بررسی پلی مورفیسم های ژنهای DHFRوMTHFRوTymSوCBS وSHMT1وIKZF1ومتیلاسیون وبیان ژن های TET2, ,WWOX,FHIT,P73 در کودکان مبتلا به لوسمی لنفوبلاستیک حاد و افراد سالم

Evaluation of DHFR,MTHFR,TymS,CBS,SHMT1,IKZF1Genes polymorphisms and methylation and expression of TET2,WWOX,FHIT,P73, Genes in childhood acute lymphoblastic leukemia and healthy subjects


چاپ صفحه 		پژوهان
صفحه نخست سامانه		 مجری و همکاران
مجری و همکاران		 اطلاعات تفضیلی
اطلاعات تفضیلی		 دانلود
دانلود 		علوم پزشکی زاهدان
علوم پزشکی زاهدان

مجریان: محمد هاشمی

کلمات کلیدی:

اطلاعات کلی طرح
hide/show

کد طرح 6858
عنوان فارسی طرح بررسی پلی مورفیسم های ژنهای DHFRوMTHFRوTymSوCBS وSHMT1وIKZF1ومتیلاسیون وبیان ژن های TET2, ,WWOX,FHIT,P73 در کودکان مبتلا به لوسمی لنفوبلاستیک حاد و افراد سالم
عنوان لاتین طرح Evaluation of DHFR,MTHFR,TymS,CBS,SHMT1,IKZF1Genes polymorphisms and methylation and expression of TET2,WWOX,FHIT,P73, Genes in childhood acute lymphoblastic leukemia and healthy subjects
نوع طرح
محل اجرای طرح مرکز تحقیقات سلولی و مولکولی
رسته مطالعاتی مورد شاهدی
دانشکده/مرکز دانشکده پزشکی زاهدان
زمان اجرا -روز

اطلاعات مجری و همکاران
hide/show

نام و نام‌خانوادگی سمت در طرح نوع همکاری درجه‌تحصیلی پست الکترونیک
غلامرضا بهاریهمکاردانشجودکترای تخصصی r_b_1333@yahoo.com
محمد هاشمیاستاد راهنمای اول پایان نامه دانشجوییاستاد راهنمادکترا - PHDmhd.hashemi@gmail.com
محسن طاهریمشاوراستاد مشاوردکترای تخصصی taheri@zaums.ac.ir

اطلاعات تفضیلی
hide/show

عنوان متن
خلاصه طرح به فارسی بررسی پلی مورفیسم های ژنهای DHFRوMTHFRوTymSوCBS وSHMT1وIKZF1ومتیلاسیون وبیان ژن های TET2, ,WWOX,FHIT,P73 در کودکان مبتلا به لوسمی لنفوبلاستیک حاد و افراد سالم
خلاصه طرح به لاتینEvaluation of DHFR,MTHFR,TymS,CBS,SHMT1,IKZF1Genes polymorphisms and methylation and expression of TET2,WWOX,FHIT,P73, Genes in childhood acute lymphoblastic leukemia and healthy subjects
بيان مسئله تحقيق/اهمیت پژوهش( Acute Lymphoblastic Leukemia) ALLلوسمی حاد لنفوبلاستیک شایعترین لوسمی کودکان می باشد. 25تا30درصد تمامی بدخیمی های کودکان را شامل می شود.اگرچه شمای کلینیکی ، پاتولوژیکی و ایمونولوژیکی آن به خوبی مشخص شده است ، اما در مورد منشاء ایجاد آن اطلاعات اندکی وجود د ارد. علل وعوامل اصلی ایجاد لوسمی ناشناخته است وبه نظر می رسد عوامل ژنتیکی و محیطی در آن دخیل باشند. لوسمی معمولا در نتیجه جابجایی DNA،اینورشن یا حذفها در ژنها و هموستاز و تکامل سلولهای خونی ایجاد می شود.1
ALL هم در کودکان و هم در بزرگسالان بروز می کند ولی پیک شیوع آن در 2 تا 5 سالگی می-باشد. علل متعدد بیرونی (محیطی) و استعداد ابتلاء ژنتیکی باعث بروز آن می شود. بقاء در ALL کودکان تا حدود 90% بهبود یافته است. 2 میزان بقاء برای ALL کودکان در 4 دهه ی گذشته به طور قابل ملاحظه ای افزایش یافته است. (بقاء 5 ساله بیش از 90%) .همه ساله در آمریکا 14382 مورد جدید سرطان در افراد زیر 20 سال تشخیص داده می شود. تقریبا21% ) 2970( از این موارد ALLمی باشد. میزان بروز سالانه در آمریکا برای افراد زیر 20 سال ،35 نفردریک میلیون نفر جمعیت می باشد که در مردان میزان بروز بیشتر از زنان است. تفاوت قابل ملاحظه ای در وقوع بین کودکان سفید و سیاه وجود دارد که در بین کودکان سفید تقریباً میزان بروز دو برابر بیشتر است. بیشترین بروز ALL کودکان در سنین بین 2 تا 5 سال رخ می دهد. در بین ملل مختلف تفاوت قابل ملاحظه ای در بروز ALL کودکان و بزرگسالان وجود دارد. ALL کودکان یکی از این سرطان هاست. در بیمارستان تحقیقاتی St jude بقای بلند مدت از 10% در اواسط دهه ی 1960 تا 90% تا به امروز افزایش یافته است. 3
پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی (SNP)که در آن یک جفت باز تغییر می کنند ممکن است در ساختمان یا بیان پروتئین ها موثرباشند.بنابراین تعیین و مشخص نمودن تغییرات توزیع SNPدر جمعیتهای مختلف ممکن است استعداد به ابتلا به بعضی بیماری هارا روشن نماید. پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی (SNP) در تعدادی از ژنها در ALLبررسی شده اند.ما نیز برآن شدیم تا تعدادی ازاین ژنها از جمله ژنهای مرتبط با متابولیسم مسیر فولات را در جمعیت بیماران ALLمراجعه کننده به بیمارستان علی بن ابیطالب(ع)زاهدان بررسی نماییم.

