین مختلف به ارتباط جهش در ژن های خاص و ابتلا به این بیماری اشاره کرده اند، که از این میان می توان به مطالعه Heon و همکاران در سال 2002 اشاره کرد که ارتباط این بیماری با 4 جهش در ژن VSX1(R166W,L159M ,D144E,H244R) را مورد بررسی قرار دادند (12).

همچنین Bisceglia وهمکاران نیزارتباط 4 جهش دیگر ژن( VSX1) بااین بیماری را بیان کردند(13).



فاکتور های بیو شیمیایی:

تا کنون نظریه های بیو شیمیایی مختلفی برای دلیل ایجاد کراتوکونوس ارائه شده است که با این نظریه ها می توان تغییر ساختاری قرنیه چشم در طی این بیماری را به خوبی بیان کرد.

Maatta و همکاران وی توانستند طی تحقیقات خود، انواع متفاوتی از کلاژن های نوع XIII وXV وXVIII را در بین بیماران مبتلا و افراد نرمال پیدا کنند. بر این اساس پیشنهاد کردند که این تفاوت می تواند یک نقش کلیدی در روند تبدیل شدن قرنیه نرمال به فرم بر آمده داشته باشد(14, 15).

تخریب زیاد بافت همبند قرنیه در کراتوکونوس مشاهده شده است، که می تواند نتیجه فعالیت آنزیم های پروتئاز های خاص که باعث آغاز فرآیند پروتئولیز یا افزایش فعالیت سایر آنزیم های کاتابولیکی باشد(16) یا حتی بر اثر کاهش سطح مهارکننده پروتئاز ها مانندآلفا 2ماکروگلوبولین و الفا 1 آنتی پروتئازها باشد(17, 18).

از آنجاکه 70 درصدوزن قرنیه را کلاژن تشکیل می دهدو بامطالعات بیوشیمی این مسئله به اثبات رسیده است که قرنیه کراتوکونیک محتوای کمتری از کلاژن را شامل می باشد لذا نازک و گشادشدن قرنیه در کراتوکونوس موید تجزیه ماتریکس خارج سلولی است که این عمل به وسیله آنزیم های کلاژناز و ژلاتیناز که اعضای ماتریکس متالوپروتئیناز(MMP)از خانواده اندوپپتیداز هستند صورت می گیرد.ماتریکس متالوپروتئیناز به شدت توسط مهار کننده های اختصاصی خود بنام مهار کننده های بافتی متالوپروتئیناز(TIMP) تنظیم

می شوند(19).



