بررسی الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی و فراوانی ژن های(AdeABC )پمپ های افلاکس خانواده RND درجدایه های اسینتوباکتربومانی جداشده از بیماران بیمارستان های آموزشی شهر زاهدان

Evaluation of antibiotic resistance pattern and frequencey of efflux pump genes of RND family (Ade ABC ) in Acinetobacter baumanni isolates from educational hospital of zahedan


چاپ صفحه
پژوهان
صفحه نخست سامانه
مجری و همکاران
مجری و همکاران
اطلاعات تفضیلی
اطلاعات تفضیلی
دانلود
دانلود
علوم پزشکی زاهدان
علوم پزشکی زاهدان

مجریان: شهرام شهرکی زاهدانی

کلمات کلیدی: آسینتوباکتر بومانی، adeABC، RND

اطلاعات کلی طرح
hide/show

کد طرح 8631
عنوان فارسی طرح بررسی الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی و فراوانی ژن های(AdeABC )پمپ های افلاکس خانواده RND درجدایه های اسینتوباکتربومانی جداشده از بیماران بیمارستان های آموزشی شهر زاهدان
عنوان لاتین طرح Evaluation of antibiotic resistance pattern and frequencey of efflux pump genes of RND family (Ade ABC ) in Acinetobacter baumanni isolates from educational hospital of zahedan
نوع طرح کاربردی
محل اجرای طرح دانشگاه علوم پزشکی زاهدان
رسته مطالعاتی مطالعه تجربی (Experimental)(مطالعه کمی)
دانشکده/مرکز دانشکده پزشکی زاهدان
زمان اجرا -روز 360

اطلاعات مجری و همکاران
hide/show

نام و نام‌خانوادگی سمت در طرح نوع همکاری درجه‌تحصیلی پست الکترونیک
شهرام شهرکی زاهدانیاستاد راهنمای اول پایان نامه دانشجوییمشاور علمیدکترای تخصصی shahram17ir@yahoo.com
مهدی زندحقیقیاستاد راهنمای دوم پایان نامه دانشجوییمشاور علمیدکترای تخصصی mehdizand12@gmail.com
علیرضا انصاری مقدممشاورمشاور آماردکترای تخصصی ansariaLireza@yahoo.com
عاطفه بزیدانشجوانجام آزمایشاتکارشناسی ارشدatefeh.bazzii@gmail.com

اطلاعات تفضیلی
hide/show

عنوان متن
خلاصه طرح به فارسی بررسی الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی و فراوانی ژن های(AdeABC )پمپ های افلاکس خانواده RND درجدایه های اسینتوباکتربومانی جداشده از بیماران بیمارستان های آموزشی شهر زاهدان
خلاصه طرح به لاتینEvaluation of antibiotic resistance pattern and frequencey of efflux pump genes of RND family (Ade ABC ) in Acinetobacter baumanni isolates from educational hospital of zahedan
محل اول بکارگیری نتایج تحقیق

بیمارستان ها

بيان مسئله تحقيق/اهمیت پژوهش

آسینتوباکتر(Acinetobacter) کوکوباسیل گرم منفی و هوازی است که می تواند برای مدتی طولانی در محیط وتجهیزات مراقبت بهداشتی زنده بماند(1) . جنس اسینتوباکتر حاوی بیش از 32 گونه مختلف است واسینتوباکتر بومانی گونه غالب میباشد (2)که عامل بیماری های مختلفی از قبیل پنومونی ،سپتی سمی ،عفونت های دستگاه ادراری ، عفونت های پوستی و زخم ،مننژیت و اندوکاردیت میباشد (3, 4) . اسینتوباکتر بومانی یک پاتوژن فرصت طلب در حال گسترش است که گروههای مختلفی از مردم ،به ویژه بیماران بستری در بخش مراقبت های ویژه([1]ICU) را تحت تاثیر قرار میدهد . ریسک فاکتور های متعدد مستعد کننده عفونت با این باکتری شامل : بستری طولانی مدت در بیمارستان ، نقص ایمنی ،اعمال جراحی ،تماس طولانی مدت با بیماران کلونیزه شده،سوختگی ، کهولت سن، مصرف عوامل آنتی باکتریال وسیع الطیف و وجود عوامل تهاجمی مثل کاتتر میباشند(5).یکی از مشکلات ایجاد شده توسط اسینتوباکتر بومانی بروز مقاومت آنتی بیوتیکی می باشد که مشکلات زیادی را در درمان و بهبود بیماران ایجاد میکند (6).مقاومت آنتی بیوتیکی اسینتوباکتر بومانی به واسطه مکانیسم های اکتسابی و ذاتی است که این مکانیسم ها شامل : موتاسیون در ژن های هدف ،تغییر نفوذپذیری غشای خارجی و افزایش بیان پمپ های افلاکس میباشد .(7, 8)شیوع سریع مقاومت گونه های آسینتوباکتربومانی به همه ی بتالاکتام ها از جمله کارباپنم ها، نشان دهنده پتانسیل این ارگانیسم برای پاسخ سریع به تغییر فشار محیط می باشد.(9) آسینتوباکتربومانی می تواند از طریق جهش در ژن های gyrA و parC نسبت به کینولون ها و با بیان آنزیم های تغییردهنده آمینوگلیکوزید در برابر آمینوگلیکوزیدها مقاوم شود.(10)