(Methylentetrahydrofolate reductase) MTHFRیک آنزیم متابولیکی مسیر فولات است که واکنش تبدیل 5،10متیلن تترا هیدروفولات به 5متیل تترا هیدروفولات را کاتالیز میکند.ژن کد کننده آن برروی کروموزوم1واقع شده است(1p36.3) .پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی (SNP)که در آن یک جفت باز تغییر می کنند ممکن است در ساختمان یا بیان پروتئین ها موثرباشند.بنابراین تعیین و مشخص نمودن تغییرات توزیع SNPدر جمعیتهای مختلف ممکن است استعداد ژنها را به ابتلا به بعضی بیماری ها روشن نماید.پلی مورفیسم های ژن MTHFRنشان داده شده است که با ایجاد لوسمی درارتباط است. دو SNPدر ژن MTHFRبیش از سایر SNPها در ارتباط با ALLمورد مطالعه قرار گرفته است.یکی C677T (rs1801133) که آلانین رادر کدون222به والین تبدیل می کند،ودیگری A1298C(rs1801131)که گلوتامات را در کدون429به آلانین تبدیل می نماید.تغییرات این دو جایگاه منجربه کاهش فعالیت آنزیم و کاهش میزان فولات در پلاسما ودرنتیجه افزایش هموسیستئین می گردد.همراهی پلی مورفیسمهای این ژن با تعدادی از سرطانها ازجمله پروستات،کولورکتال،کلیه و مثانه مشاهده شده است.همچنین rs13306561 نیز پلی مورفیسم آن مطالعه شده است4. اخیرا ارتباط بین پلی مورفیسمهای MTHFRواستعداد ابتلا به ALLکودکان بطور جدی مورد بررسی قرار گرفته است. 5 .6 .7.8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15.
چون توزیع فراوانی ژن MTHFRدر جمعیت های گوناگون متفاوت است وگزارشهای متعددی از ارتباط بین پلی مورفیسم های ژنMTHFR و لوسمی درجمعیتهای مختلف گزارش شده برآن شدیم تا ما نیز فراوانی پلی مورفیسم این سه جایگاه رادر جمعیت کودکان مبتلا بهALLمراجعه کننده به بیمارستان علی ابن ابیطالب(ع)زاهدان وارتباط آنهارابا استعداد ابتلا به ALLبررسی کنیم.
DHFR (Dihydrofolate reductase)دی هیدروفولات ردوکتاز، دی هیدروفولات را به تترا هیدروفولات تبدیل می کند. مسیری که برای سنتز ازنو(De novo) پورین ها گروه متیل را فراهم می کند. همین طوردر سنتز تیمیدیلیک اسید و اسیدهای آمینه معین شرکت می کند. ژن کدکننده ی این آنزیم روی کروموزوم 5 قرار دارد. (5q11.2-13.2).
در مورد این ژن هم مطالعات متعددی برروی پلی مورفیسم هایش صورت گرفته است.تعدادی از اینSNPهادرارتباط با ALLبوده است.
ما نیزrs144629981,rs201874762,rs1643657,rs12517451 رابرروی جمعیت بیمار و سالم در مطالعه مان بررسی می کنیم. 4. 7. 6.16. 17. 18.19. 20.

TymS (Tymidylate Synthase) =TS– این آنزیم متیلاسیون دزوکسی اوریدیلات را به دزوکسی تیمیدیلات با به کار بردن 5 و 10 متیلن تتراهیدرفولات به عنوان کوفاکتور کاتالیز می کند. این عمل مخزن dTMP را برای رونویسی و ترمیم DNA فراهم می کند. این آنزیم برای داروهای هموتراپی سرطان به عنوان یک مولکول هدف می باشد. ژن کدکننده ی آن روی کروموزم 18 می-باشد. آنزیم های زیادی در متابولیسم فولات دخیلند. از میان آن ها TS یک آنزیم تعیین کننده است و بنابراین یک کاندید خوب برای مطالعه ی اثر پلی مورفیسم در متابولیسم ژن فولات در پیشرفت بدخیمی ها می باشد.
TS توسط ژن TS که روی کروموزم18p11.32 قرار دارد کد می شود و نقش اساسی در پایداری و بالانس ترکیبات دزوکسی نوکلوتیدهای موردنیاز برای سنتز وترمیم DNA دارد. (به-وسیله ی کاتالیز تبدیل dump به dtmp). معمول ترین پلی مورفیسم در TS توالی های تکراری پشت سر هم 28 جفت بازی دوتایی 2R یا سه تایی 3R در انتهای ´ 5 بلافاصله بعد از ناحیه ی شروع در قسمت بالا دست (ناحیه ی غیرقابل ترجمه ی ´5 (UTR-´5) ژن TS می باشد ،که (TSER) هم نامیده می شود. که بیان پروتئین در سلول های سرطانی را تحت تاثیر قرار می دهد.
وجود 3R در مقابل 2R تکرارهای 28 جفت بازی در ناحیه ی افزایش دهنده (inhancer) با افزایش بیان TS هم در invitro و هم invivo همراه است.(.21.22. 23. )این افزایش بیان ممکن است با افزایش تبدیل dUMP به dTMP سازگار باشد. درنتیجه کاهش میزان اوراسیل و عدم فراهم سازی اوراسیل برای DNA برای تقسیم سریع سلول های دودمانی خون ساز می تواند نقش محافظتی برعلیه پیشرفت ALL داشته باشد. 24. پلی مورفیسم تکرار توالی 28 جفت بازی TS نشان داده شده است که ریسک ALL را در جمعیت های گوناگون تعدیل می کند. اما نتایج به دست آمده بحث انگیز هستند و برای اثبات و شفاف سازی نیاز به تحقیقات بیشتری می باشد. 24.25.26. هدف از مطالعه ی حاضر تعیین فراوانی پلی مورفیسم TSER و امکان وابستگی با استعداد ابتلا به ALL در بیماران مراجعه کننده به بیمارستان علی بن ابیطالب (ع) زاهدان می باشد. همچنین پلی مرفیسمهای زیر را نیز مورد بررسی قرارمی دهیم.
Rs34743033,rs502396,rs2847153,rs2853532,rs1059393, rs16430(6bp del/ins),

CBS (Cystathionine-beta-synthase)-پروتئینی که توسط این ژن کد می شود یک هموتترامر است که تبدیل هموسیستئین را به سیستاتیونین کاتالیز می کند. (اولین مرحله از راه ترانس سولفوراسیون). پروتئین ساخته شده به طور آلوستریک به وسیله ی آدنوزیل- میتونین فعال می شود و پریدوکسال فسفات را به عنوان کوناکتور به کار می برد. نقص در این ژن باعث کمبود CBS می شود که می تواند باعث هموسیستئینوری گردد. جایگاه این ژن در کروموزوم 21 واقع است.21q22.3
وریانت های متعددی از ژن CBS در ارتباط با سرطان های مختلف مثل مغز و دستگاه گوارش و شش گزارش شده است. (.27. 7. 28. 29. 30.)
آنزیم CBS در مسیر ترانس سولفوراسیون (انتقال سولفور) ازجمله کاتالیز غیرقابل برگشت هموسیتئین به سیستاتیونین نقش دارد. که بیان بیش ازحد آن مقادیر هموسیتئین را کاهش می دهد که شامل نقص عملکرد فولات می گردد (به دام انداختن فولات). چون هموسیتئین در محل تقاطع سنتز DNA و مسیر ترمیم و مسیر متیلاسیون می باشد ، بیان زیاد آن ممکن است منجربه تغییر همه ی این مسیرها شود. CBS در کودکان تریزومی 21 (سندروم داون) بیش از اندازه بیان می شود و درنتیجه آسیب های سلولی که به وسیله ی به دام انداختن فولات ایجاد می شود در کودکان با سندروم داون مشاهده می گردد. 7
پلی مورفیسمهای زیر را درمطالعه مان مورد بررسی قرار می دهیم.
Rs719037,rs72058776,rs11700748, ,rs2851391,rs11909493,.


