بررسی پلی مورفیسم ژنهای miR99B (rs34738545)، miR211 (rs8039189)، miR29A (rs157907)، miR365A (rs30230, rs30232)، miR140 (rs2102066, rs2270840)، miR143 (rs41291957, rs353292) و miR4454 (rs7665892, rs150509310) در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و مقایسه آنها با افراد سالم

Evaluation of genetic polymorphism miR99B (rs34738545), miR211 (rs8039189), miR29A (rs157907), miR365A (rs30230, rs30232), miR140 (rs2102066, rs2270840), miR143 (rs41291957, rs353292), and miR4454 (rs7665892, rs150509310) in the patients with chronic kidney disease compared with healthy people


چاپ صفحه
پژوهان
صفحه نخست سامانه
مجری و همکاران
مجری و همکاران
اطلاعات تفضیلی
اطلاعات تفضیلی
دانلود
دانلود
علوم پزشکی زاهدان
علوم پزشکی زاهدان

مجریان: سامان سرگزی

کلمات کلیدی: اختلال مزمن کلیوی، میکرو آر ان ای و پلی مورفیسم

اطلاعات کلی طرح
hide/show

کد طرح 9457
عنوان فارسی طرح بررسی پلی مورفیسم ژنهای miR99B (rs34738545)، miR211 (rs8039189)، miR29A (rs157907)، miR365A (rs30230, rs30232)، miR140 (rs2102066, rs2270840)، miR143 (rs41291957, rs353292) و miR4454 (rs7665892, rs150509310) در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و مقایسه آنها با افراد سالم
عنوان لاتین طرح Evaluation of genetic polymorphism miR99B (rs34738545), miR211 (rs8039189), miR29A (rs157907), miR365A (rs30230, rs30232), miR140 (rs2102066, rs2270840), miR143 (rs41291957, rs353292), and miR4454 (rs7665892, rs150509310) in the patients with chronic kidney disease compared with healthy people
نوع طرح بنیادی
محل اجرای طرح مرکز تحقیقات سلولی و مولکولی
رسته مطالعاتی مطالعه مورد/شاهد(Case/control)(مطالعه کمی)
دانشکده/مرکز مرکز تحقیقات سلولی ومولکولی
زمان اجرا -روز 720

اطلاعات مجری و همکاران
hide/show

نام و نام‌خانوادگی سمت در طرح نوع همکاری درجه‌تحصیلی پست الکترونیک
رامین سراوانیهمکارتدوین طرحدکترای تخصصی saravaniramin@yahoo.com
حامد طاهریهمکارارزیابی بیماراندکترای تخصصی Dr_taheri_113114@yahoo.com
میلاد حیدری نیاهمکاراستخراج اطلاعات لازم از بانکهای اطلاعاتی کارشناسی ارشدmilad_heidari@sci.ui.ac.ir
مهدیه جعفری شاهرودیهمکارانجام تستهای آزمایشی بر روی نمونه هاکارشناسی ارشدmahdiehjafari6@gmail.com
سامان سرگزیمجریتدوین طرحدکترای تخصصی sgz.biomed@gmail.com

اطلاعات تفضیلی
hide/show

عنوان متن
خلاصه طرح به فارسی بررسی پلی مورفیسم ژنهای miR99B (rs34738545)، miR211 (rs8039189)، miR29A (rs157907)، miR365A (rs30230, rs30232)، miR140 (rs2102066, rs2270840)، miR143 (rs41291957, rs353292) و miR4454 (rs7665892, rs150509310) در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و مقایسه آنها با افراد سالم
خلاصه طرح به لاتینEvaluation of genetic polymorphism miR99B (rs34738545), miR211 (rs8039189), miR29A (rs157907), miR365A (rs30230, rs30232), miR140 (rs2102066, rs2270840), miR143 (rs41291957, rs353292), and miR4454 (rs7665892, rs150509310) in the patients with chronic kidney disease compared with healthy people
محل اول بکارگیری نتایج تحقیق
بيان مسئله تحقيق/اهمیت پژوهش

بیماری مزمن کلیوی (CKD) به شرایط بالینی گفته می شود که کارکرد موثر کلیه مختل شود به شرطی که ایجاد و پیشرفت بیماری، سیری تدریجی و کند (طی ماه­ها یا سال­ها) داشته باشد. کلیه‌ها دو عدد اندام لوبیایی شکل هستند که در دو طرف ستون فقرات قرار گرفته‌اند که وظیفه­ ی خارج کردن تمام محصولات زاید و آب اضافی از را دارند و به نوعی به عنوان نوعی سد تصفیه کننده برای بدن عمل می‌کنند(1). هر گونه بیماری که کلیه‌ها را تحت تأثیر قرار دهد، به تدریج توانایی تصفیه‌ی آن‌ها را کاهش می‌دهد و به این ترتیب محصولات زاید در خون انباشته می‌شوند. محاسبات ریاضی که بر اساس سن، جنس و نژاد فرد است، میزان تصفیه‌ی گلومرولی (GFR) را محاسبه می‌کند. شاخص GFR  در واقع مقداری از خون است که کلیه می‌تواند در واحد زمان تصفیه کند که این شاخص برای تعیین وضعیت سلامتی کلیه به کار می‌رود و به وسیله‌ی آن می‌توان CKD و مراحل آن را در فرد بررسی کرد (2). در یک فرد طبیعی در حالت عادی، GFR برابر و یا بیشتر از 90 میلی لیتر در دقیقه است. با وجود این که علل متنوعی سبب بیماری‌های مزمن کلیوی می‌شوند، اما دیابت و فشارخون بالا شایع‌ترین علل هستند. علل متنوع دیگر نیز سبب CKD می‌شوند که از زمینه­ی ژنتیکی می­توان به عنوان یکی از عوامل مهم در اتیولوژی این بیماری مزمن نام برد (3). Staging یا درجه بندی بیماری CKD به صورت زیر است:

در مرحله‌ی نخست، GFR برابر یا بیشتر از 90 میلی لیتر در دقیقه است، که با میزان آن در کلیه‌ی سالم برابر است. تقریباً هیچ علامتی وجود ندارد و بنا بر این تشخیص این مشکل دشوار است. اما به طور کلی، به بیمارانی که به مشکلات کلیوی مبتلا هستند توصیه می‌شود آزمایش‌های مربوط به تعیین مقدار کراتینین یا اوره در خون، را انجام دهند. مقدار بالای کراتینین در خون یا پروتئین‌ها در ادرار شاخص خوبی است که نشان می‌دهد فرد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی است. روش‌های دیگری برای پی بردن به وضعیت کلیه‌ی فرد وجود دارند که شامل MRI، امواج فرا صوت (سونو گرافی)، اشعه‌ی X و CT اسکن، است. اگر بتوان مشکل را در این مرحله تشخیص داد، در نتیجه درمان نیز ساده‌تر خواهد بود و از داروها می‌توان برای توقف، به تعویق انداختن یا تغییر علایم و بهبود CKD استفاده کرد. در مرحله‌‌ی دوم، علائم در این مرحله به آسانی مرحله‌ی اول قابل شناسایی نیستند و عمدتاْ شاخص GFR بین 60 و 89 میلی لیتر در دقیقه است (4). در این مرحله نیز تشخیص با اشعه‌ی  X، MRI، فرا صوت (سونو گرافی) و CT اسکن امکان پذیر است. به طور کلی برای فردی که در مرحله‌ی دوم این بیماری کلیوی شناسایی شده است، دیالیز کلیوی لازم نیست. طی مرحله‌ی سوم علائم ظاهر می‌شوند و میزان GFR به 30 تا 59 میلی لیتر در دقیقه کاهش می‌یابد. مایعات در قسمت‌های مختلف بدن انباشته می‌شوند و علامت آن تورم در دست‌ها و پاها است. رنگ ادرار فرد نیز تغییرات قابل توجهی می‌کند. رنگ ادرار به نارنجی، قرمز یا قهوه‌ای تیره تغییر می‌کند (5). در مرحله‌ی چهارم CKD با کاهش بیشتر  GFR، علائم بیشتری در بیمار ظاهر می‌شود. در نتیجه‌ی افزایش سطح محتویات ادرار در خون، بیمار با مشکل تنفسی رو به رو می‌شود و میزان فیلتراسیون گلومرولی بین 15 تا 29 میلی لیتر در دقیقه است. در stage نهایی مبتلایان به CKD (مرحله­ی پنجم)، نارسایی کامل (انتهایی) کلیه  مشاهده می­شود که در این مرحله GFR کمتر از 15 میلی لیتر در دقیقه است و در برخی موارد ممکن است به صفر برسد.