یکی از رویدادهای ژنتیکی منحصربه فرد که موجب مقاومت چنددارویی [2](MDR) می شود بیان بیش ازحد یک سیستم خروجی به نام افلاکس (efflux) است.(11) بیان بیش ازحد سیستم افلاکس چنددارویی با دفع و بیرون کردن طیف گسترده ای از داروها باعث کاهش تجمع آنتی بیوتیک شده و یک سیستم کارآمد برای مقاومت در برابر داروها می باشد.(12)سیستم های افلاکس به عنوان یکی از مهمترین مکانیسم های مقاومت ذاتی و اکتسابی در باکتری ها به حساب آمده و توانایی دفع مواد سمی مانند آنتی بیوتیکها ، داروها ،مواد شیمیایی و همچنین ترشح فراورده های سلولی را به خارج از سلول دارند . پمپ های افلاکس مانع از ایجاد غلظت مناسبی از مواد سمی برای مهار باکتری ها شده و به عنوان مکانیسم دفاعی علیه مواد مضر محیط سبب بقای باکتری در محیط های مختلف میشود (13, 14)

پمپ های افلاکس باکتریایی بر اساس تعداد واحدهای تشکیل دهنده ، منبع انرژی استفاده شده پمپ و نوع ملکول هایی که دفع میکنند به 6 خانواده تقسیم میشوند :[3]ABC ،MFS [4]،[5]MATE ،SMR [6]،[7]RND ،[8]DMT (15)که از بین آنها پمپ های خانواده RND و MATE وMFS در اسینتوباکتربومانی میباشند (16) .پمپ های افلاکس خانواده RND با توجه به ساختار با بقیه متفاوت بوده و فقط در باکتری های گرم منفی یافت میشوند . دارای ناقل های بزرگ بوده و بازدهی این ناقل ها به دلیل اینکه سوبسترا را مستقیما به محیط خارج پمپ میکنند ، بیشتر از سایر ناقل ها میباشد (17).این خانواده قادر به دفع انواعی از ترکیبات از جمله مواد باردار مانند تتراسایکلین ،کینولون ها، کلرامفنیکل و بتالاکتام میباشد .ساختار افلاکس پمپ RND شامل 12 آلفاهلیکس با دو لوپ بزرگ و 900 اسید آمینه است که یک کمپلکس 3 قسمتی را با دومین های پری پلاسمی و کانال های غشای خارجی و پروتئین های پری پلاسمی تشکیل می دهد (18, 19) این کمپلکس های انتقال دهنده چندپروتئینی انواع متنوعی از مواد شامل آنتی بیوتیک ها، رنگ ها، موادشوینده و مولکول هایی از میزبان را از پری پلاسم به فضای خارج سلولی حمل میکند(20) . در آسینتوباکتر بومانی مشخص شده است که سه پمپ RND مختلف شامل AdeABC, AdeFGH وAdeIJK بسیاری از آنتی بیوتیک ها را از باکتری خارج می کنند.(21)AdeABC یکی از مهمترین سیستم های افلاکس متعلق به خانواده RND است که از3 ژن adeC (کد کننده پروتئین غشای خارجی )، ژن adeA (کد کننده پروتئین فیوژن غشا ) و ژن adeB (کدکننده پروتئین غشای داخلی ) تشکیل شده است (22, 23)این ژن ها بر روی کروموزوم باکتری و در مجاورت هم یک اپرون را میسازند (16).اپرون adeABC در حدود 80% از سویه های اسینتوباکتر بومانی وجود دارد (24, 25) و بیان بیش از حد آن منجر به کاهش حساسیت به آمینوگلیکوزید ها ، سفپیم ، فلوروکینولون ها ، کلرامفنیکل ، تتراسایکلین و تایجسیکلین میشود(26). بیان اپرون ژن های پمپ adeABC تحت کنترل سیستم دو جزئی RS است که از ژن های (تنظیم کننده پاسخ )adeR و (کیناز حسگر )adeS ساخته شده و در بالادست ژن adeA قراردارد (27)

طی مطالعه ای که در سال 2017 در لهستان انجام شد اکثر گونه های بومانی دارای مقاومت بالا (90%) به فلوروکینولون، سفتازیدیم، پیپراسیلین/تازوباکتام بودند(28).

در پاریس سال 2013 طی مطالعه ای که روی 14 ایزوله ی اسینتوباکتر بومانی انجام شد ، ژن adeB در 13 مورد تشخیص داده شد و بیان بیش از حد AdeB در 10 سویه مشاهده شد (29).

درسال2007 در هلند از 116 سویه آسینتوباکتر بومانی ، 95 سویه دارای ژن های adeA، adeB بودند و ژن AdeC تنها در 49 سویه یافت شد.در همین مطالعه 29% سویه ها حساس به تمام عوامل ضد میکروبی ، 59% مقاوم به 3 عامل ضد میکروبی یا بیشتر و 12% از سویه ها مقاوم به یک یا دو عامل ضدمیکروبی بودند(30).