SHMT1 (Serin hydroxyl methyl Transferase)روی کروموزم 17قرار دارد. (17p11.2). این ژن فرم سیتوزولی سرین هیدروکسی متیل ترانسفراز را کد می کند که کوآنزیم آن پیریدوکسال فسفات می باشد و واکنش قابل برگشت تبدیل سرین و تتراهیدروفولات را به گلیسین و 5 و10 متیلن THF کاتالیز می کند.
دو ایزو آنزیم برای SHMT وجود دارد یکی در سیتوزول واقع است که به وسیله ی ژن SHMT1 در کروموزم 17 (17p11.2) کد می شودو دیگری در میتوکندری است که به وسیله ی ژن SHMT2 که در کروموزم12 (12q13.2) واقع است کد می شود.
SHM1 یک نقش حیاتی در فراهم کردن واحدهای تک کربنه برای سنتز پورین تیمیدیلات و متیونین دارد. (علاوه بر سایر عملکردهای متابولیکی) .چون SHMT1 نقش تدارکاتی برای واحدهای تک کربنه برای مسیرهای چندگانه فولات دارد، اختلالات بیان پروتئین ها یا فعالیت آنزیم ها به پلی مورفیسم های آن بستگی دارد و می تواند باعث کمبود فولات ازطریق کاهش فراهم سازی ریشه های تک کربنه برای متیلاسیون مجدد هموسیستئین و سنتز DNA گردد .
(.24. 31. 26.32. 33.).بنابراین یک ژن مناسب برای مطالعه ما می باشد. که ما درتحقیقمان پلی مورفیسمهای زیر را بررسی می کنیم.
Rs1979277,rs11868708,rs9909104,rs2273027,rs9901160

IKZF1 این ژن روی کروموزم7 (q12.2 7) قرار دارد. این ژن ,فاکتور رونویسی متعلق به یک خانواده از پروتئین های انگشت روی، اتصالی به DNA را کد می کند. بیان این پروتئین به سیستم خونی لنفوئیدی در نوزادان و بزرگسالان مرتبط است و وظایفش به عنوان تنظیم کننده ی تمایز لنفوسیت ها شناخته شده است. در این ژن واریانت های رونویسی متعددی ایزوفورم های مختلفی را کد می کنند. همه ی ایزوفورم ها دارای یک ناحیه مشترک در انتهای کربوکسیل خود می باشند. که در آن دو موتیف انگشت روی (Zinc Finger ) برای هترودیمریزه شدن وجود دارد. همچنین برای برهم کنش با سایر پروتئین ها تعدادی موتیف انگشت روی در انتهای آمینو قراردارد.ونیز دارای تعدادی سیگنال موضعی هسته ای می باشند که اتصال یا عدم اتصال به DNA را میسر می سازد. تنها تعداد کمی از ایزوفورم ها ،سه یا بیشتر از سه موتیف روی در انتهای N خود دارند که تمایل بالایی برای اتصال به یک جایگاه ویژه از توالی عناصر DNA در پروموتورهای ژن های هدف دارند. ایزوفورم هایی که نمی توانند به DNA متصل شوند به طور وسیعی در سیتوپلاسم یافت می شوند و گمان می رود به عنوان فاکتورهای غالب منفی عمل نمایند. بیان بیش از حد ایزوفورم های غالب منفی با بدخیمی های سلول-های B مثل ALL همراه است. 34. 35. 36. 37. 38. 39. مطالعات مرتبط با ژنوم در لوسمی کودکان جایگاههای متعددی از ژن IKZF1 را که مرتبط با استعداد ابتلا به لوسمی لنفوبلاستیک حادکودکان می باشد مشخص نموده اند . مثلا یکی از این پلی مورفیسمها که مورد مطالعه Ross وهمکارانش قرار گرفته 11978267 rs می باشد.35 .ما هم در مطالعه مان این پلی مورفیسم و سایر پلی مورفیسمهای زیر را در بیماران و افراد سالم بررسی می نماییم..
.,rs4132601, ,rs11978267,rs11980379, rs10272724


TET2 (Methylcytosine dioxygenase)(Ten-eleven-Translocation2) این ژن در کروموزم 4q24 قرار دارد. پروتئینی که توسط این ژن ساخته می شود یک متیل سیتوزین دی اکسیژناز وابسته به 2-اکسوگلوتارات و آهن می باشد.این آنزیم تبدیل متیل سیتوزین به 5 هیدروکسی متیل سیتوزین را در DNA کاتالیز می کند. بنابراین در سیستم تنظیم متیلاسیون DNAوخونسازی دخیل است.کاهش دربیان TET2موجب افزایش در تعدادسلولهای بنیادی خونساز می گردد.
TET2 به عنوان یک ژن سرکوبگر تومور شناخته شده است.موتاسیون های آن در تعدادی از بیماری هااز جمله میلودیسپلازی (MSD) ،نئوپلازی میلوپرولیفراتیو(MPN)،لوسمی حاد میلوئیدی (AML) ولوسمی مزمن میلومونوسیتی (CMML) مشاهده شده است.40.41. 42. 43.
مانیز متیلاسیون در ناحیه پرموتور و بیان این ژن را درافراد بیمار وسالم مورد مطالعه قرار می دهیم.

WWOX- ایجاد سرطان یک پروسه چند مسیره و پیچیده شامل تغییرات ژنتیکی از جمله غیر فعال شدن ژنهای سرکوبگر تومورها می باشد. WWOX(WWOxidoreductase). یک ژن سرکوبگر تومورها حاوی جایگاه شکننده می باشد. جایگاه این ژن برروی کروموزوم 16 می باشد.(16q23.1,16q23.2).این جایگاه شکننده Fragile))دارای حذفهای ژنی و تغییرات کروموزومی فراوان می باشد.قالب خواندن ORF(Open Reading Frame)این ژن ،طولی معادل 1245جفت باز داردکه یک پروتئین 414اسید آمینه ای را کد می کند.این ژن حاوی 9 اگزون می باشد و پروتئین WWOXدر ناحیه انتهای آمینوی خود دو دمین WWداردودر ناحیه وسط یک دمین شبه اکسیدوردوکتاز دارد.
پروتئین کد شده در انسان بیش از 90%با پروتئین موجود در بدن موش شباهت دارد.
این پروتئین در موش یک واسطه ضروری برای عملکرد TNF که در آپوپتوز نقش دارد می باشد.بنابراین بنظر می رسد در انسان نیز نقشی در آپوپتوز داشته باشد.44 مطالعات نشان داده اند، فقدان یا کاهش بیان این ژن یک مرحله مهم در شروع تومورزایی در انواع تومورها ازجمله پستان،شش،مری،کلیه وگردن می باشد.45
تیروزین کیناز،Src،موجب فسفوریلاسیونWWOXدرتیروزین 33دراولین دومن WWمی شودو اتصال آن را به P73تقویت می کند.علاوه براین ،بیان زیاد WWOX بیان P73 را زیاد می کند و توزیع مجدد P73 هسته ای را در سیتوپلاسم باعث می گرددو موجب پیشرفت آپوپتوز سلول می شود.بنابراین فقدان بیان WWOX ممکن است موجب کاهش یاسرکوب نقش عملکردی P73 در آپوپتوز شود که ممکن است منجر به ایجاد تومورها شود. واینکه WWOX ممکن است با FHIT و P73 در ایجاد و توسعه تومورها همکاری نماید.تغییرات اپی ژنتیکی به طور وسیعی در ایجاد و توسعه لوسمی نقش دارند. متیلاسیون DNA یک مکانیسم شناخته شده در اپی ژنتیک است. متیلاسیون DNA موجب خاموشی ژن های سرکوبگر تومور می شوند. 46.47. با توجه به مطالب ذکرشده ما در مطالعه مان به بررسی متیلاسیون و بیان ژن WWOX در افراد بیمار و سالم می پردازیم.

