بررسی پلی مورفیسم های ژنهای(POLRE2 (rs3787016 (PRNCR1 ( rs13252298, rs7007694, rs1456315 (GAS5 (rs145204276 در مردان مبتلا به سرطان پروستات در مقایسه با مردان سالم .

 سرطان پروستات یکی‌ از شایع‌ترین بدخیمی‌ها در میان مردان در کشور‌های صنعتی محسوب میشود و از هر  100000 نفر3/25 نفر به این سرطان مبتلا می شوند . سرطان پروستات  دومین سرطان شایع در مردان است (1).  میزان شیوع سرطان پروستات در جهان متفاوت است.در اروپا و ایالت متحده آمریکا میزان شیوع آن بیشتر از جنوب و شرق آسیا است. در چین از هر ۱۰۰۰۰۰ نفر 16 نفر مبتلا به سرطان پروستات میشوند (۲). شیوع سرطان پروستات در ایران نسبت به جوامع غربی پایین تر است . شیوع این بیماری قابل مقایسه با کشورهای آسیایی است (4و۳). درسال 2008 به طور تقریبی 192,280 مورد به سرطان پروستات درایالات متحده شناسایی شدند که 27,360 مورد از آن ها منجر به مرگ شد (5) علت ابتلا به سرطان پروستات هنوز به طور دقیق مشخص نیست اما بسیاری از فاکتور‌های محیطی‌ مثل سنّ ، تغذیه و تغییرات سطح هورمون‌ها و بسیاری از فاکتور‌های ژنتیکی مانند تاریخچه فامیلی ، نژاد ، برخی‌ جهش‌ها و پلی مورفیسم ژنی  به عنوان ریسک فاکتور میتوانند باعث ایجاد سرطان پروستات شوند (6و7).

آنتی‌ژن اختصاصی پروستات (PSA) یک سرین پروتئاز است که اولین‌بار در مایع منی انسان یافت شد. بالا رفتن این آنتی‌ژن در سرم میتواند با بیماری‌های خوشخیم و همچنین متاستاز پروستات مرتبط باشد.(PSA)  در حال حاضر یک بیومارکر مهم برای تشخیص زود هنگام سرطان پروستات و پیگیری روند درمان این سرطان است (8و9و10و11).

پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی یا SNP (single nucleotide polymorphism) تغییرات تک نوکلئوتیدی در توالی DNA است که سبب ایجاد ژنوتیپ های مختلف می شود.طبق مطالعات انجام شده این تغییرات ژنتیکی ممکن است ریسک ابتلا به برخی بیماری ها از جمله سرطان ها را در جمعیت هایی با ژنوتیپ خاصی افزایش دهد (12)

non-coding RNAs(nc RNAs) : تجزیه تحلیل در رونوشت ژنوم انسان نشانگر این است که بخش عمده ژنوم انسان  رونویسی می شود،ولی‌ با این حال مقدار کمی‌ از این ژنوم تقریبا( 2% )رونویسی شده به پروتئین ترجمه می شود (13-18) قسمت اعظم این ژن های رونویسی شده راNon- coding RNAs   ها تشکیل می دهند که رونویسی شده اما ترجمه نمی شوند.non coding RNAs  ها عموما به 2 دسته تقسیم می شوند   1.Housekeeping  ncRNAs     و   2.regulatory ncRNAs (17).  regulatory ncRNAs  ها حداقل به 2 دسته تقسیم می شوند 1.short ncRNAs    مثل  small interfering RNAs    و  micro RNA 2 .Long ncRNAs  (19-22)

