بررسی پلی مورفیسم ژن های MSMB (rs10993994, rs12770171, rs10994385) و PRKCI (rs4955720, rs546950) در افراد مبتلا به سرطان پروستات نسبت به افراد سالم.

Evaluation of genetic polymorphisms of MSMB (rs10993994, rs12770171, rs10994385) and PRKCI (rs4955720, rs546950) genes in people with prostate cancer and compare with healthy ones.


چاپ صفحه 		پژوهان
صفحه نخست سامانه		 مجری و همکاران
مجری و همکاران		 اطلاعات تفضیلی
اطلاعات تفضیلی		 دانلود
دانلود 		علوم پزشکی زاهدان
علوم پزشکی زاهدان

مجریان: محمد هاشمی

کلمات کلیدی:

اطلاعات کلی طرح
hide/show

کد طرح 7080
عنوان فارسی طرح بررسی پلی مورفیسم ژن های MSMB (rs10993994, rs12770171, rs10994385) و PRKCI (rs4955720, rs546950) در افراد مبتلا به سرطان پروستات نسبت به افراد سالم.
عنوان لاتین طرح Evaluation of genetic polymorphisms of MSMB (rs10993994, rs12770171, rs10994385) and PRKCI (rs4955720, rs546950) genes in people with prostate cancer and compare with healthy ones.
نوع طرح
محل اجرای طرح مدیریت توسعه فناوری سلامت
رسته مطالعاتی بنیادی
دانشکده/مرکز دانشگاه علوم پزشکی
زمان اجرا -روز 366

اطلاعات مجری و همکاران
hide/show

نام و نام‌خانوادگی سمت در طرح نوع همکاری درجه‌تحصیلی پست الکترونیک
غزاله شاهکارهمکار gh.shahkar@yahoo.com
محمد هاشمیمجریاستاد راهنمادکترا - PHDmhd.hashemi@gmail.com

اطلاعات تفضیلی
hide/show

عنوان متن
خلاصه طرح به فارسی بررسی پلی مورفیسم ژن های MSMB (rs10993994, rs12770171, rs10994385) و PRKCI (rs4955720, rs546950) در افراد مبتلا به سرطان پروستات نسبت به افراد سالم.
خلاصه طرح به لاتینEvaluation of genetic polymorphisms of MSMB (rs10993994, rs12770171, rs10994385) and PRKCI (rs4955720, rs546950) genes in people with prostate cancer and compare with healthy ones.
بيان مسئله تحقيق/اهمیت پژوهشسرطان پروستات (prca) یکی از شایع ترین بدخیمی ها در کشورهای توسعه یافته است و سومین عامل مرگ و میر وابسته به سرطان در میان مردان می باشد. ریسک فاکتور های این بیماری افزایش سن، سابقه خانوادگی و اصل و نسب آفریقایی است.(1)
در مردان آفریقا آمریکا 6/234 نفر در هر 100 هزار نفر و در مردان اروپا آمریکا 4/150 نفر در هر 100 هزار نفر مبتلا به این بیماری اند و در آفریقا آمریکا 3/62 نفر در 100 هزار نفر و در اروپا آمریکا 6/25 نفر در 100 هزار نفر منجر به مرگ داشتند.(2)
هفت جایگاه مرتبط با سرطان پروستات روی کروموزوم های 3، 6، 7، 10، 11، 19 و X گزارش شده است. خطر بروز سرطان پروستات در مورد بستگان درجه اول مردان دو برابر دیگران می باشد.(3) علت سرطان پروستات پیچیده است ولی این سرطان با پلی مورفیسم در 3 ژن کد کننده محصولات پروستات در ارتباط است. ژن KLK2 (کدکننده پپتید مرتبط با Kallikrein2 یا hlk2) ژن KLK3 (کدکننده آنتی ژن اختصاصی پروستات PSA) و ژن MSMB (کدکننده B-میکروسمینو پروتئین). PSA و hk2 دو عضو خانواده سرین پروتئازها هستند که توسط ژن های KLK2 و KLK3 روی کروموزوم q19 کد می شوند و در افراد مبتلا به سرطان پروستات افزایش می یابند. به علاوه گزارش شده است که پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی در KLK2 و همولوگ KLK3 با سرطان پروستات در ارتباط است.
PSA و hk2 به عنوان بیومارکرهایی برای تشخیص سرطان پروستات استفاده می شود و افزایش آن ها یک ریسک فاکتور برای ابتلا به سرطان پروستات است.(4)
پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی یا SNP (single nucleotide polymorphism) تغییرات تک نوکلئوتیدی در توالی DNA است که سبب ایجاد ژنوتیپ های مختلف می شود.طبق مطالعات انجام شده این تغییرات ژنتیکی ممکن است ریسک ابتلا به برخی بیماری ها از جمله سرطان ها را در جمعیت هایی با ژنوتیپ خاصی افزایش دهند.(5)