(Fragile Histidine Triad) –FHIT
-این ژن عضوی از خانواده (Histidine Triad Gene)می باشد.وآنزیم دی آدنوزین تری فسفات هیدرولازرا کد می کند ( diadenosine 59,5--p1,p3-triphosphate)
نیز یک ژن سرکوبگر تومورها و حاوی جایگاه شکننده در روی کروموزوم 3 می باشد (3P14.2) (Fragile)(FRA3B)می باشد.آسیبهای القایی کارسینوژنی در این ناحیه منجر به جابجایی و رونویسی نادرست این ژن می شود.در حقیقت رونویسی نادرست از این ژن دربیش از نیمی ازسرطان های کولون،معده و مری مشاهده شده است. فقدان یا کاهش بیان این ژن نیز نشان داده شده است که یک مرحله مهم در شروع تومورزایی در انواع تومورها ازجمله پستان، شش، مری،کلیه وگردن می باشد. 48
گزارش های متعددی دلالت براختلال در بیان ژن FHIT در سلول های لوسمیک دارند.
در موشهایی که ژن FHIT در آنها ناک اوت شده است ریسک ابتلا به تومورهای خودبخودی افزایش پیدا نموده است. همچنین حساسیت این موشها به مواد سرطانزا افزایش پیدا می کند وهمینطور ترانسفکشن FHIT در سلولهای تومورژنیک باعث مهار تومورزایی در موشها می شود. همه این یافته ها این ایده را تائید می کند که FHIT یک ژن سرکوبگر تومور است.پروتئین FHIT ممکن است در متابولیسم سوبستراهای پلی فسفوریلاسیون دی آدنوزین(مثل AP3A ) شرکت نمایند. این سوبستراها می توانند بوسیله سیتوکاین ها در مسیر سیگنالینگ داخلی سلول القا شوند. تعدادی از مشاهدات بر این دلالت دارند که فعال شدن کاسپاز 8 با آپوپتوز از طریق FHIT ارتباط دارد.49تصور می شود که FHIT ممکن است عملکرد پروآپوپتوزی را از طریق مسیر کاسپاز اعمال نماید50.ناحیه پروموتر اطراف اگزون 1 در ژن FHIT حاوی جزایر CpG میباشد که نشان داده شده است که در سرطان های مری ،شش ،پستان ، پروستات ، مثانه ، گردن ، و دهان هایپر متیله شده است.46ما نیز در مطالعه مان متیلاسیون و بیان ژن FHIT را مورد بررسی قرار می دهیم.

—P73 یک ژن سرکوبگر تومور است و تصور می شود در رشد و القای توقف چرخه سلولی و آپوپتوز سلول نقش دارد.ژن TP73 روی کروموزوم 1 قرار دارد.(1P36.32).وحاوی 14 اگزون اصلی می باشد.پروتئین کامل P73 (TP73) دارای یک دومن رونویسی TAD (Tranceactivation Domain) در انتهای N ، یک ناحیه غنی از پرولین(PR=Proline-rich-region) ،یک دومن مرکزی برای اتصال به DNA و دومن الیگومریزه کننده در انتهای C دارد.در P73 یک موتیف استریل آلفا (SAM)اضافی در انتهای C وجود داردکه در P63 هم وجود دارد ولی در P53 موجود نیست.نسخه ای که توسط پروموتر P1 تولید می شود پروتئین هایی را کد می کند که TAD آنها کامل است و فعال می باشند .اما نسخه هایی که بوسیله پروموتر P2 تولید می شوند پروتئین هایی را کد می کنند که TAD آنها ناقص است واز نظر رونویسی غیر فعال می باشند (ایزوفورمهای  ) .واریانتهای کوتاه شده از انتهای N با حذف 2 اگزون از اگزونهای اولیه ایجاد می شوند.همه نسخه ها می توانند متحمل برشهای متوالی از اگزون های C ترمینال شوند ، بنابراین انواع ایزوفورمهای ترکیبی ایجاد می شوند. تنها ایزوفورم آلفا است که در انتهای C دارای دومن SAM می باشد. 51
ایزوفورمهای رونویسی شده فعال P73 در تمامی انواع سلولهای انسان کشف شده اند. ایزوفورمهای P73 از هموتترامر تشکیل شده اند . ولی با انواع P53 وحشی برهمکنش نمی دهد. بهرحال فرم موتانت P53 با P73 پیوند یافته و فعالیت آن را از بین می برد.
P73 رونویسی ژنهای وابسته وغیروابسته به P53 را تنظیم می کند. ایزوفورم P73 یک مهار کننده قوی نسخه های فعال P73 و P53 می باشد. Pozniak و همکاران دریافتند که علاوه بر TAP73 ایزوفورمهای P73 نیز در تکامل مغز و سیستم اعصاب سمپاتیک دخالت دارد.
ایزوفورمهای ناقص شده از N انتهایی مانع مرگ برنامه ریزی شده نرون ها می شوند.
بنابراین فعالیت ایزوفورمهای P73 در دانستن اثر تغییرات ژنتیکی در بیماریهای اعصاب مهم می باشد. P73 هم شبیه P53 خاصیت پروآپوپتوزی دارد.
P73 رونویسی ژنهایی راکه در تنظیم مرگ برنامه ریزی شده سلول (PCD=Programmed Cell Death)دخالت دارند، به عنوان یک فاکتور رونویسی عمل می کند.
القای بیان رسپتورهای مرگ سلولی، تنظیم کننده های سیکل سلولی و پروتئین های خانواده Bcl-2 در پاسخ به سیگنالهای استرس ، اهمیت P73 را در بیولوژی سرطان سلول روشن کرده است.E2F1یک عضو از خانواده فاکتور رونویسی E2Fمی باشد و یک تعدیل کننده مستقیم میزانP73در سلولها می باشد.E2F1یک فاکتور رونویسی هسته ای است و دارای خواص انکوژنی و پروآپوپتوزی می باشد.
اطلاعات تاکنون نشان داده ه اند که فعالیت پرو آپوپتوزی E2F1 منجر به پایداری خاصیت سرکوبگری تومور در P53 می گردد. E2F1 میزان پروتئین P14 را افزایش می دهد. P14 با اتصال به کمپلکس MDM2-P53 مانع از تخریب MDM2 می شود. با توجه به شباهت زیاد ساختمانی بین P53 و P73 باور براین است که E2F1 ممکن است میزان P73 را به همان طریق P53 تحت تاثیر قرار دهد. P73 از راه دیگری نیز توسط E2F1 تنظیم می شود. E2F1 به توالی از پروموتر P73 اتصال یافته و رونویسی از ژن P73 را افزایش می دهد. بنابراین فعالیت پروآپوپتوزی E2F1 به P53 وP73هردو وابسته است.
ChK1,ChK2 (Checkpoint Kinase 1,2) دو تنظیم کننده دیگر P73 می باشند که تجمع P73 را تحت شرایط استرس ژنوتوکسیک القا می کنند.سلولهایی که بیان ژن های ChK1,ChK2 در آنها خاموش است، میزان کمتری از P73 را در هنگام مواجهه با عوامل آسیب رساننده به DNA نشان می دهند. علاوه برآن ChK1,ChK2 میزانmRNA , P73 را کاهش می دهند.تنظیم P73 در سطح رونویسی در گرو فعالیت ZEB رپرسور(Zinc finger E-Box binding homeobox) میباشد. ZEB به ناحیه تنظیمی 1Kb که در اولین اینترون ژن P73 قرار دارد متصل می شود. ثابت شده است که این قطعه فعالیت پروموتر P73 را در حضور E2F1 تضعیف می نماید.
Corn و همکاران نشان دادند که هایپرمتیلاسیون یعنوان یک مکانسیم تنظیمی جایگزین در بیان P73 عمل می کند. هایپرمتیلاسیمون در ناحیه پروموترP73 منجر به مهار بیان P73 در لوسمی لنفوسیتی حاد ویا لنفوم بورکیت شده است اما در سایر انواع تومورها یا در لنفوسیتهای سالم ویا سلولهای مغز استخوان مهار صورت نمی گیرد. بنابراین این تغییر اپی ژنیکی در پروموتر P73 بنظر می رسد برای بدخیمیهای هماتولوژی اختصاصی باشد. 52 همه این یافته ها نشان می دهد که FHIT و WWOX و P73 در پاتوژنز تومورها نقش مهمی دارند.
ما نیز در این مطالعه به بررسی متیلاسیون ژن P73درناحیه پروموتورو بیان ژن مذکور می پردازیم
مشکل جاری که سیاست گزار با آن مواجه است کدام است؟
محل اول بکارگیری نتایج تحقیق
پیشنهاد اول نحوه کاربرد
روش های موجود کدامها هستند؟
منافع و مضرات روشهای موجود کدامند؟
سوالات و / یا فرضیات پژوهشفراوانی پلی مورفیسم rs1801133در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs1801131در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است
فراوانی پلی مورفیسم rs13306561در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs12517451در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs1643657در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs201874762در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs144629981در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs1059393در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است
فراوانی پلی مورفیسم rs2853532در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs2847153در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs502396در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs34743033در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs16430در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs2851391در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs11909493در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs11700748در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs72058776در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs719037در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs9901160در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است
فراوانی پلی مورفیسم rs2273027در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs9909104در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs11868708در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs1979277در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs11980379در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs11978267در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs4132601در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs10272724در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
متیلاسیون ژن TET2 در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
متیلاسیون ژن WWOX در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
متیلاسیون ژن FHIT در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
متیلاسیون ژن P73 در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
بیان ژن TET2 در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
بیان ژن WWOX در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
بیان ژن FHIT در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
بیان ژن P73 در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم متفاوت است.
هدف کلی طرحتعیین پلی مورفیسم های ژنهای

