چاپ صفحه |  صفحه نخست سامانه |  مجری و همکاران |  اطلاعات تفضیلی |  دانلود | علوم پزشکی زاهدان |
| کد طرح | 6923 |
| عنوان فارسی طرح | بررسی پلی مورفیسم های rs861019 و rs2235371 ژن IRIF6 و rs17563 ژن BMP4 و rs3923086 و rs7224837 ژن AXIN2 در مبتلایان به شکاف لب و/یا شکاف کام غیر سندرمی در جمعیت استان سیستان و بلوچستان |
| عنوان لاتین طرح | Evaluation of IRIF6 rs861019 , rs2235371 & BMP4 rs17563 & AXIN2 rs3923086 , rs7224837 Polymorphisms in Non Syndromic Cleft lip and/or palate in Sistan & Baloochestan Population |
| نوع طرح | کاربردی |
| محل اجرای طرح | مدیریت توسعه فناوری سلامت |
| رسته مطالعاتی | مورد شاهدی |
| دانشکده/مرکز | دانشکده پزشکی زاهدان |
| زمان اجرا -روز | 365 |
| نام و نامخانوادگی | سمت در طرح | نوع همکاری | درجهتحصیلی | پست الکترونیک |
|---|---|---|---|---|
| هوشنگ رفیقدوست | مجری | دکترای تخصصی | rafighdoosth@yahoo.com | |
| محمد هاشمی | همکار | دکترا - PHD | mhd.hashemi@gmail.com | |
| محسن طاهری | همکار | دکترای تخصصی | taheri@zaums.ac.ir | |
| غلامرضا بهاری | همکار | دکترای تخصصی | r_b_1333@yahoo.com |
| عنوان | متن |
|---|---|
| خلاصه طرح به فارسی | بررسی پلی مورفیسم های rs861019 و rs2235371 ژن IRIF6 و rs17563 ژن BMP4 و rs3923086 و rs7224837 ژن AXIN2 در مبتلایان به شکاف لب و/یا شکاف کام غیر سندرمی در جمعیت استان سیستان و بلوچستان |
| خلاصه طرح به لاتین | Evaluation of IRIF6 rs861019 , rs2235371 & BMP4 rs17563 & AXIN2 rs3923086 , rs7224837 Polymorphisms in Non Syndromic Cleft lip and/or palate in Sistan & Baloochestan Population |
| بيان مسئله تحقيق/اهمیت پژوهش | شکاف های دهانی غیرسندرمیک جزو بیشترین آنومالیهای مادرزادی در تولدهای زنده است . و شامل دو نوع جداگانه است : شکاف لب با و بدون شکاف کام (CL/P) و شکاف کام به تنهایی (CPO) . شکاف لب آسیبی است مادرزادی که بصورت شکافی در لب فوقانی خودنمایی می کند . شکاف مذبور ممکنست تمام یا قسمتی از لب را فرا گرفته و گاهی یکطرفه و زمانی دوطرفه باشد . پاره ای از موارد نوزادی متولد می شود که شکافی در سقف دهان دارد.این شکاف ممکنست سرتاسر کام و یا قسمتی از آن را فرا گیرد، برخی اوقات یک طرفه و زمانی دو طرفه می باشد . ناهنجاری مزبور مادرزادی است و گاهی به تنهایی دیده میشود و زمانی هم توام با شکاف لب ظاهر می گردد .(1)
CPO شیوع کمتری داشته و به مقدار 1 به ازای 1500 تولد زنده ، در بیشترین میزان بروز است . در مقابل CL/P میزان شیوع تقریبا" 2-1 به ازای 1000 تولد زنده دارد .که این میزان در آسیایی ها نسبت به اروپائیها و آفریقاییها بیشتر است . فراوانی شکاف لب در ایران 1163/1 است .