Long non-coding RNAs  ( Lnc RNAs) ها حاوی 100-200 نوکلئوتیداند (23).  این RNA ها نقش های مهمی درفعالیت های بیولوژیک مانند ترجمه، پیرایش، تغییرات اپی ژنتیک، چرخه سلولی، پاسخ به شوک حرارتی ، imprinting (24-28)، جنین زایی (29) و تنظیم پاسخ ایمنی (30)، تعدیل اثرات هموستاز در سلول، اپوپتوز (31)، رشد و تمایزسلولی ( 32)، غیر فعال کردن کروموزوم  X ایفا می کنند (33و34). به خاطر نقش های مهم و متعددی که در فرایندهای بیولوژیکی دارند اختلال در بیان این RNA ها می تواند در بروز برخی سرطان ها نقش داشته باشد (35-39). مطالعات اخیر نشان می دهد که این ژن ها به عنوان پروتوانکوژن (40)  و یا سرکوب گر تومور عمل می کنند (41) و در سرطان های مختلف از جمله سرطان روده بزرگ (42)، سرطان پروستات (43) و سرطان هپاتوسلولار نقش ایفا می کنند (44و45). شواهد نشان می دهدکه Lnc RNAs نه تنها در تومورزایی دخیل اند بلکه به عنوان شاخص پیش اگهی در سرطان مطرح هستند (46-48).  به علاوه مطالعات نشان میدهد که اختلال در بیان این ژن ها سبب برخی اختلالات عصبی از جمله الزایمر (49)، اسکیزوفرنی (51و50) و اوتیسم شود (51و52).

 قرار دارد (53) و 364 (19p13) این ژن برروی بازوی کوتاه کروموزوم 19 POLRE2ژن  rs3787016 C>T

پلیمرازRNAواقع است که ساب یونیت های  POLRE2 بر روی چهارمین اینترون ژن Rs3787016 . کیلوبازاست

1و2و3 راکد میکند. اطلاعات قبلی پیشنهاد میدادند که این SNP همچنین در LNC RNA  AC112706.1 هم وجود دارد و با ژن POLRE2 همپوشانی دارد (54). مطالعاتی در سال 2013 در صربستان انجام شد و شواهد نشان داد ارتباطی بین این جایگاه و سرطان پروستات وجود ندارد (55) در دیگر مطالعه ای در سال 2015 در چین بر روی همین جایگاه انجام شد نشان داد که الل T میتواند ریسک ابتلا به سرطان سلول های سنگفرشی مری را در میان افراد سیگاری و الکلی و زنان جوان کاهش دهد (56). در همین مطاله مشاهده شدکه ژنوتیپ  CTو TT نقش محافظت کننده در سرطان سلول های سنگفرشی مری دارند ( 57).

rs7007694  C/T    ژن PRNCR1 این ژن برروی بازوی بلند کروموزوم 8  (8q24) قرار دارد (58). در مطالعاتی که در سال 2013 در چین انجام شد نشان دادکه الل C ریسک  ابتلا به سرطان روده بزرگ را کاهش میدهد (59).

rs13252298 A/G   ژن PRNCR1 این ژن برروی بازوی بلند کروموزوم 8  (8q24) قرار دارد (58). در مطالعاتی که در سال 2013 در چین انجام شد دیده شد که ژنوتیپ AG و الل G در این جایگاه  با کاهش خطر ابتلا به سرطان روده بزرگ مرتبط بوده است (59(.

rs 1456315 A/G ژن PRNCR1 این ژن برروی بازوی بلند کروموزوم 8 (8q24) قرار دارد (58). در مطالعاتی که در سال 2013 در چین انجام شد دیده شد که ژنوتیپ AG باعث کاهش خطر ابتلا به سرطان روده بزرگ شد در مقایسه با ژنوتیپ  AA(59). همچنین متوجه شده اند که این جایگاه ژنی با اندازه تومور در سرطان روده بزرگ مرتبط است (59).

 rs 145204276 indel ژن GAS5 این ژن برروی بازوی بلند کروموزوم 1  (1q25) قرار دارد (60).  به عنوان سرکوب کننده اپوپتوز دررده سلولی thymoma در موش شناسایی شد (60). در ازمایشات انجام شده بعدی بر روی بسیاری از رده های سلولی انسان نشان داد که نه تنها این ژن باعث سرکوب اپوپتوز نمی شود بلکه باعث القا و پیشرفت اپوپتوز هم میشود (61و62). GAS5 Lnc RNA همچنین باعث توقف چرخه سلولی در فاز G0/G1 (62) و کاهش CDK6, cyclin D1, E2F1 و افزایش p21 در سلول می شود (63-70). نقص در تنظیم بیان  این ژن باعث انواع بسیاری  از سرطان ها میشود (71و72). در مطالعه ای که در سال 2015 در چین بر روی این جایگاه انجام شد نشان داد که ژنوتیپ ins/del یا del/del باعث افزایش خطر سرطان سلول های کبدی میشود در مقایسه با ژنوتیپ ins/ins  .  indel 5 باز در ناحیه پروموتور ژن GAS5 باعث افزایش خطر ابتلا به سرطان سلول های کبدی می شود (73).