 میکرو RNAها (miRNA) گروه بزرگی از RNA های کوچک غیر کد کننده می‌باشند که طولی حدود 22-18 نوکلئوتید دارند و به‌عنوان مولکول راهنما در فرآیند خاموش‌سازی RNA ها نقش ایفا می‌کنند. مکان اتصال miRNA ها اکثراً در ناحیه‌ی 3'-UTR مولکول mRNA هدف قرار دارد (6). miRNA ها فعالیت‌های زیادی از قبیل کنترل چرخه سلولی، تمایز، پایداری ژنومی، رگ زایی و نیز فعالیت‌های متنوع دیگری را بر عهده‌ دارند (7). افزایش  یا کاهش بیان و تکثیر برخی miRNA ها باعث  پیشرفت روند سرطان و سایر بیماری های مزمن می‌شود. بنابراین تغییر در الگوی بیان miRNA ها که با سرطان در ارتباط است می‌تواند به‌عنوان نشانگری از وضعیت پیشرفت بیماری به حساب می آید (7). یک سری از  miRNA­ها با ثبات بالا و بیان حفظ شده؛ به عنوان بیومارکرها در پزشکی بالینی شناخته شده اند، آنها همچنین ارتباط گسترده­ای با کنترل هوموستازیس گلوکز و دیابت نوع دو (T2DM) دارند (8). در حال حاضر، miRNA ها به علت عملکرد در شروع و پیشرفت دیابت، انواع سرطان و بیماری­های خود ایمنی و همینطور بیماری های مزمن کلیوی برای تحقیق در مورد بیومارکرهای موثر در تشخیص زودهنگام و سریع این اختلالات مورد توجه فراوانی قرار گرفته­اند هستند (9-11). در همین حال، یک سری از miRNAs مرتبط با شناسایی شده اند، به عنوان مثال ارتباط افزایش سطح بیان مقادیر سرمی ,miR 299-3p , miR 3147 , miR 193B-3P , miR 331-3p ,miR 365A-3p , miR 151A-5P , miR 19B , 3p -miR 374B-5p miR 195-5p , miR 181B-5p , miR 24-3p , miR 4454 , let-7a-5p - miR 30B-5p و کاهش سطح بیان miR-143/145 miR 140-5p ، miR-29A و miR-211 در بیماری CKD تایید شده است (11-13). ژن  MIR143، به عنوان عضو خوشه  miR-143/145 یک توالی بسیار محافظت شده داشته و در کروموزوم پنجم قرار دارد. MiR-143 یک عملکرد خاص را در تنظیم و کنترل فعالیت متابولیک انرژی و چربی نشان می دهد (14). علاوه بر این، مطالعات قبلی نیز نشان داده است که بیان بیش از حد miR-143  ممکن است به متابولیسم انرژی سلولی آسیب رسانده، بنابراین منجر به گلیکوژنولیز در کبد و افزایش گلوکز خون گردد. در عین حال، این سطح بالایmiR-143  همچنین می تواند فسفریلاسیون AKT را مهار و ظرفیت تنظیمی گلوکز خون را در حضور انسولین مهار کند، در نتیجه باعث ایجاد مقاومت به انسولین و دیابت ناشی از آن می شود (15). علاوه بر این، miR-143 به تمایز آدیپوسیت­های پیش ساز مرتبط است. همچنینmiR-143  ممکن است بتواند به عنوان یک بیومارکر احتمالی برای تشخیص، پیشگیری و درمان بیماران مبتلا به بیماری­های کلیوی در نظر گرفته شود(16). چندین پلی­ مورفیسم تک نوکلئوتید(SNP)، در پروموتر خوشه miR-143/145 کشف شده ­اند (17). تحقیقات بعدی بر روی این کلاسترژنی نشان داد که از میان SNPهای مختلف این ژن، پلی­ مورفیسم­های rs41291957 (فراوانی آلل مغلوب=0.12) و rs353292 (فراوانی آلل مغلوب=0.28) در فاصله­ی ۲ کیلوباز از ناحیه­ ی کد کننده ­ی این خوشه ژنی قرار گرفته اند. طی مطالعه ای در سال 2016 ، Yuanو همکاران ارتباط آماری بین پلی مورفیسم A/G rs353292 قرار گرفته در ناحیه­ی پروموتری 143/145 و سرطان کلورکتال را گزارش دادند (17). همچنین بین فراوانی آللی و ژنوتیپی rs41291957 A/G  و ریسک ابتلا به بیماری­های قلبی ژنتیکی و اندومتریوز در جمعیت چینی ارتباط معنی داری مشاهده شده است (18, 19)، ولی بررسی موتاسیون­های تک نوکلئوتیدی این جایگاه­های ژنی در مبتلایان به بیماری های کلیوی انجام نشده است. لازم به ذکر استmiR-143  وmiR-145 (miR-143/145)، از RNA غیر کد شونده بلندی (long ncRNAs) به نام MIR143HG  (MIR143 host gene)، مشتق گردیده و در خوشه ای در ناحیه کروموزومی 5q32-33  قرار دارند، در بسیاری از انواع سرطان­ها کاهش می­یابند از آنجا که ژن های هدف پیش بینی شده برای miR145 در مسیرهای سیگنالینگ مربوط به MAPK، JNK، و TGFβ مشارکت دارند (20). همچنین گزارش شده است بیان این دو ژن در اختلالات مزمن کلیوی کاهش می یابد (13). مطالعات نشان داده است افزایش بیان ژن هم اکسیژناز 1 (Hmx1) در اثر کاهش بیان ژن miR211 می تواند در ایجاد آسیب های کلیوی دخیل باشد زیرا Hmx1 به عنوان تارگتی برای miR211 و miR204 معرفی شده است (21). همچنین در غیاب بیان miR211 برخی از ژن ها در رده­ ی PIG3V دچار افزایش بیان شده بودند که احتمال می رود ژن­های زیردست miR211 باشند. miR211 از ناحیه اینترونی ژن TRPM بیان می شود و مسئول تنظیم فسفریلاسیون اکسیداتیو و متابولیسم انرژی در میتوکندری می باشد (22). طی مطالعه ­ی Cheng و همکاران بر روی 30 بیمار مبتلا به کارسینوم سلول­های کلیوی RCC))، بیان ژنmiR211 در 7 بیمار افزایش و در 18 بیمار کاهش نشان داد (23). بر این اساس، rs8039189 G/T  (فراوانی آلل مغلوب= 0.18) به عنوان یک جایگاه تازه شناخته شده در فاصله ­ی 2 کیلوباز فرادست ژن miR211 قرار دارد. ژن miR99B در ناحیه ­یGRCh38.p12  از کروموزوم 19 قرار گرفته و مطالعات متعددی تغییر بیان این ژن را با بروز بیماری هایی از جملهmetastatic clear cell Renal Cell Carcinoma (ccRCC) و همینطور پیلونفریت حاد کلیوی مرتبط دانسته ­اند (24, 25). جایگاه ژنی rs34738545 A/G با فراوانی آلل مغلوب 0.11 بر روی کروموزوم 19 واقع شده است و در فاصله­ ی 2 کیلوباز بالا دست ناحیه­ی کد کننده­ ی ژن miR99B و در ناحیه ­ی اینترونی ژن­هایSPACA6  و SPACA6P-AS واقع شده است. Zawada و تیم تحقیقاتی وی در سال 2016 طی مطالعه ای پروفایل بیانی miRهای دارای اهمیت پاتولوژیک را در مبتلایان به CKD بررسی کردند و مشاهده کردند بیان miR140 در این افراد کاهش معنی داری نسبت به گروه کنترل دارد (26). در مطالعه ی دیگری مشخص شد بیان ژن miR140 در افراد دارای CKD پیشرونده نسبت به گروه شاهد کمتر است (27). کاهش بیان در ژن­های کد کننده­ ی miR منجر به تغییر بیان ژن­های تارگت این RNAهای تنظیمی شده و می تواند تأثیر مهمی در پاتوژنز بیماری های کلیوی داشته باشد طی مطالعاتی در سالهای 2014 و 2015 ارتباط پلی مورفیسم rs2102066 A/G  (واقع شده در فاصله­ ی 500 بازی فرودست ژن miR140 و با فراوانی آلل مغلوب 0.15) و ریسک ابتلا به اختلالات اسکلتی به اثبات رسیده است (28). همچنین ارتباطی بین پلی مورفیسم جایگاه rs2270840 A/T (MAF=0.14)  این ژن و بیماری های کلیوی گزارش نشده است. جایگاه rs157907 A/G با فراوانی آللی (MAF=0.22) بر روی کروموزوم 7 واقع شده است و در فاصله ی 2 کیلوبازی فرادست خوشه ژنی miR29A و miR29B1 قرار گرفته است. این variation ژنی با ریسک بروز و پیشرفت بیماری Myopia و سرطان معده در ارتباط بوده است (29, 30). دو جایگاه rs30230 C/T و rs30232 A/G  در فاصله­ ی 2 کیلوبازی ژن miR356A و در ناحیه­ ی اینترونی ژن miR193BHG قرار گرفته­ اند (با فراوانی آللی 0.29 و 0.33 واقع روی کروموزوم 16). بر خلاف اغلب miRهای نام برده شده در این مطالعه، Zhao و همکاران عنوان کردند بیان ژن کد کننده ­ی miR374B در لنفوسیت های جدا شده از افراد مبتلا به CKD افزایش معنی داری داشته است (31).  