MSMB ژنی است که روی کروموزوم شماره 10 قرار دارد. ((10q 11.2. محصول این ژن پروتئین ترشحی 94 (PSP94) است.این پروتئین شامل 94 آمینواسید است و 7/10 کیلو دالتون وزن دارد. PSP94 از اعضای خانواده فاکتورهای متصل شونده به ایمونوگلبولین ها و یکی از سه پروتئین اصلی ترشح شده توسط سلول های اپیتلیال پروستات به داخل پلاسما می باشد.(6)
PSP94 پروتئین اصلی تشکیل دهنده مایع منی و مارکر سرطان پروستات است.(7) این پروتئین سرکوب کننده رشد تومور و متاستاز می باشد و بیان آن با پیشرفت سرطان کاهش می یابد. همولوگ PSP94 میل اتصال بالا به پروتئین های ترشحی غنی از سیستئین دارد و برخی از آن ها نیز مسدودکننده کانال های یونی اند.
اگرچه عملکرد بیولوژیک دقیق PSP94 ناشناخته است ولی چند نقش بالقوه برای آن در نطر گرفته شده است از جمله:
با اتصال به ایمونوگلبولین ها، پاسخ ایمنی در دستگاه تناسلی زن را تنطیم کرده و مانع حرکت اسپرم می شود و مهارکننده آکروزوم سر اسپرم نیز می باشد. همولوگ این پروتئین هم چنین در بافت پستان و تخمدان خانم ها نیز مشاهده می شود. علاوه بر آن در بافت دستگاه تنفسی و معده وجود دارد.(8)

PRKCI (protein kinase c inhibitor) ژنی است که روی کروموزوم 3 قرار دارد (3q 26/3).
پروتئین غیر معمول کیناز apkci یکی از اعضای خانواده پروتئین کیناز C توسط این ژن کدگزاری می شود که نقش های بسیار زیاد و متعدد در ترمیم سلولی، تقسیم سلولی، بقا، تمایز و آپوپتوز دارد و علاوه بر آن مطالعات متعددی نشان می دهد که بیان ژن apkcλ /I در بافت سرطانی پروستات در انسان افزایش می یابد. اما رابطه بین میزان این پروتئین و پیشرفت سرطان پروستات هنوز مشخص نیست.(9)