مطالعات در رابطه با پلی مورفیسم ژن های long non-coding RNAs و سرطان اندک می باشد و با توجه به اینکه تا کنون مطالعاتی در ایران در رابطه با نقش پلی مورفیسم این ژن ها و سرطان گزارش نشده است ما به بررسی ارتباط پلی مورفیسم این ژن ها و سرطان پروستات می پردازیم.

فراوانی پلی مورفیسم rs3787016  ژن POLRE2  در مردان مبتلا به سرطان پروستات با مردان سالم متفاوت است .

فراوانی پلی مورفیسم rs13252298 ژن PRNCR1 در مردان مبتلا به سرطان  پروستات ومردان سالم متفاوت است .

فراوانی پلی مورفیسم  rs7007694 ژن PRNCR1 در مردان مبتلا به سرطان پروستات ومردان سالم متفاوت است .

فراوانی پلی مورفیسم  rs1456315 ژن PRNCR1 در مردان مبتلا به سرطان پروستات ومردان سالم متفاوت است.

 فراوانی پلی مورفیسمrs145204276 ژن GAS5 ژن در  مردان مبتلا به سرطان پروستات ومردان سالم متفاوت است .

POLRE2 (rs3787016) تعیین توزیع فراوانی پلی مورفیسم ژنهای

PRNCR1 (rs13252298, rs7007694, rs1456315) , GAS5 (rs145204276(

در مردان مبتلا به سرطان پروستات  در مقایسه با مردان سالم.

تعیین و مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs3787016  ژن   POLRE2 در مردان مبتلا به سرطان پروستات و مردان سالم.

تعیین و مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs13252298 ژن PRNCR1 در مردان مبتلا به سرطان پروستات  و مردان سالم.

تعیین و مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs7007694  ژن PRNCR1  در مردان مبتلا به سرطان پروستات و

مردان سالم.

تعیین و مقایسه فراوانی پلی مورفیسم  rs1456315 ژن PRNCR1 در مردان مبتلا به سرطان پروستات و مردان سالم.

تعیین و مقایسه فراوانی پلی مورفیسم  rs145204276 ژنGAS5  در مردان مبتلا به سرطان پروستات و  مردان سالم.

. polymorphism). : SNP (single nucleotideتغییرات تک نوکلئوتیدی در توالی DNA است که سبب ایجاد ژنوتیپ های مختلف می شود.طبق مطالعات انجام شده این تغییرات ژنتیکی ممکن است ریسک ابتلا به برخی بیماری ها از جمله سرطان ها را در جمعیت هایی با ژنوتیپ خاصی افزایش دهد

موردی – شاهدی (case –control)

افراد مبتلا به سرطان پروستات مراجعه کننده به بیمارستان لبافی نژاد تهران که بیماری ان ها توسط پاتولوژیست تایید شده و بیماری زمینه ای دیگری ندارند به عنوان گروه مورد وارد مطالعه میشوند. گروه شاهد از نمونه های خون افراد سالم که به بیمارستان شهید لبافی نژاد تهران  مراجعه نموده ولی هیچ بیماری زمینه ای در آن ها مشاهده نشده است انتخاب شده است .گروه مورد و شاهد از نظر سن همسان سازی میشوند.