سنتز miRNA ها تحت تنظیم بسیار دقیق قرار دارد به ‌طوری ‌که برهم خوردن این تنظیم باعث بروز بیماری‌های مزمن مختلفی می‌شود (32). عوامل مختلفی ممکن است سبب برهم خوردن این تنظیم شوند ازجمله تغییران اپی ژنتیک و چندشکلی‌های تک نوکلئوتیدی (SNPs) (33). تغییرات تک نوکلئوتیدی که درون ژن miRNA­ها اتفاق می‌افتد می‌تواند با تغییر اختصاصیت عملکرد miRNA، باعث تغییر در اتصال به توالی‌های هدف یا تغییر در بیان ژن‌های هدف گردد و یا اینکه با تغییر در فرآیندهای پردازش miRNA باعث تغییر در میزان بیان miRNA شود (34) .با توجه به شیوع نسبتاً بالای بیماری CKD ، بر آن شدیم تا میزان شیوع پلی مورفیسم­های تک نوکلئوتیدی احتمالی در 6 ژن  MIR140, MIR211, MIR365A، MIR29A, MIR99B ، MIR143/145 که تنها تغییرات بیان آن­ها در بیماران کلیوی اثبات شده است، را در جمعیتی از بیماران بستری شده در بیمارستان­های علی بن ابیطالب (ع)، خاتم الأنبیاء، بو علی و کلنیک عدالت زاهدان بررسی کنیم. بدیهی است شناخت جایگاه های ژنی موثر در بروز این بیماری، کمک شایان توجهی به روند درمان و تشخیص به موقع این اختلال مزمن تهدید کننده­ ی سلامت جامعه ، در آینده خواهد نمود.

 

 

مشکل جاری که سیاست گزار با آن مواجه است کدام است؟
روش های موجود کدامها هستند؟
پیشنهاد اول نحوه کاربرد
محل دوم بکارگیری نتایج تحقیق
سوالات و / یا فرضیات پژوهش

توزیع فراوانی پلی مورفیسم rs34738545   ژن  miR99B در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و افراد سالم متفاوت است.

توزیع فراوانی پلی مورفیسم rs8039189 ژن miR211 در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و افراد سالم متفاوت است.

توزیع فراوانی پلی مورفیسم rs157907 ژن miR29A در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و افراد سالم متفاوت است.

توزیع فراوانی پلی مورفیسم rs30230 ژن miR365A در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و افراد سالم متفاوت است.

توزیع فراوانی پلی مورفیسم rs30232 ژن miR365A در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و افراد سالم متفاوت است.

توزیع فراوانی پلی مورفیسم rs2102066 ژن miR140 در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و افراد سالم متفاوت است.

توزیع فراوانی پلی مورفیسم rs2270840 ژن miR140 در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و افراد سالم متفاوت است.

توزیع فراوانی پلی مورفیسم rs41291957 ژن miR143 در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و افراد سالم متفاوت است.

توزیع فراوانی پلی مورفیسم rs353292 ژن miR143 در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و افراد سالم متفاوت است.

 

هدف کلی طرح

تعیین فراوانی پلی مورفیسم ژن­های miR99B (rs34738545)، miR211 (rs8039189)، miR29A (rs157907)، miR365A (rs30230, rs30232)، miR140 (rs2102066, rs2270840)  و miR143 (rs41291957, rs353292) در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و مقایسه آن­ها با افراد سالم

منافع و مضرات روشهای موجود کدامند؟
چرا پیام تحقیق شما حلال مشکل جاری است؟
اهداف اختصاصی

مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs34738545 ژن miR99B در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و افراد سالم.

مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs8039189 ژن  miR211   در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و افراد سالم.

مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs157907 ژن miR29A در  در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و افراد سالم.

مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs30230 ژن miR365A  در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و افراد سالم.

مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs30232 ژن  miR365A در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و افراد سالم.

مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs2102066 ژن miR140 در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و افراد سالم.

مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs2270840 ژن miR140 در در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و افراد سالم.

مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs41291957 ژن miR143 در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و افراد سالم.

مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs353292 ژن miR143 در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و افراد سالم.

 

 

پیشنهاد دوم نحوه کاربرد
محل سوم بکارگیری نتایج تحقیق
سازمانها، مراکز و موسسات و سایر بهره برداران بالقوه دستاوردهای طرح

دانشگاه علوم پزشکی زاهدان

پیام تحقیق شما چه منافعی از نظر هزینه، کارایی و بهره وری برای مدیر دارد؟
برای اجرای راه حل پیشنهادی شما چه موانع و حمایتهایی وجود دارند؟
تعریف واژه های تخصصی

بیماری مزمن کلیوی (CKD): به شرایط بالینی گفته می شود که کارکرد موثر کلیه مختل شود به شرطی که ایجاد و پیشرفت بیماری، سیری تدریجی و کند (طی ماه­ها یا سال­ها) داشته باشد.

