بررسی فراوانی ژن های بتالاکتامازی GES، IMP ، VIM ، SPM ، GIM ، SIM ،AIM ، NDM و الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی در سویه های آسینتو باکتر بومانی جدا شده از بیماران مراجعه کننده به بیمارستان های آموزشی زاهدان

ارگانیسم های عامل عفونت های بیمارستانی مشکلات فراوانی را برای بیماران وبخش درمانی ایجاد می کنند(1).در بین این باکتریها آسینتوباکتر یک پاتوژن مهم بیمارستانی است که کنترل عفونتهای ناشی از آن به دلیل مقاومت های دارویی چندگانه مشکل است (2). آسینتوباکتر یک کوکو باسیل گرم منفی ، هوازی ، پلی مورف ، غیر متحرک و از اعضا خانواده نایسریاسه می باشد که معمولا در همه نقاط طبیعت از جمله آب ، خاک ، فاضلاب ، ریشه گیاهان و مواد غذایی یافت می شوند (3) این باکتری در سال 1911 توسط یک میکروبیولوژیست هلندی به نام بایرینک کشف گردید(4). جنس آسینتوباکتر حاوی 32 گونه مختلف می باشد که رایج ترین و مهمترین گونه آن در سویه های بالینی آسینتوباکتر بومانی می باشد(5) بطوریکه در سال 2004 مرکز کنترل بیماری (CD ) Centers for Disease Control and Prevention گونه ی آسینتوباکتر بومانی را عامل 80% عفونتهای آسینتوباکتر اعلام کرد که به عنوان یک عامل مهم در عفونتهای بیمارستانی شناسایی می شود و شیوع آن از سراسر جهان گزارش شده است (6) این باکتری عامل 2-10%تمام عفونتهای گرم منفی و عامل 9% از کل عفونتهای بیمارستانی می باشد(7).

آسینتوباکتر بومانی بخشی از فلور نرمال پوست بخصوص در نواحی مرطوب بدن مانند کشاله ران ، زیر بغل و بین انگشتان می باشد و میتواند دردهان وگلو نیز مستقر شود و در افراد سالم باعث عفونتهای جدی شود (8). این ارگانیسم از راه  مجاری تنفسی ، زخم های باز، کاتتر ادراری  وارد بدن می شود و باعث باکتریمی مرتبط با کاتتر، آندوکاردیت، عفونت پوست ، پنومونی مرتبط با ونتیلاتور، عفونت دستگاه ادراری، مننژیت ، عفونت زخم )9( و همچنین عامل اصلی عفونت های بیمارستانی بخصوص در بیماران بستری در بخش ICU  به علت شرایط خاص این بیماران و استفاده از تجهیزات مختلف پزشکی در طول درمان در این بیماران می باشد (10) همچنین در بیماران دچار سوختگی آسینتوباکتر به عنوان پاتوژن فرصت طلب باعث عفونت خون می شود(11). میزان کلونیزاسیون آسینتوباکتر بومانی طی سالهای اخیر در افراد بستری شده در حال افزایش است (12) زیرا این باکتری قادر است به مدت طولانی در محیط بیمارستان زنده بماند (13) توانایی این باکتری در زنده ماندن  در سطوح  مختلف در بیمارستانها از جمله کاتتر و سایر تجهیزات پزشکی و همچنین مقاومت به آنتی بیوتیک ها ، مقاومت به خشکی و مقاومت به مواد ضدعفونی کننده عامل گسترش بیمارستانی این باکتری می باشد (14) .

یک مشکل اصلی در درمان و کنترل عفونتها ، مقاومت آنتی بیوتیکی می باشد در مورد مقاومت سویه های آسینتوباکتر به تمامی آنتی بیوتیک های شناخته شده گزارش هایی از سراسر دنیا وجود دارد (15).  به علت مقاومت چند دارویی ، درمان عفونتهای ناشی از این باکتری مشکل بوده و باعث 23% مرگ و میر بیماران بستری در بیمارستان و 43% مرگ ومیر بیماران بستری در ICU می شود (16).  این باکتری توانایی بالایی برای کسب مقاومت به چندین کلاس از آنتی بیوتیک ها از جمله

Aminoglycoside)-  fluoroquinolo -  -Lactamβ( و بیان ژن های متعدد عامل مقاومت دارویی را دارد (17) بطوریکه امروزه میزان افزایش مقاومت به دارو در سویه های آسینتوباکتر بومانی یک نگرانی بزرگ در سراسر جهان می باشد (18)وجود این سویه ها با طولانی شدن مدت بستری ، افزایش هزینه درمان و در نهایت مرگ ومیر بیماران ارتباط دارد )19(.