   برای بررسی پلی مورفیسم ژنی٬ افراد مبتلا به سرطان پروستات در تهران که قبلا  از آنها خون گرفته شده وموارد جدید که هم اکنون تحت درمان می باشند به تعداد حداقل 150 نفر  مورد مطالعه هستند. گروه شاهد از نمونه های خون افراد سالم که به بیمارستان شهید لبافی نژاد تهران  مراجعه نموده ولی هیچ بیماری زمینه ای در آن ها مشاهده نشده است انتخاب شده است

 آسان در دسترس

با استفاده از پرسشنامه و نتایج حاصل از یافته های آزمایشگاهی.

برای بررسی  پلی مورفیسم ژنی نمونه خون در 20- درجه سانتیگراد نگهداری می‌شود. DNA نمونه خون افراد گروه شاهد و مورد به روش salting out تخلیص می‌شود. پرایمرهای اختصاصی جهت تعیین پلی مورفیسم ژنی به روش ARMS-PCR و RFLP-PCR طراحی می شود. در مرحله بعد شرایط PCR برای تعیین این پلی مورفیسم ها بهینه می شود و سپس پلی مورفیسم ها ی ژنی ذکر شده در نمونه ها با این تکنیک آنالیز می شوند.درنهایت محصول PCR رابرای تائید روش مورد بررسی الکتروفورز بر روی ژل اگارز می کنیم.

پس از گردآوری اطلاعات لازم، یافته ها در نرم افزار آماری SPSS  وارد گشته و داده ها با استفاده از آزمون­های آماری χ2  و تی تست مستقل و Regression Logistic مورد تجزیه و تحلیل قرار خواهند گرفت.

تمامی بیماران تحت مطالعه آگاهانه و برای مقاصد علمی  اقدام به دادن نمونه خواهند کرد. شرکت در این طرح هیچ گونه هزینه ای برای بیماران ندارد و نام و مشخصات بیماران گزارش نخواهد شد.کدهای 1، 2، 3، 8، 10، 11، 13، 15، 18، 25، 28، مصوب کمیته کشوری اخلاق در پژوهش های علوم پزشکی که در دفترچه راهنمای عمومی اخلاق در پژوهش‌های دارای آزمودنی انسانی در جمهوری اسلامی ایران، دربردارنده‌ی اصول و مقررات اخلاقی‎ مطرح  و در سال 1392 در 31 بند تصویب شده است و همچنین کدهای 1، 2، 3، 4، 7 مربوط به دفترچه راهنمای اخلاقی پژوهش بر روی عضو و بافت انسانی در جمهوری اسلامی ایران از قسمت راهنمای عمومی در این طرح رعایت می شود.

- عدم همکاری بیمار

-مشکل تهیه مواد وامکان طولانی شدن زمان دریافت آنها

سرطان پروستات پلی مورفیسم ، , Long non-coding RNAs

POLRE2 (rs3787016)

PRNCR1 (rs13252298, rs7007694, rs1456315), GAS5 (rs145204276)

1. Jemal A, Siegel R, Ward E, Hao Y, Xu J, Murray T et al. Cancer

statistics, 2008. CA Cancer J Clin 2008; 58: 71–96.

2. Brinkman M, Reulen RC, Kellen E, Buntinx F, Zeegers MP. Are men

with low selenium levels at increased risk of prostate cancer? Eur J

Cancer. 2006;42(15):2463-71.

3. Yang L, Duff MO, Graveley BR, Carmichael GG, Chen LL (2011) Genomewide

characterization of non-polyadenylated RNAs. Genome Biol 12: R16.

4. ‌Baade PD, Youlden DR, Cramb SM, Dunn J, Gardiner RA. Epidemiology of prostate cancer in the Asia-Pacific region. Prostate Int 2013;1:47–58

5.Xu B, Feng NH, Li PC, Tao J, Wu D, Zhang ZD, et al. A functional polymorphism in Pre-miR-146a gene is associated with prostate cancer risk and mature miR-146a expression in vivo. The Prostate. 2010 Apr 1;70(5):467-72. PubMed PMID: 19902466.

6.Pourmand G, Ziaee AA, Abedi AR, Mehrsai A, Alavi HA, Ahmadi A, et al. Role of PTEN gene in progression of prostate cancer. Urology journal. 2007 Spring;4(2):95-100. PubMed PMID: 17701929.

