بررسی فراوانی پلی مورفیسم های rs422951 و ژن Notch4 در بیماران مبتلا به سل ریوی و افراد سالم شهر زاهدان

(مشتمل بر مرور تحقیقات گذشته داخلی و خارجی مرتبط با موضوع با ذکر منابع و توجیه ضرورت انجام طرح) :

سل (TB) یک بیماری عفونی باستانی است که توسط مایکو باکتریوم توبرکلوزیس (MTB) ایجاد می‌شود. علی‌رغم پیشرفت قابل‌توجه در تشخیص بیماری، درمان و واکسن‌ها، بیماری و مرگ و میر ناشی از سل همچنان بالا است (1). سازمان بهداشت جهانی در سال ۲۰۱۷ حدود ۱۰ میلیون مورد جدید و ۱.۵۷ میلیون مرگ را در سراسر جهان گزارش کرده‌است (2).

براساس آخرین آمار سازمان جهانی بهداشت، بیشترین موارد سل و مرگ و میر ناشی از آن در کشورهای در حال توسعه منجمله افغانستان و پاکستان که در زمره ی ۲۲ کشور پر بیماری عفونی دنیا قرار دارند، رخ می دهد (۳). در ایران نیز استان سیستان و بلوچستان به دلیل همجواری با دو کشور افغانستان و پاکستان بیشترین میزان های بروز و شیوع بیماری سل ریوی را دارا است. بر اساس آخرین آمار منتشره از وزارت بهداشت، در سال ۱۳۹۶ در ایران در جمعیت ۸۱۰۷۰۰۰۰ نفره و در استان سیستان و بلوچستان در جمعیت ۱۱۹8۴۱۴ به ترتیب میزان بروز میل ۸۸۱۹ نفر (88/%10) و ۳6۲ نفر (21/%30) سل روی اسمیر مثبت ۴4۲۶ نفر (46/%5) و ۲۲۸ نفر(03/%19)، سل ریوی اسمیر منفی ۱۷۴۱ نفر(15/%2) و ۴۳ نفر (59/%3) و سل خارج روی ۲362 نفر (91/%2) و ۷۶ نفر (34/%6) بوده است، که بالاترین میزان بروز سل در ایران مربوط به این استان است (4). بنابراین ضرورت توجه بیشتر به این بیماری را در این استان خاطر نشان می کند. علاوه بر این، بیماری سل می‌تواند مدت زیادی بدون هیچ نشانه‌ای از عفونت در میزبان باقی بماند و تنها 10-۵% درصد از افراد آلوده مبتلا به سل فعال هستند. یک توضیح مهم برای این پدیده مربوط به تعامل بین سل و سیستم ایمنی میزبان است که در تعادل دینامیکی است (1،5).

بنابراین، اگر چه سل یک بیماری عفونی است، عوامل ژنتیکی میزبان، به ویژه آن‌هایی که در وضعیت ایمنی میزبان درگیر هستند، نقش مهمی در هتروژنیتی قابل‌توجه در استعداد ابتلا به سل دارند (6،7). علاوه بر ژن‌های جهش‌یافته نادر که باعث سندرم‌های خانوادگی می‌شوند (8)، گزارش‌شده که بسیاری از ژن‌های مربوط به سیستم ایمنی با استعداد ابتلا به سل در موارد تک گیر همراه هستند، مانند ژن آنتی‌ژن لکوسیت انسانی (‏HLA) (9)، ژن گیرنده ویتامین D (VDR) (10)، ژن گیرنده شبه تول (‏TLR) (11)، ژن اینترفرون گاما (‏IFN – γ) و ژن‌های مربوط به سایتوکاین و کموکاین. (12). علاوه بر این، مطالعه ارتباط گسترده ژنوم (‏GWAS)، براساس انواع ژن ظرفیت بالا و فناوری توالی یابی، مقیاس و دامنه کشف ژن‌های مستعد کننده را گسترش داده‌است. مطالعات مبتنی بر GWAS تعدادی از مکان‌های پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی (‏SNP) با ویژگی پایین مرتبط با خطر سل را شناسایی کرده‌اند، مانند 5q3.3 (13)، 20p13 و 14q24.3 (14). این یافته‌ها این فرض را تقویت کرده‌اند که ژنتیک میزبان در استعداد ابتلا به سل نقش دارد. با این حال، نتایج تا حدودی ناهمگن بوده و تایید مکرر آن‌ها در جمعیت‌های دیگر دشوار است. با توجه به بار بیماری سل در چین، بررسی پایه‌های ژنتیکی استعداد ابتلا به بیماری سل در جمعیت چین، براساس یک نمونه بزرگ، می‌تواند درک بهتری از اساس بیماری‌زایی استعداد ابتلا به بیماری سل فراهم کند. به طور کلی، ماکروفاژها، مایکوباکتریوم سل مهاجم را مستقیما به عنوان بخشی از دفاع اولیه سیستم ایمنی میزبان در نظر می‌گیرند و گیرنده‌های شبه تول به آزاد سازی سیتوکینها و فعال‌سازی آنزیم‌ها کمک می‌کنند. چنین فعل و انفعالات همزادان، آزادسازی سیتوکینهای پیش التهابی را تعدیل می‌کند، از جمله IL - ۱، عامل نکروز تومور آلفا (‏TNF- آلفا)‏، اینترلوکین ۱۲ (‏IL۱۲)‏و اینترلوکین ۶ (‏IL - ۶)‏و شروع پاسخ‌های ایمنی ذاتی میکند (15). علاوه بر این، این واسطه‌های التهابی، انتقال سلول‌های دندریتیک به غدد لنفاوی محلی را برای شروع ایمنی تطبیقی برای کشتن باکتری یا جلوگیری از رشد آن برای محدود کردن آن به مرحله نهفته، افزایش می‌دهند. ایمنی انطباقی براساس شناخت خاص آنتی‌ژن و تکثیر و تمایز بعدی سلول‌های T همراه با آزاد سازی سیتوکین مربوطه و ایمنی عقیم‌سازی است (15،16). تمام این رویدادها توسط شبکه سیگنال دهی سیتوکینهای چندکاربردی هماهنگ شده‌اند که در مقاومت و حساسیت میزبان هم در مدل‌های حیوانی و هم در انسان‌ها نقش میانجی ایفا می‌کنند (15،16). بنابراین، شناسایی مولکول کلیدی در مسیر سیگنال دهی میزبان به درک مکانیسم بیماری‌زایی کمک خواهد کرد و ایده‌های جدیدی برای بهبود درمان فراهم می‌کند. مسیر سیگنال دهی Notch به طور گسترده در سیگنال دهی برای تشخیص، تکثیر، تمایز و آپوپتوز سلول‌های مختلف بافت درگیر است و هم ایمنی ذاتی و هم ایمنی انطباقی را تنظیم می‌کند (17،18). علامت دهی Aberrant Notch با سرطان (19) و بیماری‌های التهابی در ارتباط است (20،21). علاوه بر این، Notch نقش مهمی در تعیین سرنوشت سلول ایفا می‌کند و در توسعه ریه و فرآیندهای بیماری‌های ریوی نقش دارد (22). انسان‌ها چهار گیرنده Notch و پنج لیگاند دارند. (17). Notch4 عضوی از خانواده گیرنده‌های Notch و یک گیرنده فراغشایی حفاظت‌شده تکاملی است. ژن Notch4 ، که بین ژن G18 در مرکز ناحیه HLA III و ژن DRA در انتهای تلومری منطقه II قرار دارد، جایگاه مهمی در HLA اشغال کرده و در پیوستگی عدم تعادل با لوکوس های خاص HLA است (23،24).

