
| کد طرح | 6308 |
| عنوان فارسی طرح | بررسی ژنوتیپهای حذف/الحاق 16 جفت بازی ژن p53در بیماران مبتلا به سرطان سینه و مقایسه آن با خانمهای سالم |
| عنوان لاتین طرح | Examination of P53 16 bp insertion/deletion polymorphism in patients with breast cancer and compare with healthy women |
| نوع طرح | کاربردی |
| محل اجرای طرح | مدیریت توسعه فناوری سلامت |
| رسته مطالعاتی | مورد شاهدی |
| دانشکده/مرکز | دانشگاه علوم پزشکی |
| زمان اجرا -روز | 365 |

| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح | نوع همکاری | درجهتحصیلی | پست الکترونیک |
|---|---|---|---|---|
| ابراهیم اسکندری نسب | مجری | کارشناس ارشد | eenasab@yahoo.com | |
| محمد هاشمی | همکار | دکترا - PHD | mhd.hashemi@gmail.com | |
| محسن طاهری | همکار | دکترای تخصصی | taheri@zaums.ac.ir | |
| محبوبه ابراهیمی | همکار | کارشناس ارشد | ebrahimi.m22@gmail.com | |
| شادی امینی نیا | همکار | کارشناس ارشد | shadi_am65@yahoo.com |

| عنوان | متن |
|---|---|
| خلاصه طرح به فارسی | بررسی ژنوتیپهای حذف/الحاق 16 جفت بازی ژن p53در بیماران مبتلا به سرطان سینه و مقایسه آن با خانمهای سالم |
| خلاصه طرح به لاتین | Examination of P53 16 bp insertion/deletion polymorphism in patients with breast cancer and compare with healthy women |
| محل اول بکارگیری نتایج تحقیق | |
| بيان مسئله تحقيق/اهمیت پژوهش | سرطان سینه یکی ازدلایل مهم امراض ومرگ ومیر درزنان می باشد وهنوزدرمورداتیولوژی این بیماری اطلاعات ناچیزی در دسترس است. سرطان سینه ، تکثیر بدخیم آن دسته از سلول های اپیتلیال است که مجاری یا لوبول های پستان را می پوشانند . در سال 2007 حدود 185510 مورد سرطان مهاجم پستان و 40910 مرگ در ایالات متحده روی داد. بدخیمی های با منشا اپیتلیال پستان ، شایعترین علت سرطان در زنان ( به جز سرطان پوست ) است که حدود 3/1 همه سرطان های زنان را تشکیل می دهد. ریسک فاکتورهایی ازقبیل قاعدگی زودرس، یائسگی باتاخیر، نازایی یا سن زیاد درهنگام اولین زایش ممکن است مسئول 3/1 دیگر موارد ایجاد کننده سرطان سینه می باشند. با بهبود وضعیت درمان و تشخیص زودرس ، مرگ و میر ناشی از سرطان پستان در ایالات متحده به صورت قابل توجهی در حال کاهش است[1-5].
