چاپ صفحه |  صفحه نخست سامانه |  مجری و همکاران |  اطلاعات تفضیلی |  دانلود | علوم پزشکی زاهدان |
| کد طرح | 6684 |
| عنوان فارسی طرح | بررسی پلی مورفیسم هایrs2239751,rs414171 ژن CISHدرافراد مبتلا به سل ریوی و افراد سالم شهر زاهدان |
| عنوان لاتین طرح | Evaluation of (rs2239751,rs414171 )CISH gene polymorphisms in pulmonary tuberculosis and healthy subjects in zahedan |
| نوع طرح | توسعه ای |
| محل اجرای طرح | مدیریت توسعه فناوری سلامت |
| رسته مطالعاتی | مورد شاهدی |
| دانشکده/مرکز | دانشگاه علوم پزشکی |
| زمان اجرا -روز | 366 |
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح | نوع همکاری | درجهتحصیلی | پست الکترونیک |
|---|---|---|---|---|
| ابوالحسن صفدری | همکار | دکترای تخصصی | abolhassansafdari99@gmail.com | |
| محمد نادری | مجری | استاد راهنما | دکترای تخصصی | naderi597@gmail.com |
| محسن طاهری | مشاور | مشاور تخصصی | دکترای تخصصی | taheri@zaums.ac.ir |
| عنوان | متن |
|---|---|
| خلاصه طرح به فارسی | بررسی پلی مورفیسم هایrs2239751,rs414171 ژن CISHدرافراد مبتلا به سل ریوی و افراد سالم شهر زاهدان |
| خلاصه طرح به لاتین | Evaluation of (rs2239751,rs414171 )CISH gene polymorphisms in pulmonary tuberculosis and healthy subjects in zahedan |
| بيان مسئله تحقيق/اهمیت پژوهش | سل (TB) یکی از قدیمی ترین بیماریهای شناخته شده ایست که در انسان ایجاد می شود و در صورت عدم درمان در بیش از 50 درصد موارد بعد از پنج سال با مرگ و میر همراه خواهد بود1 توبرکلوز بعد از HIV دومین علت مرگ و میر ناشی از بیماریهای عفونی در جهان می باشد و در سال 1993 سازمان بهداشت جهانی از این بیماری به عنوان اورژانس بهداشت جهانی یاد کرده است.2 بیش از 90 در صد موارد بیماری و مرگ ناشی از سل در کشور های در حال توسعه بوده است که 75 در صد آنها در گروه سنی فعال از نظر اقتصادی یعنی(54-15)سالگی رخ میدهد.3و4
در ایران شایع ترین نوع سل، سل ریوی بوده، به طوری که سل ریوی اسمیر خلط مثبت 53% کل موارد سل را تشکیل می دهد.سل خارج ریوی نیز 28% کل موارد سل را شامل می شود.در میان استان ها، گلستان و سیستان و بلوچستان بیشترین میزان های بروز و شیوع را در کشور دارا هستند.بر طبق آخرین آمار منتشره وزارت بهداشت(از جمعیت تحت پوشش دانشگاه ها)، میزان بروز بیماری سل به ترتیب در زابل و زاهدان 7/109 و 6/36 در 100000 نفر جمعیت در سال 88 گزارش شده است.5 TB معمولاً ریه را درگیر می کند هر چند تا یک سوم موارد ارگانهای دیگر هم درگیرند، شایعترین محل هایی که در سل خارج ریوی درگیر می شوند به ترتیب شیوع عبارتند از: غدد لنفاوی، پلور، دستگاه گوارش، استخوانها و مفاصل، مغز و پریتوئن. در اثر گسترش هماتوژن در بیماران مبتلا به HIV سل خارج ریوی امروز بیش از گذشته ایجاد می شود2 به طوری که سل خارج ریوی در 60-40 % مبتلایان به AIDS اثبات شده است.1 تقریبا 10 درصد افراد مبتلا به عفونت مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به سمت بیماری ریوی یا خارج ریوی سل پیشرفت می کنند و از جمله عوامل موثر در پیشرفت عفونت به بیماری فعال سل عوامل دفاعی بدن میزبان می باشد.6که در این بین فاکتورهای ژنتیک میزبان از جمله مهمترین موارد تعیین کننده استعداد میزبان برای ابتلا به بیماری فعال و موارد شدید و مقاوم