7.Asgari M, Morakabati A. Estrogen receptor beta expression in prostate adenocarcinoma. Diagnostic pathology. 2011;6:61. PubMed PMID: 21733187. Pubmed Central PMCID: 3151201.

8.Abrahamsson,P-E.,Lilija,H.& Oesterling, J.E. (1997).Molecular forms of serum prostate-specific antigen. Urologic clinics North America 24,363-365     

9.Crawford, E.D. DeAntoni, E.P. & Ross, C.A (1996).The role of  prostate-specific antigen in the chemoprevention of prostate cancer.

10.Montie, J.E. & Meyers, S.E. (1997).Defining the ideal tymor marker for prostate cancer. Urologic clinics North America 24,247-252.

11. Bratt O, Lilja H. Serum markers in prostate cancer detection. Curr Opin Urol 2015;25:59–64. [2] Heidenreich A, Abrahamsson PA, Artibani W, et al. Early detection of prostate cancer: European Association of Urology recommendation. Eur Urol 2013;64:347–54

12. Zhang K, Zhou B, Wang Y, Rao L, Zhang L. The TLR4 gene polymorphisms and susceptibility to cancer: a systematic review and meta-analysis. European journal of cancer. 2013 Mar;49(4):946-54. PubMed PMID: 23084080.

13. Bertone,P. et al. (2004) Global identification of human transcribed sequences

with genome tiling arrays. Science, 306, 2242–2246.

14.ENCODE Project Consortium et al. (2007). Identification and analysis of

functional elements in 1% of the human genome by the ENCODE pilot

project. Nature, 447, 799–816.

15. Cheng,J. et al. (2005) Transcriptional maps of 10 human chromosomes at

5-nucleotide resolution. Science, 308, 1149–1154.

16. Kapranov,P. et al. (2007) RNA maps reveal new RNA classes and a possible

function for pervasive transcription. Science, 316, 1484–1488.

17. Rinn JL, Chang HY. Genome regulation by long noncoding

RNAs. Annu Rev Biochem 2012;81:145–166.

18. Birney E, Stamatoyannopoulos JA, Dutta A, et al. Identification

and analysis of functional elements in 1% of the

human genome by the ENCODE pilot project. Nature

2007;447:799–816.

19. Carthew,R.W. et al. (2009) Origins and mechanisms of miRNAs and siRNAs.

Cell, 136, 642–655.

20. Malone,C.D. et al. (2009) Small RNAs as guardians of the genome. Cell,

136, 656–668.

21. Baek,D. et al. (2008) The impact of microRNAs on protein output. Nature,

455, 64–71.

22. Selbach,M. et al. (2008) Widespread changes in protein synthesis induced

by microRNAs. Nature, 455, 58–63

23.Ørom,U.A. et al. (2010) Long noncoding RNAs with enhancer-like function

in human cells. Cell, 143, 46–58.

24. Li Z, Rana TM. Decoding the noncoding: Prospective of

lncRNA-mediated innate immune regulation. RNA Biol

2014;11:979–985.

25. Kino T, Hurt DE, Ichijo T, Nader N, Chrousos GP. Noncoding

RNA gas5 is a growth arrest- and starvation-associated

repressor of the glucocorticoid receptor. Sci Signal 2010;3:

ra8.

26. Brannan CI, Dees EC, Ingram RS, Tilghman SM. The product

of the H19 gene may function as an RNA. Mol Cell Biol

1990;10:28–36.

27. Chen B, Yu M, Chang Q, et al. Mdig de-represses H19 large

intergenic non-coding RNA (lincRNA) by down-regulating

H3K9me3 and heterochromatin. Oncotarget 2013;4:

1427–1437.

28. Ma L, Bajic VB, Zhang Z. On the classification of long noncoding

RNAs. RNA Biol 2013;10:925–933.

29.Grote P, Herrmann BG. The long non-coding RNA Fendrr

links epigenetic control mechanisms to gene regulatory

networks in mammalian embryogenesis. RNA Biol

2013;10:1579–1585

30.Li Z, Rana TM. Decoding the noncoding: Prospective of

lncRNA-mediated innate immune regulation. RNA Biol

2014;11:979–985

31. Lakhotia SC. Long non-coding RNAs coordinate cellular responses

to stress. Wiley Interdisciplin Rev RNA. 2012;3:779–96.

