بررسی ژنوتیپ هایVNTR اینترلوکین ۱ رسپتور آنتاگونیست در بیماران مبتلا به سل ریوی در مقایسه با افراد سالم

Evaluation of IL-1RN VNTR genotypes in patients with tuberculosis and comparison with healthy subjects


چاپ صفحه 		پژوهان
صفحه نخست سامانه		 مجری و همکاران
مجری و همکاران		 اطلاعات تفضیلی
اطلاعات تفضیلی		 دانلود
دانلود 		علوم پزشکی زاهدان
علوم پزشکی زاهدان

مجریان: محمد هاشمی

کلمات کلیدی:

اطلاعات کلی طرح
hide/show

کد طرح 6127
عنوان فارسی طرح بررسی ژنوتیپ هایVNTR اینترلوکین ۱ رسپتور آنتاگونیست در بیماران مبتلا به سل ریوی در مقایسه با افراد سالم
عنوان لاتین طرح Evaluation of IL-1RN VNTR genotypes in patients with tuberculosis and comparison with healthy subjects
نوع طرح
محل اجرای طرح مدیریت توسعه فناوری سلامت
رسته مطالعاتی مورد شاهدی
دانشکده/مرکز دانشکده پزشکی زاهدان
زمان اجرا -روز

اطلاعات مجری و همکاران
hide/show

نام و نام‌خانوادگی سمت در طرح نوع همکاری درجه‌تحصیلی پست الکترونیک
محمد هاشمیمجریتدوین طرحدکترا - PHDmhd.hashemi@gmail.com
محمد نادریهمکار دکترای تخصصی naderi597@gmail.com
ابراهیم اسکندری نسبهمکار کارشناس ارشدeenasab@yahoo.com
محبوبه ابراهیمیهمکار کارشناس ارشدebrahimi.m22@gmail.com
شادی امینی نیاهمکار کارشناس ارشدshadi_am65@yahoo.com

