بررسی پلی مورفیسم ژنی ژنهای CCNE 1 (rs 3218073, rs1406)و hTERT (rs 2736098, rs2735940) و RYR3 (rs 1044129, ) و mir- 367 (rs 150161032, rs113912016)در زنان مبتلا به سرطان سینه در مقایسه با زنان سالم

Evaluation of genetic polymorphism CCNE 1 (rs 3218073) , hTERT (rs 2736098, rs2735940) , RYR3 (rs 1044129) , mir- 367 (rs 150161032, rs113912016) in patients with breast cancer in comparison with healthy women


چاپ صفحه 		پژوهان
صفحه نخست سامانه		 مجری و همکاران
مجری و همکاران		 اطلاعات تفضیلی
اطلاعات تفضیلی		 دانلود
دانلود 		علوم پزشکی زاهدان
علوم پزشکی زاهدان

مجریان: محمد هاشمی

کلمات کلیدی:

اطلاعات کلی طرح
hide/show

کد طرح 6104
عنوان فارسی طرح بررسی پلی مورفیسم ژنی ژنهای CCNE 1 (rs 3218073, rs1406)و hTERT (rs 2736098, rs2735940) و RYR3 (rs 1044129, ) و mir- 367 (rs 150161032, rs113912016)در زنان مبتلا به سرطان سینه در مقایسه با زنان سالم
عنوان لاتین طرح Evaluation of genetic polymorphism CCNE 1 (rs 3218073) , hTERT (rs 2736098, rs2735940) , RYR3 (rs 1044129) , mir- 367 (rs 150161032, rs113912016) in patients with breast cancer in comparison with healthy women
نوع طرح
محل اجرای طرح مدیریت توسعه فناوری سلامت
رسته مطالعاتی مورد شاهدی
دانشکده/مرکز دانشکده پزشکی زاهدان
زمان اجرا -روز

اطلاعات مجری و همکاران
hide/show

نام و نام‌خانوادگی سمت در طرح نوع همکاری درجه‌تحصیلی پست الکترونیک
محمد هاشمیمجریاستاد راهنمادکترا - PHDmhd.hashemi@gmail.com
شادی امینی نیاهمکاردانشجوکارشناس ارشدshadi_am65@yahoo.com
ابراهیم اسکندری نسبمشاوراستاد مشاورکارشناس ارشدeenasab@yahoo.com

اطلاعات تفضیلی
hide/show

عنوان متن
خلاصه طرح به فارسی بررسی پلی مورفیسم ژنی ژنهای CCNE 1 (rs 3218073, rs1406)و hTERT (rs 2736098, rs2735940) و RYR3 (rs 1044129, ) و mir- 367 (rs 150161032, rs113912016)در زنان مبتلا به سرطان سینه در مقایسه با زنان سالم
خلاصه طرح به لاتینEvaluation of genetic polymorphism CCNE 1 (rs 3218073) , hTERT (rs 2736098, rs2735940) , RYR3 (rs 1044129) , mir- 367 (rs 150161032, rs113912016) in patients with breast cancer in comparison with healthy women
بيان مسئله تحقيق/اهمیت پژوهشسرطان سینه یکی ازدلایل مهم امراض ومرگ ومیر درزنان می باشد وهنوزدرمورداتیولوژی این بیماری اطلاعات ناچیزی در دسترس است. سرطان سینه ، تکثیر بدخیم آن دسته از سلول های اپیتلیال است که مجاری یا لوبول های پستان را می پوشانند (1).در سال2011 حدود 230480 مورد سرطان مهاجم پستان در ایالات متحده شناسایی شد که 39520 مورد از آن منجر به مرگ شد(2). بدخیمی های با منشا اپیتلیال پستان ، شایعترین علت سرطان در زنان ( به جز سرطان پوست ) است که حدود 3/1 همه سرطان های زنان را تشکیل می دهد. ریسک فاکتورهایی ازقبیل قاعدگی زودرس، یائسگی باتاخیر، نازایی یا سن زیاد درهنگام اولین زایش ممکن است مسئول 3/1 دیگر موارد ایجاد کننده سرطان سینه می باشند. با بهبود وضعیت درمان و تشخیص زودرس ، مرگ و میر ناشی از سرطان پستان در ایالات متحده به صورت قابل توجهی در حال کاهش است(1-3).
SNP :پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی تغییر در توالی DNA است که فقط در یک نوکلئوتید رخ می دهد و مشاهده شده است که این تغییرات می تواند در بعضی بیماری ها یک ریسک فاکتور باشد(4-5).