علاوه بر بیان شدن بر روی سلول‌های غددی و اپی تلیال پانکراس در ریه (25)، Notch4 عمدتا در ماکروفاژهای بالغ بیان می‌شود که باسیل را به طور مستقیم در خود فرو می‌برد و اولین دفاع از ایمنی ذاتی را آغاز می‌کند (26). مطالعه اخیر نشان داد که گیرنده Notch4  یک عامل محافظتی مهم در برابر پاسخ التهابی ایمنی ذاتی به اوزن در ریه بود. (25) علاوه بر این، مشخص شده‌است که Notch4  نقش محافظتی در واکنش التهابی به عفونت سل دارد (‏27). در کل، با توجه به حفاظت ژنتیکی Notch4  و موقعیت سلولی خاص آن و پاسخ‌های ایمنی به آن، ممکن است Notch4 نقش مهمی در بیماری‌های عفونی ریه از جمله سل ایفا کند. تعداد مطالعات در مورد انواع Notch4  و ارتباط آن‌ها با استعداد ابتلا به بیماری در حال افزایش است و شامل مطالعات در مورد سرطان کبد (28)، خود ایمنی و بیماری‌های عفونی است. (29)

1. مطالعه Zheng و همکارانش در سال 2018 با عنوان شناسایی ارتباط ژنتیکی وسیع دو مکان خطر ابتلا به سل را در چینی‌های هان منتشر کردند که ​​​​​​آن ها یک مطالعه چند مرحله‌ای در سطح ژنوم بر روی ۲۹۴۹ بیمار سل ریوی و ۵۰۹۰ کنترل سالم (‏۸۳۳ مورد و ۱۲۲۰ کنترل در سطح ژنوم) ‏از جمعیت چینی‌های هان انجام دادند. آن ها دو مکان خطر کشف کردند: 14q24.3 (rs12437118, P_combined = 1.72 × 10⁻¹¹ OR = 1.277, ESRRB) و (rs6114027, P_combined = 2.37 × 10⁻¹¹, OR = 1.339, TGM6). علاوه بر این، آن ها مشخص کردند که آلل خطر rs6114027 مربوط به کاهش رونوشت‌های TGM6 در PBMCs از بیماران سل ریوی و بیماری شدیدتر سل ریوی است. علاوه بر این، آن ها متوجه شدند که موش‌های دارای نقص tgm6 بیشتر مستعد عفونت با مایکوباکتریوم توبرکلوزیس هستند. نتایج آن ها دیدگاه‌های جدیدی را در مورد علل ژنتیکی سل ارائه می‌دهد (30). ​

۲. مطالعه Zhang و همکارانش در سال 2020  با عنوان یک جهش بد Notch4 مرتبط با استعداد ابتلا به سل در جمعیت چین، منتشر شد که در مجموع ۹۰۰ بیمار مبتلا به سل و ۱۵۳۴ فرد سالم به عنوان کنترل به ترتیب در بیمارستان غرب چین از ژانویه ۲۰۱۴ تا فوریه ۲۰۱۶ وارد مطالعه شدند، دوازده SNP انتخاب شده توسط کیت اختصاصی اسکن SNP 48-plex 2 با استفاده از طرح ژنوتیپ انجام شد. (rs2071277، rs2071285، rs206016، rs438475 ، rs2256594، rs429853، rs422951، rs415929، rs915895، rs443198، rs3830041 و rs375244). فراوانی alleles، ژنوتیپ‌ها و مدل‌های ژنتیکی متغیرها بین دو گروه مقایسه شدند، در حالی که تعاملات SNPSNP توسط نرم‌افزار کاهش بعد چند عاملی (‏MDR) تحلیل شدند. نسبت احتمال (‏OR) با فاصله اطمینان ۹۵ % (‏CI) محاسبه شد.  G allele rs2071277 از Notch4 با کاهش خطر ابتلا به سل همراه بود (‏OR 0.844; 95% CI 0.748–0.954, p = .006).G allele rs422951 از Notch4 با کاهش خطر ابتلا به سل مرتبط بود (‏OR 0.818; 95% CI 0.703–0.950, p = .008). این یافته‌ها با نتایج حاصل از مدل غالب و مدل افزایشی سازگار بودند. فراوانی آلل، ژنوتیپ و مدل ژنتیکی برای سایر SNP ها در دو گروه مشابه بود (‏همه p بزرگتر از 0.05). یک هاپلوتیپ (‏GTG) متشکل از rs2071277، rs2071285 و rs206016 با خطر سل همراه بود (p = .011). نتایج نشان داد مطالعه آن ها اولین مطالعه‌ای است که نشان می‌دهد انواع مختلف G allele از rs2071277 و rs422951 در Notch4 حساسیت به بیماری سل در یک جمعیت چینی تاثیر می‌گذارند و نشان می‌دهد که علامت دهی Notch4 در پاتوژنز بیماری سل دخالت دارد. مطالعات بیشتر با تایید کارکردی درک ما از نقش سیگنال دهی Notch4 را اصلاح کرده و راه‌های جدیدی برای مداخله درمانی فراهم می‌کند (31). ​