در سال2009 در کانادا ، 75% از ایزوله هایی که مقاومت چند دارویی بالایی داشتند adeABC مثبت بودند (23).

طی مطالعه ای در شهر تهران سال 1396 شیوع ژن های adeAو adeB 100% و adeC 20.4% گزارش گردید (31).

در ایران در سال 1395 فراوانی ژن adeA 88.5% ، adeB 100% و adeC 93.9% گزارش گردید (32).

درمطالعه ای که سال 1393 در اراک روی 56 ایزوله اسینتو باکتر بومانی انجام شد تمامی 56 ایزوله آسینتوباکتر بومانی نسبت به آنتی بیوتیک های سفوتاکسیم، سفتازیدیم، سفوکسیتین، سفپیم، پیپراسیلین/تازوباکتام، ازترونام و سیپروفلوکساسین مقاوم بودند و ژن های adeA و adeB در 100 درصد ایزوله ها و ژن adeC در5/96 درصد ایزوله ها یافت شدند(33).

لذا با توجه به نقش بارز این پمپ در مقاومت آنتی بیوتیکی و با توجه به اینکه در ایران مطالعات کمی در این زمینه صورت گرفته و در زاهدان نیز این نوع مطالعه تاکنون انجام نشده است ، این تحقیق با هدف بررسی فراوانی ژن های کد کننده پمپ افلاکس AdeABC در ایزوله های بالینی آسینتوباکتر بومانی جداشده از بیماران بیمارستان های آموزشی شهر زاهدان انجام میگیرد.

 

1- intensive care unit

[2] -Multidrug resistance
 

[3]- ATP-binding cassette

[4] - major facilitator superfamily

[5] - multidrug and toxic compound extrusion

[6] - small multidrug resistance

[7] - resistance nodulation division

[8] - The drug metabolite transpoter

مشکل جاری که سیاست گزار با آن مواجه است کدام است؟
روش های موجود کدامها هستند؟
پیشنهاد اول نحوه کاربرد

بررسی فراوانی ژن های adeABC در اسینتوباکتر بومانی

محل دوم بکارگیری نتایج تحقیق
سوالات و / یا فرضیات پژوهش

 

1. ایزوله های بالینی آسینتوباکتربومانی نسبت به کدام آنتی بیوتیک ها مقاوم هستند؟

2.فراوانی ژن کدکننده پمپ افلاکس AdeAدرایزوله های بالینی آسینتوباکتر بومانی چقدر است؟

3.فراوانی ژن کدکننده پمپ افلاکس AdeBدرایزوله های بالینی آسینتوباکتر بومانی چقدر است؟

4.فراوانی ژن کدکننده پمپ افلاکس AdeCدرایزوله های بالینی آسینتوباکتر بومانی چقدر است؟

هدف کلی طرح

بررسی الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی و فراوانی ژن های کد کننده افلاکس AdeABC در سویه های آسینتوباکتر بومانی جداشده از بیماران بیمارستان های آموزشی شهر زاهدان

منافع و مضرات روشهای موجود کدامند؟
چرا پیام تحقیق شما حلال مشکل جاری است؟
اهداف اختصاصی

 

1. تعیین الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی در ایزوله های بالینی آسینتوباکتربومانی

2.تعیین فراوانی ژن کدکننده پمپ تراوشی AdeBدرایزوله های بالینی آسینتوباکتر بومانی

3.تعیین فراوانی ژن کدکننده پمپ تراوشی AdeCدرایزوله های بالینی آسینتوباکتر بومانی

4 .تعیین فراوانی ژن کدکننده پمپ تراوشی AdeA درایزوله های بالینی آسینتوباکتر بومانی

پیشنهاد دوم نحوه کاربرد
محل سوم بکارگیری نتایج تحقیق
سازمانها، مراکز و موسسات و سایر بهره برداران بالقوه دستاوردهای طرح

دانشکده پزشکی

پیام تحقیق شما چه منافعی از نظر هزینه، کارایی و بهره وری برای مدیر دارد؟
برای اجرای راه حل پیشنهادی شما چه موانع و حمایتهایی وجود دارند؟
تعریف واژه های تخصصی

آسینتوباکتر بومانی:گونه ای از باکتری های گرم منفی هوازی که عموما در آزمایشگاه بالینی یافت میشود و به طور معمول به آنتی بیوتیک ها مقاومت دارد.

AdeABC :یک نوع از RND افلاکس پمپ های جدا شده از اسینتو باکتر بومانی

RND: نوعی از افلاکس پمپ هایی که باعث کسب مقاومت ذاتی باکتری به آنتی بیوتیک میشود.