بیماری می باشد.7 مطالعات نشان دادند که فاکتورهای ژنتیکی با پیامد بیماری TBبا یک میزان توارث 36 تا 80 درصد همراهی دارند.8 پاسخ سایتوکاینی التهابی یک ویژگی کلیدی در پاسخ دفاعی ایمنی میزبان نسبت به عفونت مایکوباکتریوم توبرکلوزیس می باشد.8 و 9 در طول فاز اولیه پاسخ ایمنی Adaptive،اینترلوکین2،میزان وطول مدت پاسخT-cell بعد از مواجهه با انتی ژن را تعیین میکند وبلوغ ماکروفاژها وتکثیر NK-cellوB--CELL را افزایش میدهد.10 پروتین های خانوادهSOCS پیامدهنده سایتوکاینی به طور منفی فعالیت اینترلوکین2 را تنظیم می کنند.CISH یک عضوی از خانواده SOCS می باشد که در همراهی باIL-2افزایش بیان ژنتیکی در پاسخ به عفونت دارد.11 و 12 پروتینی که بوسیله CISH رمزگذاری می شود بوسیله توقف فعالیت تبدیل کننده پیام ،سیگنال های سایتوکاینی و رونویسی5(STAT5) را مهار میکند.13CISHبه گیرنده های Phosphorylated tyrosin residues متصل میشود وسپس از اتصالشان به STAT5)) جلوگیری میکند.19- 14هر دو فعالسازی STAT5وبیان فاکتور ترانس کریپتاز گلوبین(GATA3) تمایز سلول های لنفوسیت(CD4)T به سلول هایTh2))را انجام میدهند.20به علاوه یک مطالعه نشان داد که میزان بیان CISH به طور چشمگیری در سلول های Th2از سلول هایTh1 بیشتر است .21یک مطالعه قبلی واریانت هایی از ژن CISH که با میزان بالای ابتلای به مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ارتباط داشتند را نشان داد.مطالعات قبلی الل هایی از SNP که ارتباط باافزایش میزان ابتلا به TB در بیمارانی از جمعیت کشورهای مالاوی و هنگ-کنگ داشت را نشان دادند.22در مطالعه ای که در کشور چین انجام شده rs414171(posision-292) وrs2239751(posision+1320) به عنوان ریسک فاکتور برای TB معرفی شدند.23با توجه به اهمیت بیماری سل و شیوع قابل ملاحظه آن در منطقه و لزوم تشخیص و درمان به موقع، به خصوص در افراد مبتلا به عفونت، و به این دلیل که تاکنون در تعدادی کمی از مطالعات، ارتباط مابین پلی مورفیسم در بیماران سل مورد بررسی قرار گرفته است و جهت بررسی وجود ارتباط بین بروز انواع شدید بیماری سل ریوی در افراد مبتلا به این عفونت با پلی مورفیسم ژن CISH این مطالعه طراحی شده است. هدف از انجام این مطالعه مقایسه بررسی فراوانی پلی مورفیسم های ژن CISHدر بیماران مبتلا به سل و گروه شاهد در شهرستان زاهدان می باشد، تا بتوان با استفاده از نتایج این مطالعه برنامه ریزی های لازم برای اقدامات تشخیصی و درمانی مناسب خصوصا در افراد مستعد موارد شدید بیماری سل اجرا نمود Topham, D. J., Teglund, S., Sexl, V., McKay, C., Wang, D., et al. (1999). Stat5 is required for IL -2- induced cell cycle progression of periphereal T cells. Immunity, 10, 249-259. 20- Zhu J. Transcriptional regulation of Th2 cell differentiation. Immunol Cell Biol 2010; 244-9. 21- Nakajima Y, Tsuge I, Kondo Y, et al. Up-regulated cytokine- inducible SH2- containing protein expression in allergen-stimulated T cells from hen,s egg-allergic patients. Clin Exp Allergy 2008; 38: 1499-56. 22- Khor, C. C., Vannberg, F. O., Chapman, S. J., Guo, H., Wong, S. H., Walley, A. J., et al. (2010). CISH and susceptibility to infectious diseases. New England Journal of Medicinem 362, 2092-2101. 23- Lan Zhao. Haiqing Chu. Xiaogang Xu. Jun Yue. Huiping Li. Minggui Wang. Association Between Single- Nucleotide Polymorphism in CISH Gene and Susceptibility to Tuberculosis in Chinese Han Population. Cell Biochem Biophys- 2013. |