اطلاعات تفضیلی
hide/show

عنوان متن
خلاصه طرح به فارسی بررسی ژنوتیپ هایVNTR اینترلوکین ۱ رسپتور آنتاگونیست در بیماران مبتلا به سل ریوی در مقایسه با افراد سالم
خلاصه طرح به لاتینEvaluation of IL-1RN VNTR genotypes in patients with tuberculosis and comparison with healthy subjects
بيان مسئله تحقيق/اهمیت پژوهشواژه توبرکولوزیس شامل طیف وسیعی از بیماریهای بالینی ایجاد شده بوسیله باکتری به نام مایکوباکتریوم توبرکولوزیس می باشد. امروز یکی از بزرگ ترین مسائل بهداشت جهانی بیماری سل می باشد.WHOدر سال1993 توبرکلوزیس را به عنوان یک اورژانس سلامت جهانی معرفی کرد که می تواند به سمت مشکل جهانی بزرگی پیش برود.سل با وجود همه امکانات تشخیصی مجهز و تمام داروهای مؤثر همچنان رو به گسترش است . در حال حاضر بیماری سل در میان بیماری های عفونی شایع ترین عامل کشنده بالغین (حتی بیشتر از ایدز و مالاریا ) در تمام جهان است (١و٢).بیش از ٩٠٪ موارد جدید سل هر سال از کشورهای در حال توسعه گزارش می شوند. WHO تخمین زد که سالیانه حدود٨/٨ میلیون مورد جدید سل در سراسر جهان اتفاق می افتد که ٩/٤ میلیون نفر در کشورهای در حال توسعه اسیا و ٦/٠ میلیون نفر در خاور میانه می باشد(٣).اگر چه به دلیل شناسایی ناکافی و اگاهی ناقص موارد گزارش شده فقط حدود ٦٠٪ کل موارد تخمین زده شده را بیان می کنند. در حال حاضر بیش از٢٠ میلیون نفردر جهان مبتلا به بیماری سل هستند ، که بیش از ٨٠ در صد این موارد در ٢٢کشور در حال توسعه هستند. (١)
همسایگی ایران با دو کشور افغانستان و پاکستان (از این ٢٢ کشور) و همچنین عراق (با بحران های چندین ساله اخیر آن) و کشور های تازه استقلال یافته شمال ایران ( با شیوع بالای سل مقاوم به چند دارو) توجه بیش از پیش ما را به این بیماری ضروری می سازد .(١)
بر اساس مطالعات انجام شده و بررسی های به عمل آمده توسط کارشناسان سازمان بهداشت جهانی و کارشناسان جمهوری اسلامی ایران ، میزان مورد انتظار سل در کل کشور حداکثر ٢٧مورد به ازاء یکصد هزار نفر جمعیت تخمین زده شده است.بیشترین بروز انواع سل بدون در نظر گرفتن ملیت بیماران ، در استان سیستان و بلوچستان و در شهرستان زابل گزارش شده است. (١٠٤ مورد به ازاء یکصد هزار نفر جمعیت)(٤)
میزان بروز موارد سل ریوی با اسمیرخلط مثبت در کل کشور ٨/٦ نفر به ازاء یکصد هزار نفر جمعیت می باشد و بیشترین میزان بروز سل ریوی با اسمیر خلط مثبت بدون در نظر گرفتن ملیت بیماران در سیستان و بلوچستان ودر شهرستان زابل با ٢/٦١مورد به ازاء هر یکصد هزار نفر جمعیت گزارش شده است.(٤)
در بین افراد آلوده به مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بروز بیماری بالینی بسیار کمتر از شیوع عفونت است ؛ و عموماً در ٩٠در صد افراد آلوده به آن هرگز بیماری سل ایجاد نمی شود . از ١٠ درصد باقی مانده یک دوم آنها در طی دو سال به سمت بیماری سل پیشرفت می کنند.(٢)مطالعات اپیدمیولوژیک بیانگر این است که ترکیب ژنتیکی بعضی گروههای نژادی ممکن است زمینه مساعد ابتلا به عفونت و پیشرفت به سمت بیماری سل را فراهم کند . مدارک اخیر از نقش فاکتورهای ژنتیکی متعدد میزبان در استعداد ابتلا به بیماری سل حمایت می کنند .تخمین زده می شود که فقط ده درصد افراد ) –HIVمنفی) الوده با این باکتری در طول عمرشان به بیماری بالینی مبتلا شوند.بنابراین عده ای از اشخاص استعداد بیشتری برای ابتلا دارند که احتمالا نتیجه تعامل بین عوامل متعدد میزبان و محیط می باشد.)٥)
مشاهدات متعددی مطرح کننده این موضوع هستند که فاکتورهای ژنتیکی نقش کلیدی در مقاومت ذاتی به عفونت و ایجاد بیماری با مایکوباکتریوم توبرکلوزیس دارند. وجود این مقاومت که طبیعت پلی ژنیک دارد بوسیله درجات متفاوت حساسیت به مایکوباکتریوم توبرکلوزیس در جمعیت های مختلف مطرح شده است.(٣ ).