برای درمان عفونتهای ناشی از این باکتری آنتی بیوتیک های خانواده بتالاکتام مورد استفاده قرار می گیرد که در سالهای اخیر افزایش استفاده از این آنتی بیوتیک ها منجر به ظهور سویه های مقاوم شده است (20). باکتری ها توسط مکانیسم هایی که شامل تولید آنزیم های بتالاکتام ، تغییر در PBP ( (Penicillin binding proteins، جهش در پورین ها و افزایش فعالیت پمپ افلاکس  به آنتی بیوتیک های بتالاکتام مقاوم می شوند (21). در سال 1980کارباپنم ها به عنوان گزینه درمانی جدید برای عفونتهای باکتریایی از جمله آسینتوباکتر معرفی شدند (18) .کارباپنم ها گروهی از بتالاکتام ها هستند که توسط استرپتومایسس کاتیلیه) Streptomyces cattylea ( تولید می شوند و شامل (ایمی پنم ، مروپنم ، ارتاپنم و دوری پنم ) می باشند و امروزه به عنوان آنتی بیوتیک انتخابی برای درمان عفونت های آسینتوباکتر مقاوم به چند دارو مورد استفاده قرار می گیرند (20) بااین حال افزایش مقاومت به این آنتی بیوتیک ها به یک نگرانی بزرگ در سراسر جهان تبدیل شده است و درمان را با محدودیت جدی مواجه ساخته است (22). کرباپنم ها آنتی بیوتیک های باکتریوسیدال هستند و مکانیسم عمل آنها مهار سنتز دیواره سلولی در باکتریها می باشد که باعث افزایش نفوذ پذیری غشای خارجی باکتری و اثر روی سیستم پمپ آنها می شود (23) مقاومت به کارباپنم ها در آسینتوباکتر توسط مکانیسم های آنزیمی و غیر آنزیمی ایجاد می شود که شامل تغییر پروتیین های غشای خارجی )OMPs(، پمپ های افلاکس  و تغییرات در پروتیین های متصل شونده به پنی سیلین می باشد که مهمترین مکانیسم مقاومت به کرباپنم ها  در آسینتوباکتر بامانی مقاومت آنزیمی از نوع کرباپنمازها می باشد (21).براساس طبقه بندی آمبلر ) (Amble، آنزیم های هیدرولیز کننده کارباپنم به سه گروهB, A  , D تقسیم می شوند گروه A بتالاکتامازهایی هستند که در جایگاه فعال آنزیم اسید آمینه سرین دارند و با کلاولانیک اسید مهار می شوند که شاملKPC  که بیشتر در سودوموناس آئروژینوزا و انتروباکتریاسه یافت می شوند و GES  که در آسینتوباکتر بومانی می باشد(24).

 آنزیم Guiana Extended spectrum)) GES برای اولین بار در سال 2000 در یک سویه بالینی کلبسیلا پنومونیه در فرانسه شناسایی شد (15).از سال 2000 تاکنون از سراسر جهان بیش از 15 نوع از آنزیم های GES گزارش شده است که شایع ترین آنها  GES 1 و  GES 2 می باشد ژن های GES اغلب روی پلاسمید قرار دارند و توانایی هیدرولیز ایمی پنم و سفالوسپورین وسیع الطیف را دارا می باشند (25-26). کلاسB  آمبلر شامل متالوبتالاکتاماز ها (MBLs ) می باشد،MBLs  بتالاکتامازهایی هستند که به عنصر روی (Zn) درجایگاه فعال خود نیاز دارند که شامل زیر کلاس های B1-B3 می باشند(24) . متالوبتالاکتامازها برای اولین بار در سال 1960 در باسیلوس سریوس شناخته شد(27-28) و می توانند طیف وسیعی از پنی سیلین ها ، سفالوسپورین ها ، و کارباپنم ها را با شکستن پیوند آمیدی در حلقه بتالاکتام هیدرولیز کنند ولی قادر به هیدرولیز مونوباکتام ها نمی باشند و توسط کلاولانیک اسید، تازوباکتام و سولباکتام مهار نمی شوند البته  در محیطinvitro  توسط ترکیبات شلات کننده مانند اتیلن دی آمین تترااستیک اسید ( EDTA)   و مشتقات تیول مهار می شوند (29-30). MBLs  ها شامل آنزیم های IMP-VIM –SPM - GIM- SIM -AIM-NDM  می باشند که شایع ترین این آنزیمها VIM و IMP  می باشد (31). متالوبتالاکتاماز نوع IMP (Imipenemase)  برای اولین بار در یک سویه سودوموناس آئروژینوزا در سال 1988 در ژاپن گزارش شد آنزیم IMP از زیر کلاس B1 می باشد ژن این آنزیم روی اینتگرون کلاس یک پلاسمید 120 کیلوبازی قرار دارد و تاکنون بیش از 44 نوع از ژن bla IMP در باسیل های گرم منفی گزارش شده است (32) این ژن می تواند ایمی پنم و برخی از سفالوسپورین های وسیع اطیف را هیدرولیز کند (15). متالوبتالاکتامازهای (VIM (Verao Imipenamse برای اولین بار در سال 1990 شهر ورونای ایتالیا در سودوموناس آیروژینوزا گزارش شد و تاکنون بیشتر از 38 نوع از این ژن گزارش شده است (29). ژن این آنزیم روی اینتگرون کلاس 1 قرار دارد آنزیم  VIMبه بتالاکتامازهایی چون پی پراسین، سفتازیدیم، ایمی پنم و ازترونام مقاوم می باشد(33-34).