کلاژن پروتئینی است که در ماتریکس خارج سلولی جانوران، وجود دارد. کلاژن فراوانترین پروتئین بدن محسوب می‌گردد. پروتئین کلاژن بصورت رشته‌های کلاژن مشاهده می‌شود. رشته‌های کلاژن در همه انواع بافت همبند، ولی به میزان متفاوت یافت PMID: 7525507.
19. Collier SA. Is the corneal degradation in keratoconus caused by matrix-metalloproteinases? Clinical & experimental ophthalmology. 2001 Dec;29(6):340-4. PubMed PMID: 11778801.
20. Drew BT, Smith TO, Littlewood C, Sturrock B. Do structural changes (eg, collagen/matrix) explain the response to therapeutic exercises in tendinopathy: a systematic review. British journal of sports medicine. 2012 Oct 31. PubMed PMID: 23118117.
21. Segura AM, Frazier OH, Buja LM. Fibrosis and heart failure. Heart failure reviews. 2012 Nov 4. PubMed PMID: 23124941.
22. Engvall E, Ruoslahti E. Binding of soluble form of fibroblast surface protein, fibronectin, to collagen. International journal of cancer Journal international du cancer. 1977 Jul 15;20(1):1-5. PubMed PMID: 903179.
23. Brilla CG, Zhou G, Matsubara L, Weber KT. Collagen metabolism in cultured adult rat cardiac fibroblasts: response to angiotensin II and aldosterone. Journal of molecular and cellular cardiology. 1994 Jul;26(7):809-20. PubMed PMID: 7966349.
24. Pescucci C, Mari F, Longo I, Vogiatzi P, Caselli R, Scala E, et al. Autosomal-dominant Alport syndrome: natural history of a disease due to COL4A3 or COL4A4 gene. Kidney international. 2004 May;65(5):1598-603. PubMed PMID: 15086897.
25. Zhang Y, Wang F, Ding J, Zhang H, Zhao D, Yu L, et al. Genotype-phenotype correlations in 17 Chinese patients with autosomal recessive Alport syndrome. American journal of medical genetics Part A. 2012 Sep;158A(9):2188-93. PubMed PMID: 22887978.
26. Meguro A, Ideta H, Ota M, Ito N, Ideta R, Yonemoto J, et al. Common variants in the COL4A4 gene confer susceptibility to lattice degeneration of the retina. PloS one. 2012;7(6):e39300. PubMed PMID: 22723992. Pubmed Central PMCID: 3378527.
27. Chen YM, Miner JH. Glomerular basement membrane and related glomerular disease. Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine. 2012 Oct;160(4):291-7. PubMed PMID: 22683419. Pubmed Central PMCID: 3477400.
28. Nie XC, Wang JP, Zhu W, Xu XY, Xing YN, Yu M, et al. COL4A3 expression correlates with pathogenesis, pathologic behaviors, and prognosis of gastric carcinomas. Human pathology. 2013 Jan;44(1):77-86. PubMed PMID: 22939955.
29. Stabuc-Silih M, Ravnik-Glavac M, Glavac D, Hawlina M, Strazisar M. Polymorphisms in COL4A3 and COL4A4 genes associated with keratoconus. Molecular vision. 2009;15:2848-60. PubMed PMID: 20029656. Pubmed Central PMCID: 2796875.
30. Heidet L, Arrondel C, Forestier L, Cohen-Solal L, Mollet G, Gutierrez B, et al. Structure of the human type IV collagen gene COL4A3 and mutations in autosomal Alport syndrome. Journal of the American Society of Nephrology : JASN. 2001 Jan;12(1):97-106. PubMed PMID: 11134255.
31. Rana K, Tonna S, Wang YY, Sin L, Lin T, Shaw E, et al. Nine novel COL4A3 and COL4A4 mutations and polymorphisms identified in inherited membrane diseases. Pediatric nephrology. 2007 May;22(5):652-7. PubMed PMID: 17216251.
32. Brew K, Nagase H. The tissue inhibitors of metalloproteinases (TIMPs): an ancient family with structural and functional diversity. Biochimica et biophysica acta. 2010 Jan;1803(1):55-71. PubMed PMID: 20080133. Pubmed Central PMCID: 2853873.
33. Kumar M, Bhadoria DP, Dutta K, Singh S, Gupta J, Kumar R, et al. Combinatorial effect of TIMP-1 and alpha1AT gene polymorphisms on development of chronic obstructive pulmonary disease. Clinical biochemistry. 2011 Sep;44(13):1067-73. PubMed PMID: 21763297.
34. Skarmoutsou E, D'Amico F, Marchini M, Malaponte G, Scorza R, Mazzarino MC. Association of TIMP-1 +372 SNP with digital ulcer manifestation in female systemic sclerosis patients. Human immunology. 2012 Sep;73(9):950-3. PubMed PMID: 22820628.
35. Yi YC, Chen MK, Chen LY, Ho ES, Ying TH, Wang PH, et al. Genetic polymorphism of the tissue inhibitor of metalloproteinase-1 is associated with an increased risk of endometrial cancer. Clinica می‌شوند. سنتز کلاژن به‌وسیله فیبروبلاست‌ها مشابه ساخت سایر پروتئین‌ها می‌باشد. سنتز کلاژن توسط سلول‌های استئوبلاست دراستخوان، کندروبلاست در غضروف، ادونتوبلاست در دندان، سلول‌های ماهیچه صاف در دیواره رگ‌های خونی و سلول‌های اپیتلیال نیز انجام می‌گیرد. ترکیب اسید آمینه تشکیل دهنده کلاژن در بافت‌های مختلف دارای تفاوت‌های جزئی است(20, 21).