32. Dereure O. Role of non-coding RNA ANRIL in the genesis of

plexiform neurofibromas in neurofibromatosis type 1. Ann

Dermatol Venereol. 2012;139:421–2.

33. J.T. Lee, Epigenetic regulation by long noncoding RNAs, Science 338 (2012)1435–1439.

34. D. Lessing, M.C. Anguera, J.T. Lee, X chromosome inactivation and epigeneticresponses to cellular reprogramming, Annu. Rev. Genom. Hum. Genet. 14(2013) 85–110.

35. Zhang L, Zhou XF, Pan GF, Zhao JP. Enhanced expression of

long non-coding RNA ZXF1 promoted the invasion and

metastasis in lung adenocarcinoma. Biomed Pharmacother

2014;68:401–407.

36. Jiao F, Hu H, Yuan C, et al. Elevated expression level of long

noncoding RNA MALAT-1 facilitates cell growth, migration

and invasion in pancreatic cancer. Oncol Rep 2014;32:

2485–2492.

37. Shi X, Sun M, Liu H, et al. A critical role for the long noncoding

RNA GAS5 in proliferation and apoptosis in nonsmall-

cell lung cancer. Mol Carcinog 2013.

38. Chen B, Yu M, Chang Q, et al. Mdig de-represses H19 large

intergenic non-coding RNA (lincRNA) by down-regulating

H3K9me3 and heterochromatin. Oncotarget 2013;4:

1427–1437

39. Weber DG, Johnen G, Casjens S, et al. Evaluation of long

noncoding RNA MALAT1 as a candidate blood-based

biomarker for the diagnosis of non-small cell lung cancer.

BMC Res Notes 2013;6:518.

40. Li L, Feng T, Lian Y, Zhang G, Garen A, Song X. Role of human

noncoding RNAs in the control of tumorigenesis. Proc Natl Acad

Sci U S A. 2009;106:12956–61.

41. Zhang X, Rice K, Wang Y, Chen W, Zhong Y, Nakayama Y, et al.

Maternally expressed gene 3 (MEG3) noncoding ribonucleic acid:

isoform structure, expression, and functions. Endocrinology.

2010;151:939–47.

42. Pibouin L, Villaudy J, Ferbus D, Muleris M, Prosperi MT,

Remvikos Y, et al. Cloning of the mRNA of overexpression in

colon carcinoma-1: a sequence overexpressed in a subset of colon

carcinomas. Cancer Genet Cytogenet. 2002;133:55–60.

43. Fu X, Ravindranath L, Tran N, Petrovics G, Srivastava S.

Regulation of apoptosis by a prostate-specific and prostate

cancer-associated noncoding gene, PCGEM1. DNA Cell Biol.

2006;25:135–41.

44. Calin GA, Liu CG, Ferracin M, Hyslop T, Spizzo R, Sevignani C,

et al. Ultraconserved regions encoding ncRNAs are altered in human

leukemias and carcinomas. Cancer Cell. 2007;12:215–29.

45. Lin R, Maeda S, Liu C, Karin M, Edgington TS. A large noncoding

RNA is a marker for murine hepatocellular carcinomas and a spectrum

of human carcinomas. Oncogene. 2007;26:851–8.

46. Ying L, Huang Y, Chen H et al: Downregulated MEG3 activates autopha­gy and increases cell proliferation in bladder cancer. Mol Biosyst, 2013; 9: 407–11

47. Zhao Y, Guo Q, Chen J et al: Role of long non-coding RNA HULC in cell pro­liferation, apoptosis and tumor metastasis of gastric cancer: A clinical and in vitro investigation. Oncol Rep, 2014; 31: 358–64

48. Huang JF, Guo YJ, Zhao CX et al: Hepatitis B virus X protein (HBx)-related long noncoding RNA (lncRNA) down-regulated expression by HBx (Dreh) inhibits hepatocellular carcinoma metastasis by targeting the intermedi­ate filament protein vimentin. Hepatology, 2013; 57: 1882–92