متالوبتالاکتامازهای نوع SPM (Sao Paulo Metallo B lactamase )  در سال 1997 در سائوپایولو برزیل گزارش شد و از نظر توالی ژن بیشترین شباهت را با ژن bla IMP  دارد و مانند IMP و VIM  توانایی هیدرولیز کلاولانیک اسید و ازترونام را ندارد سوبسترای SPM پنی سیلین هایی مثل پنی سیلین ، آمپی سیلین ،پیپراسیلین و سفالوتین می باشد (35-32).  متالوبتالاکتاماز  (Germany Imipenemase)GIM  در سال 2002 در سویه سودوموناس آئروژینوزادر آلمان شناسایی شد  توالی این ژن بیشترین تشابه را با bla IMP-4 وbla IMP1 و  bla IMP 6  دارد و روی اینتگرونهای کلاس یک حمل می شود این ژن فقط به پلی میکسین حساس می باشد (32).

متالوبتالاکتامازهای نوع SIM  (Seoul Imipenemase)  نیز جز زیرکلاس B1 می باشد و اولین بار در کره جنوبی در باکتری آسینتوباکتر بومانی گزارش شد این آنزیم قادر به هیدرولیز طیف گسترده ای از آنتی بیوتیک های بتالاکتام مانند پنی سیلین ها، سفالوسپورین ها وکرباپنم ها می باشد (36-37). متالوبتالاکتامازهای AIM برای اولین بار در استرالیا در سودوموناس آئروژنزای جدا شده از یک بیمار دچار ضعف ایمنی گزارش شد و نسبت به دیگر آنزیم ها مثل GIM،SIM،VIM،IMP کمتر شناخته شده است (32) .

متالوبتالاکتاماز دهلی نو( (New Delhi Metalo β-lactamase  NDMاولین بار در سال 2008 در کلبسیلا پنومونیه و اشریشیاکلی و در یک بیمار سوئدی که از هند برگشته بود شناسایی گردید(38) و تاکنون در بسیاری از کشورها مانند انگلستان ، کانادا ، استرالیا و خاورمیانه گزارش شده است(39). باکتریهای تولید کننده NDM  به تمام گروههای آنتی بیوتیکی (فلوروکینولونها ،آمینوگلیکوزیدها ،و بتالاکتام ها ) مقاوم هستند و سویه های دارای ژن bla NDM  مقاومت سطح بالایی به کارباپانم ها ایجاد می کنند(40). باکتریهای تولیدکنندهbla NDM-1 به عنوان یک تهدید جدید در سلامت بشر شناخته شده زیرا این ژن روی پلاسمیدهای بزرگ شناسایی شده و به راحتی بین باکتریها انتقال می یابد (40).

در مطالعه ای که در سال 2016 در تهران انجام شد از 108 سویه آسینتوباکتر بومانی فراوانی ژن bla VIM %17/44 گزارش شد و ژن های , bla NDM , bla GIM  bla AIM وbla DIM  در هیچ سویه ای مشاهده نگردید(40).

در مطالعه ی دیگری که در سال 2018 در بندرعباس انجام شد از 81 سویه آسینتوباکتربومانی فراوانی ژن IMP 16% گزارش شدو ژن VIM در هیچ سویه ای مشاهده نگردید(9).

طی مطالعه دیگری که در سال 2014 در تهران انجام شد از 108 سویه ی آسینتوباکتر بومانی فراوانی ژن IMP 48/3% گزارش شد وژنSPM  در هیچ سویه ای یافت نشد (41).

در مطالعه ای که در سال 2015 در کویت انجام شد 100 سویه آسینتوباکتر بومانی مورد بررسی قرار گرفتند که در این مطالعه ژنهای  VIM, IMP , NDM وGES  در هیچ سویه ای مشاهده نگردید(42).

 در مطالعه ای که در سال 2018 در تایلند انجام شد از 339 سویه آسینتوباکتر بومانی فراوانی ژن NDM 1/9 % گزارش شد(43). 

در مطالعه ای که در سال 2018 در تونس انجام شد از 101 سویه آسینتوباکتر بومانی ژن NDM  فقط در یک سویه مشاهده گردید و فراوانی آن (1%>) گزارش شد و ژنهای IMP  و VIM در هیچ سویه ای مشاهده نشدند(44) .

در مطالعه ای که در سال 2016 در ترکیه انجام شده بود از 519 سویه آسینتوباکتر بومانی فراوانی ژن bla GES  5/1% و فراوانی ژن  bla VIM 2/0% گزارش شد(45).