(2) از نظر تکامل جنینی در پایان هفته چهارم برجستگیهای صورتی ظاهر میشوند . در طی هفته پنجم، پلاکودهای ( ضخیم شدگی های ) بینی به داخل می روند و گوده های بینی را بوجود می آورند . در طی دو هفته بعد ، برجستگیهای ماگزیلا ( فک بالایی ) بزرگ میشوند و در همین هنگام به سمت داخل هم رشد می کنند و برجستگیهای میانی بینی را به طرف خط وسط می فشارند سپس شکاف بین برجستگی میانی بینی و برجستگی ماگزیلاری از بین می رود، و این دو به هم جوش می خورند . بنابراین لب بالایی توسط دو برجستگی میانی و دو برجستگی ماگزیلاری تشکیل میشوند . ساختاری که از ادغام دو برجستگی ماگزیلاری تشکیل می شود، قطعه بین دو ماگزیلا ( Inter maxillary segment ) نام دارد . گرچه کام اولیه از قطعه بین دو ماگزیلا مشتق می شود، بخش اصلی کام نهایی توسط دو بیرون زدگی طاقچه مانند از برجستگیهای ماگزیلاری ساخته می شود . در هفته هفتم این زوائد بالا می روند تا در بالای زبان بصورت افقی در آیند و به یکدیگر متصل شده، کام ثانویه را ایجاد کنند . این اتصال در هفته هشتم شروع و در هفته دوازدهم کامل می شود .(3) لب شکری به علت نچسبیدن یا اتصال ناقص برجستگی ماگزیلاری به برجستگی میانی بینی در یک طرف یا دو طرف ایجاد می شوند .(3) کام شکری به علت نچسبیدن طاقچه های کامی به یکدیگر ایجاد میشود . معلوم شده است که طاقچه های کامی در جنس مونث تقریبا" یک هفته دیرتر از جنس مذکر به هم می چسبند . این مساله می تواند توجیهی برای شیوع بیشتر کام شکری منفرد در جنس مونث باشد .(4) اتیولوژی شکافهای دهانی مخلوطی از فاکتورهای ژنتیکی و محیطی است . در بیماران با جمعیت های مختلف که سابقه خانوادگی مثبت دارند، فاکتورهای ژنتیکی نقش مهمی در تولدهای زنده همراه با این مشکل ایفاء می کنند . محققین در سالهای اخیر به این نتیجه رسیده اند که فاکتورهای ژنتیکی مشخص، یک محیط مناسب برای اثر فاکتورهای محیطی خارجی ایجاد می کنند که این باعث شروع مکانیسم آنها میشود و هر دو با هم شکاف را ایجاد می کنند .(5) ژن IRIF6 (Interferon Regulatory Factor – 6 ) بر روی کروموزوم 1q32 قرار داشته و نقش کلیدی در شکل گیری طبیعی صورت ایفاء می کند . این ژن در در لبه های داخلی صفحات کامی بیان شده و باعث اتصال آنها به یکدیگر و شکل گیری کام ثانویه می شود .(6) ژن BMP4 ) Bone Morphogenetic Protein 4 ( بر روی کروموزوم 14q22-q23 قرار داشته و نقش مهمی در تکامل لب و رشد کام ثانویه ایفاء می کند . این ژن در اپی تلیال زوائد ماندیبول و ماگزیلا بیان شده و در بافت مزانشیمال اطراف فرونتونازال و زوائد جانبی ماگزیلاری به عنوان عامل تنظیم کننده در چسبیدن لب فوقانی به زوائد صورت ایفای نقش می کند .(7) ژن AXIN2 ) Axis or Axil Inhebition Protein 2 ( بر روی کروموزوم 17q21-q25 قرار داشته و جهش این ژن در بروز نقائص دندانی، همچنین بدشکلیهای فک دیده می شود . پروتئین AXIN2 که در انسان توسط ژن AXIN2 کد می شود، عامل اصلی برای فسفوریلاسیون –actinβ می باشد . AXIN2 در طول ادنتوژنزیس در مزانشیم لایه های زیرین اپی تلیوم فک بالایی و پایینی، جوانه دندانی و همچنین در مزانشیم ادنتوبلاستها و پری ادنتوبلاستها بیان می شود . نقص پروتئین ساخته شده از AXIN2 می تواند عوارض دندانی و فک و صورت را ایجاد کند .(8) بررسی متون و مقالات گذشته : در مطالعه ای که در سالهای 2006-2003 توسط دکتر یاسایی وهمکارانش از دانشگاه علوم پزشکی شهید صدوقی یزد بر روی نوزادان تازه متولد شده در 12 بیمارستان شهرستان یزد انجام شد نتیجه این بود که شیوع شکاف لب و کام در یزد 86/0 به ازای 1000 تولد زنده می باشد .