DHFR(rs144629981 ,rs201874762 ,rs12517451,rs1643657 )و MTHFR(rs1801133,rs1801131,rs13306561 ) و TymS(rs502396,rs2847153,rs2853532,rs34743033,rs16430,rs1059393,) , CBS(rs719037,rs72058776,rs11700748 ,rs2851391,rs11909493)

و) SHMT1(rs1979277,rs11868708,rs9909104,rs2273027,rs9901160و ) rs10272724 , IKZF1(,rs4132601,rs11978267,rs11980379

ومتیلاسیون وبیان ژن های TET2, ,WWOX,FHIT,P73 در کودکان مبتلا به لوسمی لنفوبلاستیک حاد و افراد سالم .

محل دوم بکارگیری نتایج تحقیق
پیشنهاد دوم نحوه کاربرد
اهداف اختصاصیمقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs1801133در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs1801131در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs13306561در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs12517451در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs1643657در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs201874762در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs144629981در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs1059393در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs2853532در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs2847153در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs502396در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs34743033در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs16430در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs2851391در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs11909493در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs11700748در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs72058776در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs719037در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs9901160در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs2273027در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs9909104در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs11868708در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs1979277در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs11980379در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs11978267در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs4132601در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs10272724در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه متیلاسیون ژن TET2 در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه متیلاسیون ژن WWOX در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه متیلاسیون ژن FHIT در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه متیلاسیون ژن P73 در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم .
مقایسه بیان ژن TET2 در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه بیان ژن WWOX در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه بیان ژن FHIT در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم.
مقایسه بیان ژن P73 در افراد مبتلا بهALL و افراد سالم
چرا پیام تحقیق شما حلال مشکل جاری است؟
پیام تحقیق شما چه منافعی از نظر هزینه، کارایی و بهره وری برای مدیر دارد؟
سازمانها، مراکز و موسسات و سایر بهره برداران بالقوه دستاوردهای طرحدانشگاه علوم پزشکی زاهدان
محل سوم بکارگیری نتایج تحقیق
اهداف كاربردی
پیشنهاد سوم نحوه کاربرد
تعریف واژه های تخصصیلوسمی حاد لنفوبلاستیک=این بیماری در اثر تکثیر و تکامل ناقص گویچه‌های سفید خون و پیش سازهای آن در خون و مغز استخوان ایجاد می‌شود.
پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی=یک تغییر در DNA است که در یک نوکلئوتید (A,C،G,T) در ژنوم بین افراد یک گونه بیولوژیکی یا بین یک جفت کروموزوم در یک فرد این نوکلئوتید تفاوت دارد
برای اجرای راه حل پیشنهادی شما چه موانع و حمایتهایی وجود دارند؟
نوع مطالعهمورد-شاهدی
محل چهارم بکارگیری نتایج تحقیق
پیشنهاد چهارم نحوه کاربرد
جامعه مورد مطالعه(معرفی مشارکت کنندگان)/ محیط پژوهش(معیارهای ورود و خروج ذکر شوند)نمونه های جمع آوری شده از کودکان مبتلا به ALL براساس معیارهای تشخیص بالینی و آزمایشگاهی (FAB) ونیز نمونه های جدیدی که پس از این جمع آوری می شود
حجم نمونه و روش محاسبه آنبرای بررسی پلی مورفیسم ژنی٬ کودکان مبتلا به ALLدر زاهدان که قبلا از آنها خون گرفته شده وموارد جدید که هم اکنون تحت درمان می باشند به تعداد حداقل 100 نفر . گروه شاهد از نمونه های خون کودکان سالم که قبلاً در طرح بررسی شیوع سندروم نفروتیک وارد مطالعه شده اند انتخاب شده است (حداقل 120نمونه).برای بررسی متیلاسیون وبیان ژن حداقل 30 نمونه بیمار و30 نمونه سالم مورد مطالعه قرار می گیرند.
روش نمونه گیری(نحوه تخصیص تصادفی و همسانسازی در صورت لزوم ذکر شود)روش نمونه گیری آسان در دسترس میباشد.
روش و ابزار جمع آوري داده ها / صحت و استحکام داده ها (پرسشنامه یا فرم اطلاعاتی ضمیمه شود)مشاهده و بررسی های آزمایشگاهی
روش اجرای طرح(با جزئیات بطور کامل شرح داده شود)پس از تصویب پروپوزال از بیمارانی که براساس معیارهای تشخیصی در آنها وافراد سالم خونگیری می‌شود. نمونه خون در 20- درجه سانتیگراد نگهداری می‌شود. DNA نمونه خون این افراد به روش Salting out تخلیص می‌شود،
پرایمرهای اختصاصیT - ARMS و ARM معمولی و یا RFLP طراحی شده وپس از بهینه سازی شرایط PCR ژنوتیپ گروه شاهد ومورد بااین روش موردارزیابی قرارمی گیرد. محصول PCR روی ژل آگارز 2% برده با اتیدیوم بروماید رنگ آمیزی گردیده و محصولات PCR مورد ارزیابی قرارگرفته وژنوتیپ افراد تعیین می گردد.برای بررسی متیلاسیون نیز پس از استخراج DNA از نمونه های خونی بابی سولفیت سدیم متیله شده و با روش MS-PCR متیلاسیون مورد بررسی قرار می گیرد . برای بررسی بیان ژن نیز ابتدا RNA توسط کیت مربوطه از نمونه ها استخراج وسپس از روی آنها cDNA ساخته می شود و سپس با تکنیک RT-PCR بیان ژن ها تعیین و مقایسه می گردند.
روش تجزیه، تحليل و توصیف داده‌ها (نمونه‌اي از جدول توخالي ضميمه شود و روش هاي آماري مورد استفاده به طور كامل توضيح داده شود)(کیفی و کمی)پس از گردآوری اطلاعات لازم، یافته‌ها در نرم‌افزار آماری SPSS وارد گشته و با استفاده از آزمون آماری t-test مستقل برای متغیرهای کمی و آزمون X2برای مقایسه فراوانی پلی مورفیسمها در دو گروه مورد استفاده قرار میگیرد .