اینترلوکین-۱ یکی از اینترلوکین های پیش التهابی قوی است که در پاسخ های ایمنی التهابی نقش دارد. L-1alpha, IL-1beta and IL-1 receptor antagonist (IL-1Ra)
جزو خانواده اینترلوکین ۱ می باشند (۶). در حالی که اینترلوکین های ۱ آلفا و بتا سیتوکین های التهابی هستند IL-1 receptor antagonist (IL-1Ra) سیتوکینی است که نقش ضد لتهابی دارد. این سیتوکین به گیرنده اینترلوکین ۱ متصل شده ولی آن را فعال نمی کند و بعنوان بلاکر عمل می نماید (۷).
ژن کد کننده IL-1 receptor antagonist (IL-1Ra) روی کروموزوم ۲( 2q14 ) وافع است (۸).
پلی مورفیسم در اینترون ۲ این ژن شامل ۲ تا۶ توالی تکراری پی در پی ۸۶ جفت باز می باشد (۹). مطالعات نشان داده است که این پلی مورفیسم با میزان تولید پروتیین IL-1Ra ارتباط دارد. آلل ۲ با ریسک بیمار های عفونی خودایمنی و سرطان ارتباط دارد(۱۰-۱۳)
هدف از این مطالعه بررسی ارتباط بین پلیمورفیسم c ژن IL-1 receptor antagonist (IL-1Ra در بیماران مبتلا به سل ریوی می باشد
سوالات و / یا فرضیات پژوهشفراوانی ژنوتیپهای IL-1RN 1- در بیماران مبتلا به سل ریویبا افراد سالم متفاوت است.
هدف کلی طرحتععین توزیع فراوانی ژنوتیپ هایVNTR اینترلوکین ۱ رسپتور آنتاگونیست در بیماران مبتلا به سل ریوی در مقایسه با افراد سالم
اهداف اختصاصیمقایسه فراوانی ژنوتیپ هایVNTR اینترلوکین ۱ رسپتور آنتاگونیست در بیماران مبتلا به سل ریوی در مقایسه با افراد سالم
سازمانها، مراکز و موسسات و سایر بهره برداران بالقوه دستاوردهای طرح
تعریف واژه های تخصصیپلی‌مورفیسم: اختلاف توالی بازهای DNA در افراد یا گروه های مختلف
نوع مطالعهمورد-شاهدی
جامعه مورد مطالعه(معرفی مشارکت کنندگان)/ محیط پژوهش(معیارهای ورود و خروج ذکر شوند)این مطالعه افراد مبتلا به سل ریوی را که بیماریشان با اسمیر مثبت خلط یا مایع حاصل از لاواژ برونکوالوئولار ویا کشت مثبت این نمونه ها اثبات شده مورد بررسی قرار می دهد . نمونه ها از بین بیماران تحت درمان ضد سل مرکز بهداشت و یا موارد شناخته شده جدید مراجعه کننده به بیمارستان بوعلی که شرایط ذکر شده را داشته باشند٬ انتخاب می شوند. افرادی که حاضر به بررسی نباشند از مطالعه حذف می شوند.
حجم نمونه و روش محاسبه آنحجم نمونه حداقل ۲۰۰مورد بیمار از بین بیماران مسلول ریوی مراجعه کننده به بیمارستان بو علی ویا مرکز بهداشت زاهدان که تحت درمان بوده ویا درمان شده اند انتخاب می شوند.
به همین تعداد نیز از افراد سالم جامعه که به بیماری سل مبتلا نشده اند و سابقه هیچ گونه بیماری سیستمیک ندارند انتخاب میشوند
روش نمونه گیری(نحوه تخصیص تصادفی و همسانسازی در صورت لزوم ذکر شود) آسان و در دست رس
روش و ابزار جمع آوري داده ها / صحت و استحکام داده ها (پرسشنامه یا فرم اطلاعاتی ضمیمه شود)مشاهده و بررسی‌های آزمایشگاهی
روش اجرای طرح(با جزئیات بطور کامل شرح داده شود)پس از تصویب پروپوزال از بیمارانی که بر اساس معیارهای تشخیصی در آن ها سل تشخیص داده می شود و یا سل قطعی داشته و تحت درمان می باشند خونگیری می شود. همچنین از افراد گروه شاهد نیز خونگیری به عمل می آید. نمونه خون در 20- درجه سانتی گراد نگهداری می شود . DNA نمونه خون این افراد به روش salting out تخلیص میشود٬ سپس پرایمرهای اختصاصی برای تعیین ژنوتیپ با روش PCRطراحی می شود. سپس شرایط PCR بهینه سازی می شود و محصول PCR روی ژل آگاروز الکتوفورز می شود و ژنوتیپ ها تعیین می شود.
روش تجزیه، تحليل و توصیف داده‌ها (نمونه‌اي از جدول توخالي ضميمه شود و روش هاي آماري مورد استفاده به طور كامل توضيح داده شود)(کیفی و کمی) پس از گردآوری اطلاعات لازم، یافته‌ها در نرم افزار آماری17 SPSS وارد گشته و با استفاده از آزمون آماری Chi square داده‌ها مورد تجزیه و تحلیل قرار خواهند گرفت