تا کنون بیش از 19 نوع کلاژن شناخته شده است که فراوان ترین آن کلاژن نوع I در رشته های سفید مانند درم پوست،رباط، زردپی، عاج دندان می باشد که عملکرد آن ، مقاومت در برابر نیروهای کششی است(22, 23).

COL4A4:این ژن روی کروموزوم 2q35_q37 قرار دارد و یکی از 6 زیر واحد کلاژن IV را کد می کند. مانند سایر ژن های کلازن IV این ژن در یک ساختار سر به سر با یکی دیگر از ژن های کلاژن نوع IV سازمان دهی شده است به گونه ای که هر جفت ژن، پروموتر مشترک دارند. دو رونوشت متفاوت فقط در سایت آغاز رونویسی برای این ژن شناسایی شده است،ولی سایت های مشترک برای ژن کلاژن،در پلی آدنیلاسیون 3’UTR یافت می شود. موتاسیون در این ژن با سندروم اتوزومال مغلوب آل پورت(گلومرول نفروپاتی ارثی)نوع II و با هماچوری خوش خیم فامیلی (بیماری غشا پایه نازک) همراه است(24).



یان کین ژان وفانگ وانگ و همکارانشان مطالعه ای در سال 2012 روی 17 بیمار چینی مبتلا به الپورت انجام دادند و مشخص گردید که یک پلی مورفیسم در ژن (pro1572leu : c4715C>T)col4a4 باعث ابتلای به این بیماری می گردد(25).

در بررسی دیگری در سال 2012 که روی پلی مورفیسم ژن col4a4 با(rs4675115، rs4675124، rs3769641،rs3923084، rs2229814، rs4389330، rs7558981،( rs 6718820 و روی بیماران مبتلا به مشکل شبکیه چشم (lattic degeneration )ومقایسه آن با افراد سالم در کشور ژاپن انجام گرفت، مشخص گردید که این ژن شدیدا در ارتباط با این بیماری است(26).



در مطالعه ای در سال 2012 که در مورد بیماری glomerular روی چندین ژن مختلف انجام گرفت، نشان داد که پلی مورفیسم در ژن col4a4 باعث ابتلا ی به این بیماری می گردد(27).



COL4A3:این ژن جزء خانواده تیپ IV کلاژن است و روی کرموزوم

2q 36-q37 قرار دارد که شامل 52 اگزون می باشد.این ژن در یک ساختار سربه سر با کلاژن های دیگر تیپ IV سازماندهی شده است و بنابراین هر جفت ژن در یک پروموتر شریک هستند.توزیع این ژن محدود به غشاءپایه در بافت های خاصی می باشد که می توان ازآن جمله به غشاءپایه حلزون گوش،غشاءپایه کپسول قدامی عدسی چشم و غشاءپایه آلوئولار مویرگی اشاره کرد.جهش در این ژن موجب بروز بیماری اتوزومال مغلوب سندرم آلپورت و همچنین در بروز سندروم گودپسچر(Goodpasture)که در آن اتوآنتی بادی ها باآنتی ژن COL4A3 در غشاءپایه آئول و گلومرول کلیه متصل می شود نقش دارد.تحقیقات اخیر نقش کلاژن تیپIV را در چسبندگی های سلولی نشان داده است(28).



در تحقیقی در سال 2009 استابوک و همکاران پلی مورفیسم در ژن COL4A3 رادر بیماران کراتوکونوس در جمعیت اسلوونی بررسی کردندو دریافتند که دو پلی مورفیسم در( D326Y and P574L)(rs55703767)دراین ژن در بیماران مبتلا به کراتوکونوس معنا دار می باشد،همچنین در ژن COL4A4 نیز پلی مورفیسم در(F1644F)(rs2228557) نیز در بیماری ذکر شده معنی داراست(29).



HEIDET و همکارانش در طی تحقیقی در فرانسه درسال 2001 نشان دادند پلی مورفیسم در ژن COL4A3 مسئول بروز سندروم(اتوزومال مغلوب)آلپورت است که موجب غیر طبیعی شدن غشاءپایه گلومرال، نفروپاتی وهماچوری پیش رونده می باشد(30).