ملاحظات اخلاقی با رضایت کامل از بیماران نمونه‌گیری می‌شود و تعهد می‌شود نام و مشخصات بیماران در هیچ‌ گزارشی قید نشود و انجام آزمایشات هیچ‌گونه هزینه‌ای برای بیمار نخواهد داشت.
(کدهای اخلاقی 1 و 17,2,24,)
محدودیتهای اجرائی طرح و پیش بینی جهت حل آنهامحدودیت طرح شامل عدم همکاری بعضی بیماران و افراد سالم می‌باشد.دعوت به همکاری از افراد بیشتر
کلمات کلیدیپلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی-متیلاسیون- لوسمی لنفوبلاستیک حاد -بیان ژن
Single Nucleotide Polymorphism(SNP)-Methylation-Acute Lymphoblastic Leukemia-Gene expression
فهرست منابع و مراجع•
• References:
1. Kamel AM, Moussa HS, Ebid GT, Bu RR, Bhatia KG. Synergistic effect of methyltetrahydrofolate reductase (MTHFR) C677T and A1298C polymorphism as risk modifiers of pediatric acute lymphoblastic leukemia. J Egypt Natl Canc Inst 2007;19(2):96-105.
2. Inaba H, Greaves M, Mullighan CG. Acute lymphoblastic leukaemia. Lancet 2013;381(9881):1943-55.
3. Robison LL. Late effects of acute lymphoblastic leukemia therapy in patients diagnosed at 0-20 years of age. Hematology Am Soc Hematol Educ Program 2011;2011:238-42.
4. Lautner-Csorba O, Gezsi A, Erdelyi DJ, Hullam G, Antal P, Semsei AF, et al. Roles of genetic polymorphisms in the folate pathway in childhood acute lymphoblastic leukemia evaluated by Bayesian relevance and effect size analysis. PLoS One 2013;8(8):e69843.
5. Li X, Liao Q, Zhang S, Chen M. Association of methylenetetrahytrofolate reductase (MTHFR) C677T and A1298C polymorphisms with the susceptibility of childhood acute lymphoblastic leukaemia (ALL) in Chinese population. Eur J Med Res 2014;19:5.
6. Ongaro A, De Mattei M, Della Porta MG, Rigolin G, Ambrosio C, Di Raimondo F, et al. Gene polymorphisms in folate metabolizing enzymes in adult acute lymphoblastic leukemia: effects on methotrexate-related toxicity and survival. Haematologica 2009;94(10):1391-8.
7. Metayer C, Scelo G, Chokkalingam AP, Barcellos LF, Aldrich MC, Chang JS, et al. Genetic variants in the folate pathway and risk of childhood acute lymphoblastic leukemia. Cancer Causes Control 2011;22(9):1243-58.
8. Ayad MW, El Naggar AA, El Naggar M. MTHFR C677T polymorphism: association with lymphoid neoplasm and effect on methotrexate therapy. Eur J Haematol 2014.
9. Karathanasis NV, Stiakaki E, Goulielmos G, Kalmanti M. The Effect of RFC G80A Polymorphism in Cretan children with acute lymphoblastic leukemia and its interaction with MTHFR C677T and A1298C polymorphisms. Int J Lab Hematol 2013.
10. Wang H, Wang J, Zhao L, Liu X, Mi W. Methylenetetrahydrofolate reductase polymorphisms and risk of acute lymphoblastic leukemia-evidence from an updated meta-analysis including 35 studies. BMC Med Genet 2012;13:77.
11. Lv L, Wu C, Sun H, Zhu S, Yang Y, Chen X, et al. Combined 677CC/1298AC genotypes of methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR ) reduce susceptibility to precursor B lymphoblastic leukemia in a Chinese population. Eur J Haematol 2010;84(6):506-12.
12. Krajinovic M, Lemieux-Blanchard E, Chiasson S, Primeau M, Costea I, Moghrabi A. Role of polymorphisms in MTHFR and MTHFD1 genes in the outcome of childhood acute lymphoblastic leukemia. Pharmacogenomics J 2004;4(1):66-72.
13. Krajinovic M, Lamothe S, Labuda D, Lemieux-Blanchard E, Theoret Y, Moghrabi A, et al. Role of MTHFR genetic polymorphisms in the susceptibility to childhood acute lymphoblastic leukemia. Blood 2004;103(1):252-7.
14. Hur M, Park JY, Cho HC, Lee KM, Shin HY, Cho HI. Methylenetetrahydrofolate reductase A1298C genotypes are associated with the risks of acute lymphoblastic leukaemia and chronic myelogenous leukaemia in the Korean population. Clin Lab Haematol 2006;28(3):154-9.
15. Kantar M, Kosova B, Cetingul N, Gumus S, Toroslu E, Zafer N, et al. Methylenetetrahydrofolate reductase C677T and A1298C gene polymorphisms and therapy-related toxicity in children treated for acute lymphoblastic leukemia and non-Hodgkin lymphoma. Leuk Lymphoma 2009;50(6):912-7.
16. Al-Shakfa F, Dulucq S, Brukner I, Milacic I, Ansari M, Beaulieu P, et al. DNA variants in region for noncoding interfering transcript of dihydrofolate reductase gene and outcome in childhood acute lymphoblastic leukemia. Clin Cancer Res 2009;15(22):6931-8.
17. Dulucq S, St-Onge G, Gagne V, Ansari M, Sinnett D, Labuda D, et al. DNA variants in the dihydrofolate reductase gene and outcome in childhood ALL. Blood 2008;111(7):3692-700.
18. Goto Y, Yue L, Yokoi A, Nishimura R, Uehara T, Koizumi S, et al. A novel single-nucleotide polymorphism in the 3'-untranslated region of the human dihydrofolate reductase gene with enhanced expression. Clin Cancer Res 2001;7(7):1952-6.
19. Gemmati D, De Mattei M, Catozzi L, Della Porta M, Serino ML, Ambrosio C, et al. DHFR 19-bp insertion/deletion polymorphism and MTHFR C677T in adult acute lymphoblastic leukaemia: is the risk reduction due to intracellular folate unbalancing? Am J Hematol 2009;84(8):526-9.
20. Galbiatti AL, Castro R, Caldas HC, Padovani JA, Jr., Pavarino EC, Goloni-Bertollo EM. Alterations in the expression pattern of MTHFR, DHFR, TYMS, and SLC19A1 genes after treatment of laryngeal cancer cells with high and low doses of methotrexate. Tumour Biol 2013;34(6):3765-71.
21. Horie N, Aiba H, Oguro K, Hojo H, Takeishi K. Functional analysis and DNA polymorphism of the tandemly repeated sequences in the 5'-terminal regulatory region of the human gene for thymidylate synthase. Cell Struct Funct 1995;20(3):191-7.
22. Kawakami K, Omura K, Kanehira E, Watanabe Y. Polymorphic tandem repeats in the thymidylate synthase gene is associated with its protein expression in human gastrointestinal cancers. Anticancer Res 1999;19(4B):3249-52.
23. Kawakami K, Salonga D, Park JM, Danenberg KD, Uetake H, Brabender J, et al. Different lengths of a polymorphic repeat sequence in the thymidylate synthase gene affect translational efficiency but not its gene expression. Clin Cancer Res 2001;7(12):4096-101.