۳. مطالعه Zhang و همکارانش در سال 2018 با عنوان اهمیت تنوع ژنتیکی مشترک TLR2 در فنوتیپ بالینی و خطر بیماری سل در یک جمعیت غربی چین منتشر شد که در مجموع ۱۱۰۹ فرد (‏۶۳۴ بیمار مبتلا به سل و ۴۷۵ فرد سالم) با استفاده از یک کیت TM اسکن SNP 2x48-Plex SNP به صورت دلخواه برای rs3804099، rs3804100 و rs76112010 ژنوتیپ شدند. تجزیه و تحلیل آماری بین ۳ SNP منتخب و خطر و فنوتیپ سل در این مطالعه انجام شد. مقدار قابل‌توجهی از SNP در رابطه با استعداد ابتلا به عفونت سل و فنوتیپ بالینی مورد تحقیق بیشتر قرار گرفتند. ​هیچ کدام از سه جایگاه ژنتیکی (‏rs3804099، rs3804100 و rs76112010) ‏تفاوت آماری قابل توجهی را بین تمام موارد سل و افراد سالم در ژنوتیپ، فراوانی آلل ها و مدل‌های ژنتیکی نشان ندادند (‏همه p بیشتر از ۰.۰۵)‏. مقایسه آماری درمان مجدد موارد سل و کنترل سالم یا موارد اولیه نشان داد که rs3804099 به طور قابل‌توجهی با افزایش خطر ابتلا به سل در جمعیت غرب چین در ارتباط است. در مورد فراوانی ژنوتیپ‌ها، زیر گروه‌های گروه درمان مجدد سل در مقایسه با گروه کنترل سالم و درمان مجدد سل در مقایسه با گروه تحلیل اولیه سل به ترتیب p = 0.041 و p = 0.002 را نشان دادند. برای مدل مغلوب، زیر گروه درمان مجدد گروه سل در مقابل گروه کنترل سالم و درمان مجدد گروه سل در مقابل گروه سل اولیه به ترتیب p = 0.028 و P = 0.002 پس از اصلاح بونفرونی را نشان دادند. علاوه بر این، تجزیه و تحلیل ژنوتیپ‌های rs76112010 در رابطه با فنوتیپ بالینی سل فعال با استفاده از مدل غالب نشان داد که به شدت با پارامترهای خونی مختلف ارتباط دارد (اریتروسیت P = 0.043، هموگلوبین P = 0.047، هماتوکریت P = 0.027). نتایج نشان داد مطالعه آن ها، جوامع قابل‌توجهی از rs3804099 را با حساسیت به سل در تحلیل زیر گروه درمان مجدد سل نشان داد. مطالعه آن ها پیشنهاد کرد که تنوع ژنتیکی مشترک TLR2 ممکن است بر توسعه سل و فنوتیپ بیماری در جمعیت غربی چین تاثیر بگذارد(32). ​

۴. مطالعهVerhein در سال 2015 با عنوان نقش‌های بدیع برای Notch3 و Notch4 دریافت کنندگان در بیان ژن و حساسیت به التهاب ریه در موش‌ها منتشر شد که ​موش‌های نوع وحشی (‏WT)، Notch3 (‏Notch3-/-)‏، و Notch4  (‏Notch4 -/-) ‏موش‌های ضربه فنی شده در معرض ازن (‏۰.۳ ppm) یا هوای فیلتر شده به مدت ۶ – 72 ساعت قرار گرفتند. ​​​​​​​​​اوزن نسبت به کنترل‌های در معرض هوا، پروتئین مایع شستشوی برونکوآلوئولار (‏BALF)، شاخص نفوذپذیری ریه را در تمام ژنوتیپ‌ها افزایش داد، اما غلظت‌های بیشتری در Notch4-/- در مقایسه با موش‌های WT و Notch3-/- یافت شد. میانگین بیشتر تعداد نوتروفیلهای BALF در موش‌های Notch3-/- و Notch4-/- در مقایسه با موش‌های WT بعد از قرار گرفتن در معرض ازن یافت شد. بیان Tnf کل ریه به طور قابل‌توجهی بعد از ازن در موش‌های ناتیچ ۳ و Notch4-/-  افزایش یافت، و به طور قابل‌توجهی در موش‌های Notch3-/- در مقایسه با موش‌های WT بیشتر بود. تحلیل‌های آماری از ترانسکریپتوم، شبکه‌های ژنی که به طور متفاوت بین WT و موش‌های ضربه فنی شده و بعد از ازن بیان شده‌بودند را شناسایی کرد، و شامل Trim30، عضو مسیر التهابی، و Traf6، یک عضو علامت دهی التهابی بود. ​نتایج نشان داد این یافته های جدید مطابق با Notch3 و Notch4 به عنوان ژن های مستعد آسیب ریه ناشی اوزن هستند و نشان می دهد که گیرنده های شکاف از ایمنی ذاتی محافظت می کنند (33).

5. مطالعه Wu و همکاران در سال 2005 با عنوان تعیین مولکولی انتقال Notch4 در سلول‌های عروقی منتشر شد که آن ها بررسی کردند که چگونه بیان NOTCH4 در سلول‌های اندوتلیال انسان و در موش‌های تراژنی تنظیم می‌شود. پیشبرنده NOTCH4 و بخش &۵& NOTCH4 در یک الگوی تغییر هیستونی خاص سلول اندوتلیال مونتاژ شدند. تجزیه و تحلیل رونوشت‌های اولیه NOTCH4 در سلول‌های اندوتلیال ورید بندناف انسان توسط RNA فلورسنس در هیبریداسیون در محل آشکار کرد که ۳۶ % از سلول‌ها یک یا هر دو آلل NOTCH4 را رونویسی کردند. پیشبرنده NOTCH4 برای انتقال نسخه‌برداری ویژه سلول‌های اندوتلیال در سنجش ترانسفکشن کافی بود، اما برای بیان در عروق جنین‌های ترانسفکت شده موش، اینترون ۱ یا توالی‌های بالادست مورد نیاز بود. مجموعه پروتئین فعال‌کننده ویژه نوع سلولی ۱ (‏AP-1)‏، کروماتین NOTCH4 را اشغال کرده و رونویسی ویژه سلول اندوتلیال را سبب شدند. عوامل رگ زایی عروقی، AP-1 را فعال کرده و ژن NOTCH4 اندوژن را در سلول‌های HeLa از حالت سرکوب‌شده تا حالت فعال رونویسی، مجددا برنامه‌ریزی کردند. این نتایج یک مسیر AP-1- Notch4 را نشان می‌دهد، که ما پیشنهاد می‌کنیم برای انتقال سیگنال‌های آنژیوژنیک بسیار مهم است و براساس انتقال سیگنال اشتباه در سرطان تنظیم می‌شود (34).