همچنین در سال 2007 در تحقیقی در جمعیت استرالیا رانا و همکارانش که بر روی نمونه های تصادفی و غیر مرتبط کار می کردند توانستند بین پلی مورفیسم در ژن COL4A3 و نفروپاتی بر اثر نازک شدن غشاءپایه (TBMN)ارتباط معنادار برقرار کنند واثر ژن بر این بیماری رااثبات کنند(31).





TIMP-1:( tissue inhibitors of metalloproteinases)مهارکننده های بافتی متالو پروتئیناز،

این ژن روی کروموزوم X11p11.23–11.4 قرار دارد این ژن در ژنوم انسان شامل چهار پارالوگ 4-1-TIMP می باشد .به صورت کلی عمل اصلی این پروتئین به عنوان مهار کننده ماتریکس متالوپروتئیناز (MMP)می باشد ولی فعالیت های وسیع دیگری نیز برای آن مطرح شده است.

از جمله مهار چندین دیس انتگرین- متالوپروتئیناز ،اثر بر رشد و نمو سلولی،مهاجرت سلولی،اثر ضدرگزایی،اثر حمایتی یا مهاری در آپوپتوز و درانعطاف پذیری سیناپس ها نیز دارای نقش می باشد.

TIMP تنظیم کننده کلیدی متالوپروتئینازاست که باعث مهار تجزیه ماتریکس خارج سلولی می شودو در بازسازی و نوآرائی بافت هاو رفتار سلولی اثر می گذارد

TIMP-1حدود %40-37 با سایر پارالوگ ها شباهت داردو دارای فعالیت محدود بر روی MMP-14 -16, -19, -24 می باشد.نقش اصلیTIMP-1 در جلوگیری از بروز یا پیشرفت کراتوکونوس در جلوگیری از فعالیت پروتئیناز هایی چون کلاژناز،ژلاتیناز واسترو میلینازدر ماتریکس خارج سلولی است که با مهار تجزیه ECM سبب کنترل بیماری می گردد(32).



طی تحقیقی که در سال 2011 در هند صورت گرفت کومار و همکاران که برروی پلی مورفیسم TIMP-1 در پیشرفت بیماری مزمن انسداد ریوی کار می کردند نشان دادند که ژن مزبور در(rs6609533)ارتباط معنی داری با بیماری دارد و باعث پیشرفت بیماری می شود(33).



در تحقیقی در سال2012 در ایتالیا صورت گرفت که درآن اسکارموتسوو و همکاران پلی مورفیسم ژن TIMP-1 در(rs4898)را در ظهور زخم برروی زنان مبتلا به اسکلروز سیستماتیک مورد بررسی قرار دادند و پلی مورفیسم در این ژن را در احتمال بروز بیماری نشان دادند(34).

در تایوان یو-چیایو وای و همکاران در سال 2009 طی تحقیقی پلی مورفیسم ژن TIMP-1 را دراحتمال افزایش ریسک ابتلا به سرطان اندومتریال موردارزیابی قراردادند و بین پلی مورفیسم در این ژن و ریسک ابتلا به بیماری ارتباط معنی داری chimica acta; international journal of clinical chemistry. 2009 Nov;409(1-2):127-31. PubMed PMID: 19758569.
یافتند(35).

مشکل جاری که سیاست گزار با آن مواجه است کدام است؟
روش های موجود کدامها هستند؟
پیشنهاد اول نحوه کاربرد
محل دوم بکارگیری نتایج تحقیق
سوالات و / یا فرضیات پژوهش
توزیع فراوانی پلی مورفیسم ژن COL4A4(rs2228557 در افراد مبتلا به کراتوکونوس و افراد سالم متفاوت است.

توزیع فراوانی پلی مورفیسم ژن(COL4A3(rs55703767 در افراد مبتلا به کراتوکونوس و افراد سالم متفاوت است.

توزیع فراوانی پلی مورفیسم ژن(TIMP-1(rs4898 در افراد مبتلا به کراتوکونوس و افراد سالم متفاوت است.