| سوالات و / یا فرضیات پژوهش | 1. توزیع فراوانی ژنوتیپ هایrs2239751,rs414171 ژن CISHدر بیماران مبتلا به سل ریوی و گروه شاهد متفاوت است. |
| هدف کلی طرح | بررسی پلی مورفیسم های هایrs2239751,rs414171 ژن CISHدر بیماران مبتلا به سل ریوی و افراد سالم |
| اهداف اختصاصی | 1- مقایسه فراوانی ژنوتیپ rs414171 مربوط به ژن CISH درافرادمبتلا به سل ریوی و افرادسالم
2- مقایسه فراوانی ژنوتیپ rs2239751 مربوط به ژن CISH درافرادمبتلا به سل ریوی و افرادسالم |
| سازمانها، مراکز و موسسات و سایر بهره برداران بالقوه دستاوردهای طرح | |
| تعریف واژه های تخصصی | SNP:Single Nucleotide Polymorphism
CISH:cytokine-inducible SRC homology 2 domain SOCS:suppresor of cytokine signaling |
| نوع مطالعه | مورد- شاهدی (case-control) |
| جامعه مورد مطالعه(معرفی مشارکت کنندگان)/ محیط پژوهش(معیارهای ورود و خروج ذکر شوند) | کلیه بیماران مبتلا به سل که در سال1393 جهت ارزیابی و درمان به بیمارستان بوعلی زاهدان مراجعه می کنند و نمونه هایی که از قبل موجود بوده اند.
معیار ورود به مطالعه : 1- سن بالای 16 سال 2- عدم وجود هر گونه عفونت سیستمیک یا موضعی (با یا بدون درگیری ریوی) 3- عدم وجود هر گونه بیماری غیر عفونی سیستمیک حاد یا مزمن (با یا بدون درگیری ریوی) 4- عدم وجود هر گونه نئوپلاسم تشخیص داده شده (با یا بدون درگیری ریوی) معیار ورود به گروه شاهد: معیار ورود در گروه شاهد نیز سن بالای 16سال و عدم وجود هر گونه عفونت سیستمیک یا موضعی (با یا بدون درگیری ریوی)، عدم وجود هر گونه بیماری غیر عفونی سیستمیک حاد یا مزمن(با یا بدون درگیری ریوی) و عدم وجود هر گونه نئو پلاسم تشخیص داده شده(با یا بدون درگیری ریوی) خواهد بود. معیار خروج از مطالعه : عدم همکاری بیمار از ادامه طرح |
| حجم نمونه و روش محاسبه آن | حجم نمونه حداقل 200 نفر شامل کلیه بیماران مسلول ریوی تشخیص داده شده تحت درمان یا درمان شده شهرستان زاهدان در سال 1393 می باشد.به همین تعداد نیز از افراد سالم جامعه که به بیماری سل مبتلا نشده اند و سابقه هیچ گونه بیماری سیستمیک ندارند انتخاب میشوند. |
| روش نمونه گیری(نحوه تخصیص تصادفی و همسانسازی در صورت لزوم ذکر شود) | تصادفی ساده |
| روش و ابزار جمع آوري داده ها / صحت و استحکام داده ها (پرسشنامه یا فرم اطلاعاتی ضمیمه شود) | در این مطالعه جهت جمع آوری اطلاعات از تکنیک مشاهده ای (observational) استفاده می شود، و اطلاعات کلی و مشخصات دموگرافیک فرد شامل: جنس، سن، سابقه خانوادگی ابتلا به بیماری سل و نتایج آزمایشگاهی با استفاده از معاینه، شرح حال و اطلاعات پرونده در فرم های اطلاعاتی ثبت می شود. |
| روش اجرای طرح(با جزئیات بطور کامل شرح داده شود) | هدف از انجام این مطالعه مورد- شاهدی، مقایسه فراوانی پلی مورفیسم های ژن CISH در بیماران مبتلا به سل و گروه شاهد می باشد. در این مطالعه تعداد 200نفر از بیماران مبتلا به سل ریوی بالای 16 سال که در سال 3139 به بیمارستان بوعلی شهر زاهدان جهت ارزیابی و درمان مراجعه می کنند و 200 نفر از افراد سالم بالای 16 سال به عنوان گروه شاهد مورد مطالعه قرار خواهند گرفت.