6. مطالعه Zheng و همکاران در سال 2018 با عنوان Notch4 به طور منفی واکنش التهابی به مایکو باکتریوم سل عفونی را با استفاده از روش فعال کردن TAK1 تنظیم میکند، منتشر شد. در این مطالعه، دریافتند که موشهای دارای کمبود Notch4 در برابر عفونت سل مقاومتر هستند، با یک باکتری بسیار کمتر و تغییرات پاتولوژیک کمتری در ریهها وجود دارد. NOTCH4 تولید سیتوکینهای پیش التهابی توسط تعامل با TAK1 و مهار فعال‌سازی آن را مهار کرد. علاوه بر این، آن ها متوجه شدند که دامنه داخل سلولی کوچک ۴ از توزیع خودکار TRAF6 جلوگیری کرده و توزیع غیر معمول TRAF6 را سرکوب می‌کند. این نتایج نشان می‌دهد که NOTCH4 تنظیم‌کننده منفی واکنش التهابی ناشی از سل است و درمان با مهار کننده Notch می‌تواند به عنوان یک راهبرد درمانی جدید برای سل عمل کند (35).

با این حال، تا آنجا که ما می‌دانیم، نقش عملکردی Notch4  در عفونت سل نامشخص باقی مانده‌است و هیچ ارتباط ژنتیکی بین گونه‌های Notch4  و استعداد ابتلا به سل گزارش نشده است. بنابراین، با توجه به بار سنگین بیماری سل در استان سیستان و بلوچستان، هدف از این مطالعه تعیین پلی مورفیسم های rs422951 و  rs2071277 ژن Notch4 در بیماران مبتلا به سل ریوی و افراد سالم شهر زاهدان خواهد بود. درک مکانیسم‌های بیماری‌زایی ممکن است برای پیش‌گیری و درمان فردی ارزشمند باشد. ​

(مشتمل بر مرور تحقیقات گذشته داخلی و خارجی مرتبط با موضوع با ذکر منابع و توجیه ضرورت انجام طرح) :

سل (TB) یک بیماری عفونی باستانی است که توسط مایکو باکتریوم توبرکلوزیس (MTB) ایجاد می‌شود. علی‌رغم پیشرفت قابل‌توجه در تشخیص بیماری، درمان و واکسن‌ها، بیماری و مرگ و میر ناشی از سل همچنان بالا است (1). سازمان بهداشت جهانی در سال ۲۰۱۷ حدود ۱۰ میلیون مورد جدید و ۱.۵۷ میلیون مرگ را در سراسر جهان گزارش کرده‌است (2).

براساس آخرین آمار سازمان جهانی بهداشت، بیشترین موارد سل و مرگ و میر ناشی از آن در کشورهای در حال توسعه منجمله افغانستان و پاکستان که در زمره ی ۲۲ کشور پر بیماری عفونی دنیا قرار دارند، رخ می دهد (۳). در ایران نیز استان سیستان و بلوچستان به دلیل همجواری با دو کشور افغانستان و پاکستان بیشترین میزان های بروز و شیوع بیماری سل ریوی را دارا است. بر اساس آخرین آمار منتشره از وزارت بهداشت، در سال ۱۳۹۶ در ایران در جمعیت ۸۱۰۷۰۰۰۰ نفره و در استان سیستان و بلوچستان در جمعیت ۱۱۹8۴۱۴ به ترتیب میزان بروز میل ۸۸۱۹ نفر (88/%10) و ۳6۲ نفر (21/%30) سل روی اسمیر مثبت ۴4۲۶ نفر (46/%5) و ۲۲۸ نفر(03/%19)، سل ریوی اسمیر منفی ۱۷۴۱ نفر(15/%2) و ۴۳ نفر (59/%3) و سل خارج روی ۲362 نفر (91/%2) و ۷۶ نفر (34/%6) بوده است، که بالاترین میزان بروز سل در ایران مربوط به این استان است (4). بنابراین ضرورت توجه بیشتر به این بیماری را در این استان خاطر نشان می کند. علاوه بر این، بیماری سل می‌تواند مدت زیادی بدون هیچ نشانه‌ای از عفونت در میزبان باقی بماند و تنها 10-۵% درصد از افراد آلوده مبتلا به سل فعال هستند. یک توضیح مهم برای این پدیده مربوط به تعامل بین سل و سیستم ایمنی میزبان است که در تعادل دینامیکی است (1،5).