توزیع فراوانی پلی مورفیسم ژن TIMP-1(rs 6609533 در افراد مبتلا به کراتوکونوس و افراد سالم متفاوت است.
هدف کلی طرحمقایسه پلی مورفیسم های ژن هایCOL4A4(rs2228557), COL4A3(rs55703767) TIMP-1(rs4898), TIMP-1(rs 6609533 در بیماران مبتلا به کراتوکونوس و افراد سالم
منافع و مضرات روشهای موجود کدامند؟
چرا پیام تحقیق شما حلال مشکل جاری است؟
اهداف اختصاصیمقایسه توزیع فراوانی پلی مورفیسم ژن (COL4A4(rs2228557 در افراد مبتلا به کراتوکونوس و افراد سالم
مقایسه توزیع فراوانی پلی مورفیسم ژن (COL4A3(rs55703767 در افراد مبتلا به کراتوکونوس و افراد سالم
مقایسه توزیع فراوانی پلی مورفیسم ژن (TIMP-1(rs4898 در افراد مبتلا به کراتوکونوس و افراد سالم
مقایسه توزیع فراوانی پلی مورفیسم ژن (TIMP-1(rs 6609533در افراد مبتلا به کراتوکونوس و افراد سالم
پیشنهاد دوم نحوه کاربرد
محل سوم بکارگیری نتایج تحقیق
سازمانها، مراکز و موسسات و سایر بهره برداران بالقوه دستاوردهای طرحدانشگاه علوم پزشکی زاهدان
پیام تحقیق شما چه منافعی از نظر هزینه، کارایی و بهره وری برای مدیر دارد؟
برای اجرای راه حل پیشنهادی شما چه موانع و حمایتهایی وجود دارند؟
تعریف واژه های تخصصی
پیشنهاد سوم نحوه کاربرد
محل چهارم بکارگیری نتایج تحقیق
نوع مطالعهموردی – شاهدی
جامعه مورد مطالعه(معرفی مشارکت کنندگان)/ محیط پژوهش(معیارهای ورود و خروج ذکر شوند) بیماران مبتلا به کراتوکونوس مراجعه کننده به مرکز چشم پزشکی الزهرا(س) زاهدان وافراد سالم که مبتلا به کراتوکونوس نبوده و بیماری سیستمیک شناخته شده ای ندارند (گروه کنترل توسط چشم پزشک معاینه می شوند و از نظر بینایی و بیماری های چشمی اگر مشکلی نداشته باشند و هیچ نسبت فامیلی با افراد کراتوکونوسی مراجعه کننده به مرکز چشم پزشکی الزهرا (س) زاهدان نداشته باشندانتخاب می شوند.
پیشنهاد چهارم نحوه کاربرد
حجم نمونه و روش محاسبه آنبرای بررسی پلی مورفیسم از افراد مبتلا به کراتوکونوس حداقل 110 نفر بیمار وحداقل 150 نفر شاهد(بدون ارتباط فامیلی) نمونه خون تهیه می گردد.
روش نمونه گیری(نحوه تخصیص تصادفی و همسانسازی در صورت لزوم ذکر شود)در دسترس
روش و ابزار جمع آوري داده ها / صحت و استحکام داده ها (پرسشنامه یا فرم اطلاعاتی ضمیمه شود)مشاهده و بررسی های آزمایشگاهی
روش اجرای طرح(با جزئیات بطور کامل شرح داده شود)افراد مورد مطالعه در بین افرادی که کراتوکونوس درآنها تایید شده است ؛ انتخاب می شوند . لیست این افراد از دفترمدارک پزشکی بیمارستان الزهرا(س) گرفته می شود .دراین دفتر مشخصات، شماره تلفن و آدرس بیماران کراتوکونوس ثبت شده است . بعداز تعیین افراد مورد مطالعه طی لیستی که از منابع فوق تهیه گردیده،با آنها تماس گرفته می شود، بیماران مراجعه ودر صورت رضایت برای شرکت در طرح از آنها نمونه خون گرفته می شود(2 cc) و نمونه های اخذ شده به آزمایشگاه منتقل می شود برای گروه کنترل ازنمونه خون افراد سالم بدون سابقه فامیلی ابتلا به کراتوکونوس استفاده می شود.
از نمونه خونی که از افراد مبتلا و سالم خونگیری به عمل آمده،DNA با استفاده از روش Salting out و به صورت دستی DNA استخراج می شود.