شیوع  و گسترش عفونت های بیمارستانی از علل شایع و مهم مرگ و میر، ناتوانی، افزایش طول مدت بستری و افزایش هزینه های بیمارستانی و بروزمشکلات بهداشتی می باشند. آسینتوباکترهای مقاوم به چنددارو مشکلات درمانی دردنیا ایجاد نموده اندو درکشورایران نیز یک مشکل نوظهور می باشند و یک تهدید جدی در سلامت بشر می باشد و از آنجایی که شیوع باکتریها و فراوانی مقاومت آنتی بیوتیکی در مناطق مختلف می تواند متفاوت باشد هدف از این مطالعه بررسی فراوانی سویه های اسینتوباکتربومانی تولیدکننده بتالاکتامازهای GES، IMP ، VIM ، SPM ، GIM ، SIM ،AIM ، NDM  به روش فنوتیپی و ژنوتیپی جدا شده از بیماران مراجعه کننده به  بیمارستان های آموزش شهر زاهدان انجام می گیرد.

1. توزیع فراوانی الگوی مقاومت و حساسیت آنتی بیوتیکی در سویه های آسینتو باکتر بومانی چگونه است؟

2. توزیع فراوانی ژن  GESدرایزوله های بالینی آسینتوباکتر بومانی چگونه  است؟

3. توزیع فراوانی ژن  NDMدرایزوله های بالینی آسینتوباکتر بومانی چگونه  است؟

4.توزیع فراوانی ژن GIMدرایزوله های بالینی آسینتوباکتر بومانی چگونه  است؟

5.توزیع فراوانی ژن  VIMدر ایزوله های بالینی آسینتوباکتر بومانی چگونه است؟

6.توزیع فراوانی ژن  IMPدر ایزوله های بالینی آسینتوباکتر بومانی چگونه است؟

7.توزیع فراوانی ژن  SPMدر ایزوله های بالینی آسینتوباکتر بومانی چگونه است؟

8.توزیع فراوانی ژنAIM   در ایزوله های بالینی آسینتوباکتر بومانی چگونه است؟

9.توزیع فراوانی ژن SIM در ایزوله های بالینی آسینتوباکتر بومانی چگونه است؟

بررسی فراوانی ژنهای بتالاکتامازی (( GES -SIM- IMP-SPM-GIM-VIM-AIM-NDM و الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی در سویه های آسینتو باکتر بومانی جدا شده از بیمارستان های آموزشی زاهدان

1. تعیین  توزیع فراوانی الگوی مقاومت و حساسیت آنتی بیوتیکی در سویه های آسینتوباکتر بومانی در بیمارستان های آموزشی شهر زاهدان

2. تعیین فراوانی ژن  GES در  ایزوله های بالینی آسینتوباکتر بومانی در بیمارستان های آموزشی شهر زاهدان

3. تعیین فراوانی ژنSIM  درایزوله های بالینی آسینتوباکتر بومانی  در بیمارستان های آموزشی شهر زاهدان

4. تعیین فراوانی ژن  NDMدر ایزوله های بالینی آسینتو باکتر بومانی در بیمارستان های آموزشی شهر زاهدان 

5. تعیین فراوانی ژن AIM در ایزوله های بالینی آسینتو باکتر بومانی در بیمارستان های آموزشی شهر زاهدان 

6. تعیین فراوانی ژن VIM در ایزوله های بالینی آسینتو باکتر بومانی در بیمارستان های آموزشی شهر زاهدان 

7. تعیین فراوانی ژن  GIM در ایزوله های بالینی آسینتو باکتر بومانی در بیمارستان های آموزشی شهر زاهدان 

8. تعیین فراوانی ژن  SPM در ایزوله های بالینی آسینتو باکتر بومانی در بیمارستان های آموزشی شهر زاهدان 

9. تعیین فراوانی ژن  IMP در ایزوله های بالینی آسینتو باکتر بومانی در بیمارستان های آموزشی شهر زاهدان 

پژوهشگران

آسینتوباکتر بومانی:گونه ای از باکتری های گرم منفی هوازی که عموما در آزمایشگاه بالینی یافت میشود و به طور معمول به آنتی بیوتیک ها مقاومت دارد

مقطعی(توصیفی)

ایزوله های بالینی آسینتوباکتر بومانی جداشده از بیماران  بیمارستان های آموزشی شهر زاهدان

حجم نمونه با استفاده از فرمول کوکران با در نظر گرفتن α= 0.05  و d=0.05 از حداقل 70 و حداکثر 385 نمونه متغیر است که با توجه به محدودیت زمان جمع آوری نمونه ، 120 در نظر گرفته شد

با استفاده از روش نمونه گیری آسان یا در دسترس پس از تصویب طرح تا زمان رسیدن به حجم نمونه مورد نظر مطالعه ادامه خواهد داشت.

نمونه هایی که از بیماران بستری به آزمایشگاه ارسال میشود کشت و تعیین هویت شده ، سپس از نظر مقاومت دارویی و وجود ژن های GES -SIM- IMP – SPM –GIM –VIM –AIM - NDM مورد بررسی قرار میگیرند.