بنابراین، اگر چه سل یک بیماری عفونی است، عوامل ژنتیکی میزبان، به ویژه آن‌هایی که در وضعیت ایمنی میزبان درگیر هستند، نقش مهمی در هتروژنیتی قابل‌توجه در استعداد ابتلا به سل دارند (6،7). علاوه بر ژن‌های جهش‌یافته نادر که باعث سندرم‌های خانوادگی می‌شوند (8)، گزارش‌شده که بسیاری از ژن‌های مربوط به سیستم ایمنی با استعداد ابتلا به سل در موارد تک گیر همراه هستند، مانند ژن آنتی‌ژن لکوسیت انسانی (‏HLA) (9)، ژن گیرنده ویتامین D (VDR) (10)، ژن گیرنده شبه تول (‏TLR) (11)، ژن اینترفرون گاما (‏IFN – γ) و ژن‌های مربوط به سایتوکاین و کموکاین. (12). علاوه بر این، مطالعه ارتباط گسترده ژنوم (‏GWAS)، براساس انواع ژن ظرفیت بالا و فناوری توالی یابی، مقیاس و دامنه کشف ژن‌های مستعد کننده را گسترش داده‌است. مطالعات مبتنی بر GWAS تعدادی از مکان‌های پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی (‏SNP) با ویژگی پایین مرتبط با خطر سل را شناسایی کرده‌اند، مانند 5q3.3 (13)، 20p13 و 14q24.3 (14). این یافته‌ها این فرض را تقویت کرده‌اند که ژنتیک میزبان در استعداد ابتلا به سل نقش دارد. با این حال، نتایج تا حدودی ناهمگن بوده و تایید مکرر آن‌ها در جمعیت‌های دیگر دشوار است. با توجه به بار بیماری سل در چین، بررسی پایه‌های ژنتیکی استعداد ابتلا به بیماری سل در جمعیت چین، براساس یک نمونه بزرگ، می‌تواند درک بهتری از اساس بیماری‌زایی استعداد ابتلا به بیماری سل فراهم کند. به طور کلی، ماکروفاژها، مایکوباکتریوم سل مهاجم را مستقیما به عنوان بخشی از دفاع اولیه سیستم ایمنی میزبان در نظر می‌گیرند و گیرنده‌های شبه تول به آزاد سازی سیتوکینها و فعال‌سازی آنزیم‌ها کمک می‌کنند. چنین فعل و انفعالات همزادان، آزادسازی سیتوکینهای پیش التهابی را تعدیل می‌کند، از جمله IL - ۱، عامل نکروز تومور آلفا (‏TNF- آلفا)‏، اینترلوکین ۱۲ (‏IL۱۲)‏و اینترلوکین ۶ (‏IL - ۶)‏و شروع پاسخ‌های ایمنی ذاتی میکند (15). علاوه بر این، این واسطه‌های التهابی، انتقال سلول‌های دندریتیک به غدد لنفاوی محلی را برای شروع ایمنی تطبیقی برای کشتن باکتری یا جلوگیری از رشد آن برای محدود کردن آن به مرحله نهفته، افزایش می‌دهند. ایمنی انطباقی براساس شناخت خاص آنتی‌ژن و تکثیر و تمایز بعدی سلول‌های T همراه با آزاد سازی سیتوکین مربوطه و ایمنی عقیم‌سازی است (15،16). تمام این رویدادها توسط شبکه سیگنال دهی سیتوکینهای چندکاربردی هماهنگ شده‌اند که در مقاومت و حساسیت میزبان هم در مدل‌های حیوانی و هم در انسان‌ها نقش میانجی ایفا می‌کنند (15،16). بنابراین، شناسایی مولکول کلیدی در مسیر سیگنال دهی میزبان به درک مکانیسم بیماری‌زایی کمک خواهد کرد و ایده‌های جدیدی برای بهبود درمان فراهم می‌کند. مسیر سیگنال دهی Notch به طور گسترده در سیگنال دهی برای تشخیص، تکثیر، تمایز و آپوپتوز سلول‌های مختلف بافت درگیر است و هم ایمنی ذاتی و هم ایمنی انطباقی را تنظیم می‌کند (17،18). علامت دهی Aberrant Notch با سرطان (19) و بیماری‌های التهابی در ارتباط است (20،21). علاوه بر این، Notch نقش مهمی در تعیین سرنوشت سلول ایفا می‌کند و در توسعه ریه و فرآیندهای بیماری‌های ریوی نقش دارد (22). انسان‌ها چهار گیرنده Notch و پنج لیگاند دارند. (17). Notch4 عضوی از خانواده گیرنده‌های Notch و یک گیرنده فراغشایی حفاظت‌شده تکاملی است. ژن Notch4 ، که بین ژن G18 در مرکز ناحیه HLA III و ژن DRA در انتهای تلومری منطقه II قرار دارد، جایگاه مهمی در HLA اشغال کرده و در پیوستگی عدم تعادل با لوکوس های خاص HLA است (23،24).

علاوه بر بیان شدن بر روی سلول‌های غددی و اپی تلیال پانکراس در ریه (25)، Notch4 عمدتا در ماکروفاژهای بالغ بیان می‌شود که باسیل را به طور مستقیم در خود فرو می‌برد و اولین دفاع از ایمنی ذاتی را آغاز می‌کند (26). مطالعه اخیر نشان داد که گیرنده Notch4  یک عامل محافظتی مهم در برابر پاسخ التهابی ایمنی ذاتی به اوزن در ریه بود. (25) علاوه بر این، مشخص شده‌است که Notch4  نقش محافظتی در واکنش التهابی به عفونت سل دارد (‏27). در کل، با توجه به حفاظت ژنتیکی Notch4  و موقعیت سلولی خاص آن و پاسخ‌های ایمنی به آن، ممکن است Notch4 نقش مهمی در بیماری‌های عفونی ریه از جمله سل ایفا کند. تعداد مطالعات در مورد انواع Notch4  و ارتباط آن‌ها با استعداد ابتلا به بیماری در حال افزایش است و شامل مطالعات در مورد سرطان کبد (28)، خود ایمنی و بیماری‌های عفونی است. (29)

1. مطالعه Zheng و همکارانش در سال 2018 با عنوان شناسایی ارتباط ژنتیکی وسیع دو مکان خطر ابتلا به سل را در چینی‌های هان منتشر کردند که ​​​​​​آن ها یک مطالعه چند مرحله‌ای در سطح ژنوم بر روی ۲۹۴۹ بیمار سل ریوی و ۵۰۹۰ کنترل سالم (‏۸۳۳ مورد و ۱۲۲۰ کنترل در سطح ژنوم) ‏از جمعیت چینی‌های هان انجام دادند. آن ها دو مکان خطر کشف کردند: 14q24.3 (rs12437118, P_combined = 1.72 × 10⁻¹¹ OR = 1.277, ESRRB) و (rs6114027, P_combined = 2.37 × 10⁻¹¹, OR = 1.339, TGM6). علاوه بر این، آن ها مشخص کردند که آلل خطر rs6114027 مربوط به کاهش رونوشت‌های TGM6 در PBMCs از بیماران سل ریوی و بیماری شدیدتر سل ریوی است. علاوه بر این، آن ها متوجه شدند که موش‌های دارای نقص tgm6 بیشتر مستعد عفونت با مایکوباکتریوم توبرکلوزیس هستند. نتایج آن ها دیدگاه‌های جدیدی را در مورد علل ژنتیکی سل ارائه می‌دهد (30). ​