ابتدا توالی ژن مورد نظر از ژن بانک جستجو شده، سپس پلی مورفیسم های اختصاصی آن بررسی و در شرایط PCR بهینه می شود(به روش
ARMS_PCR (amplification refractory meditation system_polymrase chain reaction و پلی مورفیسم های مورد نظر مورد ارزیابی قرار می گیرند.برای تایید صحت روش تعدادی از نمونه ها توالی یابی می شود.
در این روشPCR از 4 پرایمر به صورت همزمان استفاده می کنیم ومحصول را بلافاصله روی ژل می بریم. بعد از انجام الکتروفورز آن را با استفاده از دستگاه ژل داکت بررسی می کنیم.
روش تجزیه، تحليل و توصیف داده‌ها (نمونه‌اي از جدول توخالي ضميمه شود و روش هاي آماري مورد استفاده به طور كامل توضيح داده شود)(کیفی و کمی)پس از گردآوری اطلاعات لازم، یافته ها در نرم افزار آماری SPSS وارد گشته و داده ها با استفاده از آزمون های آماری χ2 مورد تجزیه و تحلیل قرار خواهند گرفت.
ملاحظات اخلاقی با رضایت کامل از بیماران نمونه گیری شده و تعهد می شود نام ومشخصات بیماران در هیچ گزارشی قید نشود. انجام آزمایشات هیچ گونه هزینه ای برای بیمار نخواهد داشت (باتوجه به کد های اخلاقی شماره های (1،2،20،17)
محدودیتهای اجرائی طرح و پیش بینی جهت حل آنها- عدم همکاری بیمار
- مشکل تهیه مواد وامکان طولانی شدن زمان دریافت آنها
کلمات کلیدیkeratoconus, polymorphism,COL4A4,COL4A3,TIMP-1
فهرست منابع و مراجع