miRNA :این آر ان آ های کوچک که حدود 22 نوکلئوتید طول دارند اندوژن و بسیار حفاظت شده می باشند و نیز در بسیاری از فرایند های بیولوژیک از جمله: تکثیر ،آپوپتوز،تومورزایی و فرایندهای ضد تومورزایی میتواند اعمال اثر کنند. این میکرو آر ان آ ها از روی اینترون ژن ها رونویسی می شوند و محل اثرشان 3'UTR ام آر ان آها (mRNA) می باشد. این miRNA ها به دو روش بیان ژن را مهار میکنند یا از طریق اتصال به mRNA وتخریب آن و یا از طریق مهار ترجمه ی mRNA هدف به پروتئین مورد نظر،این نقش را ایفا می کنند. تا سال 2011 حدود 1424 miRNA مختلف شناخته شده اند. (6-8)
پلی مورفیسم هایی که در مسیر های مرتبط با miRNA ها می توانند اثر خود را اعمال کنند ؛سه دسته اند:(7)
پلی مورفیسم ژن های کد کننده ی پروتئین های دخیل در مسیر سنتز miRNA ,مثل RISC یا Drosha و...(9-10)
پلی مورفیسم هایی که در توالی ژن کد کننده ی اینترون وجود دارد و نتیجه ی آن ایجاد miRNA های ناکارامد است. مثل پلی مورفیسم ژنPRI-MIR-125A که منجر به تولید بیش از مقدار مورد نیاز hsa-MIR-125A می شود(11).
پلی مورفیسم هایی که درژن کد کننده ی 3'UTR اگزون mRNA اتفاق افتاده و مانع اثر بخشی miRNA هایشان میشوند(9-10) همانند انواع پلی مورفیسم هایی که در این طرح بررسی خواهند شد.
CCNE1 rs3218073 C>T :این پلی مورفیسم روی ژن مربوط به 3'UTR واقع بر mRNAی پروتئین )CCNE1 Cyclin E1)که محل اتصال Mir-151 است و در موقعیت q1219 میباشد واقع است.سایکلین ها به عنوان تنظیم گر های CDK کیناز ها عمل می کنند، سایکلین E1 زیر واحد تنظیمی CDK2 است که در مرحله ی گذر از G1 به S چرخه ی سلولی مشاهده می شود این پروتئین در طول مرحله ی S کم کم فعالیت خود را از دست می دهد، موتاسیون در ژن کد کننده ی این پروتئین منجر به بیان بیش از حد آن می شود و بیان زیاد ان در بسیاری از تومور ها مشاهده شده است از جمله (12)Nasopharyngeal cancer(NPC). بررسی این ژن در سرطان سینه برای اولین بار انجام خواهد شد .
hTERT rs 2736098 G>A : این پلی مورفیسم در ژن کد دهنده ی 3'UTR موجود در mRNA ی مربوط به پروتئین hTERT (human telomerase reverse transcriptase) واقع است که در موقعیت 5p15.33 قرار دارد و زیر واحد کاتالیتیک تلومراز را کد می کند. این پروتئین نقش در تنظیم تکثیر و نیز کارسینوژنز ایفا می کند .تلومراز یک ساختار نوکلئوپروتئینی است که از انتهای کروموزوم در برابر تخریب محافظت کرده و از اتصال کروموزوم های مجاور با هم جلوگیری می نماید .تلومراز در سلولهای تمایز نیافته و نیز سلولهای سرطانی شده فعال است و می تواند با ساخت زیاد تلومر به سلول سرطانی برای بقا کمک کند ,در سلولهای سوماتیک تلومراز فعالیت خود را با افزایش سن از دست می دهد اما در سلول سرطانی تلومراز فعال است . موتاسیون در ژن کد دهنده ی این پروتئین میتواند منجر به به فعال شدن بیش از حد آن شود.ارتباط این پلی مورفیسم و هپاتوسلولار کارسینومادر پژوهشی که در چین انجام شد، مشاهده گشت(13-15) .در این پژوهش برای اولین بار نقش این پلی مورفیسم در سرطان سینه بررسی خواهد شد.
RYR3 rs 1044129 A>G :این پلی مورفیسم در ژن کد کننده ی 3'UTR مربوط به mRNA پروتئین گیرنده ی ریانودین(RYR3)واقع است که در موقعیت 15q14-q15 قرار دارد. 3'UTR مربوط به این mRNA محل اتصال MIR-367 میباشد.RYR3 یک ایزوفرم از RYR (ryanodine receptor) است که یک کانال آزاد کننده ی کلسیم در شبکه ی سارکوپلاسمی است و نقشی اساسی در تنظیم میزان کلسیم بر عهده دارد و در رشد ، مورفولوژی و مهاجرت سلول سرطانی دخالت دارد . پلی مورفیسم این ژن در جایگاه ذکر شده با فراوانی سرطان سینه در جامعه ی تیانجین چین ارتباط معنا داری نشان داد(16).