rs10993994 (C/T) در فاصله pb57 در بالادست اگزون اول ژن MSMB در ناحیه پروموتور پروگزیمال آن منطقه قرار گرفته است.(6)
در مطالعه ای در جمعیت چین در سال 2013 پلی مورفیسم این جایگاه در ژن MSMB موجب عدم انجام اسپرماتوژنز و عدم باروری در مردان شده است.(7) در مطالعه ای دیگر در جمعیت واشینگتن آمریکا در سال 2013 مشاهده شده است که رابطه معناداری بین پلی مورفیسم این جایگاه و خطر بروز سرطان پروستات وجود دارد.(10) در یک بررسی در نیویورک در سال 2010، رابطه معناداری بین پلی مورفیسم جایگاه rs10993994 و خطر بروز سرطان پروستات وجود ندارد.(11)
روی جایگاه هایrs10994385 (C/G) از ژن MSMB تا کنون کاری انجام نشده است و برای اولین بار به بررسی اثر پلی مورفیسم آن ها بر روی سرطان پروستات می پردازیم.
روی جایگاه rs12770171 (C/T) از ژن MSMB در سال 2009 در بوستون مطالعه ای صورت گرفته است و رابطه ی معناداری بین پلی مورفیسم این جایگاه و خطر ابتلا به سرطان پروستات وجود نداشته است.(12) ما به بررسی رایطه بین پلی مورفیسم این جایگاه و ابتلا به سرطان در جمعیت تهران می پردازیم.
جایگاه rs546950 (A/G) در اینترون اول ژن PRKCI قرار دارد ولی جایگاه rs4955720 (A/C) در پایین دست آخرین اگزون ژن PRKCI در منطقه UTR’3 در فاصله kb84 از جایگاه rs546950 قرار گرفته است.(9)
در مورد جایگاه های rs4955720 و rs546950 تنها یک مطالعه در سال 2014 در چین صورت گرفته است که مشخص می کند پلی مورفیسم این جایگاه ها با خطر بروز سرطان پروستات مرتبط است.(13) از آنجایی که این جایگاه های ژنی دارای اهمیت کاربردی هستند ما به بررسی اهمیت آن در سرطان پروستات می پردازیم.
سوالات و / یا فرضیات پژوهش
فراوانی پلی مورفیسم rs10993994در افراد مبتلا به سرطان پروستات و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs12770171در افراد مبتلا به سرطان پروستات و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs10994385 در افراد مبتلا به سرطان پروستات و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs4955720در افراد مبتلا به سرطان پروستات و افراد سالم متفاوت است.
فراوانی پلی مورفیسم rs546950در افراد مبتلا به سرطان پروستات و افراد سالم متفاوت است.
هدف کلی طرحتعیین پلی مورفیسم ژن های MSMB (rs10993994, rs12770171, rs10994385) و PRKCI (rs4955720, rs546950 در افراد مبتلا به سرطان پروستات نسبت به افراد سالم.
اهداف اختصاصیتعیین فراوانی پلی مورفیسم rs10993994 در افراد مبتلا به سرطان پروستات و افراد سالم.
تعیین فراوانی پلی مورفیسم rs12770171 در افراد مبتلا به سرطان پروستات و افراد سالم.
تعیین فراوانی پلی مورفیسم rs10994385 در افراد مبتلا به سرطان پروستات و افراد سالم.
تعیین فراوانی پلی مورفیسم rs4955720 در افراد مبتلا به سرطان پروستات و افراد سالم.
تعیین فراوانی پلی مورفیسم rs546950 در افراد مبتلا به سرطان پروستات و افراد سالم.
سازمانها، مراکز و موسسات و سایر بهره برداران بالقوه دستاوردهای طرحدانشگاه علوم پزشکی زاهدان- گروه بیوشیمی
تعریف واژه های تخصصیSNP:پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی تغییر در توالی DNAاست که فقط در یک نوکلئوتید رخ می دهد و مشاهده شده است که این تغییرات می تواند در بعضی بیماری ها یک ریسک فاکتور باشد.
نوع مطالعهموردی – شاهدی (case –control)
جامعه مورد مطالعه(معرفی مشارکت کنندگان)/ محیط پژوهش(معیارهای ورود و خروج ذکر شوند)کلیه مردان مبتلا به سرطان پروستات که بیماری در آن ها توسط پاتولوژیست تایید شده است وبیماری زمینه ای دیگری ندارند وگروه کنترل نیز از افراد مراجعه کننده به بیمارستان لبافی نژادتهران جهت چکاپ مراجعه می کنند سالم بوده وبیماری شناخته شده ای ندارند.گروه های مورد و شاهد از لحاظ سن همسان سازی می شود.