بر روی ژنوم نقاطی وجود دارد که به طور ارثی ممکن است در افراد مختلف متفاوت بوده که به آن پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی (SNP) می گویند. وضعیت های مختلف این پلی مورفیسم ممکن است فرد را مستعد به بیماری خاصی کند. در نتیجه تشخیص وضعیت پلی مورفیسم های خاص، ممکن است به ما پیش آگهی درباره مستعد شدن فرد به بیماری خاص دهد. چند شکلی DNA به عنوان یک نشانگر ژنتیکی برای شناسایی افراد در زمینههای گوناگونی کاربرد دارد. یکی از این چند شکلیها، چند شکلی نوکلئوتیدی (nucleotide polymorphism Single) است که به اختصار بصورت SNP نشان داده میشود. [6] در حال حاضر، توجهات رو به رشدی به پلی مورفیسم های از نوع حذف و اضافه های کوتاه (indels) در تحقیقات ژنتیکی انسانی می شود. Indels بعنوان یک منبع غنی از مارکرهای ژنتیکی شناخته شده اند که بطور وسیعی در طول ژنوم پراکنده شده اند، اما نه به فراوانی SNPها. بعنوان مثال Mills و همکاران داده های تحقیقات توالی یابی را در جهت شناسایی 415436 indels که در جمعیتهای انسانی تقسیم شده اند مورد بررسی قرار دادند که تخمین زدند که در بین بیش از 10 میلیون پلی مورفیسم شناخته شده در انسان، 1.5 میلیون از نوع indels هستند. مزیت های گوناگونی برای indels در مقایسه با SNPs گزارش شده است. بطرز مهمی indels می توانند با روشهای ساده-ای بر اساس اندازه شان جداسازی شوند. مزیت دیگر آنها نسبت بهSNP ها آن است که احتمال اینکه دو جهشindel با طول دقیقا یکسان روی یک موقعیت ژنومی قرار داشته باشند بسیار ضعیف است، که بدین معنی است که indels هایمشترک می توانند با دقت بالایی بعنوان شاخصهای تعیین هویت اجدادی بکار روند. Indel ها در ناحیه توالی کد کننده احتمال تخریب کنندگی بیشتری نسبت به موتاسیونهای نقطه ای دارند، از اینرو indelها از طریق ایجاد موتاسینهای تغییر قالب خوانش سبب کاهش تنوع خود بعلت انتخاب منفی می گردند. از جانب دیگر، موتاسیونهای نقطه ای درنواحی کدینگ، در مقایسه با indels بیشتر در معرض انتخاب مثبت هستند. [6] ژن tp53 (protein 53 tumor)که در موقعیت17p13 واقع است و بنام تومور ساپرسور ژن خوانده می شود، پروتئینی 53 کیلو دالتونی را کد میدهد که نقش مهمی در تنظیم چرخه ی سلولی ،آپوپتوز و استحکام DNA بر عهده دارد به همین دلیل مخافظ ژنوم خوانده می شود . اختلالات DNA یا استرس های ژنوتوکسیک ممکن است موجب القای tP53 گردد و منجر به توقف رشد سلول شده و در نهایت القای اپوپتوز شود ،عمل tP53 کاهش دادن احتمال سرطان ها از طریق القای اپوپتوز در سلولهایی است که در انها مسیرهای انکوژنیک فعال شده اند . موتاسیون هایی که در نواحی متفاوت از ژن p53 رخ می دهند میتوانند موجب افزایش یا کاهش عملکرد این پروتئین شوند [7-10]. گفته شده است انواع متفاوتی از سرطان ها باپلی مورفیسم 16 جفت بازی این ژن در جمعیت های متفاوت مرتبط میباشد از جمله ،سرطان رحم(زنان برزیلی)[11] ،اسکیزوفرنی(نژاد پرتغالی)[12] و سرطان سینه (نژاد کرواسی ،یونانی)[13-15] . به دلیل اهمیت این پروتئین،ما بر آنیم ارتباط این حذف 16 جفت بازی در ژن مذکور را با سرطان سینه در جامعه ی زاهدان مورد بررسی قرار دهیم. |
| مشکل جاری که سیاست گزار با آن مواجه است کدام است؟ | |
| روش های موجود کدامها هستند؟ | |
| پیشنهاد اول نحوه کاربرد | |
| محل دوم بکارگیری نتایج تحقیق | |
| سوالات و / یا فرضیات پژوهش | فراوانی ژنوتیپهای P53 (Ins/Ins, Ins/del, del/del) در بیماران مبتلا به سرطان سینه وخانمهای سالم متفاوت است. |