در مورد miRNA-367 rs150161032 A/G مطالعه ای صورت نگرفته است، اما ازآنجایی که این جایگاه ژنی دارای اهمیت عملکردی است ما به بررسی اهمیت آن در سرطان سینه می پردازیم.
سوالات و / یا فرضیات پژوهشفراوانی پلی مورفیسم rs3218073 ژن CCNE1 در زنان مبتلا به سرطان سینه و زنان سالم با هم تفاوت دارد .
فراوانی پلی مورفیسم rs1406ژن CCNE1 در زنان مبتلا به سرطان سینه و زنان سالم با هم تفاوت دارد .
فراوانی پلی مورفیسم rs2736098 ژن hTERT در زنان مبتلا به سرطان سینه و زنان سالم با هم تفاوت دارد .
فراوانی پلی مورفیسم 2736098ژن hTERT در زنان مبتلا به سرطان سینه و زنان سالم با هم تفاوت دارد
فراوانی پلی مورفیسم rs1044129 ژن RYR3 در زنان مبتلا به سرطان سینه و زنان سالم با هم تفاوت دارد .
فراوانی پلی مورفیسم rs150161032 ژن mir _367 در زنان مبتلا به سرطان سینه و زنان سالم با هم تفاوت دارد .
فراوانی پلی مورفیسم rs113912016ژن mir _367 در زنان مبتلا به سرطان سینه و زنان سالم با هم تفاوت دارد .
هدف کلی طرح تعیین توزیع فراوانی پلی مورفیسم ژنهای CCNE 1 (rs 3218073) و
hTERT (rs 2736098) و RYR3 (rs 1044129) و mir- 367 (rs 150161032)در زنان مبتلا به سرطان سینه درمقایسه با زنان سالم.
اهداف اختصاصیمقایسه ی فراوانی پلی مورفیسم rs3218073 ژن CCNE1 در زنان مبتلا به سرطان سینه و زنان سالم
مقایسه ی فراوانی پلی مورفیسم rs2736098 ژن hTERT در زنان مبتلا به سرطان سینه و زنان سالم
مقایسه ی فراوانی پلی مورفیسم rs1044129 ژن RYR3 در زنان مبتلا به سرطان سینه و زنان سالم
مقایسه ی فراوانی پلی مورفیسم rs150161032 ژن 7mir 36در زنان مبتلا به سرطان سینه و زنان سالم
سازمانها، مراکز و موسسات و سایر بهره برداران بالقوه دستاوردهای طرح
تعریف واژه های تخصصی
نوع مطالعهموردی -شاهدی
جامعه مورد مطالعه(معرفی مشارکت کنندگان)/ محیط پژوهش(معیارهای ورود و خروج ذکر شوند)کلیه بیماران مبتلا به سرطان پستان که هم اکنون تحت درمان بوده و موارد جدیدی که تشخیص داده شده و مراجعه می کنند. یک ونیم برابر تعدادنمونه های مورد از خانم های سالم که مبتلا به سرطان پستان نبوده و بیماری سیستمیک شناخته شده ای ندارند.
حجم نمونه و روش محاسبه آنبرای بررسی پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی و حذف ژنی٬ از خانم های مبتلا به سرطان سینه در زاهدان که هم اکنون تحت درمان می باشند به تعداد 150 نفر خون گرفته می شود. گروه شاهد از نمونه های خون خانم های سالم که در طرح بررسی شیوع سندروم متابولیک وارد مطالعه شده اند استفاده می شود(حداقل 225 نفر)
روش نمونه گیری(نحوه تخصیص تصادفی و همسانسازی در صورت لزوم ذکر شود)
آسان در دسترس
روش و ابزار جمع آوري داده ها / صحت و استحکام داده ها (پرسشنامه یا فرم اطلاعاتی ضمیمه شود)
روش اجرای طرح(با جزئیات بطور کامل شرح داده شود)برای بررسی پلی مورفیسم و حذف ژنی نمونه خون در 20- درجه سانتیگراد نگهداری می‌شود. DNA نمونه خون افراد گروه شاهد و مورد به روش salting out تخلیص می‌شود. پرایمرهای اختصاصی جهت تعیین پلی مورفیسم ژنی به روش ARMS-PCR(AMPLIFICATION REFRACTORY MEDIATION SYSTEM-POLYMERASECHAIN REACTION) طراحی می شود. در مرحله بعد شرایط PCR برای تعیین این پلی مورفیسم ها بهینه می شود و سپس پلی مورفیسم ها ی ژنی ذکر شده در نمونه ها با این تکنیک آنالیز می شوند. برای صحت عملکرد پرایمرها از سکانس ژنومی استفاده میشود.درنهایت محصول PCR رابرای تائید روش مورد بررسی الکتروفورز می کنیم..