۲. مطالعه Zhang و همکارانش در سال 2020  با عنوان یک جهش بد Notch4 مرتبط با استعداد ابتلا به سل در جمعیت چین، منتشر شد که در مجموع ۹۰۰ بیمار مبتلا به سل و ۱۵۳۴ فرد سالم به عنوان کنترل به ترتیب در بیمارستان غرب چین از ژانویه ۲۰۱۴ تا فوریه ۲۰۱۶ وارد مطالعه شدند، دوازده SNP انتخاب شده توسط کیت اختصاصی اسکن SNP 48-plex 2 با استفاده از طرح ژنوتیپ انجام شد. (rs2071277، rs2071285، rs206016، rs438475 ، rs2256594، rs429853، rs422951، rs415929، rs915895، rs443198، rs3830041 و rs375244). فراوانی alleles، ژنوتیپ‌ها و مدل‌های ژنتیکی متغیرها بین دو گروه مقایسه شدند، در حالی که تعاملات SNPSNP توسط نرم‌افزار کاهش بعد چند عاملی (‏MDR) تحلیل شدند. نسبت احتمال (‏OR) با فاصله اطمینان ۹۵ % (‏CI) محاسبه شد.  G allele rs2071277 از Notch4 با کاهش خطر ابتلا به سل همراه بود (‏OR 0.844; 95% CI 0.748–0.954, p = .006).G allele rs422951 از Notch4 با کاهش خطر ابتلا به سل مرتبط بود (‏OR 0.818; 95% CI 0.703–0.950, p = .008). این یافته‌ها با نتایج حاصل از مدل غالب و مدل افزایشی سازگار بودند. فراوانی آلل، ژنوتیپ و مدل ژنتیکی برای سایر SNP ها در دو گروه مشابه بود (‏همه p بزرگتر از 0.05). یک هاپلوتیپ (‏GTG) متشکل از rs2071277، rs2071285 و rs206016 با خطر سل همراه بود (p = .011). نتایج نشان داد مطالعه آن ها اولین مطالعه‌ای است که نشان می‌دهد انواع مختلف G allele از rs2071277 و rs422951 در Notch4 حساسیت به بیماری سل در یک جمعیت چینی تاثیر می‌گذارند و نشان می‌دهد که علامت دهی Notch4 در پاتوژنز بیماری سل دخالت دارد. مطالعات بیشتر با تایید کارکردی درک ما از نقش سیگنال دهی Notch4 را اصلاح کرده و راه‌های جدیدی برای مداخله درمانی فراهم می‌کند (31). ​

۳. مطالعه Zhang و همکارانش در سال 2018 با عنوان اهمیت تنوع ژنتیکی مشترک TLR2 در فنوتیپ بالینی و خطر بیماری سل در یک جمعیت غربی چین منتشر شد که در مجموع ۱۱۰۹ فرد (‏۶۳۴ بیمار مبتلا به سل و ۴۷۵ فرد سالم) با استفاده از یک کیت TM اسکن SNP 2x48-Plex SNP به صورت دلخواه برای rs3804099، rs3804100 و rs76112010 ژنوتیپ شدند. تجزیه و تحلیل آماری بین ۳ SNP منتخب و خطر و فنوتیپ سل در این مطالعه انجام شد. مقدار قابل‌توجهی از SNP در رابطه با استعداد ابتلا به عفونت سل و فنوتیپ بالینی مورد تحقیق بیشتر قرار گرفتند. ​هیچ کدام از سه جایگاه ژنتیکی (‏rs3804099، rs3804100 و rs76112010) ‏تفاوت آماری قابل توجهی را بین تمام موارد سل و افراد سالم در ژنوتیپ، فراوانی آلل ها و مدل‌های ژنتیکی نشان ندادند (‏همه p بیشتر از ۰.۰۵)‏. مقایسه آماری درمان مجدد موارد سل و کنترل سالم یا موارد اولیه نشان داد که rs3804099 به طور قابل‌توجهی با افزایش خطر ابتلا به سل در جمعیت غرب چین در ارتباط است. در مورد فراوانی ژنوتیپ‌ها، زیر گروه‌های گروه درمان مجدد سل در مقایسه با گروه کنترل سالم و درمان مجدد سل در مقایسه با گروه تحلیل اولیه سل به ترتیب p = 0.041 و p = 0.002 را نشان دادند. برای مدل مغلوب، زیر گروه درمان مجدد گروه سل در مقابل گروه کنترل سالم و درمان مجدد گروه سل در مقابل گروه سل اولیه به ترتیب p = 0.028 و P = 0.002 پس از اصلاح بونفرونی را نشان دادند. علاوه بر این، تجزیه و تحلیل ژنوتیپ‌های rs76112010 در رابطه با فنوتیپ بالینی سل فعال با استفاده از مدل غالب نشان داد که به شدت با پارامترهای خونی مختلف ارتباط دارد (اریتروسیت P = 0.043، هموگلوبین P = 0.047، هماتوکریت P = 0.027). نتایج نشان داد مطالعه آن ها، جوامع قابل‌توجهی از rs3804099 را با حساسیت به سل در تحلیل زیر گروه درمان مجدد سل نشان داد. مطالعه آن ها پیشنهاد کرد که تنوع ژنتیکی مشترک TLR2 ممکن است بر توسعه سل و فنوتیپ بیماری در جمعیت غربی چین تاثیر بگذارد(32). ​