پیشنهاد سوم نحوه کاربرد
محل چهارم بکارگیری نتایج تحقیق
نوع مطالعه

توصیفی- مقطعی

جامعه مورد مطالعه(معرفی مشارکت کنندگان)/ محیط پژوهش(معیارهای ورود و خروج ذکر شوند)

ایزوله های بالینی آسینتوباکتر بومانی جداشده از بیماران بیمارستان های آموزشی شهر زاهدان

پیشنهاد چهارم نحوه کاربرد
حجم نمونه و روش محاسبه آن

حجم نمونه با استفاده از فرمول کوکران وبا درنظر گرفتن 0.05=α و 0.05=d از حداقل 16 و حداکثر 384 نمونه متغیر است که با توجه به محدودیت زمانی جمع آوری نمونه ، حجم نمونه را 100 در نظر میگیریم.

روش نمونه گیری(نحوه تخصیص تصادفی و همسانسازی در صورت لزوم ذکر شود)

نمونه گیری به صورت غیراحتمالی و در دسترس صورت میگیرد.

روش و ابزار جمع آوري داده ها / صحت و استحکام داده ها (پرسشنامه یا فرم اطلاعاتی ضمیمه شود)

نمونه هایی که از بیماران بستری به آزمایشگاه ارسال میشود کشت و تعیین هویت شده سپس از نظر مقاومت دارویی و وجود ژن های AdeA و AdeB و AdeC مورد بررسی قرار میگیرند.

روش اجرای طرح(با جزئیات بطور کامل شرح داده شود)

در این مطالعه از نمونه های مختلفی که از بیماران بیمارستان های آموزشی شهر زاهدان به آزمایشگاه ارسال شده است استفاده می گردد.این نمونه ها در محیط های کشت اولیه شامل بلاد آگار و مکانکی آگار کشت داده می شوند بعد از انکوباسیون باکتری های جدا شده با استفاده از روش های استاندارد میکروب شناسی شامل رنگ آمیزی گرم ، تست اکسیداز ، کشت روی محیط TSI و SIM و OF و رشد در دمای 42 درجه سانتی گراد تعیین هویت میشوند و تست اختصاصی گونه به کمک ژن bla OXA-51 توسط واکنش PCR انجام خواهد گردید. پس از تعیین هویت به صورت کشت ذخیره در محیط کشت BHI حاوی 15% گلیسرول وارد کرده وتا زمان استخراج DNA در دمای 70- فریز میگردند.

تست های حساسیت آنتی بیوتیکی

جهت بررسی حساسیت آنتی بیوتیکی ازتست دیسک دیفیوژن آگار به روش کربی بایر مطابق با استاندارد (CLSI)Clinical and laboratory standard institute استفاده میگردد. به طور خلاصه سوسپانسیونی از کلنی های باکتری با کدورت نیم مک فارلند تهیه و پس از آغشته کردن سواپ استریل با سوسپانسیون ، آن را به خوبی روی محیط مولر هینتون آگار پخش نموده ، پس از قرار دادن دیسک های آنتی بیوتیک روی پلیت قطر هاله عدم رشد پس از انکوباسیون در دمای 37 درجه سانتی گراد با خط کش اندازه گیری و نتایج مطابق با دستورالعمل مربوطه ثبت خواهد شد در این آزمون از سویه کنترل ATCC25922 Ecoli به عنوان کنترل کیفی استفاده خواهد شد .

آنتی بیوتیک های مورد استفاده :

این آنتی بیوتیک ها شامل : ایمی پنم ، مروپنم ، سفتازیدیم ، سفپیم ، سیپروفلوکساسین ، تری متوپریم سولفامتوکسازول ، توبرامایسین ،جنتامایسن ، آمپیسیلین ، آمپیسیلین-سولباکتام ، مانیوسیکلین ، داکسی سایکلین ، تایجی سیکلین و ریفامپین می باشند که از شرکت MAST خریداری میگردند.

MIC :به روش E-testبرای کلستین طبق توصیه CLSI انجام و تفسیر میگردد.

استخراج DNA: به روش جوشاندنboiling ) (انجام خواهد شد .

واکنش PCR : واکنش PCR جهت بررسی ژن های adeAو adeB و adeC پمپ افلاکس استفاده خواهد شد . بدین گونه که پس از بهینه سازی شرایط ، واکنش PCR صورت خواهد گرفت و محصولات روی ژل الکترفورز شده و سپس تعدادی از آنها جهت تعیین توالی به شرکت تکاپوزیست ارسال خواهد شد . از پرایمر های زیر نیز جهت تکثیر ژن های مورد نظر استفاده خواهد شد .

 

رفرنس

اندازه محصول

 

توالی نوکلئوتیدی

 

 

پرایمر

 

 

(34)

 

353 جفت باز

 

TAATGCTTTGATCGGCCTTG

 

TGGATTGCACTTCATCTTGG

 

 

bla OXA-51 F

 

bla OXA-51 R

 

 

(35)

510 جفت باز

CTCTAGCCGATGTCGCTCAA

 

ATACCTGAGGCTCGCCACTG

AdeA F

 

AdeA R

 

 

(36)

862 جفت باز

 

 

AAGTATGAATTGATGCTGC

 

AACGATTATATTGTTGTGG

AdeB F

 

AdeB R

(35)

 

435 جفت باز

 

 

TGCGGCAGGTTAGCCCATCG

 

GCGGAACAGGATGACCTGCT

AdeC F

 

AdeC R

 