| هدف کلی طرح | مقایسه ژنوتیپهای P53 (Ins/Ins, Ins/del, del/del) در بیماران مبتلا به سرطان سینه وخانمهای سالم |
| منافع و مضرات روشهای موجود کدامند؟ | |
| چرا پیام تحقیق شما حلال مشکل جاری است؟ | |
| اهداف اختصاصی | مقایسه ژنوتیپهای (Ins/Ins, Ins/del, del/del) P53 در بیماران مبتلا به سرطان سینه وخانمهای سالم |
| پیشنهاد دوم نحوه کاربرد | |
| محل سوم بکارگیری نتایج تحقیق | |
| سازمانها، مراکز و موسسات و سایر بهره برداران بالقوه دستاوردهای طرح | |
| پیام تحقیق شما چه منافعی از نظر هزینه، کارایی و بهره وری برای مدیر دارد؟ | |
| برای اجرای راه حل پیشنهادی شما چه موانع و حمایتهایی وجود دارند؟ | |
| تعریف واژه های تخصصی | پلیمورفیسم تک نوکلئوتیدی (single nucleotide polymorphism: SNP): اختلاف فقط یک باز در DNA. ساده ترین و شایع ترین نوع پلیمورفیسم می باشد. |
| پیشنهاد سوم نحوه کاربرد | |
| محل چهارم بکارگیری نتایج تحقیق | |
| نوع مطالعه | مورد-شاهدی |
| جامعه مورد مطالعه(معرفی مشارکت کنندگان)/ محیط پژوهش(معیارهای ورود و خروج ذکر شوند) | کلیه بیماران مبتلا به سرطان پستان که هم اکنون تحت درمان بوده و موارد جدیدی که تشخیص داده شده و مراجعه می کنند. یک ونیم برابر تعدادنمونه های مورد از خانم های سالم که مبتلا به سرطان پستان نبوده و بیماری سیستمیک شناخته شده ای ندارند. |
| پیشنهاد چهارم نحوه کاربرد | |
| حجم نمونه و روش محاسبه آن | برای بررسی پلی مورفیسم های ژنی٬ از خانم های مبتلا به سرطان سینه در زاهدان که هم اکنون تحت درمان می باشند به تعداد 150 نفر خون گرفته می شود. گروه شاهد از نمونه های خون خانم های سالم که در طرح بررسی شیوع سندروم متابولیک وارد مطالعه شده اند استفاده می شود ( حداقل 200 نفر ). |
| روش نمونه گیری(نحوه تخصیص تصادفی و همسانسازی در صورت لزوم ذکر شود) | (نحوه تخصیص تصادفی و همسان سازی در صورت لزوم ذکر شود): نمونه خون از تعداد مورد نظر بیماران مبتلا به سرطان سینه دارای معیارهای فوقالذکر و نیز همان تعداد افراد سالم گرفته وجهت بررسیها به آزمایشگاه فرستاده میشود. |
| روش و ابزار جمع آوري داده ها / صحت و استحکام داده ها (پرسشنامه یا فرم اطلاعاتی ضمیمه شود) | مشاهده و بررسیهای آزمایشگاهی |
| روش اجرای طرح(با جزئیات بطور کامل شرح داده شود) | نمونه خون تام در 20- درجه سانتیگراد نگهداری میشود . DNA ژنومی از خون تام به روش salting out تخلیص میشود. پرایمرهای اختصاصی جهت بررسی حذف ژنی طراحی میشود سپس شرایط PCR بهینه میشود و بررسی پلیمورفیسم ژنی با این روش مورد ارزیابی قرار میگیرد. |
| روش تجزیه، تحليل و توصیف دادهها (نمونهاي از جدول توخالي ضميمه شود و روش هاي آماري مورد استفاده به طور كامل توضيح داده شود)(کیفی و کمی) | پس از گردآوری اطلاعات لازم، یافتهها در نرم افزار آماری17 SPSS وارد گشته و با استفاده از آزمون آماری Chi square دادهها مورد تجزیه و تحلیل قرار خواهند گرفت. |
| ملاحظات اخلاقی | با رضایت کامل از بیماران نمونه گیری می شود و تعهد می شود نام ومشخصات بیماران در هیچ گزارشی قید نشود. انجام آزمایشات هیچ گونه هزینه ای برای بیمار نخواهد داشت (باتوجه به کد های اخلاقی شماره های 1، 2،20،17) |
| محدودیتهای اجرائی طرح و پیش بینی جهت حل آنها | - عدم همکاری بیمار
-مشکل تهیه مواد وامکان طولانی شدن زمان دریافت آنها |
| کلمات کلیدی | سرطان سینه، پلیمورفیسم تکنوکلئوتیدی، ژن P53 |
| فهرست منابع و مراجع | 1. Even-Sapir, E. and M. Inbar, PET in women with high risk for breast or ovarian cancer. Lancet Oncol, 2010. 11(9): p. 899-905.