24. Skibola CF, Smith MT, Hubbard A, Shane B, Roberts AC, Law GR, et al. Polymorphisms in the thymidylate synthase and serine hydroxymethyltransferase genes and risk of adult acute lymphocytic leukemia. Blood 2002;99(10):3786-91.
25. Petra BG, Janez J, Vita D. Gene-gene interactions in the folate metabolic pathway influence the risk for acute lymphoblastic leukemia in children. Leuk Lymphoma 2007;48(4):786-92.
26. de Jonge R, Tissing WJ, Hooijberg JH, Jansen G, Kaspers GJ, Lindemans J, et al. Polymorphisms in folate-related genes and risk of pediatric acute lymphoblastic leukemia. Blood 2009;113(10):2284-9.
27. Ouyang S, Liu Z, Li Y, Ma F, Wu J. Cystathionine beta-synthase 844ins68 polymorphism is unrelated to susceptibility to neural tube defects. Gene 2014;535(2):119-23.
28. Du SX, Xiao J, Guan F, Sun LM, Wu WS, Tang H, et al. Predictive role of cerebrospinal fluid hydrogen sulfide in central nervous system leukemia. Chin Med J (Engl) 2011;124(21):3450-4.
29. Borze I, Guled M, Musse S, Raunio A, Elonen E, Saarinen-Pihkala U, et al. MicroRNA microarrays on archive bone marrow core biopsies of leukemias--method validation. Leuk Res 2011;35(2):188-95.
30. Krajinovic M, Robaey P, Chiasson S, Lemieux-Blanchard E, Rouillard M, Primeau M, et al. Polymorphisms of genes controlling homocysteine levels and IQ score following the treatment for childhood ALL. Pharmacogenomics 2005;6(3):293-302.
31. Pabalan N, Jarjanazi H, Ozcelik H. A meta-analysis of the C1420T polymorphism in cytosolic serine hydroxymethyltransferase (SHMT1) among Caucasian colorectal cancer populations. Int J Colorectal Dis 2013;28(7):925-32.
32. Lightfoot TJ, Skibola CF, Willett EV, Skibola DR, Allan JM, Coppede F, et al. Risk of non-Hodgkin lymphoma associated with polymorphisms in folate-metabolizing genes. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 2005;14(12):2999-3003.
33. de Jonge R, Hooijberg JH, van Zelst BD, Jansen G, van Zantwijk CH, Kaspers GJ, et al. Effect of polymorphisms in folate-related genes on in vitro methotrexate sensitivity in pediatric acute lymphoblastic leukemia. Blood 2005;106(2):717-20.
34. Wang Y, Chen J, Li J, Deng J, Rui Y, Lu Q, et al. Association of three polymorphisms in ARID5B, IKZF1 and CEBPE with the risk of childhood acute lymphoblastic leukemia in a Chinese population. Gene 2013;524(2):203-7.
35. Ross JA, Linabery AM, Blommer CN, Langer EK, Spector LG, Hilden JM, et al. Genetic variants modify susceptibility to leukemia in infants: a Children's Oncology Group report. Pediatr Blood Cancer 2013;60(1):31-4.
36. Swafford AD, Howson JM, Davison LJ, Wallace C, Smyth DJ, Schuilenburg H, et al. An allele of IKZF1 (Ikaros) conferring susceptibility to childhood acute lymphoblastic leukemia protects against type 1 diabetes. Diabetes 2011;60(3):1041-4.
37. Prasad RB, Hosking FJ, Vijayakrishnan J, Papaemmanuil E, Koehler R, Greaves M, et al. Verification of the susceptibility loci on 7p12.2, 10q21.2, and 14q11.2 in precursor B-cell acute lymphoblastic leukemia of childhood. Blood 2010;115(9):1765-7.
38. Martinelli G, Iacobucci I, Storlazzi CT, Vignetti M, Paoloni F, Cilloni D, et al. IKZF1 (Ikaros) deletions in BCR-ABL1-positive acute lymphoblastic leukemia are associated with short disease-free survival and high rate of cumulative incidence of relapse: a GIMEMA AL WP report. J Clin Oncol 2009;27(31):5202-7.
39. Iacobucci I, Storlazzi CT, Cilloni D, Lonetti A, Ottaviani E, Soverini S, et al. Identification and molecular characterization of recurrent genomic deletions on 7p12 in the IKZF1 gene in a large cohort of BCR-ABL1-positive acute lymphoblastic leukemia patients: on behalf of Gruppo Italiano Malattie Ematologiche dell'Adulto Acute Leukemia Working Party (GIMEMA AL WP). Blood 2009;114(10):2159-67.
40. Musialik E, Bujko M, Wypych A, Matysiak M, Siedlecki JA. TET2 Promoter DNA Methylation and Expression Analysis in Pediatric B-cell Acute Lymphoblastic Leukemia. Hematol Rep 2014;6(1):5333.
41. Yan L, Ping N, Zhu M, Sun A, Xue Y, Ruan C, et al. Clinical, immunophenotypic, cytogenetic, and molecular genetic features in 117 adult patients with mixed-phenotype acute leukemia defined by WHO-2008 classification. Haematologica 2012;97(11):1708-12.
42. Hubbeling HG, Frank DM, Hexner EO. Myelofibrosis 2012: it's complicated. Ther Adv Hematol 2012;3(3):131-46.
43. Chung YR, Schatoff E, Abdel-Wahab O. Epigenetic alterations in hematopoietic malignancies. Int J Hematol 2012;96(4):413-27.
44. Yu K, Fan J, Ding X, Li C, Wang J, Xiang Y, et al. Association study of a functional copy number variation in the WWOX gene with risk of gliomas among Chinese people. Int J Cancer 2014.
45. Hezova R, Ehrmann J, Kolar Z. WWOX, a new potential tumor suppressor gene. Biomed Pap Med Fac Univ Palacky Olomouc Czech Repub 2007;151(1):11-5.
46. Zheng S, Ma X, Zhang L, Gunn L, Smith MT, Wiemels JL, et al. Hypermethylation of the 5' CpG island of the FHIT gene is associated with hyperdiploid and translocation-negative subtypes of pediatric leukemia. Cancer Res 2004;64(6):2000-6.
47. Cui Z, Lin D, Cheng F, Luo L, Kong L, Xu J, et al. The role of the WWOX gene in leukemia and its mechanisms of action. Oncol Rep 2013;29(6):2154-62.
48. Hallas C, Albitar M, Letofsky J, Keating MJ, Huebner K, Croce CM. Loss of FHIT expression in acute lymphoblastic leukemia. Clin Cancer Res 1999;5(9):2409-14.
49. Dumon KR, Ishii H, Fong LY, Zanesi N, Fidanza V, Mancini R, et al. FHIT gene therapy prevents tumor development in Fhit-deficient mice. Proc Natl Acad Sci U S A 2001;98(6):3346-51.
50. Roz L, Gramegna M, Ishii H, Croce CM, Sozzi G. Restoration of fragile histidine triad (FHIT) expression induces apoptosis and suppresses tumorigenicity in lung and cervical cancer cell lines. Proc Natl Acad Sci U S A 2002;99(6):3615-20.
51. Bisso A, Collavin L, Del Sal G. p73 as a pharmaceutical target for cancer therapy. Curr Pharm Des 2011;17(6):578-90.
52. Zawacka-Pankau J, Kostecka A, Sznarkowska A, Hedstrom E, Kawiak A. p73 tumor suppressor protein: a close relative of p53 not only in structure but also in anti-cancer approach? Cell Cycle 2010;9(4):720-8.