در این مطالعه از نمونه های مختلفی که از بیماران  بیمارستان های آموزشی شهر زاهدان به آزمایشگاه ارسال شده است استفاده می گردد. این نمونه ها در محیط های کشت اولیه شامل بلاد آگار و مکانکی آگار کشت داده می شوند بعد از انکوباسیون باکتری های جدا شده با استفاده از روش های استاندارد میکروب شناسی شامل رنگ آمیزی گرم ، تست اکسیداز ، کشت روی محیط TSI ، SIM ،OF و رشد در دمای 42 درجه سانتی گراد تعیین هویت می شوند . و تست اختصاصی گونه به کمک ژن bla OXA-51  توسط واکنش PCR انجام خواهد گردید پس از تعیین هویت به صورت کشت ذخیره در محیط کشت BHI   حاوی  15% گلیسرول وارد کرده و تا زمان استخراج DNA در دمای 70- فریز می گردند.

تست های حساسیت آنتی بیوتیکی

جهت بررسی حساسیت آنتی بیوتیکی ازتست دیسک دیفیوژن آگار به روش کربی– بایر مطابق با استاندارد (CLSI)Clinical and laboratory standard institute استفاده میگردد. به طور خلاصه سوسپانسیونی از کلنی های باکتری با کدورت نیم مک فارلند تهیه و پس از آغشته کردن سواپ استریل با سوسپانسیون ، آن را به خوبی روی محیط مولر هینتون آگار پخش نموده ، پس از قرار دادن دیسک های آنتی بیوتیک روی پلیت قطر هاله عدم رشد پس از انکوباسیون در دمای 37 درجه سانتی گراد با خط کش اندازه گیری و نتایج مطابق با دستورالعمل مربوطه ثبت خواهد شد در این آزمون از سویه کنترل ATCC25922 Ecoli به عنوان کنترل کیفی استفاده خواهد شد

این آنتی بیوتیک ها شامل : ایمی پنم ، مروپنم ، سفتازیدیم ، سفپیم ، سیپروفلوکساسین ، تری متوپریم سولفامتوکسازول ، توبرامایسین ،جنتامایسن ، آمپیسیلین ، آمپیسیلین-سولباکتام ، مانیوسیکلین ، داکسی سایکلین ، تایجی سیکلین ،سفتازیدیم ،سفوتاکسیم، کوتریموکسازول،  ریفامپین می باشند که از شرکت MAST خریداری میگردند.

برای بررسی آنزیم های کرباپنماز به روش فنوتیپی از آزمون دیسک دیفیوژن ترکیبی استفاده خواهد شد

در این آزمون  ترکیبی معادل غلظت نیم مک فارلند از نمونه های مقاوم به کرباپنم تهیه و روی محیط مولرهینتون آگار کشت چمنی داده پس از چند دقیقه دو عدد دیسک ایمی پنم 10 میکروگرم با فاصله روی پلیت قرار داده می شود روی یکی از دیسک ها 10 میکرولیتر EDTA نیم مولار ریخته و به مدت 24-18 ساعت در 37 درجه انکوبه می گردد سپس هاله عدم رشد دیسک ایمی پنم و (ایمی پنم + EDTA ) با هم مقایسه می شوند. نمونه هایی که هاله عدم رشد (دیسک ایمی پنم + EDTA) آنها 7 میلی متر بیشتر از دیسک ایمی پنم می باشد به عنوان سویه های متالوبتالاکتاماز مثبت در نظر گرفته می شوند.

MIC :به روش براث دیلوشن برای کولستین طبق توصیه CLSI انجام و تفسیر میگردد.

استخراج DNA: ژن های متالوبتالاکتامازروی پلاسمید و عناصرژنتیکی متحرک قرار دارند و می توانند به کروموزوم اصلی باکتری وارد شوند ، استخراج DNA به روش جوشاندنboiling ) (انجام خواهد شد .

واکنش PCR : جهت بررسی ژن های GES - SIM - IMP -SPM -GIM –VIM- AIM - NDM   استفاده خواهد شد .  بدین گونه که پس از بهینه سازی شرایط ، واکنش  صورت خواهد گرفت و محصولات روی ژل الکترفورز شده و سپس تعدادی از آنها جهت تعیین توالی به شرکت تکاپوزیست ارسال خواهد شد . از پرایمر های زیر نیز جهت تکثیر ژن های مورد نظر استفاده خواهد شد

برای  توصیف داده ها از جداول توزیع فراوانی و نرم افزار SPSSو در صورت نیاز از سایر شاخص های آماری مرتبط استفاده خواهد شد .