روش تجزیه، تحليل و توصیف داده‌ها (نمونه‌اي از جدول توخالي ضميمه شود و روش هاي آماري مورد استفاده به طور كامل توضيح داده شود)(کیفی و کمی)پس از گردآوری اطلاعات لازم، یافته ها در نرم افزار آماری SPSS وارد گشته و داده ها با استفاده از آزمون های آماری χ2 و تی تست مستقل مورد تجزیه و تحلیل قرار خواهند گرفت
ملاحظات اخلاقی با رضایت کامل از بیماران نمونه گیری میشود و تعهد میشود نام و مشخصات بیماران در هیچ گزارشی قید نشود.انجام آزمایشات هیچ گونه هزینه ای برای بیمار نخواهد داشت( با توجه به کدهای اخلاقی شماره ی 1،17،20،2)
محدودیتهای اجرائی طرح و پیش بینی جهت حل آنها-عدم همکاری بیمار

-مشکل تهیه ی مواد و امکان طولانی شدن زمان دریافت آنها
کلمات کلیدیسرطان سینه ، پلی مورفیسم وmiRNA
فهرست منابع و مراجع1. Even-Sapir E, Inbar M. PET in women with high risk for breast or ovarian cancer. Lancet Oncol. 2010 Sep;11(9):899-905.
2. DeSantis C, Siegel R, Bandi P, Jemal A. Breast cancer statistics, 2011. CA Cancer J Clin. 2011 Nov-Dec;61(6):409-18.
3. Sotiropoulou G, Pampalakis G, Lianidou E, Mourelatos Z. Emerging roles of microRNAs as molecular switches in the integrated circuit of the cancer cell. Rna. 2009 Aug;15(8):1443-61.
4. Tomas C, Stangegaard M, Borsting C, Hansen AJ, Morling N, Consortium S. Typing of 48 autosomal SNPs and amelogenin with GenPlex SNP genotyping system in forensic genetics. Forensic Sci Int-Gen. 2008 Dec;3(1):1-6.
5. Sobrino B, Brion M, Carracedo A. SNPs in forensic genetics: a review on SNP typing methodologies. Forensic Science International. 2005 Nov 25;154(2-3):181-94.
6. Wang W, Li F, Mao Y, Zhou H, Sun J, Li R, et al. A miR-570 binding site polymorphism in the B7-H1 gene is associated with the risk of gastric adenocarcinoma. Hum Genet. 2013 Feb 21.
7. Duan R, Pak C, Jin P. Single nucleotide polymorphism associated with mature miR-125a alters the processing of pri-miRNA. Hum Mol Genet. 2007 May 1;16(9):1124-31.
8. Kawasaki H, Wadhwa R, Taira K. World of small RNAs: from ribozymes to siRNA and miRNA. Differentiation. 2004 Mar;72(2-3):58-64.
9. Mueller C, Tang QS, Gruntman A, Blomenkamp K, Teckman J, Song LN, et al. Sustained miRNA-mediated Knockdown of Mutant AAT With Simultaneous Augmentation of Wild-type AAT Has Minimal Effect on Global Liver miRNA Profiles (vol 20, pg 590, 2012). Molecular Therapy. 2013 Feb;21(2):493-.