49. M.A. Faghihi, F. Modarresi, A.M. Khalil, D.E. Wood, B.G. Sahagan, T.E. Morgan,C.E. Finch, G. St Laurent, P.J. Kenny 3rd, C. Wahlestedt, Expression of anoncoding RNA is elevated in Alzheimer’s disease and drives rapidfeed-forward regulation of beta-secretase, Nat. Med. 14 (2008) 723–730

50. J.K. Millar, R. James, N.J. Brandon, P.A. Thomson, DISC1 and DISC2:discovering and dissecting molecular mechanisms underlying psychiatricillness, Ann. Med. 36 (2004) 367–378.

51. M.N. Ziats, O.M. Rennert, Aberrant expression of long noncoding RNAs inautistic brain, J. Mol. Neurosci. 49 (2013) 589–593

52. M.E. Talkowski, G. Maussion, L. Crapper, J.A. Rosenfeld, I. Blumenthal, C.Hanscom, C. Chiang, A. Lindgren, S. Pereira, D. Ruderfer, A.B. Diallo, J.P.Lopez, G. Turecki, E.S. Chen, C. Gigek, D.J. Harris, V. Lip, Y. An, M. Biagioli,M.E. Macdonald, M. Lin, S.J. Haggarty, P. Sklar, S. Purcell, M. Kellis, S.Schwartz, L.G. Shaffer, M.R. Natowicz, Y. Shen, C.C. Morton, J.F. Gusella, C.Ernst, Disruption of a large intergenic noncoding RNA in subjects withneurodevelopmental disabilities, Am. J. Hum. Genet. 91 (2012) 1128–1134

53.Jin G, Sun J, Isaacs SD, Wiley KE, Kim ST, Chu

LW, Zhang Z, Zhao H, Zheng SL, Isaacs WB, Xu

J. Human polymorphisms at long non-coding

RNAs (lncRNAs) and association with prostate

cancer risk. Carcinogenesis 2011; 32: 1655-

1659.

54.Jin G, Sun J, Isaacs SD, Wiley KE, Kim ST, Chu

LW, Zhang Z, Zhao H, Zheng SL, Isaacs WB, Xu

J. Human polymorphisms at long non-coding

RNAs (lncRNAs) and association with prostate

cancer risk. Carcinogenesis 2011; 32: 1655-

1659.

55. Nikolić Z, Brajušković G, Pavićević DLS, Kojić AS, Vukotić VD,

Tomović SM, Cerović SJ ,et al. Assessment of possible association between rs3787016

and prostate cancer risk in Serbian population. Int J Clin Exp Med. 2013; 6(1): 57–66.

56. Kang M, Sang Y, Gu H,Zheng L, Wang L, Liu C,  et al. Long noncoding RNAs POLR2E rs3787016 C/T and HULC

rs7763881 A/C polymorphisms are associated with decreased risk of esophageal cancer. Tumor Biol. (2015) 36:6401–6408

57. Kang M & Sang Y & Gu H & Zheng L & Wang5 L &

Liu CH,ET AL. Long noncoding RNAs POLR2E rs3787016 C/T and HULC

rs7763881 A/C polymorphisms are associated with decreased risk

of esophageal cancer. Tumor Biol. (2015) 36:6401–6408

58. Chung S, Nakagawa H, Uemura M, Piao L, Ashikawa K, Hosono N, Takata R,

Akamatsu S, Kawaguchi T, Morizono T, Tsunoda T, Daigo Y, Matsuda K,

Kamatani N, Nakamura Y, Kubo M: Association of a novel long non-coding

rna in 8q24 with prostate cancer susceptibility. Cancer Sci 2011,

102:245–252.

59. Li L, Sun R, Liang Y, Pan X, Li Z, Bai P, et al. Association between polymorphisms in long

non-coding RNA PRNCR1 in 8q24 and risk of

colorectal cancer. Journal of Experimental & Clinical Cancer Research. 2013, 32:104

60.Coccia, E.M. et al. (1992) Regulation and expression of a growth arrest-specific

gene (gas5) during growth, differentiation, and development. Mol. Cell Biol., 12,

3514-3521.