روش تجزیه، تحليل و توصیف داده‌ها (نمونه‌اي از جدول توخالي ضميمه شود و روش هاي آماري مورد استفاده به طور كامل توضيح داده شود)(کیفی و کمی)

برای توصیف داده ها از جداول توزیع فراوانی و نرم افزار SPSS و در صورت نیاز از سایر شاخص های آماری مرتبط استفاده خواهد شد

منفی

تعداد - درصد

مثبت

تعداد-درصد

نوع ژن

 

 

Ade A

 

 

Ade B

 

 

Ade C

 

ملاحظات اخلاقی

از دفترچه راهنمای عمومی اخلاق در پژوهشهای علوم پزشکی  دارای آزمودنی انسانی  در جمهوری اسلامی ایران کد های اخلاقی شماره 1(هدف اصلی هر پژوهشباید ارتقای سلامت انسانها توأم با رعایت کرامت و حقوق ایشان باشد)،شماره 9(در پژوهشهای پزشکی که ممکن است به محیط زیست آسیب برسانند، باید احتیاطهای لازم در جهت حفظ و نگهداری و عدم آسیب رسانی به محیط ریست انجام گیرد.)،شماره 10 ،شماره13 (کسب رضایت آگاهانه) ،شماره 14 (اگر در طول اجرای پژوهش تغییری در نحوه اجرای پژوهش داده شود ، باید موضوع به اطلاع کمیتهی اخلاق رسانده شود)،شماره 19  (عدم قبول شرکت در پژوهش، یا ادامه ندادن به همکاری، نباید هیچگونه تأثیری بر خدمات درمانی که در همان مؤسسه – نظیر بیمارستان – به فرد ارائه میشود، داشته باشد. این موضوع باید در فرایند اخذ رضایت آگاهانه، به آزمودنی اطلاع داده شود.) ، شماره  25،شماره 28(پژوهشگران موظفند که نتایج پژوهشهای خود را صادقانه ، دقیق، و کامل منتشر کنند. )و شماره 31 (روش پژوهش نباید با ارزشهای احتماعی، فرهنگی و دینی  جامعه در تناقض باشد)رعایت خواهد شد.