10. Mueller C, Tang QS, Gruntman A, Blomenkamp K, Teckman J, Song LN, et al. Sustained miRNA-mediated Knockdown of Mutant AAT With Simultaneous Augmentation of Wild-type AAT Has Minimal Effect on Global Liver miRNA Profiles. Molecular Therapy. 2012 Mar;20(3):590-600.
11. Hu Y, Liu CM, Qi L, He TZ, Shi-Guo L, Hao CJ, et al. Two common SNPs in pri-miR-125a alter the mature miRNA expression and associate with recurrent pregnancy loss in a Han-Chinese population. RNA Biol. 2011 Sep-Oct;8(5):861-72.
12. Liu Y, Cai H, Liu J, Fan H, Wang Z, Wang Q, et al. A miR-151 binding site polymorphism in the 3'-untranslated region of the cyclin E1 gene associated with nasopharyngeal carcinoma. Biochem Biophys Res Commun. 2013 Mar 22;432(4):660-5.
13. Dong J, Wang L, Tian YP, Guo Y, Liu HY. [hTERT single nucleotide polymorphism is associated with increased risks of hepatocellular carcinoma and tumor metastasis]. Nan Fang Yi Ke Da Xue Xue Bao. 2011 Jan;31(1):49-52.
14. Liu M, Wang RF, Zhang CL, Yan P, Yu MM, Di LJ, et al. Noninvasive imaging of human telomerase reverse transcriptase (hTERT) messenger RNA with 99mTc-radiolabeled antisense probes in malignant tumors. J Nucl Med. 2007 Dec;48(12):2028-36.
15. Zhang C, Tian YP, Wang Y, Guo FH, Qin JF, Ni H. hTERT rs2736098 genetic variants and susceptibility of hepatocellular carcinoma in the Chinese population: a case-control study. Hepatobiliary Pancreat Dis Int. 2013 Feb;12(1):74-9.
16. Zhang L, Liu Y, Song F, Zheng H, Hu L, Lu H, et al. Functional SNP in the microRNA-367 binding site in the 3'UTR of the calcium channel ryanodine receptor gene 3 (RYR3) affects breast cancer risk and calcification. Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Aug 16;108(33):13653-8.

پیوست ها
hide/show

نام فایل تاریخ درج فایل اندازه فایل دانلود
5.jpg1392/03/16149088دانلود
3.jpg1392/03/23144501دانلود
2.jpg1392/03/23165092دانلود
137_334_rezayatname akhlagh(1).doc1392/03/2387552دانلود
2.pdf1392/03/23305891دانلود
3.pdf1392/03/231625907دانلود
1.pdf1392/03/23331866دانلود
نهایی.docx1392/07/14143984دانلود
6104.bmp1392/11/0712684726دانلود