1. Nottingham. J Practical observations on conical cornea. 1984:p. 1–19.
2. Zadnik K, Barr JT, Gordon MO, Edrington TB. Biomicroscopic signs and disease severity in keratoconus. Collaborative Longitudinal Evaluation of Keratoconus (CLEK) Study Group. Cornea. 1996 Mar;15(2):139-46. PubMed PMID: 8925661.
3. Stabuc-Silih M, Strazisar M, Ravnik-Glavac M, Hawlina M, Glavac D. Genetics and clinical characteristics of keratoconus. Acta dermatovenerologica Alpina, Panonica, et Adriatica. 2010;19(2):3-10. PubMed PMID: 20664914.
4. Kennedy RH, Bourne WM, Dyer JA. A 48-year clinical and epidemiologic study of keratoconus. American journal of ophthalmology. 1986 Mar 15;101(3):267-73. PubMed PMID: 3513592.
5. Bykhovskaya Y, Li X, Epifantseva I, Haritunians T, Siscovick D, Aldave A, et al. Variation in the lysyl oxidase (LOX) gene is associated with keratoconus in family-based and case-control studies. Investigative ophthalmology & visual science. 2012;53(7):4152-7. PubMed PMID: 22661479.
6. CW B. The Ophthalmic Assistant: A Text for Allied and Associated Ophthalmic Personnel. Optometry & Vision Science. 2007;84(3):162.
7. Li X, Rabinowitz YS, Rasheed K, Yang H. Longitudinal study of the normal eyes in unilateral keratoconus patients. Ophthalmology. 2004 Mar;111(3):440-6. PubMed PMID: 15019316.
8. Nowak DM, Gajecka M. The genetics of keratoconus. Middle East African journal of ophthalmology. 2011 Jan;18(1):2-6. PubMed PMID: 21572727. Pubmed Central PMCID: 3085147.
9. Hammerstein W. [Genetics of conical cornea (author's transl)]. Albrecht von Graefes Archiv fur klinische und experimentelle Ophthalmologie Albrecht von Graefe's archive for clinical and experimental ophthalmology. 1974;190(4):293-308. PubMed PMID: 4547927. Zur Genetik des Keratoconus.
10. Parker J, Ko WW, Pavlopoulos G, Wolfe PJ, Rabinowitz YS, Feldman ST. Videokeratography of keratoconus in monozygotic twins. Journal of refractive surgery. 1996 Jan-Feb;12(1):180-3. PubMed PMID: 8963810.
11. Weed KH, MacEwen CJ, McGhee CN. The variable expression of keratoconus within monozygotic twins: dundee University Scottish Keratoconus Study (DUSKS). Contact lens & anterior eye : the journal of the British Contact Lens Association. 2006 Jul;29(3):123-6. PubMed PMID: 16677846.
12. Heon E, Greenberg A, Kopp KK, Rootman D, Vincent AL, Billingsley G, et al. VSX1: a gene for posterior polymorphous dystrophy and keratoconus. Human molecular genetics. 2002 May 1;11(9):1029-36. PubMed PMID: 11978762.
13. Bisceglia L, Ciaschetti M, De Bonis P, Campo PA, Pizzicoli C, Scala C, et al. VSX1 mutational analysis in a series of Italian patients affected by keratoconus: detection of a novel mutation. Investigative ophthalmology & visual science. 2005 Jan;46(1):39-45. PubMed PMID: 15623752.
14. Maatta M, Heljasvaara R, Sormunen R, Pihlajaniemi T, Autio-Harmainen H, Tervo T. Differential expression of collagen types XVIII/endostatin and XV in normal, keratoconus, and scarred human corneas. Cornea. 2006 Apr;25(3):341-9. PubMed PMID: 16633037.
15. Maatta M, Vaisanen T, Vaisanen MR, Pihlajaniemi T, Tervo T. Altered expression of type XIII collagen in keratoconus and scarred human cornea: Increased expression in scarred cornea is associated with myofibroblast transformation. Cornea. 2006 May;25(4):448-53. PubMed PMID: 16670484.
16. Fukuchi T, Yue BY, Sugar J, Lam S. Lysosomal enzyme activities in conjunctival tissues of patients with keratoconus. Archives of ophthalmology. 1994 Oct;112(10):1368-74. PubMed PMID: 7945042.
17. Sawaguchi S, Yue BY, Sugar J, Gilboy JE. Lysosomal enzyme abnormalities in keratoconus. Archives of ophthalmology. 1989 Oct;107(10):1507-10. PubMed PMID: 2803101.
18. Sawaguchi S, Twining SS, Yue BY, Chang SH, Zhou X, Loushin G, et al. Alpha 2-macroglobulin levels in normal human and keratoconus corneas. Investigative ophthalmology & visual science. 1994 Nov;35(12):4008-14. PubMed