محدودیتهای اجرائی طرح و پیش بینی جهت حل آنها

محدودیت ها: تهیه مواد و ابزار مورد نیاز برای آزمایش

راه حل: افزایش زمان انجام طرح

کلمات کلیدی

آسینتوباکتر بومانی، adeABC، RND

فهرست منابع و مراجع
  1. Sunenshine RH, Wright M-O, Maragakis LL, Harris AD, Song X, Hebden J, et al. Multidrug-resistant Acinetobacter Infection Mortality Rate and Length of Hospitalization. Emerg Infect Dis. 2007;13(1):97-103.
  2. Zarrilli R, Giannouli M, Tomasone F, Triassi M, Tsakris A. Carbapenem resistance in Acinetobacter baumannii: the molecular epidemic features of an emerging problem in health care facilities. The Journal of Infection in Developing Countries. 2009;3(05):335-41.
  3. Bou G, Cerveró G, Dominguez MA, Quereda C, Martínez-Beltrán J. Characterization of a nosocomial outbreak caused by a multiresistant acinetobacter baumannii strain with a carbapenem-hydrolyzing enzyme: high-level carbapenem resistance inA. baumannii Is Not Due solely to the presence of β-lactamases. Journal of Clinical Microbiology. 2000;38(9):3299-305.
  4. Gordon NC, Wareham DW. Multidrug-resistant Acinetobacter baumannii: mechanisms of virulence and resistance. International journal of antimicrobial agents. 2010;35(3):219-26.
  5. Fournier PE, Richet H, Weinstein RA. The epidemiology and control of Acinetobacter baumannii in health care facilities. Clinical infectious diseases. 2006;42(5):692-9.
  6. Damier-Piolle L, Magnet S, Brémont S, Lambert T, Courvalin P. AdeIJK, a resistance-nodulation-cell division pump effluxing multiple antibiotics in Acinetobacter baumannii. Antimicrobial agents and chemotherapy. 2008;52(2):557-62.
  7. Poirel L, Nordmann P. Carbapenem resistance in Acinetobacter baumannii: mechanisms and epidemiology. Clinical Microbiology and Infection. 2006;12(9):826-36.
  8. Quale J, Bratu S, Landman D, Heddurshetti R. Molecular epidemiology and mechanisms of carbapenem resistance in Acinetobacter baumannii endemic in New York City. Clinical infectious diseases. 2003;37(2):214-20.
  9. Peleg AY, Seifert H, Paterson DL. Acinetobacter baumannii: Emergence of a Successful Pathogen. Clin Microbiol Rev. 2008;21(3):538-82.
  10. L. Silvia Munoz-Price MD, Robert A. Weinstein MD. Acinetobacter Infection. N Engl J Med. 2008;358:1271-81.
  11. Coyne S, Courvalin P, Perichon B. Efflux-Mediated Antibiotic Resistance in Acinetobacter spp. Antimicrobial agents and chemotherapy. 2011;55(3):947-53.
  12. Nikaido H. Multidrug Resistance in Bacteria. Annual Review of Biochemistry 2009;78:119-46.
  13. Schneiders T, Findlay J, Amyes SG. Efflux Pumps in Acinetobacter baumannii. Acinetobacter Biology and Pathogenesis: Springer; 2008. p. 105-27.
  14. Poole K. Mechanisms of bacterial biocide and antibiotic resistance. Journal of Applied Microbiology. 2002;92(s1).
  15. Soto SM. Role of efflux pumps in the antibiotic resistance of bacteria embedded in a biofilm. Virulence. 2013;4(3):223-9.
  16. Higgins PG, Wisplinghoff H, Stefanik D, Seifert H. Selection of topoisomerase mutations and overexpression of adeB mRNA transcripts during an outbreak of Acinetobacter baumannii. Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 2004;54(4):821-3.
  17. Wieczorek P, Sacha P, Hauschild T, Zórawski M, Krawczyk M, Tryniszewska E. Multidrug resistant Acinetobacter baumannii--the role of AdeABC (RND family) efflux pump in resistance to antibiotics. Folia Histochemica et Cytobiologica. 2008;46(3):257-67.
  18. Nikaido H, Takatsuka Y. Mechanisms of RND multidrug efflux pumps. Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Proteins and Proteomics. 2009;1794(5):769-81.
  19. Anes J, McCusker MP, Fanning S, Martins M. The ins and outs of RND efflux pumps in Escherichia coli. Frontiers in microbiology. 2015;6.
  20. Blair JM, Piddock LJ. Structure, function and inhibition of RND efflux pumps in Gram-negative bacteria: an update. Current Opinion in Microbiology. 2009;12(5):512-9.
  21. Fernando D, Kumar A. Growth phase-dependent expression of RND efflux pump- and outer membrane porin-encoding genes in Acinetobacter baumannii ATCC 19606. J Antimicrob Chemother. 2012;67(3):569-72.
  22. Coyne S, Courvalin P, Périchon B. Efflux-mediated antibiotic resistance in Acinetobacter spp. Antimicrobial agents and chemotherapy. 2011;55(3):947-53.
  23. Lin L, Ling B-D, Li X-Z. Distribution of the multidrug efflux pump genes, adeABC, adeDE and adeIJK, and class 1 integron genes in multiple-antimicrobial-resistant clinical isolates of Acinetobacter baumannii–Acinetobacter calcoaceticus complex. International journal of antimicrobial agents. 2009;33(1):27-32.
  24. Zgurskaya HI, Weeks JW, Ntreh AT, Nickels LM, Wolloscheck D. Mechanism of coupling drug transport reactions located in two different membranes. Frontiers in microbiology. 2015;6.
  25. Köhler T, Pechère J-C, Plesiat P. Bacterial antibiotic efflux systems of medical importance. Cellular and Molecular Life Sciences. 1999;56(9):771-8.
  26. Coyne S, Guigon G, Courvalin P, Périchon B. Screening and quantification of the expression of antibiotic resistance genes in Acinetobacter baumannii with a microarray. Antimicrobial agents and chemotherapy. 2010;54(1):333-40.
  27. PiotrWieczorek, Sacha P, Hauschild T, Zórawski M, Krawczyk M, Tryniszewska E. Multidrug resistant Acinetobacter baumannii – the role of AdeABC (RND family) efflux pump in resistance to antibiotics. Folia histochemica et cytobiologica. 2008;46(3):257-67.
  28. Grochowalska A, Kozioł-Montewka M, Sobieszczańska A. Analysis of Acinetobacter baumannii resistance patterns in patients with chronic obstructive pulmonary disease (COPD) in terms of choice of effective empiric antibiotic therapy. Ann Agric Environ Med. 2017;24(2):307-11.
  29. Yoon E-J, Courvalin P, Grillot-Courvalin C. Mutations AdeABC Overexpression and AdeRS Acinetobacter baumannii: Major Role for Multidrug-Resistant Clinical Isolates of RND-Type Efflux Pumps in. Antimicrob Agents Chemother. 2013;57(7):2990-5.
  30. Nemec A, Maixnerová M, Reijden TJKvd, Broek PJvd, Dijkshoorn L. Relationship between the AdeABC efflux system gene content, netilmicin susceptibility and multidrug resistance in a genotypically diverse collection of Acinetobacter baumannii strains J Antimicrob Chemother. 2007;60(3):483-9.
  31. Savari M, Ekrami A, Shoja S, Bahador A. Plasmid borne Carbapenem-Hydrolyzing Class D β-Lactamases (CHDLs) and AdeABC efflux pump conferring carbapenem-tigecycline resistance among Acinetobacter baumannii isolates harboring TnAbaRs. Microbial Pathogenesis. 2017;104:310-7.
  32. Angoti G, Bandehpour M, Goudarzi H, Hajizadeh M, Zarringhalam Moghaddam M, Kouchaki A. Detection of Efflux Pump Genes (adeA, adeB, adeC and abeM) in Acinetobacter baumannii Isolated from Hospitalize Patients, North-west of Iran. Infection, Epidemiology and Medicine. 2016;2(4):8-11.
  33. ژاپونینژاد ع, صوفیان م, غزنویراد اا. در سویه های بالینی آسینتوباکتر بومانی و ارزیابی نقش آن در ایجاد مقاومت نسبت به ایمیپنم AdeABC تشخیص مولکولی ژن های پمپ تراوشی دوماهنامه طبّ جنوب. 1393;5:815-23.
  34. Cherkaoui A, Emonet S, Renzi G, Schrenzel J. Characteristics of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii strains isolated in Geneva during colonization or infection. Annals of clinical microbiology and antimicrobials. 2015;14(1):42.
  35. Szabó D, Silveira F, Hujer AM, Bonomo RA, Hujer KM, Marsh JW, et al. Outer membrane protein changes and efflux pump expression together may confer resistance to ertapenem in Enterobacter cloacae. Antimicrobial agents and chemotherapy. 2006;50(8):2833-5.
  36. Snelling AM, Gerner-Smidt P, Hawkey PM, Heritage J, Parnell P, Porter C, et al. Validation of use of whole-cell repetitive extragenic palindromic sequence-based PCR (REP-PCR) for typing strains belonging to the Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii complex and application of the method to the investigation of a hospital outbreak. Journal of clinical microbiology. 1996;34(5):1193-202.