حجم نمونه و روش محاسبه آنبرای بررسی پلی مورفیسم ژنی٬ افراد مبتلا به سرطان پروستات در تهران که قبلا از آنها خون گرفته شده وموارد جدید که هم اکنون تحت درمان می باشند به تعداد حداقل 110 نفر مورد مطالعه هستند. گروه شاهد از نمونه های خون افراد سالم که به بیمارستان شهید لبافی نژاد تهران مراجعه نموده ولی هیچ بیماری زمینه ای در آن ها مشاهده نشده است انتخاب شده است (حداقل 150نمونه).
روش نمونه گیری(نحوه تخصیص تصادفی و همسانسازی در صورت لزوم ذکر شود)آسان در دسترس
روش و ابزار جمع آوري داده ها / صحت و استحکام داده ها (پرسشنامه یا فرم اطلاعاتی ضمیمه شود)
روش اجرای طرح(با جزئیات بطور کامل شرح داده شود)برای بررسی پلی مورفیسم ژنی نمونه خون در 20- درجه سانتیگراد نگهداری می‌شود. DNA نمونه خون افراد گروه شاهد و مورد به روش salting out تخلیص می‌شود. پرایمرهای اختصاصی جهت تعیین پلی مورفیسم ژنی به روش ARMS-PCR طراحی می شود. در مرحله بعد شرایط PCR برای تعیین این پلی مورفیسم ها بهینه می شود و سپس پلی مورفیسم ها ی ژنی ذکر شده در نمونه ها با این تکنیک آنالیز می شوند.درنهایت محصول PCR رابرای تائید روش مورد بررسی الکتروفورز می کنیم.
روش تجزیه، تحليل و توصیف داده‌ها (نمونه‌اي از جدول توخالي ضميمه شود و روش هاي آماري مورد استفاده به طور كامل توضيح داده شود)(کیفی و کمی)پس از گردآوری اطلاعات لازم، یافته ها در نرم افزار آماری SPSS وارد گشته و داده ها با استفاده از آزمون های آماری χ2 و تی تست مستقل و Regression Logistic مورد تجزیه و تحلیل قرار خواهند گرفت.
ملاحظات اخلاقی با رضایت کامل از بیماران نمونه گیری می شود و تعهد می شود نام ومشخصات بیماران در هیچ گزارشی قید نشود. انجام آزمایشات هیچ گونه هزینه ای برای بیمار نخواهد داشت(باتوجه به کد های اخلاقی شماره های 12،13،15،17،18،2،7،8،9،11،1،)
محدودیتهای اجرائی طرح و پیش بینی جهت حل آنها- عدم همکاری بیمار
-مشکل تهیه مواد وامکان طولانی شدن زمان دریافت آنها
کلمات کلیدی
سرطان پروستات، حذف ژنی، پلی مورفیسم
فهرست منابع و مراجع1. Rinckleb AE, Surowy HM, Luedeke M, Varga D, Schrader M, Hoegel J, et al. The prostate cancer risk locus at 10q11 is associated with DNA repair capacity. DNA repair. 2012 Aug 1;11(8):693-701. PubMed PMID: 22677538.
2. Chang BL, Spangler E, Gallagher S, Haiman CA, Henderson B, Isaacs W, et al. Validation of genome-wide prostate cancer associations in men of African descent. Cancer epidemiology, biomarkers & prevention : a publication of the American Association for Cancer Research, cosponsored by the American Society of Preventive Oncology. 2011 Jan;20(1):23-32. PubMed PMID: 21071540. Pubmed Central PMCID: 3110616.
3. Eeles RA, Kote-Jarai Z, Giles GG, Olama AA, Guy M, Jugurnauth SK, et al. Multiple newly identified loci associated with prostate cancer susceptibility. Nature genetics. 2008 Mar;40(3):316-21. PubMed PMID: 18264097.
4. Klein RJ, Hallden C, Cronin AM, Ploner A, Wiklund F, Bjartell AS, et al. Blood biomarker levels to aid discovery of cancer-related single-nucleotide polymorphisms: kallikreins and prostate cancer. Cancer prevention research. 2010 May;3(5):611-9. PubMed PMID: 20424135. Pubmed Central PMCID: 2865570.