2. Fishman, A., The effects of parity, breastfeeding, and infertility treatment on the risk of hereditary breast and ovarian cancer: a review. Int J Gynecol Cancer, 2010. 20(11 Suppl 2): p. S31-3. 3. Hutchinson, L., Screening: BRCA testing in women younger than 50 with triple-negative breast cancer is cost effective. Nat Rev Clin Oncol, 2010. 7(11): p. 611. 4. Lee, E.H., et al., Effect of BRCA1/2 mutation on short-term and long-term breast cancer survival: a systematic review and meta-analysis. Breast Cancer Res Treat, 2010. 122(1): p. 11-25. 5. Narod, S.A., BRCA mutations in the management of breast cancer: the state of the art. Nat Rev Clin Oncol, 2010. 7(12): p. 702-7. 6. Komar, A.A., Single nucleotide polymorphisms : methods and protocols. 2nd ed. Methods in molecular biology,. 2009, New York: Humana. xiv, 464 p. 7. Ahmed, A.A., et al., Driver mutations in TP53 are ubiquitous in high grade serous carcinoma of the ovary. J Pathol, 2010. 221(1): p. 49-56. 8. Dahabreh, I.J., et al., TP53 Arg72Pro polymorphism and colorectal cancer risk: a systematic review and meta-analysis. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev, 2010. 19(7): p. 1840-7. 9. Benard, J., S. Douc-Rasy, and J.C. Ahomadegbe, TP53 family members and human cancers. Hum Mutat, 2003. 21(3): p. 182-91. 10. Costa, S., et al., Importance of TP53 codon 72 and intron 3 duplication 16bp polymorphisms in prediction of susceptibility on breast cancer. BMC Cancer, 2008. 8: p. 32. 11. Fernandes, T.A., et al., Evaluation of the polymorphisms in the exons 2 to 4 of the TP53 in cervical carcinoma patients from a Brazilian population. Cell Mol Biol (Noisy-le-grand), 2008. 54 Suppl: p. OL1025-31. 12. Ni, X., et al., Human p53 tumor suppressor gene (TP53) and schizophrenia: case-control and family studies. Neurosci Lett, 2005. 388(3): p. 173-8. 13. Bisof, V., et al., TP53 gene polymorphisms and breast cancer in Croatian women: a pilot study. Eur J Gynaecol Oncol, 2010. 31(5): p. 539-44. 14. Faghani, M., et al., TP53 PIN3 polymorphism associated with breast cancer risk in Iranian women. Indian J Cancer, 2011. 48(3): p. 298-302. 15. Hrstka, R., et al., Intronic polymorphisms in TP53 indicate lymph node metastasis in breast cancer. Oncol Rep, 2009. 22(5): p. 1205-11. |
| معرفی پژوهش/ اهداف پژوهش (عین عبارت هدف پروپوزال را کپی نکنید. بلکه با جملاتی که برای مردم قابل فهم باشد (برای سواد حدود پنجم ابتدایی )هدف را برای شرکت کنندگان توضیح دهید.) در تمام این متن در صورتیکه شرکت کننده کودک یا فرد فاقد ظرفیت تصمیم گیری است باید مواردیکه منظور از "من"، فرد شرکت کننده بوده است به "کودک" یا "فرد تحت سرپرستی من" اصلاح شود و مواردیکه منظور از "من"، رضایت دهنده است به من به عنوان "ولی" یا "قیم قانونی" اصلاح شود. | |
| خون گیری (آیا طرح شما نیاز به خونگیری دارد یا خیر) | |