کدهای اخلاقی شماره 1، 2،18 ،25 ،28که به شرح زیر میباشند رعایت خواهند شد

هدف اصلی هر پژوهش باید ارتقای سلامت انسانها توام با رعایت کرامت و حقوق ایشان باشد..(کد1)

در پژوهش برآزمودنی انسانی ،سلامت وایمنی فرد فرد آزمودنی هادر طول وبعد از اجرای پژوهش،برتمامی مصالح دیگر الویت دارد .هرپژوهشی که بر روی آزمودنی انسانی انجام می گیرد ،باید توسط افرادی طراحی واجرا شود که تخصص ومهارت بالینی لازم ومرتبط را داشته باشند.در کارآزمایی های بالینی برروی بیماران یا داوطلب های سالم نظارت پزشک دارای مهارت و دانش متناسب الزامی است.(کد2)

در پژوهش هایی که از مواد بدنی (شامل بافت ها و مایعات بدن انسان) یا داده هایی استفاده می شود که هویت صاحبان آن ها معلوم یا قابل کشف و ردیابی است ،باید برای جمع آوری ،تحلیل،ذخیره سازی ویااستفاده مجدد از آن ها رضایت آگاهانه گرفته شود .در مواردی که اخذ رضایت غیرممکن باشد یااعتبار پژوهش را خدشه دار کند ،می توان در صورت بررسی مورد وتصویب کمیته اخلاق،از داده ها یا مواد بدنی ذخیره شده ،بدون اخذ رضایت آگاهانه استفاده کرد.(کد 18)

پژوهش گر مسئول رعایت اصل رازداری و حفظ اسرار آزمودنی ها و اتخاذ تدابیر مناسب برای جلوگیری از انتشار آن است.همچنین ،پژوهشگر موظف است که از رعایت حریم خصوصی آزمودنی ها در طول پژوهش اطمینان حاصل کند.هرگونه انتشار یااطلاعات به دست آمده از بیماران باید براساس رضایت آگاهانه انجام گیرد.(کد25)

پژوهش گران موظفند که نتایج پژوهش های خود را صادقانه ، دقیق، و کامل منتشر کنند.نتایج ، اعم از منفی یا مثبت، ونیز منابع تامین بودجه ، وابستگی ، وابستگی سازمانی ، و تعارض منافع در صورت وجود باید کاملا آشکارسازی شوند.پژوهشگران نباید در هنگام عقد قرارداد پژوهش هیچ گونه شرطی را مبنی بر حذف یا عدم انتشار یافته هایی که از نظر حمایت کننده پژوهش مطلوب نیست، بپذیرند.(کد28)

محدودیت ها: تهیه مواد و ابزار مورد نیاز برای آزمایش

راه حل: افزایش زمان انجام طرح

ژنهای بتالاکتاماز، آسینتو باکتر بومانی ، مقاومت چند دارویی

1-Jafari S,  Najafipoor S,  Karegar M, Abdollahy A, Mardaneh J,  Fasihy Ramandy M.et al.  Phenotypical Evaluation of Multi-Drug Resistant Acinetobacter Baumannii.journal.fums.2012;2(4):254-258.

2-Lagamayo EN. Antimicrobial resistance in major pathogens of hospital acquired pneumonia in Asian countries. Am J Infect Control. 2008; 36(4):101-108.

3-Al Atrouni A, LaureJoly-Guillou  M, Hamze M, Kempf  M. Reservoirs of non-baumannii Acinetobacter species. Front Microbiol. 2016; 7:49.

4-Peleg A, Seifert H, Paterson DL. Acinetobacter baumannii: Emergence of a successful pathogen. Clin Microbiol Rev. 2008; 21(3): 538-582.

5-Zarrilli R, Giannouli M,  Tomasone F. Carbapenem resistance in Acinetobacter baumannii the molecular epidemic features of an emerging problem in health care facilities. The Journal of Infection in Developing Countries .2009;3(05):335-341.

6 -Camp C, Tatum OL.A review of Acinetobacter baumannii as a highly successful pathogen in times of war. Lab Med 2010; 41(11):649-657.

7-Sahu PK, Iyer PS, Oak AM, Pardesi KR, Chopade  BA. Characterization of eDNA from the clinical strain Acinetobacter baumannii AIIMS 7 and its role in biofilm formation.The scientific World Journal. 2012;2012:9734-9736.

8-Neetu G, Negeswari G, Sauita J, Ravindro NM. Isolation and identification of Acinetobacter species with special reference to antibiotic resistance. J Nat Sci Bio Med. 2016; 6(1): 158-162.

9- Golestani F, Javadpour S, Kafilzadeh F, Ghalandarzadeh Daryaei Z . Determination of antibiotic resistance pattern and frequency of blaVIM & blaIMP genes in clinical isolates of Acinetobacter species in Bandar Abbass. Journal of Microbial World.2018;10(4):299-309.

10-Huang LY, Chon TL, LU PL, Tsai CA, Cho WL,Chanq FY.et al. Dissemina tion of multidrug-resistant ,Class 1integron-carrying Acinetobacter baumannii isolates in Taiwan. Clin Microbiol In fect 2008;14(11):1010-1019.