61. Mourtada-Maarabouni, M.; Hedge, V.L.; Kirkham, L.; Farzaneh, F.; Williams, G.T. Growth arrest

in human T-cells is controlled by the non-coding RNA growth-arrest-specific transcript 5 (GAS5).

J. Cell Sci. 2008, 121, 939–946.

62. Mourtada-Maarabouni, M.; Pickard, M.R.; Hedge, V.L.; Farzaneh, F.; Williams, G.T. GAS5,

a non-protein-coding RNA, controls apoptosis and is downregulated in breast cancer. Oncogene

2009, 28, 195–208.

63. Qiao, H.P.; Gao, W.S.; Huo, J.X.; Yang, Z.S. Long non-coding RNA GAS5 functions as a tumor

suppressor in renal cell carcinoma. Asian Pac. J. Cancer Prev. 2013, 14, 1077–1082.

64. Liu, Z.; Wang, W.; Jiang, J.; Bao, E.; Xu, D.; Zeng, Y.; Tao, L.; Qiu, J. Downregulation of GAS5

promotes bladder cancer cell proliferation, partly by regulating CDK6. PLoS ONE 2013, 8, e73991.

65. Lu, X.; Fang, Y.; Wang, Z.; Xie, J.; Zhan, Q.; Deng, X.; Chen, H.; Jin, J.; Peng, C., Li, H.; Shen, B.

Downregulation of gas5 increases pancreatic cancer cell proliferation by regulating CDK6.

Cell Tissue Res. 2013, 354, 891–896.

66. Shi, X.; Sun, M.; Liu, H.; Yao, Y.; Kong, R.; Chen, F.; Song, Y. A critical role for the long

non-coding RNA GAS5 in proliferation and apoptosis in non-small-cell lung cancer. Mol. Carcinog.

2013, doi:10.1002/mc.22120.

67. Renganathan, A.; Kresoja-Rakic, J.; Echeverry, N.; Ziltener, G.; Vrugt, B.; Opitz, I.; Stahel, R.A.;

Felley-Bosco, E. GAS5 long non-coding RNA in malignant pleural mesothelioma. Mol. Cancer

2014, doi:10.1186/1476-4598-13-119.

68. Sun, M.; Jin, F.Y.; Xia, R.; Kong, R.; Li, J.H.; Xu, T.P.; Liu, Y.W.; Zhang, E.B.; Liu, X.H.; De, W.

Decreased expression of long noncoding RNA GAS5 indicates a poor prognosis and promotes cell

proliferation in gastric cancer. BMC Cancer 2014, doi:10.1186/1476-4598-13-119.

69. Liu, Y.; Zhao, J.; Zhang, W.; Gan, J.; Hu, C.; Huang, G.; Zhang, Y. lncRNA GAS5 enhances G1

cell cycle arrest via binding to YBX1 to regulate p21 expression in stomach cancer. Sci. Rep. 2015,

doi:10.1038/srep10159.

70. Yin, D.; He, X.; Zhang, E.; Kong, R.; De, W.; Zhang, Z. Long noncoding RNA GAS5 affects cell

proliferation and predicts a poor prognosis in patients with colorectal cancer. Med. Oncol. 2014,

doi:10.1007/s12032-014-0253-8.

71. Pickard, M.R. et al. (2013) Long non-coding RNA GAS5 regulates apoptosis in

prostate cancer cell lines. Biochim. Biophys. Acta, 1832, 1613-1623.

72. Qiao, H.P. et al. (2013) Long non-coding RNA GAS5 functions as a tumor

suppressor in renal cell carcinoma. Asian Pac. J. Cancer Prev., 14, 1077-1082.

73.Tao  R, Hu SH, Wang sh, Zhou X, Zhang Q,

Wang CH et al. Association between indel polymorphism in the promoter region of lncRNA GAS5 and the risk of hepatocellular carcinoma. Carcinogenesis.