۴. مطالعهVerhein در سال 2015 با عنوان نقش‌های بدیع برای Notch3 و Notch4 دریافت کنندگان در بیان ژن و حساسیت به التهاب ریه در موش‌ها منتشر شد که ​​​​​​​​موش‌های نوع وحشی (‏WT)، Notch3 (‏Notch3-/-)‏، و Notch4  (‏Notch4 -/-) ‏موش‌های ضربه فنی شده در معرض ازن (‏۰.۳ ppm) یا هوای فیلتر شده به مدت ۶ – 72 ساعت قرار گرفتند. ​​​​​​​​​اوزن نسبت به کنترل‌های در معرض هوا، پروتئین مایع شستشوی برونکوآلوئولار (‏BALF)، شاخص نفوذپذیری ریه را در تمام ژنوتیپ‌ها افزایش داد، اما غلظت‌های بیشتری در Notch4-/- در مقایسه با موش‌های WT و Notch3-/- یافت شد. میانگین بیشتر تعداد نوتروفیلهای BALF در موش‌های Notch3-/- و Notch4-/- در مقایسه با موش‌های WT بعد از قرار گرفتن در معرض ازن یافت شد. بیان Tnf کل ریه به طور قابل‌توجهی بعد از ازن در موش‌های ناتیچ ۳ و Notch4-/-  افزایش یافت، و به طور قابل‌توجهی در موش‌های Notch3-/- در مقایسه با موش‌های WT بیشتر بود. تحلیل‌های آماری از ترانسکریپتوم، شبکه‌های ژنی که به طور متفاوت بین WT و موش‌های ضربه فنی شده و بعد از ازن بیان شده‌بودند را شناسایی کرد، و شامل Trim30، عضو مسیر التهابی، و Traf6، یک عضو علامت دهی التهابی بود. ​نتایج نشان داد این یافته های جدید مطابق با Notch3 و Notch4 به عنوان ژن های مستعد آسیب ریه ناشی اوزن هستند و نشان می دهد که گیرنده های شکاف از ایمنی ذاتی محافظت می کنند (33).

5. مطالعه Wu و همکاران در سال 2005 با عنوان تعیین مولکولی انتقال Notch4 در سلول‌های عروقی منتشر شد که آن ها بررسی کردند که چگونه بیان NOTCH4 در سلول‌های اندوتلیال انسان و در موش‌های تراژنی تنظیم می‌شود. پیشبرنده NOTCH4 و بخش &۵& NOTCH4 در یک الگوی تغییر هیستونی خاص سلول اندوتلیال مونتاژ شدند. تجزیه و تحلیل رونوشت‌های اولیه NOTCH4 در سلول‌های اندوتلیال ورید بندناف انسان توسط RNA فلورسنس در هیبریداسیون در محل آشکار کرد که ۳۶ % از سلول‌ها یک یا هر دو آلل NOTCH4 را رونویسی کردند. پیشبرنده NOTCH4 برای انتقال نسخه‌برداری ویژه سلول‌های اندوتلیال در سنجش ترانسفکشن کافی بود، اما برای بیان در عروق جنین‌های ترانسفکت شده موش، اینترون ۱ یا توالی‌های بالادست مورد نیاز بود. مجموعه پروتئین فعال‌کننده ویژه نوع سلولی ۱ (‏AP-1)‏، کروماتین NOTCH4 را اشغال کرده و رونویسی ویژه سلول اندوتلیال را سبب شدند. عوامل رگ زایی عروقی، AP-1 را فعال کرده و ژن NOTCH4 اندوژن را در سلول‌های HeLa از حالت سرکوب‌شده تا حالت فعال رونویسی، مجددا برنامه‌ریزی کردند. این نتایج یک مسیر AP-1- Notch4 را نشان می‌دهد، که ما پیشنهاد می‌کنیم برای انتقال سیگنال‌های آنژیوژنیک بسیار مهم است و براساس انتقال سیگنال اشتباه در سرطان تنظیم می‌شود (34).

6. مطالعه Zheng و همکاران در سال 2018 با عنوان Notch4 به طور منفی واکنش التهابی به مایکو باکتریوم سل عفونی را با استفاده از روش فعال کردن TAK1 تنظیم میکند، منتشر شد. در این مطالعه، دریافتند که موشهای دارای کمبود Notch4 در برابر عفونت سل مقاومتر هستند، با یک باکتری بسیار کمتر و تغییرات پاتولوژیک کمتری در ریهها وجود دارد. NOTCH4 تولید سیتوکینهای پیش التهابی توسط تعامل با TAK1 و مهار فعال‌سازی آن را مهار کرد. علاوه بر این، آن ها متوجه شدند که دامنه داخل سلولی کوچک ۴ از توزیع خودکار TRAF6 جلوگیری کرده و توزیع غیر معمول TRAF6 را سرکوب می‌کند. این نتایج نشان می‌دهد که NOTCH4 تنظیم‌کننده منفی واکنش التهابی ناشی از سل است و درمان با مهار کننده Notch می‌تواند به عنوان یک راهبرد درمانی جدید برای سل عمل کند (35).

با این حال، تا آنجا که ما می‌دانیم، نقش عملکردی Notch4  در عفونت سل نامشخص باقی مانده‌است و هیچ ارتباط ژنتیکی بین گونه‌های Notch4  و استعداد ابتلا به سل گزارش نشده است. بنابراین، با توجه به بار سنگین بیماری سل در استان سیستان و بلوچستان، هدف از این مطالعه تعیین پلی مورفیسم های rs422951 و  rs2071277 ژن Notch4 در بیماران مبتلا به سل ریوی و افراد سالم شهر زاهدان خواهد بود. درک مکانیسم‌های بیماری‌زایی ممکن است برای پیش‌گیری و درمان فردی ارزشمند باشد. ​

(مشتمل بر مرور تحقیقات گذشته داخلی و خارجی مرتبط با موضوع با ذکر منابع و توجیه ضرورت انجام طرح) :

سل (TB) یک بیماری عفونی باستانی است که توسط مایکو باکتریوم توبرکلوزیس (MTB) ایجاد می‌شود. علی‌رغم پیشرفت قابل‌توجه در تشخیص بیماری، درمان و واکسن‌ها، بیماری و مرگ و میر ناشی از سل همچنان بالا است (1). سازمان بهداشت جهانی در سال ۲۰۱۷ حدود ۱۰ میلیون مورد جدید و ۱.۵۷ میلیون مرگ را در سراسر جهان گزارش کرده‌است (2).