 

معرفی پژوهش/ اهداف پژوهش
(عین عبارت هدف پروپوزال را کپی نکنید. بلکه با جملاتی که برای مردم قابل فهم باشد (برای سواد حدود پنجم ابتدایی )هدف را برای شرکت کنندگان توضیح دهید.) در تمام این متن در صورتیکه شرکت کننده کودک یا فرد فاقد ظرفیت تصمیم گیری است باید مواردیکه منظور از "من"، فرد شرکت کننده بوده است به "کودک" یا "فرد تحت سرپرستی من" اصلاح شود و مواردیکه منظور از "من"، رضایت دهنده است به من به عنوان "ولی" یا "قیم قانونی" اصلاح شود.

آسینتوباکتر(Acinetobacter) کوکوباسیل گرم منفی و هوازی است که می تواند برای مدتی طولانی در محیط وتجهیزات مراقبت بهداشتی زنده بماند(1) . جنس اسینتوباکتر حاوی بیش از 32 گونه مختلف است واسینتوباکتر بومانی گونه غالب میباشد (2)که عامل بیماری های مختلفی از قبیل پنومونی ،سپتی سمی ،عفونت های دستگاه ادراری ، عفونت های پوستی و زخم ،مننژیت و اندوکاردیت میباشد (3, 4) . اسینتوباکتر بومانی یک پاتوژن فرصت طلب در حال گسترش است که گروههای مختلفی از مردم ،به ویژه بیماران بستری در بخش مراقبت های ویژه([1]ICU) را تحت تاثیر قرار میدهد . ریسک فاکتور های متعدد مستعد کننده عفونت با این باکتری شامل : بستری طولانی مدت در بیمارستان ، نقص ایمنی ،اعمال جراحی ،تماس طولانی مدت با بیماران کلونیزه شده،سوختگی ، کهولت سن، مصرف عوامل آنتی باکتریال وسیع الطیف و وجود عوامل تهاجمی مثل کاتتر میباشند(5).یکی از مشکلات ایجاد شده توسط اسینتوباکتر بومانی بروز مقاومت آنتی بیوتیکی می باشد که مشکلات زیادی را در درمان و بهبود بیماران ایجاد میکند (6).مقاومت آنتی بیوتیکی اسینتوباکتر بومانی به واسطه مکانیسم های اکتسابی و ذاتی است که این مکانیسم ها شامل : موتاسیون در ژن های هدف ،تغییر نفوذپذیری غشای خارجی و افزایش بیان پمپ های افلاکس میباشد .(7, 8)شیوع سریع مقاومت گونه های آسینتوباکتربومانی به همه ی بتالاکتام ها از جمله کارباپنم ها، نشان دهنده پتانسیل این ارگانیسم برای پاسخ سریع به تغییر فشار محیط می باشد.(9) آسینتوباکتربومانی می تواند از طریق جهش در ژن های gyrA و parC نسبت به کینولون ها و با بیان آنزیم های تغییردهنده آمینوگلیکوزید در برابر آمینوگلیکوزیدها مقاوم شود.(10)

خون گیری
(آیا طرح شما نیاز به خونگیری دارد یا خیر)

ندارد

نحوه همکاری/ مزایا ی طرح
(در این بخش برای شرکت کنندگان به زبان ساده توضیح دهید که: چه مداخله ای بر روی آنها صورت میگیرد. چه اقدامات پاراکلینیکی بر روی آنها انجام میشود. چه نمونه ای و با چه حجمی از آنها میگیرید در این مدت چند نوبت مراجعه باید داشته باشند و به چه فواصلی چه اقداماتی را در پیگیری آنها انجام میدهید. (حتی میتوانید سود بالقوه ای که شرکت کنندگان میتوانند از شرکت در این پژوهش ببرند بنویسید. این سود میتواند شرح احتمال درمان یا تشخیص بهتر بیماریشان، دریافت خدمات سلامت رایگان و یا پرداخت مشوق مالی در ازای جبران همکاریشان باشد)

با توجه به نقش بارز این پمپ در مقاومت آنتی بیوتیکی و با توجه به اینکه در ایران مطالعات کمی در این زمینه صورت گرفته و در زاهدان نیز این نوع مطالعه تاکنون انجام نشده است ، این تحقیق با هدف بررسی فراوانی ژن های کد کننده پمپ افلاکس AdeABC در ایزوله های بالینی آسینتوباکتر بومانی جداشده از بیماران بیمارستان های آموزشی شهر زاهدان انجام میگیرد.