11-McConnell MJ, Actis L, Pachon J. Acinetobacter baumannii: human infections, factors contributing to pathogenesis and animal models. FEMS Microbiol Rev.2013;37(2):130-155.

12-Al-Hassan L, El Mehallawy H, Amyes SG. Diversity in Acinetobacter baumannii isolates from paediatric cancer patients in Egypt. Clin Microbiol Infect.2013;19(11):1082-8.

13-Fukuta Y, Muder RR, Agha ME, Clarke LG, Wagener MM, Hensler AM, et al. Risk factors for acquisition of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii among cancer patients. Am J Infect Control. 2013;41(12):1249-1252.

14-Nazari Moghadam A, Hosseini Doust S-R, Mirnejad R. Prevalence PER and VEB beta-lactamase Genes among Acinetobacter baumannii

Isolated from Patients in Tehran by PCR. Iran J Med Microbiol.2014;8(4):28-35.

15-Dugal S, Fernandes A. Carbapenem hydrolysing metallo-β-lactamases. Int J Curr Pharm Res. 2011; 3(3): 9-16.

16-Rosenbaum P, Aureden K, Cloughessy M, Goss L, Kassai M, Streed S. Guide to the elimination of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii transmission in healthcare settings. Available at: http://apic.org/EliminationGuides (2010).

17-Mak JK, Kim MJ, Pham J, Tapsall J, White PA. Antibiotic resistance determinants in nosocomial strains of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii. J Antimicrob Chemother 2009; 63:47-54.

18-Shobha KL, Lenka PR, Sharma MK, Ramachandra L, Bairy I. Metallo-β-lactamase production among Pseudomonas species and Acinetobacter species in Costal Karnataka. J Clin Diagnos Res. 2009; 3(5): 1747-1753.

19- Li J, Nation RL, Turnidge JD, Milne RW, Coulthard K, Rayner CR ,et al. Colistin: the re-emerging antibiotic for multidrug-resistant Gram-negative bacterial infections. Lancet Infect Dis. 2006;6(9):589-601.

20-Perez F, Hujer A, Hujer K, Decker B, Rather P, Bonomo R.Global challenge of multidrug-resistant  Acinetobacter baumannii.Antimicrob Agents Chemother.2007;51(10):3471-3484.

21-Saga T, Yamaguchi K. History of antimicrobial agents and resistant bacteria. JMAJ. 2009; 52(2): 103-108.

22- Poirel L, Nordmann P. Carbapenem resistance in Acinetobacter baumannii: mechanisms and epidemiology. Clinical Microbiology and Infection. 2006;12(9):826-836.

23- Fournier P, Richet H, Weinstein RA. The epidemiology and control of Acinetobacter baumannii in health care facilities. Clin Infect Dis 2006; 42(5):692-699.

24-Opazo A, Dominguez M, Bello H, Amues SG, Gonzalez-Rocha G. OXA-type carbapenemases in Acintobacter baumannii in south America. J infect Dev Ctries 2012; 6(4): 311-316.

25-Pfeifer Y, Cullik A, Witte W. Resistance to cephalosporins and carbapenems in Gram-negative bacterial pathogens. Int J Med Microbiol 2010; 300(6): 371-379.

26-Paterson DL, Bonomo RA. Extended-spectrum ß-lactamases: a clinical update. Clin Microbiol Rev 2005; 18(4): 657-686.

27-Prakash MR, Veena M, Sharma A, Basavaraj KN, Viswanath G. The prospective evaluation of four convenient methods for detecting mbls in the clinical isolates. J Clin Diagnos Res. 2012; 6(7): 1196-1199.

28- Pandya NP, Prajapati SB, Mehta SJ, Kikani KM, Joshi PJ. Evaluation of various methods for detection of metallo-β-lactamase (MBL) production in gram negative bacilli. Int J Biol Med Res. 2011; 2(3): 775-777.

29-Kalantar Neyestanaki D,Mirsalehian A.Emaneini M.The importance of extended spectrum β lactamases in gram- negative enteric bacilli and thephenotypic methods of detection.Journal of kermanuniversity of medical sciences.2016;23(3):380-405.

30-Bush K, Jacoby GA. Updated functional classification of ß-lactamases. Antimicrob Agents Chemother 2010; 54(3): 969-976.

31-Zare A, Akya A, Nejat P. The frequency of blavim, blaimp, blakpc and blandm carbapenemase genes in clinical isolates of klebsiella pneumoniae in kermanshah medical centers. J Shahid Sadoughi Univ Med Sci 2015;23(8):760-769.

32-Koh T, Babini G, Woodford N, Sng L, Hall L, Livermore D. Carbapenemhydrolysing IMP-1 β-lactamase in Klebsiella pneumoniae from Singapore. The Lancet. 1999;353(9170):2162.

33-Shlaes DM. New beta-lactam-beta-lactamase inhibitor combinations in clinical development. Ann N Y Acad Sci. 2013; 1277: 105-114.