پلی‌مورفیسم: اختلاف توالی بازهای DNA در افراد یا گروه­های مختلف.

پلی‌مورفیسم تک نوکلئوتیدی (single nucleotide polymorphism: SNP): اختلاف فقط یک باز در DNA. ساده­ترین و شایع­ترین نوع پلی‌مورفیسم می­باشد.

پیشنهاد سوم نحوه کاربرد
محل چهارم بکارگیری نتایج تحقیق
نوع مطالعه

موردی شاهدی

جامعه مورد مطالعه(معرفی مشارکت کنندگان)/ محیط پژوهش(معیارهای ورود و خروج ذکر شوند)

گروه مورد: افراد دارای بیماری مزمن کلیوی (CKD) که به تشخیص پزشک متخصص بر پایه معیار های تشخیص انجمن نفرولوژی آمریکا، 2005)(35) به این بیماری مبتلا و در بخش کلیه بیمارستان ­های علی ابن ابیطالب (ع)، خاتم الأنبیاء و بوعلی شهر زاهدان بستری شده­ اند.

گروه شاهد: افراد سالم که برای انجام آزمایشات روتین به بیمارستان­های علی ابن ابیطالب (ع)، خاتم الأنبیاء و بوعلی شهر زاهدان مراجعه می کنند و مبتلا به هیچ نوعی از بیماری های کلیوی نیستند. همچنین میزانGFR آنها در بیبشتر از 90 میلی لیتر بر دقیقه است 

معیار های ورود به مطالعه: تأیید تشخیص بیماری مزمن کلیوی در افراد با سابقه­ ی بستری شدن یا مراجعه اولیه در صورتیکه بیشتر از سه ماه از تشخیص اولیه ­ی اختلال در کارکرد کلیه ­ها گذشته باشد با میزان GFR  کمتر از 90 میلی لیتر بر دقیقه طی دو بار آزمایش در فاصله ی سه ماهه) با شواهد آلبومینوری یا بدون آن.

معیار های خروج از مطالعه : زنان باردار و افراد مبتلا به اختلالات کلیوی گذرا (Transient Renal Dysfunction) و همینطور افرادی که مورد پیوند کلیه قرار گرفته ­اند از مطالعه خارج می­شوند. همچنین افرادی که دارای انواع عفونت­های حاد یا مزمن، بیماری های خود ایمنی یا بدخیمی در Stage­های انتهایی هستند وارد مطالعه نمی­ شوند.

پیشنهاد چهارم نحوه کاربرد
حجم نمونه و روش محاسبه آن

با توجه به فراوانی متوسط آللی جایگاه های مورد مطالعه، برای بررسی پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی از افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی در زاهدان به تعداد حداقل ۱۵۰ نفر با توجه به هزینه طرح خون گرفته می شود. نمونه گروه شاهد این پژوهش شامل افراد سالم که پس از همسان سازی برای سن و جنس، حداقل ۱۵۰ نفر را به روش نمونه گیری در دسترس انتخاب می کنیم

 

روش نمونه گیری(نحوه تخصیص تصادفی و همسانسازی در صورت لزوم ذکر شود)

 آسان در دسترس

روش و ابزار جمع آوري داده ها / صحت و استحکام داده ها (پرسشنامه یا فرم اطلاعاتی ضمیمه شود)

مشاهده و اندازه گیری های آزمایشگاهی

روش اجرای طرح(با جزئیات بطور کامل شرح داده شود)

بعد از کسب رضایت از بیماران و گروه کنترل برای بررسی  پلی مورفیسم  نمونه خون تام تحت شرایط استریل به مقدار 2 سی سی گرفته و در لوله حاوی ماده ضد انعقاد EDTA ریخته و در 20- درجه سانتیگراد نگهداری می‌شود. DNA نمونه خون افراد گروه شاهد و مورد به روش salting out تخلیص می‌شود. پرایمرهای اختصاصی جهت تعیین پلی مورفیسم ژنی به روش RFLP-PCR و همینطور ARMS-PCR طراحی می شود. در مرحله بعد نمونه ها در ژل اگارز 2 درصد بررسی می شوند و فراوانی ژنوتیپ­های مختلف برای هر 9 جایگاه  ژنی با این مورد ارزیابی قرار می‌گیرد. پس از تعیین ژنوتایپ برای حداقل ۵ درصد نمونه ها از روش توالی یابی (sequencing) جهت تأیید نتایج استفاده خواهد شد.

روش تجزیه، تحليل و توصیف داده‌ها (نمونه‌اي از جدول توخالي ضميمه شود و روش هاي آماري مورد استفاده به طور كامل توضيح داده شود)(کیفی و کمی)

 

P value

 

 

Control n(%)

 

Case n(%)

 

Genotypes

 

 

 

 

AA

AG

GG

rs34738545 A/G

 

 

 

GG

GT

TT

rs8039189 G/T

 

 

 

AA

AG

GG

rs157907

A/G

 

 

 

CC

CT

TT

rs30230

C/T

 

 

 

AA

AG

GG

rs30232

A/G

 

 

 

AA

AG

GG

rs2102066 A/G

 

 

 

AA

AT

TT

rs2270840 A/T

 

 

 

AA

AG

GG

rs41291957 A/G

 

 

 

AA

AG

GG

rs353292

A/G

 

پس از گردآوری اطلاعات لازم، یافته­ها در نرم افزار آماری SPSS 16 وارد شده و داده ها با استفاده از آزمون آماری Chi square ، independent sample T test داده‌ها مورد تجزیه و تحلیل قرار خواهند گرفت.   