(2) مطالعه ای در سال 2012 توسط Chen Q و همکارانش در کشور چین انجام شد. این مطالعه روی 221 تریوز آسیایی برای 3 SNPs شامل rs10130587, rs2738265 , rs2761887 و در 76 تریوز مریلندی برای SNP rs762642 از ژن BMP4 انجام شد. که نتایج حاصله در مورد rs 10130587 و ارتباطش با CL/P غیرسندرمیک در جمعیت آسیائیها معنی دار بود .(7) مطالعه ای در سال 2008 توسط Lin JY و همکارانش در کشور چین انجام شد. که یک مطالعه موردی-شاهدی روی پلی مورفیسم های ژن BMP4 در جمعیت بچه های چینی بود. ژنوتیپ 184 فرد دارای شکاف غیرسندرمیک و 205 فرد سالم به روش PCR-RFLP مورد مطالعه قرار گرفت و نتایج تفاوت معناداری را از نظر ژنوتیپ و آلل در پلی مورفیسم های BMP4 در مقایسه جمعیت بیمار و شاهد نشان داد. پلی مورفیسم 538 T/C از ژن BMP4 می تواند ریسک ابتلاء به nsCL/P را افزایش دهد .(1) مطالعه ای در سال 2009 توسط Letra A و همکارانش در کشور آمریکا انجام شد. آنها ارتباط آژنزی دندانی و شکاف های دهانی را با پلی مورفیسم های ژن AXIN2 در 500 فرد دارای عارضه و 500 فرد سالم مورد بررسی و مطالعه قرار دادند. نتایج در مقایسه دو گروه سالم و بیمار ارتباط معناداری بین شکاف کام ناکامل و AXIN2 را نشان داد . وبین AXIN2 و شکاف لب و کام یکطرفه سمت راست همراه با آژنزی دندانی ارتباط معنادار نبود .(3) مطالعه ای در سال 2010 توسط Pan Y و همکارانش در چین انجام شد. آنها ارتباط پلی مورفیسم های ژن IRIF6 با شکاف های دهانی را در جمعیت منطقه Han این کشور مورد بررسی قرار دادند. نهایتا" گزارش کردند جهش هایی که در IRIF6 اتفاق می افتد ریسک ابتلاء به NSOC را در این جمعیت افزایش داده است .(6) مطالعه ای در سال 2011 توسط Salahshourifar I و همکارانش در مالزی انجام شد. آنها نقش پلی مورفیسم های ژن IRIF6 را در ابتلاء جمعیت این کشور به CL/P غیر سندرمیک مورد بررسی قرار دادند. نتایج حاصله نشان دهنده نقش جهش های این ژن در ریسک ابتلاء به CL/P در جمعیت جنوب آسیا بود .(9) این نقص که به صورت سندرمیک وغیرسندرمیک بروز کرده ازلحاظ شناسایی عوامل ایجادکننده بسیارپیچیده است. این ناهنجاری عوارض فردی واجتماعی متعدد و درازمدتی رادرپی دارد. مبتلایان با احتساب وقت وهزینه بالا دوره طولانی از عمرشان را باید صرف درمان های جراحی، دندانی فکی، گفتاردرمانی و سایکولوژیک ناشی از این ناهنجاری ها نمایند. در کشورهایی نظیر آمریکا ، کانادا ، لهستان ، چین ، اسلونی تحقیقات فراوانی بر روی اتیولوژی ژنتیکی این بیماران انجام گرفته است که به نقش این ژنها در استعداد ابتلا به این بیماری اشاره داشته بر این اساس ما بر آن شدیم که در این استان که ازدواج های فامیلی درصد بالایی از ازدواج ها را به خود اختصاص می دهد بیماران مبتلا به شکاف لب و کام را از نظر بررسی پلی مورفیسم های IRIF6 ، BMP4 و AXIN2 مورد مطالعه و بررسی قرار دهیم و ببینیم که این پلی مورفیسم در برابر ابتلا به بیماری شکاف کام ولب نقش محافظتی دارد یا اینکه به عنوان یک عامل مستعد کننده عمل می کنند. |
| سوالات و / یا فرضیات پژوهش | 1- توزیع فراوانی پلی مورفیسم های rs861019 و rs2235371 ژن IRIF6 در مبتلایان به شکاف لب و/یا کام غیرسندرمیک در مقایسه با افراد سالم متفاوت است .