معرفی پژوهش/ اهداف پژوهش
(عین عبارت هدف پروپوزال را کپی نکنید. بلکه با جملاتی که برای مردم قابل فهم باشد (برای سواد حدود پنجم ابتدایی )هدف را برای شرکت کنندگان توضیح دهید.) در تمام این متن در صورتیکه شرکت کننده کودک یا فرد فاقد ظرفیت تصمیم گیری است باید مواردیکه منظور از "من"، فرد شرکت کننده بوده است به "کودک" یا "فرد تحت سرپرستی من" اصلاح شود و مواردیکه منظور از "من"، رضایت دهنده است به من به عنوان "ولی" یا "قیم قانونی" اصلاح شود.
خون گیری
(آیا طرح شما نیاز به خونگیری دارد یا خیر)
نحوه همکاری/ مزایا ی طرح
(در این بخش برای شرکت کنندگان به زبان ساده توضیح دهید که: چه مداخله ای بر روی آنها صورت میگیرد. چه اقدامات پاراکلینیکی بر روی آنها انجام میشود. چه نمونه ای و با چه حجمی از آنها میگیرید در این مدت چند نوبت مراجعه باید داشته باشند و به چه فواصلی چه اقداماتی را در پیگیری آنها انجام میدهید. (حتی میتوانید سود بالقوه ای که شرکت کنندگان میتوانند از شرکت در این پژوهش ببرند بنویسید. این سود میتواند شرح احتمال درمان یا تشخیص بهتر بیماریشان، دریافت خدمات سلامت رایگان و یا پرداخت مشوق مالی در ازای جبران همکاریشان باشد)
عوارض جانبی
(منظور عوارض و میزان احتمال بروز آنها در این مطالعه است)
جبران عوارض احتمالی
(برای آنکه شرکت کننده بتواند ارزیابی مناسبی از سود و زیان شرکت در پژوهش شما داشته باشد لازم است بتواند سود و زیان مداخلات معمول و مداخلات این پژوهش را مقایسه کند. به عنوان مثال میزان موفقیت و میزان عوارض هریک را مقایسه کند.) - او باید بداند كه اگر در حين و بعد از انجام پژوهش هم هر مشكلي اعم از جسمي و روحي به علت شرکت در اين پژوهش برایش پيش آمد درمان عوارض، و هزينه‌هاي آن و غرامت مربوطه بر عهده مجري خواهد بود.
هزینه های مربوط به انجام طرح تحقیقاتی
(تمام مداخلات پژوهشی باید برای بیمار رایگان باشد و بیمار بداند شامل چه مواردی هستند. )
روش های جایگزین
در صورت عدم تمایل به شرکت در مطالعه چه روش های درمانی برای بیمار ارائه خواهد شد
محرمانه بودن
بیمار باید بداندکه دست اندر كاران اين پژوهش، كليه اطلاعات مربوط به او را نزد خود به صورت محرمانه نگه‌داشته و فقط اجازه دارند نتايج كلي و گروهي اين پژوهش را بدون ذکر نام و مشخصات بیمار منتشر كنند. و كميته اخلاق در پژوهش با هدف نظارت بر رعایت حقوق وی مي‌تواند به اطلاعات ایشان دسترسي داشته باشد.
پاسخگویی به پرسش ها
در این بخش نام و اطلاعات دسترسی فردی از عوامل پژوهش را که بتواند اطلاعات صحیح و کافی در اختیار شرکت کنندگان قرار دهند و در مورد عوارض و نگرانیها راهنمایی لازم را ارائه دهند ذکر شود
حق نپذیرفتن یا انصراف
بیمار باید بداند که شرکت اودر اين پژوهش کاملاً داوطلبانه است و مجبور به شرکت در اين پژوهش نيست و در صورت عدم شرکت از مراقبت‌هاي معمول تشخيصي و درماني محروم نخواهد شد او باید بداند كه حتي پس از موافقت با شركت در پژوهش مي‌تواند هر وقت كه بخواهد، پس از اطلاع به مجري، از پژوهش خارج شود و خروج اواز پژوهش باعث محرومیت از دریافت خدمات درمانی معمول برای اونخواهد شد.
رضایت
او باید بداند که اگر اشکال يا اعتراضي نسبت به دست اندركاران يا روند پژوهش دارد مي تواند با كميته اخلاق در پژوهش دانشگاه تماس گرفته و مشکل خود را به صورت شفاهي يا كتبي مطرح نمايد. در انتهای فرم قید گردد : اينجانب موارد فوق‌الذکر را خواندم و فهميدم و بر اساس آن رضايت آگاهانه خود را براي شركت در اين پژوهش اعلام مي‌کنم. اينجانب ……………… خود را ملزم به اجراي تعهدات مربوط به مجري در مفاد فوق دانسته و متعهد مي‌گردم در تأمين حقوق و ايمني شركت كننده در اين پژوهش تلاش نمايم
پرسشنامه یا فرم اطلاعاتی

پیوست ها
hide/show

نام فایل تاریخ درج فایل اندازه فایل دانلود
Polymorphisms in COL4A3 and COL4A4 genes associated with.pdf1392/03/082857583دانلود
Combinatorial effect of TIMP-1 and ?1AT gene polymorphisms.pdf1392/03/08256454دانلود
The ?1AT and TIMP-1 Gene Polymorphism in the Development of Asthma.pdf1392/03/08615530دانلود
137_334_rezayatname akhlagh.doc1392/03/0887040دانلود
_20130530_140722011.jpg1392/03/08199302دانلود
proposal .docx1392/03/08187336دانلود
1 (1).jpeg1392/03/29714451دانلود
1 (2).jpeg1392/03/29445482دانلود
1 (3).jpeg1392/03/29417440دانلود
nahaee.docx1392/04/19188422دانلود
6077.png1392/05/236009277دانلود