ملاحظات اخلاقی

کد­های اخلاقی شماره­ ی 1، 2، 4، 7، 10، 11، 12، 13، 14، 15، 17، 19، 21، 22، 25، 28 و 31 از دفترچه ی ' راهنمای عمومی اخلاق در پژوهشهای علوم پزشکی دارای آزمودنی انسانی در جمهوری اسلامی ایران' در پژوهش فعلی رعایت خواهند شد. همچنین کدهای شماره­ ی 1، 3، 4، 6، 7، 8، 9 از راهنمای عمومی دفترچه ­ی ' ﻋﻀﻮ و ﺑﺎﻓﺖ و ژن ' و کد­های 2 و 3 از فصل چهارم این دفترچه در این مطالعه لحاظ خواهند شد.

محدودیتهای اجرائی طرح و پیش بینی جهت حل آنها

- عدم همکاری بیمار

- مشکل تهیه مواد و امکان طولانی شدن زمان دریافت آنها

-فراهم نشدن نمونه در زمان مقرر

-موجود نبودن آنزیم های محدودگر

کلمات کلیدی

اختلال مزمن کلیوی، میکرو آر ان ای و پلی مورفیسم

فهرست منابع و مراجع

        .1 Smith HW. The kidney: structure and function in health and disease: Oxford University Press, USA; 1951.

2.       Ma Y-C, Zuo L, Chen J-H, Luo Q, Yu X-Q, Li Y, et al. Modified glomerular filtration rate estimating equation for Chinese patients with chronic kidney disease. Journal of the American Society of Nephrology. 2006;17(10):2937-44.

3.       Vivante A, Hildebrandt F. Exploring the genetic basis of early-onset chronic kidney disease. Nature Reviews Nephrology. 2016;12(3):133.

4.       Levey AS, Coresh J, Balk E, Kausz AT, Levin A, Steffes MW, et al. National Kidney Foundation practice guidelines for chronic kidney disease: evaluation, classification, and stratification. Annals of internal medicine. 2003;139(2):137-47.

5.       Kirsztajn GM, Suassuna JH, Bastos MG. Dividing stage 3 of chronic kidney disease (CKD): 3A and 3B. Kidney international. 2009;76(4):462-3.

6.       Ha M, Kim VN. Regulation of microRNA biogenesis. Nature reviews Molecular cell biology. 2014;15(8):509-24.

7.       Lin S, Gregory RI. MicroRNA biogenesis pathways in cancer. Nature Reviews Cancer. 2015;15(6):321-33.

8.       Chen X, Ba Y, Ma L, Cai X, Yin Y, Wang K, et al. Characterization of microRNAs in serum: a novel class of biomarkers for diagnosis of cancer and other diseases. Cell research. 2008;18(10):997.

9.       Donadel G, Pastore D, Della-Morte D, Capuani B, Lombardo M, Pacifici F, et al. FGF-2b and h-PL transform duct and non-endocrine human pancreatic cells into endocrine insulin secreting cells by modulating differentiating genes. International journal of molecular sciences. 2017;18(11):2234.

10.     Ma L, Young J, Prabhala H, Pan E, Mestdagh P, Muth D, et al. miR-9, a MYC/MYCN-activated microRNA, regulates E-cadherin and cancer metastasis. Nature cell biology. 2010;12(3):247.

11.     Wang XH, Hu Z, Klein JD, Zhang L, Fang F, Mitch WE. Decreased miR-29 suppresses myogenesis in CKD. Journal of the American Society of Nephrology. 2011;22(11):2068-76.

12.     Trevisani F, Ghidini M, Larcher A, Lampis A, Lote H, Manunta P, et al. MicroRNA 193b-3p as a predictive biomarker of chronic kidney disease in patients undergoing radical nephrectomy for renal cell carcinoma. British journal of cancer. 2016;115(11):1343.

13.     Taïbi F, Metzinger-Le Meuth V, M'Baya-Moutoula E, seif el Islam Djelouat M, Louvet L, Bugnicourt J-M, et al. Possible involvement of microRNAs in vascular damage in experimental chronic kidney disease. Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Molecular Basis of Disease. 2014;1842(1):88-98.

14.     Chakraborty C, Doss CGP, Bandyopadhyay S, Agoramoorthy G. Influence of miRNA in insulin signaling pathway and insulin resistance: micro‐molecules with a major role in type‐2 diabetes. Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA. 2014;5(5):697-712.

15.     Jordan SD, Krüger M, Willmes DM, Redemann N, Wunderlich FT, Brönneke HS, et al. Obesity-induced overexpression of miRNA-143 inhibits insulin-stimulated AKT activation and impairs glucose metabolism. Nature cell biology. 2011;13(4):434.

16.     Wei Q, Mi QS, Dong Z. The regulation and function of microRNAs in kidney diseases. IUBMB life. 2013;65(7):602-14.

17.     Yuan F, Sun R, Li L, Jin B, Wang Y, Liang Y, et al. A functional variant rs353292 in the flanking region of miR-143/145 contributes to the risk of colorectal cancer. Scientific reports. 2016;6:30195.

18.     Nimi-Hoveidi E, Kohan L, Hashemi S. Association of miR-143 rs41291957 and rs4705342 genetic variants with endometriosis risk in infertile women. Feyz Journal of Kashan University of Medical Sciences. 2016;20.

19.     Yang L, Gao X, Luo H, Huang Q, Wei Y, Zhang G, et al. No association of pri-miR-143 rs41291957 polymorphism with the risk of congenital heart disease in a Chinese population. Pediatric cardiology. 2014;35(6):1057-61.

20.     Iorio MV, Ferracin M, Liu C-G, Veronese A, Spizzo R, Sabbioni S, et al. MicroRNA gene expression deregulation in human breast cancer. Cancer research. 2005;65(16):7065-70.

21.     Li X-Y, Zhang K, Jiang Z-Y, Cai L-H. MiR-204/miR-211 downregulation contributes to candidemia-induced kidney injuries via derepression of Hmx1 expression. Life sciences. 2014;102(2):139-44.