در گروه بیماران سل ریوی در ابتدا از کلیه بیماران مشکوک به سل ریوی (دارای علایم: سرفه همراه با خلط و کاهش وزن، هموپتزی، درد قفسه سینه، بی اشتهایی، خستگی و تعریق شبانه) اسمیر مستقیم خلط و کشت باسیل مایکوباکتریوم توبرکلوزیس (به عنوان روش استاندارد تشخیصی) انجام خواهد شد و با توجه به زمان بر بودن آماده شدن نتایج کشت، در بیمارانی که حداقل دو نمونه اسمیر خلط مثبت، یا کشت مثبت داشته باشند نمونه گیری خون انجام شده است. در ابتدا پس از کسب رضایت کامل از بیماران، اطلاعات دموگرافیک بیماران شامل: جنس، سن، سابقه خانوادگی ابتلا به بیماری سل ثبت می شود. سپس جهت نمونه گیری، (در افراد دارای معیارهای ورود به مطالعه) 3 میلی لیتر خون وریدی در لوله های حاوی EDTAجمع آوری می گرددنمونه خون در 20-درجه سانتی گراد نگهداری می شود. DNA سلول های خون محیطی به روشsalting out تخلیص می شود،پرایمرهای اختصاصی ARMS طراحی شده و پس از بهینه سازی شرایط PCR ژنوتیپ گروه شاهد و مورد با این روش مورد ارزیابی قرار می گیرد. محصول PCR روی ژل آگارز دو درصد با اتیدیوم بروماید رنگ امیزی گردیده و محصولات PCR مورد ارزیابی قرار گرفته و ژنوتیپ فرد تعیین می گردد. |
| روش تجزیه، تحليل و توصیف دادهها (نمونهاي از جدول توخالي ضميمه شود و روش هاي آماري مورد استفاده به طور كامل توضيح داده شود)(کیفی و کمی) | پس از گرداوری اطلاعات لازم،یافته ها در نر افزار آماری SPSS وارد گشته و با استفاده از آزمون آماری T-Test و Chi-Squareداده ها مورد تجزیه و تحلیل قرار خواهند گرفت
|
| ملاحظات اخلاقی | با توجه به کد شماره 1، 7 و 17 از کدهای مصوب کمیته کشوری اخلاق در پژوهش های علوم پزشکی اطلاعات بیماران در تمام طول مدت طرح و پس از آن بصورت محرمانه حفظ خواهد شد. (7) با رضایت کامل از بیماران نمونهگیری میشود و تعهد میشود نام و مشخصات بیماران در هیچ گزارشی قید نشود (1) و انجام آزمایشات هیچگونه هزینهای برای بیمار نخواهد داشت. ( 17) نتایج آزمایشات به اطلاع بیمار رسانده خواهد شد. (5) |
| محدودیتهای اجرائی طرح و پیش بینی جهت حل آنها | محدودیت های طرح شامل عدم همکاری بیماران می باشد. |
| کلمات کلیدی | SNP:Single Nucleotide Polymorphism
CISH:cytokine-inducible SRC homology 2 domain SOCS:suppresor of cytokine signaling |
| فهرست منابع و مراجع | 1- Kasper DL. Harrison's principles of internal medicine. 17th ed. New York: McGraw-Hill: 2008;p.1006-10020
2- Hass DW. Mycobacterial Disease. In: Mandell GL, Bennett JE, Dolin R, editors. Principles and Practice of Infectious Diseases. 7th ed. New York: Churchill Livingstone: 2010; p. 3129-63. 3- Alavi – Naini,Hashemi M,Mohaghegh-Montazeri M , etal.Glutaraldehyde test for rapid diagnosis off pulmonarytuberculosis intg tubere lung dis 2009,13(5):601-605 4- میر حقانی لیلا و همکاران. راهنمای کشوری مبارزه با سل. مجموعه انتشارات مر کز تحقیقات سل و بیماری های ریوی.. مر کز مدیریت بیماریها. معاونت سلامت. وزارت بهداشت و درمان وآموزش پزشکی1388 5- 5- ملیحه متانت و دیگران.اپیدمیولوژی سل در دهه اخیر و مروری بر وضعیت آن در جنوب شرق ایران.مجله تحقیقا ت علوم پزشکی زاهدان،سال 90،دوره13،شماره 9 6- Velez DR, Wejse C, Stryjewski ME, Abbate E, Hulme WF, Myers JL, et al. Variants in toll-like receptors 2 and 9 influence susceptibility to pulmonary tuberculosis in Caucasians, African-Americans, and West Africans. Hum Genet 2010 Jan; 127(1): 65-73. 7- Velez DR, Hulme WF, Myers JL, Stryjewski ME, Abbate E, Estevan R. Association of SLC11A1 with tuberculosis and interactions with NOS2A and TLR2 in African-Americans and Caucasians. Int J Tubercul Lung Dis 2009 Sep; 13(9): 1068-76. 