34- Gupta V. Metallo beta lactamases in Pseudomonas aeruginosa and

Acinetobacter species. Expert opinion on investigational drugs. 2008;17(2):131-143.

35-Helen CM. Metallo-β-lactamase in Gram-negative bacteria: introducing the era of pan-resistance?. Int J Antimicrob Agents. 2009; 33(5): 1-7.

36-Walsh TR. Emerging carbapenemases: a global perspective. Int J Antimicrob Agents. 2010; 36(3): 8-14.

37-Poole K. Resistance to ß-lactam antibiotics. Cell Mol Life Sci .2004; 61(17): 2200-2223.

38- Fallah F, Taherpour A, Vala MH, Hashemi A.Global Spread of New Delhi mettallo-beta-lactamase-1(NDM-1). Arch Clin Infect Dis.2012;6(4):171-177.

39-Goudarzi H, Hashemi A, Fallah F, Detection of blaDIM, blaAIM, blaGIM, blaNDM and blaVIM Genes among Acinetobacter baumannii strains isolated from hospitalized patients in Tehran hospitals, Iran. Iran J Med Microbiol.2016;9(4):32-39.     

40-Arya SC, Agarwal N. International travel with acquisition of multiDrug resistant Gram negative bacteria containing the New Delhi metallo-beta-lactamase gene, bla NDM-1. Travel medicine and infectious disease. 2011;9(1):47-48.

41-Noori M, Karimi A, Fallah F, Hashemi A, Alimehr S,Goudarzi H, et al. High Prevalence of Metallo beta-lactamase Producing Acinetobacter baumannii Isolated From Two Hospitals of Tehran; Iran. Arch Pediatr Infect Dis.2014;3(1):e15439.

42-Vali L, Dashti KH, Opazo-Capurro A.F. Diversity of multi-drug resistant Acinetobacter baumannii population in a major hospital in Kuwait. Original Research ARTICLE.2015;6:1-8.

43-Leunqtonqkam U, Thummeepak R, Wonqprachan S .dissemination of bla oxa-23 bla oxa -24 bla oxa 58 and bla NDM-1 Genes of Accinetobacter baumannii isolates from four tertiary Hospital n Thailand .Microb Drug Resist .2018;24(1):55-62.

44-Cheikh HB,  Dominques S, silveira E, kadri y, Rosari N.et al.Molecular characterization of carbapenemases of clinical Acinetobacter baumannii-calcoaceticuscomplex isolates from a university Hospitalin Tunisia.3 biotech .2018;8(7):297-305.

45-Beris Fs, Budak EE,Gulek D, Uzun A, Cizmeci Z, Mengeloglu FZ.et al.Investigation of the frequency and distribution of beta-lactamase genes in the clinical isolates of Acinetobacter baumannii collected from different regions of Turkey.Mikrobiyol Bul.50(4):511-521.

46-Solgi H, Ghafar Zadeh H, Shahcheraghi F.Evaluation of phenotypic and Genotypic Carbapenemase Genes in Gram-Negative Bacteria Resistant to Carbapenem and Determining their Antibiotic Resistance.Journal Of Medical School. 2017;34(405):1290-1296.

47-Rezaei A, Fazeli H , Halaji M , Moghadampour M, Faghri J. Prevalence of metallo‑beta‑lactamase producing Acinetobacter baumannii isolated from intensive care unit in tertiary care hospitals. Ann Ig 2018; 30: 330-336.

48-Voets GM, Fluit AC, Scharringa J, Stuart JC, Leverstein-van Hall MA. A set of multiplex PCRs for genotypic detection of extended-spectrum β-lactamases, carbapenemases, plasmid-mediated AmpC β-lactamases and OXA β-lactamases. Int J Antimicrob Agents. 2011;37:356–9.

.

ندارد

ندارد

ندارد

ندارد

پژوهش گر مسئول رعایت اصل رازداری و حفظ اسرار آزمودنی ها و اتخاذ تدابیر مناسب برای جلوگیری از انتشار آن است.همچنین ،پژوهشگر موظف است که از رعایت حریم خصوصی آزمودنی ها در طول پژوهش اطمینان حاصل کند.هرگونه انتشار یااطلاعات به دست آمده از بیماران باید براساس رضایت آگاهانه انجام گیرد

ندارد

در پژوهش هایی که از مواد بدنی (شامل بافت ها و مایعات بدن انسان) یا داده هایی استفاده می شود که هویت صاحبان آن ها معلوم یا قابل کشف و ردیابی است ،باید برای جمع آوری ،تحلیل،ذخیره سازی ویااستفاده مجدد از آن ها رضایت آگاهانه گرفته شود .در مواردی که اخذ رضایت غیرممکن باشد یااعتبار پژوهش را خدشه دار کند ،می توان در صورت بررسی مورد وتصویب کمیته اخلاق،از داده ها یا مواد بدنی ذخیره شده ،بدون اخذ رضایت آگاهانه استفاده کرد

-