ملاحظات اخلاقی با رضایت کامل از بیماران نمونه گیری می شود و تعهد می شود نام ومشخصات بیماران در هیچ گزارشی قید نشود. انجام آزمایشات هیچ گونه هزینه ای برای بیمار نخواهد داشت (باتوجه به کد های اخلاقی شماره های 1، 2،20،17)
محدودیتهای اجرائی طرح و پیش بینی جهت حل آنها- عدم همکاری بیمار
-مشکل تهیه مواد وامکان طولانی شدن زمان دریافت آنها
کلمات کلیدیسل VNTR IL-1RN
فهرست منابع و مراجع
میر حقانی ،لیلا و همکاران.راهنمای کشوری مبارزه با سل ۱
2)Fitzgerald DW, Sterling TR, Hass DW, Mycobacterium tuberculosis .in: Mandell J.l , bennet J.E , Dolin R ; principles and practice of infectious diseases; 7th edition . Churchill livingstone , New York 2010:3129-63.
3)Kasper D.L,et al.Harrison’s principles of internal medicine.Volume 2.17th ed.McGraw-Hill 2008:953-966
4) Khazaei HA, Rezaei N, Bagheri GR, Dankoub MA, Shahryari K, Tahai A, Mahmoudi M. Epidemiology of tuberculosis in the Southeastern Iran. Eur J Epidemiol. 2005;20(10):879-83.
5) Amim LH, Pacheco AG, Fonseca-Costa J, Loredo CS, Rabahi MF, Melo MH, Ribeiro FC, Mello FC, Oliveira MM, Lapa e Silva JR,Ottenhoff TH, Kritski AL, Santos AR. Role of IFN-gamma +874 T/A single nucleotide polymorphism in the tuberculosisoutcome among Brazilians subjects. Mol Biol Rep. 2008 Dec;35(4):563-6.
6. Grawal S, Srivastava R, Sharma B, Pandya S, Misra R, Aggarwal A. IL1RN*2 allele of IL-1receptor antagonist VNTR polymorphism is associated with susceptibility to ankylosing [corrected] spondylitis in Indian patients. Clin Rheumatol 2008;27:573-6.
7. Arend, W.P., Malyak, M., Guthridge, C.J. & Gabay, C. (1998) Interleukin-1 receptor antagonist: role in biology. Annual Review in Immunology, 16, 27-55.
8. Patterson, D., Jones, C., Hart, I., Bleskan, J., Berger, R., Geyer, D. et al. (1993) The human interleukin-1 receptor antagonist (IL1RN) gene is located in the chromosome 2q14 region. Genomics, 15, 173.
9. Tarlow, J.K., Blakemore, A.I., Lennard, A., Solari, R., Hughes, H.N., Steinkasserer, A. et al. (1993) Polymorphism in human IL-1 receptor antagonist gene intron 2 is caused by variable numbers of an 86-bp tandem repeat. Human Genetics, 91, 403.
10. Dewberry, R., Holden, H., Crossman, D. & Francis, S. (2000) Interleukin-1 receptor antagonist expression in human endo- thelial cells and atherosclerosis. Arteriosclerosis Thrombosis and Vascular Biology, 20, 2394.
11. Shukla RK, Kant S, Bhattacharya S, Mittal B. Association of cytokine gene polymorphisms in patients with chronic obstructive pulmonary disease. Oman Med J 2012;27:285-90.
12. otanovic Z, Etokebe GE, Mihelic R, Heiland Karvatn M, Mulac-Jericevic B, Tijanic T, et al. Hip osteoarthritis susceptibility is associated with IL1B -511(G>A) and IL1 RN (VNTR) genotypic polymorphisms in Croatian Caucasian population. J Orthop Res 2011;29:1137-44.
13. Zhang Y, Liu C, Peng H, Zhang J, Feng Q. IL1 receptor antagonist gene IL1-RN variable number of tandem repeats polymorphism and cancer risk: a literature review and meta-analysis. PLoS One 2012;7:e46017

پیوست ها
hide/show

نام فایل تاریخ درج فایل اندازه فایل دانلود
IL-1RN VNTR grant.docx1392/03/23193175دانلود
دانشگاه علوم پزشکی زاهدان.doc1392/03/2345568دانلود
داوری علمی6127.doc1392/04/1649664دانلود
IL-1RN_VNTR_grant.docx1392/04/16180107دانلود
IL-1RN VNTR grant.doc1392/05/08331264دانلود
6127.png1392/05/233554406دانلود