8-Moller, M., de with, E., & Hoal, E. G. (2010). Past, present and future directions in human genetic susceptibility to tuberculosis. FEMS Immunology and Medical Microbiology, 58,3-26. 9- Flynn, J. L., & Chan, J. (2003). Immune evasion by Mycobacterium tuberculosis: Living with the enemy. Current Opinion in Immunology, 15, 450-455. 10- Ellner, J.J. (2010). Immunorgegulation in TB: Observations and implications. Clinical and Translational Science, 2010(3), 23-28. 11- Jin, P., Wang, E., Provenzano, M., Deola, S., Selleri, S., Ren, J., et al. (2006). Molecular signatures induced by interleukin-2 on peripheral blood mononuclear cells and T subsets. Journal of Translational Medicine, 4, 26. 12- Kovanen, P. E., & Leonard, W. J. (2004). Cytokines and immunodeficiency diseases: critical roles of the gamma(c)- dependent cytokines interleukins 2, 4, 7, 9, 15, and 21, and their signaling pathways. Immunological Reviews, 202, 67-83. 13- Larsen, L., & Ropke, C. (2002). Suppressors of cytokine signaling (SOCS). Acta Pathologica, Microbiologica et Immunologica Scandinavica, 110, 833-844. 14-Yoshimura, A., Ohkubo, T., Kiguchi, T., Jenkins, N. A., Gilbert, D. J., Copeland, N. G., et al. (1995). A novel cytokine-inducible gene CIS encodes an SH2- containing protein that binds to tyro- sine phosphorylated interleukin 3 and erythropoietin receptors. EMBO Journal, 14, 2816-2826. 15- Matsumoto, A., Seki, Y., Kubo, M., Ohtsuka, S., Suzuki, A., Hayashi, I., et al. (1999). Suppression of STAT5 functions in liver, mammary glands, and T cells in cytokine- inducible SH2- containing protein 1 transgenic mice. Molecular and Cellular Biology, 19, 6396-6407. 16- Matsumoto, A., Masuhara, M., Mitsui, K., Yokouchi, M., Ohtsubo, M., Misawa, H., et al. (1997). CIS, a cytokine inducible SH2 protein, is a target of the JAK- STAT5 pathway and modulates STAT5 activation. Blood, 89, 3148-3154. 17- Aman, M. J., Migone, T. S., Sasaki, A., Ascherman, D. P., Zhu, M., Soldaini, E., et al. (1999). CIS associates with the interleukin- 2 receptor beta chain and inhibits interleukin- 2- dependent signaling. Journal of Biological Chemistry, 274, 30266-30272. 18- Nakajima, H., Liu, X. W., Wynshaw- Boris, A., Rosenthal, L. A., Imada, K., Finbloom, D. S., et al. (1997). An indirect effect of Stat5a in IL- 2- induced proliferation: A critical role for Stat 5a in IL- 2- mediated IL- 2 receptor alpha chain induction. Immunity, 7, 691-701. 19- Moriggl, R., |
| نام فایل | تاریخ درج فایل | اندازه فایل | دانلود |
|---|---|---|---|
| prppzal_nahayi%20-%20Copy[1].doc | 1392/12/10 | 266240 | دانلود |
| prppzal_nahayi%20-%20Copy[1].doc | 1392/12/10 | 266240 | دانلود |
| NEJMc1007642-2.pdf | 1392/12/10 | 143021 | دانلود |
| NEJMoa0905606.pdf | 1392/12/10 | 285764 | دانلود |
| Zhao-2013-Association Between.pdf | 1392/12/10 | 262851 | دانلود |
| 1 0011.jpg | 1392/12/10 | 283088 | دانلود |
| 3.jpg | 1392/12/10 | 113880 | دانلود |
| 4.jpg | 1392/12/10 | 124423 | دانلود |
| 6.jpg | 1392/12/10 | 58088 | دانلود |
| nahaee.doc | 1393/04/22 | 271360 | دانلود |