| نحوه همکاری/ مزایا ی طرح (در این بخش برای شرکت کنندگان به زبان ساده توضیح دهید که: چه مداخله ای بر روی آنها صورت میگیرد. چه اقدامات پاراکلینیکی بر روی آنها انجام میشود. چه نمونه ای و با چه حجمی از آنها میگیرید در این مدت چند نوبت مراجعه باید داشته باشند و به چه فواصلی چه اقداماتی را در پیگیری آنها انجام میدهید. (حتی میتوانید سود بالقوه ای که شرکت کنندگان میتوانند از شرکت در این پژوهش ببرند بنویسید. این سود میتواند شرح احتمال درمان یا تشخیص بهتر بیماریشان، دریافت خدمات سلامت رایگان و یا پرداخت مشوق مالی در ازای جبران همکاریشان باشد) | |
| عوارض جانبی (منظور عوارض و میزان احتمال بروز آنها در این مطالعه است) | |
| جبران عوارض احتمالی (برای آنکه شرکت کننده بتواند ارزیابی مناسبی از سود و زیان شرکت در پژوهش شما داشته باشد لازم است بتواند سود و زیان مداخلات معمول و مداخلات این پژوهش را مقایسه کند. به عنوان مثال میزان موفقیت و میزان عوارض هریک را مقایسه کند.) - او باید بداند كه اگر در حين و بعد از انجام پژوهش هم هر مشكلي اعم از جسمي و روحي به علت شرکت در اين پژوهش برایش پيش آمد درمان عوارض، و هزينههاي آن و غرامت مربوطه بر عهده مجري خواهد بود. | |
| هزینه های مربوط به انجام طرح تحقیقاتی (تمام مداخلات پژوهشی باید برای بیمار رایگان باشد و بیمار بداند شامل چه مواردی هستند. ) | |
| روش های جایگزین در صورت عدم تمایل به شرکت در مطالعه چه روش های درمانی برای بیمار ارائه خواهد شد | |
| محرمانه بودن بیمار باید بداندکه دست اندر كاران اين پژوهش، كليه اطلاعات مربوط به او را نزد خود به صورت محرمانه نگهداشته و فقط اجازه دارند نتايج كلي و گروهي اين پژوهش را بدون ذکر نام و مشخصات بیمار منتشر كنند. و كميته اخلاق در پژوهش با هدف نظارت بر رعایت حقوق وی ميتواند به اطلاعات ایشان دسترسي داشته باشد. | |
| پاسخگویی به پرسش ها در این بخش نام و اطلاعات دسترسی فردی از عوامل پژوهش را که بتواند اطلاعات صحیح و کافی در اختیار شرکت کنندگان قرار دهند و در مورد عوارض و نگرانیها راهنمایی لازم را ارائه دهند ذکر شود | |
| حق نپذیرفتن یا انصراف بیمار باید بداند که شرکت اودر اين پژوهش کاملاً داوطلبانه است و مجبور به شرکت در اين پژوهش نيست و در صورت عدم شرکت از مراقبتهاي معمول تشخيصي و درماني محروم نخواهد شد او باید بداند كه حتي پس از موافقت با شركت در پژوهش ميتواند هر وقت كه بخواهد، پس از اطلاع به مجري، از پژوهش خارج شود و خروج اواز پژوهش باعث محرومیت از دریافت خدمات درمانی معمول برای اونخواهد شد. | |
| رضایت او باید بداند که اگر اشکال يا اعتراضي نسبت به دست اندركاران يا روند پژوهش دارد مي تواند با كميته اخلاق در پژوهش دانشگاه تماس گرفته و مشکل خود را به صورت شفاهي يا كتبي مطرح نمايد. در انتهای فرم قید گردد : اينجانب موارد فوقالذکر را خواندم و فهميدم و بر اساس آن رضايت آگاهانه خود را براي شركت در اين پژوهش اعلام ميکنم. اينجانب ……………… خود را ملزم به اجراي تعهدات مربوط به مجري در مفاد فوق دانسته و متعهد ميگردم در تأمين حقوق و ايمني شركت كننده در اين پژوهش تلاش نمايم | |
| پرسشنامه یا فرم اطلاعاتی |

| نام فایل | تاریخ درج فایل | اندازه فایل | دانلود |
|---|---|---|---|
| Eskandari-Nasab et al-Scn J Immun.pdf | 1392/08/18 | 125972 | دانلود |
| Responses-new.docx | 1392/11/13 | 12409 | دانلود |
| P53 proposal on Breast1.docx | 1392/11/16 | 128509 | دانلود |