2- توزیع فراوانی پلی مورفیسم rs17563 ژن BMP4 در مبتلایان به شکاف لب و/یا کام غیرسندرمیک در مقایسه با افراد سالم متفاوت است . 3- توزیع فراوانی پلی مورفیسم های rs3923086و rs7224837ژن AXIN2 در مبتلایان به شکاف لب و/یا کام غیرسندرمیک در مقایسه با افراد سالم متفاوت است . |
| هدف کلی طرح | بررسی پلی مورفیسم های rs861019 و rs2235371 ژن IRIF6 و rs17563 ژن BMP4 و rs3923086 و rs7224837 ژن AXIN2 در مبتلایان به شکاف لب و/یا شکاف کام غیر سندرمی در جمعیت استان سیستان و بلوچستان |
| اهداف اختصاصی | 1- مقایسه فراوانی پلی مورفیسم های rs861019 و rs2235371 ژن IRIF6 در مبتلایان به شکاف لب و/یا کام غیر سندرمی با افراد سالم
2- مقایسه فراوانی پلی مورفیسم های rs17563 ژن BMP4در مبتلایان به شکاف لب و/یا کام غیر سندرمی با افراد سالم 3- مقایسه فراوانی پلی مورفیسم های rs3923086 و rs7224837ژن AXIN2 در مبتلایان به شکاف لب و/یا کام غیر سندرمی با افراد سالم |
| سازمانها، مراکز و موسسات و سایر بهره برداران بالقوه دستاوردهای طرح | |
| تعریف واژه های تخصصی | SNP : پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی که یک نوکلئوتید جایگزین نوکلئوتید دیگر می شود .
• آنومالی : ناهنجاری • CL/P : شکاف لب و/یا شکاف کام • CPO : شکاف کام به تنهایی • کرانیوفاسیال : استخوانهای سر و صورت • موتاسیون : جهش |
| نوع مطالعه | موردی – شاهدی ( Case – Control ) |
| جامعه مورد مطالعه(معرفی مشارکت کنندگان)/ محیط پژوهش(معیارهای ورود و خروج ذکر شوند) | • افراد مبتلاء به شکاف لب و/یا کام غیرسندرمیک بومی سیستانی و بلوچ کلیه مبتلایان به شکاف لب و/یا کام غیرسندرمی مراجعه کننده به کلنیک ENT و نوزادان دارای شکاف لب و/یا کام غیرسندرمیک تازه متولد شده در سطح زایشگاههای استان در گروه افراد بیمار قرار می گیرند. . معیارهای خروج افراد از مطالعه : • بیماران دارای قومیتی غیر از سیستانی و بلوچ • بیماران مبتلاء به شکافهای سندرمیک گروه شاهد : افراد سالم که هیچگونه عارضه و شکاف مادرزادی در صورت نداشته باشند در گروه شاهد قرار می گیرند . |
| حجم نمونه و روش محاسبه آن | با توجه به محدودیت زمانی و افزایش هزینه طرح ٬ حجم نمونه 100 نفر در نظر گرفته شد تا در تجزیه و تحلیل آماری
نیز خللی ایجاد نگردد و نمونه گیری بصورت آسان (حداقل 100 نفر بیمار و 100 نفر سالم) انجام می شود. |
| روش نمونه گیری(نحوه تخصیص تصادفی و همسانسازی در صورت لزوم ذکر شود) | نمونه گیری آسان و در دسترس برای نمونه های کنترل و شاهد |
| روش و ابزار جمع آوري داده ها / صحت و استحکام داده ها (پرسشنامه یا فرم اطلاعاتی ضمیمه شود) | مشاهده و بررسی های آزمایشگاهی |
| روش اجرای طرح(با جزئیات بطور کامل شرح داده شود) | پس از تصویب پروپوزال پرایمرهای اختصاصی برای بررسی پلی مورفیسم ها جهت تعیین پلی مورفیسم های rs861019 و rs2235371 ژن IRIF6 و rs17563 ژن BMP4 و rs3923086 و rs7224837 ژن AXIN2 طراحی می شود. در مرحله بعد شرایط PCR برای تعیین این پلی مورفیسم ها بهینه شده، سپس پلی مورفیسم ها ی ژنی ذکر شده درDNA نمونه خون افراد گروه شاهد و مورد (که به روش salting out تخلیص شده) با این تکنیک آنالیز می شوند . |
| روش تجزیه، تحليل و توصیف دادهها (نمونهاي از جدول توخالي ضميمه شود و روش هاي آماري مورد استفاده به طور كامل توضيح داده شود)(کیفی و کمی) | پس از گردآوری اطلاعات لازم، یافته ها در نرم افزار آماری SPSS وارد گشته و داده ها با استفاده از آزمون های آماری χ2 مورد تجزیه و تحلیل قرار خواهند گرفت. |
| ملاحظات اخلاقی | کدهای 1(هدف اصلی پژوهش ارتقای سلامت انسانها توأم با رعایت کرامت و حقوق ایشان است)
2(در پژوهش بر آزمودنی انسانی، سلامت و ایمنی فرد فرد آزمودنیها در طول و بعد از اجرای پژوهش، بر تمامی مصالح دیگر اولویت دارد ) 14و15و16و13(کسب رضایت آگاهانه و آزادانه و موارد مربوط به آن) 25( حفظ رازداری) در طرح رعایت می شود. |
| محدودیتهای اجرائی طرح و پیش بینی جهت حل آنها | • عدم همکاری بیماران و خانواده هایشان در روند نمونه گیری ،که با توضیح اهمیت پژوهش و آموزش صحیح میتوان آنرا تسهیل نمود .