22.     Laddha NC, Dwivedi M, Mansuri MS, Gani AR, Ansarullah M, Ramachandran A, et al. Vitiligo: interplay between oxidative stress and immune system. Experimental dermatology. 2013;22(4):245-50.

23.     Cheng T, Wang L, Li Y, Huang C, Zeng L, Yang J. Differential microRNA expression in renal cell carcinoma. Oncology letters. 2013;6(3):769-76.

24.     Lukamowicz-Rajska M, Mittmann C, Prummer M, Zhong Q, Bedke J, Hennenlotter J, et al. MiR-99b-5p expression and response to tyrosine kinase inhibitor treatment in clear cell renal cell carcinoma patients. Oncotarget. 2016;7(48):78433.

25.     Oghumu S, Bracewell A, Nori U, Maclean KH, Balada-Lasat J-M, Brodsky S, et al. Acute pyelonephritis in renal allografts–a new role for microRNAs? Transplantation. 2014;97(5):559.

26.     Zawada AM, Rogacev KS, Müller S, Rotter B, Winter P, Fliser D, et al. Massive analysis of cDNA Ends (MACE) and miRNA expression profiling identifies proatherogenic pathways in chronic kidney disease. Epigenetics. 2014;9(1):161-72.

27.     Rudnicki M, Perco P, Dhaene B, Leierer J, Heinzel A, Mühlberger I, et al. Renal micro RNA‐and RNA‐profiles in progressive chronic kidney disease. European journal of clinical investigation. 2016;46(3):213-26.

28.     Woods S. The role of osteoarthritis regulated microRNAs in skeletal development pathways: Newcastle University; 2014.

29.     Xie M, Li Y, Wu J, Wu J. Genetic variants in MiR-29a associated with high myopia. Ophthalmic genetics. 2016;37(4):456-8.

30.     Han B, Li Z, Liu S, Han H, Dong S, Zou H, et al. A comprehensive review of microRNA-related polymorphisms in gastric cancer. Genet Mol Res. 2016;15(2).

31.     Zhao H, Ma S-X, Shang Y-Q, Zhang H-Q, Su W. microRNAs in chronic kidney disease. Clinica Chimica Acta. 2019.

32.     Im H-I, Kenny PJ. MicroRNAs in neuronal function and dysfunction. Trends in neurosciences. 2012;35(5):325-34.

33.     Davis-Dusenbery BN, Hata A. Mechanisms of control of microRNA biogenesis. Journal of biochemistry. 2010;148(4):381-92.

34.     Ryan BM, Robles AI, Harris CC. Genetic variation in microRNA networks: the implications for cancer research. Nature Reviews Cancer. 2010;10(6):389.

35.     Berl T. American Society of Nephrology renal research report. Journal of the American Society of Nephrology. 2005.

معرفی پژوهش/ اهداف پژوهش
(عین عبارت هدف پروپوزال را کپی نکنید. بلکه با جملاتی که برای مردم قابل فهم باشد (برای سواد حدود پنجم ابتدایی )هدف را برای شرکت کنندگان توضیح دهید.) در تمام این متن در صورتیکه شرکت کننده کودک یا فرد فاقد ظرفیت تصمیم گیری است باید مواردیکه منظور از "من"، فرد شرکت کننده بوده است به "کودک" یا "فرد تحت سرپرستی من" اصلاح شود و مواردیکه منظور از "من"، رضایت دهنده است به من به عنوان "ولی" یا "قیم قانونی" اصلاح شود.

بررسی پلی مورفیسم ژن­های miR99B (rs34738545)، miR211 (rs8039189)، miR29A (rs157907)، miR365A (rs30230, rs30232)، miR140 (rs2102066, rs2270840)، miR143 (rs41291957, rs353292) و miR4454 (rs7665892, rs150509310) در افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیوی و مقایسه آن­ها با افراد سالم

خون گیری
(آیا طرح شما نیاز به خونگیری دارد یا خیر)

از بیمار در طی طرح تحقیقاتی خونگیری به عمل می آید در این قسمت میزان خون گرفته شده و دلیل این عمل باید به وضوح توضیح داده می شود

نحوه همکاری/ مزایا ی طرح
(در این بخش برای شرکت کنندگان به زبان ساده توضیح دهید که: چه مداخله ای بر روی آنها صورت میگیرد. چه اقدامات پاراکلینیکی بر روی آنها انجام میشود. چه نمونه ای و با چه حجمی از آنها میگیرید در این مدت چند نوبت مراجعه باید داشته باشند و به چه فواصلی چه اقداماتی را در پیگیری آنها انجام میدهید. (حتی میتوانید سود بالقوه ای که شرکت کنندگان میتوانند از شرکت در این پژوهش ببرند بنویسید. این سود میتواند شرح احتمال درمان یا تشخیص بهتر بیماریشان، دریافت خدمات سلامت رایگان و یا پرداخت مشوق مالی در ازای جبران همکاریشان باشد)

ندارد

عوارض جانبی
(منظور عوارض و میزان احتمال بروز آنها در این مطالعه است)

ندارد

جبران عوارض احتمالی
(برای آنکه شرکت کننده بتواند ارزیابی مناسبی از سود و زیان شرکت در پژوهش شما داشته باشد لازم است بتواند سود و زیان مداخلات معمول و مداخلات این پژوهش را مقایسه کند. به عنوان مثال میزان موفقیت و میزان عوارض هریک را مقایسه کند.) - او باید بداند كه اگر در حين و بعد از انجام پژوهش هم هر مشكلي اعم از جسمي و روحي به علت شرکت در اين پژوهش برایش پيش آمد درمان عوارض، و هزينه‌هاي آن و غرامت مربوطه بر عهده مجري خواهد بود.