5. Zhang K, Zhou B, Wang Y, Rao L, Zhang L. The TLR4 gene polymorphisms and susceptibility to cancer: a systematic review and meta-analysis. European journal of cancer. 2013 Mar;49(4):946-54. PubMed PMID: 23084080.
6. Sutcliffe S, De Marzo AM, Sfanos KS, Laurence M. MSMB variation and prostate cancer risk: Clues towards a possible fungal etiology. The Prostate. 2014 May;74(6):569-78. PubMed PMID: 24464504.
7. Chang BL, Cramer SD, Wiklund F, Isaacs SD, Stevens VL, Sun J, et al. Fine mapping association study and functional analysis implicate a SNP in MSMB at 10q11 as a causal variant for prostate cancer risk. Human molecular genetics. 2009 Apr 1;18(7):1368-75. PubMed PMID: 19153072. Pubmed Central PMCID: 2722195.
8. Kumar A, Jagtap DD, Mahale SD, Kumar M. Crystal structure of prostate secretory protein PSP94 shows an edge-to-edge association of two monomers to form a homodimer. Journal of molecular biology. 2010 Apr 9;397(4):947-56. PubMed PMID: 20184897.
9. Campa D, Canzian F, Kaaks R. Genetic variability in the PRKCI gene and prostate cancer risk. Cell cycle. 2012 Jan 15;11(2):209. PubMed PMID: 22189710.
10. Stott-Miller M, Wright JL, Stanford JL. MSMB gene variant alters the association between prostate cancer and number of sexual partners. The Prostate. 2013 Dec;73(16):1803-9. PubMed PMID: 24037734. Pubmed Central PMCID: 3992835.
11. Dahlman A, Edsjo A, Hallden C, Persson JL, Fine SW, Lilja H, et al. Effect of androgen deprivation therapy on the expression of prostate cancer biomarkers MSMB and MSMB-binding protein CRISP3. Prostate cancer and prostatic diseases. 2010 Dec;13(4):369-75. PubMed PMID: 20680031.
12. Lou H, Yeager M, Li H, Bosquet JG, Hayes RB, Orr N, et al. Fine mapping and functional analysis of a common variant in MSMB on chromosome 10q11.2 associated with prostate cancer susceptibility. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2009 May 12;106(19):7933-8. PubMed PMID: 19383797. Pubmed Central PMCID: 2671324.
13. Li Q, Gu C, Zhu Y, Wang M, Yang Y, Wang J, et al. Two novel PRKCI polymorphisms and prostate cancer risk in an Eastern Chinese Han population. Molecular carcinogenesis. 2014 Feb 10. PubMed PMID: 24510606.
14. Dohner H, Fischer K, Bentz M, Hansen K, Benner A, Cabot G, et al. p53 gene deletion predicts for poor survival and non-response to therapy with purine analogs in chronic B-cell leukemias. Blood. 1995 Mar 15;85(6):1580-9. PubMed PMID: 7888675.

پیوست ها
hide/show

نام فایل تاریخ درج فایل اندازه فایل دانلود
Zhang-2013-The TLR4 gene polymo.pdf1393/08/27336806دانلود
Sutcliffe-2014-MSMB variation and p.pdf1393/08/27109056دانلود
Li-2014-Two novel PRKCI poly.pdf1393/08/27193253دانلود
Shahkar's proposal.doc1393/08/28344576دانلود
137_334_rezayatname akhlagh_2.doc1393/08/2888576دانلود
137_334_rezayatname akhlagh_hajizadeh.doc1393/08/2889088دانلود
Proposale eslah shode metodology.doc1393/09/03346112دانلود
proposal3.docx1393/09/08127331دانلود
shahkar-final.docx1393/09/08138081دانلود
eslahie komite akhlakh.docx1393/09/19138502دانلود
eslahie komite akhlakh.docx1393/09/24138669دانلود
eslahie komite akhlakh.docx1393/09/25138834دانلود