• مطالعه بیماران دارای عارضه غیر سندرمیک می تواند در تعداد نمونه ها محدودیت ایجاد کند که با افزایش زمان اختصاص یافته جهت نمونه گیری می توان به تعداد نمونه واجد شرایط دست یافت . • مشکل تهیه مواد وامکان طولانی شدن زمان دریافت آنها |
| کلمات کلیدی | پلی مرفیسم - شکاف لب و شکاف کام- IRIF6- BMP4- AXIN2 |
| فهرست منابع و مراجع | 1. Lin JY, Chen YJ, Huang YL, Tang GP, Zhang L, Deng B, et al. Association of bone morphogenetic protein 4 gene polymorphisms with nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate in Chinese children. DNA Cell Biol. 2008 Nov;27(11):601-5. 2. Yassaei S, Mehrgerdy Z, Zareshahi G. Prevalence of cleft lip and palate in births from 2003 - 2006 in Iran. Community Dent Health. 2010 Jun;27(2):118-21. 3. Letra A, Menezes R, Granjeiro JM, Vieira AR. AXIN2 and CDH1 polymorphisms, tooth agenesis, and oral clefts. Birth Defects Res A Clin Mol Teratol. 2009 Feb;85(2):169-73. 4. Rojas-Martinez A, Reutter H, Chacon-Camacho O, Leon-Cachon RB, Munoz-Jimenez SG, Nowak S, et al. Genetic risk factors for nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate in a Mesoamerican population: Evidence for IRF6 and variants at 8q24 and 10q25. Birth Defects Res A Clin Mol Teratol. 2010 Jul;88(7):535-7. 5. Wu T, Liang KY, Hetmanski JB, Ruczinski I, Fallin MD, Ingersoll RG, et al. Evidence of gene-environment interaction for the IRF6 gene and maternal multivitamin supplementation in controlling the risk of cleft lip with/without cleft palate. Hum Genet. 2010 Oct;128(4):401-10. 6. Pan Y, Ma J, Zhang W, Du Y, Niu Y, Wang M, et al. IRF6 polymorphisms are associated with nonsyndromic orofacial clefts in a Chinese Han population. Am J Med Genet A. 2010 Oct;152A(10):2505-11. 7. Chen Q, Wang H, Hetmanski JB, Zhang T, Ruczinski I, Schwender H, et al. BMP4 was associated with NSCL/P in an Asian population. PLoS One. 2012;7(4):e35347. 8. Letra A, Bjork B, Cooper ME, Szabo-Rogers H, Deleyiannis FW, Field LL, et al. Association of AXIN2 with non-syndromic oral clefts in multiple populations. J Dent Res. 2012 May;91(5):473-8. 9. Salahshourifar I, Sulaiman WA, Zilfalil BA, Halim AS. Contribution of variants in and near the IRF6 gene to the risk of nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate in a Malay population. Am J Med Genet A. 2011 Sep;155A(9):2302-7. |
| پرسشنامه یا فرم اطلاعاتی |
| نام فایل | تاریخ درج فایل | اندازه فایل | دانلود |
|---|---|---|---|
| pasokh.docx | 1393/04/17 | 12959 | دانلود |
| eslah shode.docx | 1393/04/18 | 123702 | دانلود |