ندارد

هزینه های مربوط به انجام طرح تحقیقاتی
(تمام مداخلات پژوهشی باید برای بیمار رایگان باشد و بیمار بداند شامل چه مواردی هستند. )

تمامی هزینه های مربوط به خونگیری و جمع آوری نمونه توسط مجری پرداخت می شود و بیمار هیچ هزینه ای پرداخت نخواهد کرد.

روش های جایگزین
در صورت عدم تمایل به شرکت در مطالعه چه روش های درمانی برای بیمار ارائه خواهد شد

ندارد

محرمانه بودن
بیمار باید بداندکه دست اندر كاران اين پژوهش، كليه اطلاعات مربوط به او را نزد خود به صورت محرمانه نگه‌داشته و فقط اجازه دارند نتايج كلي و گروهي اين پژوهش را بدون ذکر نام و مشخصات بیمار منتشر كنند. و كميته اخلاق در پژوهش با هدف نظارت بر رعایت حقوق وی مي‌تواند به اطلاعات ایشان دسترسي داشته باشد.

اطلاعات بیمار به صورت کاملاً محرمانه حفظ خواهد شد.

پاسخگویی به پرسش ها
در این بخش نام و اطلاعات دسترسی فردی از عوامل پژوهش را که بتواند اطلاعات صحیح و کافی در اختیار شرکت کنندگان قرار دهند و در مورد عوارض و نگرانیها راهنمایی لازم را ارائه دهند ذکر شود

تلفن تماس برای پاسخگویی به هر گونه سوال 

دکتر سامان سرگزی 09103161030
دکتر رامین سراوانی 09155432609

حق نپذیرفتن یا انصراف
بیمار باید بداند که شرکت اودر اين پژوهش کاملاً داوطلبانه است و مجبور به شرکت در اين پژوهش نيست و در صورت عدم شرکت از مراقبت‌هاي معمول تشخيصي و درماني محروم نخواهد شد او باید بداند كه حتي پس از موافقت با شركت در پژوهش مي‌تواند هر وقت كه بخواهد، پس از اطلاع به مجري، از پژوهش خارج شود و خروج اواز پژوهش باعث محرومیت از دریافت خدمات درمانی معمول برای اونخواهد شد.

بیمار حق دارد از دادن نمونه ی خون امتناع کرده و یا در پژوهش شرکت ننماید.

رضایت
او باید بداند که اگر اشکال يا اعتراضي نسبت به دست اندركاران يا روند پژوهش دارد مي تواند با كميته اخلاق در پژوهش دانشگاه تماس گرفته و مشکل خود را به صورت شفاهي يا كتبي مطرح نمايد. در انتهای فرم قید گردد : اينجانب موارد فوق‌الذکر را خواندم و فهميدم و بر اساس آن رضايت آگاهانه خود را براي شركت در اين پژوهش اعلام مي‌کنم. اينجانب ……………… خود را ملزم به اجراي تعهدات مربوط به مجري در مفاد فوق دانسته و متعهد مي‌گردم در تأمين حقوق و ايمني شركت كننده در اين پژوهش تلاش نمايم

توضیحات حضوری مجری یا همکاران طرح بابت موافقت بیمار در جهت شرکت در این مطالعه اعلان می شود. و پس از موافقت شفاهی بیمار یک نسخه از این فرم به وی  داده شده و فرصت خواندن آن را دارد.

پرسشنامه یا فرم اطلاعاتی

فرم پرسشنامه طرح تحقیقاتی بر روی بیماران مزمن کلیوی (CKD)

نام و نام خانوادگی:

مدت زمان پیگیری:                          شماره تماس:                              گروه:  مورد       شاهد □         شماره: …..

 

                                                                                                             

 

 

جنسیت                                                                                 مرد □                  زن □

سن (year):

میزان شاخص توده بدنی (BMI)(kg/m2) :

شدت آلبومینوری   

A3 (>300 mg/g) □                A2 (30-300 mg/g) □           A1 (<30 mg/g) □

                                                                                 

سابقه خانوادگی ابتلا به بیماری­های کلیوی                                       دارد □                 ندارد □

 

سابقه­ ابتلا به دیابت                                                                   دارد □                 ندارد □

 

سابقه مصرف دخانیات                                                                دارد □                 ندارد □

 

سابقه مصرف الکل                                                                     دارد □                 ندارد □           

 

سابقه فشار خون                                                                       دارد □                 ندارد □

_________________________________________________________________________

  1. آزمایش­های مورد درخواست

آزمایش کامل ادرار                   تست­های روتین بیوشیمیایی □ CBC                          

  1. آزمایشگاه مورد مراجعه   

امام علی □                             خاتم الانبیاء □                                     بوعلی □

فرم پرسشنامه طرح تحقیقاتی بر روی بیماران مزمن کلیوی (CKD)

 

نام و نام خانوادگی:                       شماره تماس:                              گروه:  مورد       شاهد □         شماره: …..

 

FBS (mg/dl):

میزان کلسترول سرم (g/dL):

میزان تری گلیسرید سرم (g/dL):

میزان آلبومین سرم (g/dL):

میزان پروتئین توتال (g/dL) :

میزان اوریک اسید سرم (g/dL):

میزان اوره سرم (mg/dL):

میزان کراتینین سرم (mg/dL):

میزان پروتئین ادرار 24 ساعته (g):

میزانGFR  (mL/min/1.73 m2):

میزان کلسیم :

میزان فسفر :

HB

 

HCT

 

                                                                                MCV

 

MCH

 

MCHC

 

RBC

 

PLT

 

WBC

 

Neutrophils

 

Lymphocytes
 

Mix

 


پیوست ها
hide/show

نام فایل تاریخ درج فایل اندازه فایل دانلود