•
معرفی پژوهش/ اهداف پژوهش
(عین عبارت هدف پروپوزال را کپی نکنید. بلکه با جملاتی که برای مردم قابل فهم باشد (برای سواد حدود پنجم ابتدایی )هدف را برای شرکت کنندگان توضیح دهید.) در تمام این متن در صورتیکه شرکت کننده کودک یا فرد فاقد ظرفیت تصمیم گیری است باید مواردیکه منظور از "من"، فرد شرکت کننده بوده است به "کودک" یا "فرد تحت سرپرستی من" اصلاح شود و مواردیکه منظور از "من"، رضایت دهنده است به من به عنوان "ولی" یا "قیم قانونی" اصلاح شود.
خون گیری
(آیا طرح شما نیاز به خونگیری دارد یا خیر)
نحوه همکاری/ مزایا ی طرح
(در این بخش برای شرکت کنندگان به زبان ساده توضیح دهید که: چه مداخله ای بر روی آنها صورت میگیرد. چه اقدامات پاراکلینیکی بر روی آنها انجام میشود. چه نمونه ای و با چه حجمی از آنها میگیرید در این مدت چند نوبت مراجعه باید داشته باشند و به چه فواصلی چه اقداماتی را در پیگیری آنها انجام میدهید. (حتی میتوانید سود بالقوه ای که شرکت کنندگان میتوانند از شرکت در این پژوهش ببرند بنویسید. این سود میتواند شرح احتمال درمان یا تشخیص بهتر بیماریشان، دریافت خدمات سلامت رایگان و یا پرداخت مشوق مالی در ازای جبران همکاریشان باشد)
عوارض جانبی
(منظور عوارض و میزان احتمال بروز آنها در این مطالعه است)
جبران عوارض احتمالی
(برای آنکه شرکت کننده بتواند ارزیابی مناسبی از سود و زیان شرکت در پژوهش شما داشته باشد لازم است بتواند سود و زیان مداخلات معمول و مداخلات این پژوهش را مقایسه کند. به عنوان مثال میزان موفقیت و میزان عوارض هریک را مقایسه کند.) - او باید بداند كه اگر در حين و بعد از انجام پژوهش هم هر مشكلي اعم از جسمي و روحي به علت شرکت در اين پژوهش برایش پيش آمد درمان عوارض، و هزينه‌هاي آن و غرامت مربوطه بر عهده مجري خواهد بود.
هزینه های مربوط به انجام طرح تحقیقاتی
(تمام مداخلات پژوهشی باید برای بیمار رایگان باشد و بیمار بداند شامل چه مواردی هستند. )
روش های جایگزین
در صورت عدم تمایل به شرکت در مطالعه چه روش های درمانی برای بیمار ارائه خواهد شد
محرمانه بودن
بیمار باید بداندکه دست اندر كاران اين پژوهش، كليه اطلاعات مربوط به او را نزد خود به صورت محرمانه نگه‌داشته و فقط اجازه دارند نتايج كلي و گروهي اين پژوهش را بدون ذکر نام و مشخصات بیمار منتشر كنند. و كميته اخلاق در پژوهش با هدف نظارت بر رعایت حقوق وی مي‌تواند به اطلاعات ایشان دسترسي داشته باشد.
پاسخگویی به پرسش ها
در این بخش نام و اطلاعات دسترسی فردی از عوامل پژوهش را که بتواند اطلاعات صحیح و کافی در اختیار شرکت کنندگان قرار دهند و در مورد عوارض و نگرانیها راهنمایی لازم را ارائه دهند ذکر شود
حق نپذیرفتن یا انصراف
بیمار باید بداند که شرکت اودر اين پژوهش کاملاً داوطلبانه است و مجبور به شرکت در اين پژوهش نيست و در صورت عدم شرکت از مراقبت‌هاي معمول تشخيصي و درماني محروم نخواهد شد او باید بداند كه حتي پس از موافقت با شركت در پژوهش مي‌تواند هر وقت كه بخواهد، پس از اطلاع به مجري، از پژوهش خارج شود و خروج اواز پژوهش باعث محرومیت از دریافت خدمات درمانی معمول برای اونخواهد شد.
رضایت
او باید بداند که اگر اشکال يا اعتراضي نسبت به دست اندركاران يا روند پژوهش دارد مي تواند با كميته اخلاق در پژوهش دانشگاه تماس گرفته و مشکل خود را به صورت شفاهي يا كتبي مطرح نمايد. در انتهای فرم قید گردد : اينجانب موارد فوق‌الذکر را خواندم و فهميدم و بر اساس آن رضايت آگاهانه خود را براي شركت در اين پژوهش اعلام مي‌کنم. اينجانب ……………… خود را ملزم به اجراي تعهدات مربوط به مجري در مفاد فوق دانسته و متعهد مي‌گردم در تأمين حقوق و ايمني شركت كننده در اين پژوهش تلاش نمايم
تخصص
عنوان پیام پژوهشی ( حداکثر 20 کلمه)
پیام کلیدی (حداکثر 80 کلمه)
متن پیام پژوهشی ( حداکثر240 کلمه)
اهمیت موضوع(50 کلمه)
مهمترین نتایج طرح به زبان غیر تخصصی(70 کلمه)
موارد کاربرد نتایج طرح (80 کلمه)
تأثیرات و کاربردها
محدودیت‌های شواهد چه بودند؟
آیا این خبر می‌تواند از نظر اجتماعی، سیاسی، فرهنگی، بهداشتی، ارزش های دینی و قوانین سازمان غذا و دارو، تبعاتی داشته‌باشد؟
در صورتی که این طرح منتج به مقاله شده است لینک مقاله درج شود
منابع و مراجع : حداکثر چهار مرجع اصلی استفاده شده در طرح تحقیقاتی مورد نظر را ذکر نمایید
پرسشنامه یا فرم اطلاعاتی

پیوست ها
hide/show

نام فایل تاریخ درج فایل اندازه فایل دانلود
Proposal doctori.doc1393/02/29678400دانلود
Rezayat Nameh.doc1393/02/2993696دانلود
Answer to Referri.docx1393/04/0316430دانلود
Proposal Final.doc1393/04/03684544دانلود
Proposal Final.doc1393/04/11689664دانلود
pasokh eslahieh.docx1393/04/1110629دانلود
Proposal eslahshode komite akhlaghl.docx1393/04/25252869دانلود