عوارض جانبی
(منظور عوارض و میزان احتمال بروز آنها در این مطالعه است)

ندارد

جبران عوارض احتمالی
(برای آنکه شرکت کننده بتواند ارزیابی مناسبی از سود و زیان شرکت در پژوهش شما داشته باشد لازم است بتواند سود و زیان مداخلات معمول و مداخلات این پژوهش را مقایسه کند. به عنوان مثال میزان موفقیت و میزان عوارض هریک را مقایسه کند.) - او باید بداند كه اگر در حين و بعد از انجام پژوهش هم هر مشكلي اعم از جسمي و روحي به علت شرکت در اين پژوهش برایش پيش آمد درمان عوارض، و هزينه‌هاي آن و غرامت مربوطه بر عهده مجري خواهد بود.

ندارد

هزینه های مربوط به انجام طرح تحقیقاتی
(تمام مداخلات پژوهشی باید برای بیمار رایگان باشد و بیمار بداند شامل چه مواردی هستند. )

هیچ گونه هزینه ای از ابتدا تا انتهای انجام طرح از بیمار وصول نخواهد شد

روش های جایگزین
در صورت عدم تمایل به شرکت در مطالعه چه روش های درمانی برای بیمار ارائه خواهد شد

ندارد

محرمانه بودن
بیمار باید بداندکه دست اندر كاران اين پژوهش، كليه اطلاعات مربوط به او را نزد خود به صورت محرمانه نگه‌داشته و فقط اجازه دارند نتايج كلي و گروهي اين پژوهش را بدون ذکر نام و مشخصات بیمار منتشر كنند. و كميته اخلاق در پژوهش با هدف نظارت بر رعایت حقوق وی مي‌تواند به اطلاعات ایشان دسترسي داشته باشد.

کلیه ی اطلاعات هویتی بیمار.نتایج ازمایشات.واطلاعات بدست امده در طول انجام ازمایشات کاملا محرمانه نگهداری شده و به اطلاع بیمار خواهد رسید

پاسخگویی به پرسش ها
در این بخش نام و اطلاعات دسترسی فردی از عوامل پژوهش را که بتواند اطلاعات صحیح و کافی در اختیار شرکت کنندگان قرار دهند و در مورد عوارض و نگرانیها راهنمایی لازم را ارائه دهند ذکر شود

اقای دکترشهرام شهرکی- بیمارستان امام علی09151411339

 

حق نپذیرفتن یا انصراف
بیمار باید بداند که شرکت اودر اين پژوهش کاملاً داوطلبانه است و مجبور به شرکت در اين پژوهش نيست و در صورت عدم شرکت از مراقبت‌هاي معمول تشخيصي و درماني محروم نخواهد شد او باید بداند كه حتي پس از موافقت با شركت در پژوهش مي‌تواند هر وقت كه بخواهد، پس از اطلاع به مجري، از پژوهش خارج شود و خروج اواز پژوهش باعث محرومیت از دریافت خدمات درمانی معمول برای اونخواهد شد.

شرکت من در مطالعه کاملاً اختیاری است و آزاد خواهم بود که از شرکت در مطالعه امتناع نموده یا هر زمان که مایل بودم بدون آنکه تغییری در نحوه رفتار پزشک درمانگر یا نحوه درمان و مراقبت از بیماری اینجانب ایجاد شود از پژوهش مذکور خارج شوم.

رضایت
او باید بداند که اگر اشکال يا اعتراضي نسبت به دست اندركاران يا روند پژوهش دارد مي تواند با كميته اخلاق در پژوهش دانشگاه تماس گرفته و مشکل خود را به صورت شفاهي يا كتبي مطرح نمايد. در انتهای فرم قید گردد : اينجانب موارد فوق‌الذکر را خواندم و فهميدم و بر اساس آن رضايت آگاهانه خود را براي شركت در اين پژوهش اعلام مي‌کنم. اينجانب ……………… خود را ملزم به اجراي تعهدات مربوط به مجري در مفاد فوق دانسته و متعهد مي‌گردم در تأمين حقوق و ايمني شركت كننده در اين پژوهش تلاش نمايم

با توجه به اطلاعات موجود در این فرم و توضیحات حضوری مجری یا همکاران طرح موافقت خود را با شرکت در این مطالعه اعلان می نمایم. یک نسخه از این فرم به من داده شده و فرصت خواندن آن را داشته ام.

پرسشنامه یا فرم اطلاعاتی

ندارد


پیوست ها
hide/show

نام فایل تاریخ درج فایل اندازه فایل دانلود
payaname.pdf1398/03/052847797دانلود