براساس آخرین آمار سازمان جهانی بهداشت، بیشترین موارد سل و مرگ و میر ناشی از آن در کشورهای در حال توسعه منجمله افغانستان و پاکستان که در زمره ی ۲۲ کشور پر بیماری عفونی دنیا قرار دارند، رخ می دهد (۳). در ایران نیز استان سیستان و بلوچستان به دلیل همجواری با دو کشور افغانستان و پاکستان بیشترین میزان های بروز و شیوع بیماری سل ریوی را دارا است. بر اساس آخرین آمار منتشره از وزارت بهداشت، در سال ۱۳۹۶ در ایران در جمعیت ۸۱۰۷۰۰۰۰ نفره و در استان سیستان و بلوچستان در جمعیت ۱۱۹8۴۱۴ به ترتیب میزان بروز میل ۸۸۱۹ نفر (88/%10) و ۳6۲ نفر (21/%30) سل روی اسمیر مثبت ۴4۲۶ نفر (46/%5) و ۲۲۸ نفر(03/%19)، سل ریوی اسمیر منفی ۱۷۴۱ نفر(15/%2) و ۴۳ نفر (59/%3) و سل خارج روی ۲362 نفر (91/%2) و ۷۶ نفر (34/%6) بوده است، که بالاترین میزان بروز سل در ایران مربوط به این استان است (4). بنابراین ضرورت توجه بیشتر به این بیماری را در این استان خاطر نشان می کند. علاوه بر این، بیماری سل می‌تواند مدت زیادی بدون هیچ نشانه‌ای از عفونت در میزبان باقی بماند و تنها 10-۵% درصد از افراد آلوده مبتلا به سل فعال هستند. یک توضیح مهم برای این پدیده مربوط به تعامل بین سل و سیستم ایمنی میزبان است که در تعادل دینامیکی است (1،5).

بنابراین، اگر چه سل یک بیماری عفونی است، عوامل ژنتیکی میزبان، به ویژه آن‌هایی که در وضعیت ایمنی میزبان درگیر هستند، نقش مهمی در هتروژنیتی قابل‌توجه در استعداد ابتلا به سل دارند (6،7). علاوه بر ژن‌های جهش‌یافته نادر که باعث سندرم‌های خانوادگی می‌شوند (8)، گزارش‌شده که بسیاری از ژن‌های مربوط به سیستم ایمنی با استعداد ابتلا به سل در موارد تک گیر همراه هستند، مانند ژن آنتی‌ژن لکوسیت انسانی (‏HLA) (9)، ژن گیرنده ویتامین D (VDR) (10)، ژن گیرنده شبه تول (‏TLR) (11)، ژن اینترفرون گاما (‏IFN – γ) و ژن‌های مربوط به سایتوکاین و کموکاین. (12). علاوه بر این، مطالعه ارتباط گسترده ژنوم (‏GWAS)، براساس انواع ژن ظرفیت بالا و فناوری توالی یابی، مقیاس و دامنه کشف ژن‌های مستعد کننده را گسترش داده‌است. مطالعات مبتنی بر GWAS تعدادی از مکان‌های پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی (‏SNP) با ویژگی پایین مرتبط با خطر سل را شناسایی کرده‌اند، مانند 5q3.3 (13)، 20p13 و 14q24.3 (14). این یافته‌ها این فرض را تقویت کرده‌اند که ژنتیک میزبان در استعداد ابتلا به سل نقش دارد. با این حال، نتایج تا حدودی ناهمگن بوده و تایید مکرر آن‌ها در جمعیت‌های دیگر دشوار است. با توجه به بار بیماری سل در چین، بررسی پایه‌های ژنتیکی استعداد ابتلا به بیماری سل در جمعیت چین، براساس یک نمونه بزرگ، می‌تواند درک بهتری از اساس بیماری‌زایی استعداد ابتلا به بیماری سل فراهم کند. به طور کلی، ماکروفاژها، مایکوباکتریوم سل مهاجم را مستقیما به عنوان بخشی از دفاع اولیه سیستم ایمنی میزبان در نظر می‌گیرند و گیرنده‌های شبه تول به آزاد سازی سیتوکینها و فعال‌سازی آنزیم‌ها کمک می‌کنند. چنین فعل و انفعالات همزادان، آزادسازی سیتوکینهای پیش التهابی را تعدیل می‌کند، از جمله IL - ۱، عامل نکروز تومور آلفا (‏TNF- آلفا)‏، اینترلوکین ۱۲ (‏IL۱۲)‏و اینترلوکین ۶ (‏IL - ۶)‏و شروع پاسخ‌های ایمنی ذاتی میکند (15). علاوه بر این، این واسطه‌های التهابی، انتقال سلول‌های دندریتیک به غدد لنفاوی محلی را برای شروع ایمنی تطبیقی برای کشتن باکتری یا جلوگیری از رشد آن برای محدود کردن آن به مرحله نهفته، افزایش می‌دهند. ایمنی انطباقی براساس شناخت خاص آنتی‌ژن و تکثیر و تمایز بعدی سلول‌های T همراه با آزاد سازی سیتوکین مربوطه و ایمنی عقیم‌سازی است (15،16). تمام این رویدادها توسط شبکه سیگنال دهی سیتوکینهای چندکاربردی هماهنگ شده‌اند که در مقاومت و حساسیت میزبان هم در مدل‌های حیوانی و هم در انسان‌ها نقش میانجی ایفا می‌کنند (15،16). بنابراین، شناسایی مولکول کلیدی در مسیر سیگنال دهی میزبان به درک مکانیسم بیماری‌زایی کمک خواهد کرد و ایده‌های جدیدی برای بهبود درمان فراهم می‌کند. مسیر سیگنال دهی Notch به طور گسترده در سیگنال دهی برای تشخیص، تکثیر، تمایز و آپوپتوز سلول‌های مختلف بافت درگیر است و هم ایمنی ذاتی و هم ایمنی انطباقی را تنظیم می‌کند (17،18). علامت دهی Aberrant Notch با سرطان (19) و بیماری‌های التهابی در ارتباط است (20،21). علاوه بر این، Notch نقش مهمی در تعیین سرنوشت سلول ایفا می‌کند و در توسعه ریه و فرآیندهای بیماری‌های ریوی نقش دارد (22). انسان‌ها چهار گیرنده Notch و پنج لیگاند دارند. (17). Notch4 عضوی از خانواده گیرنده‌های Notch و یک گیرنده فراغشایی حفاظت‌شده تکاملی است. ژن Notch4 ، که بین ژن G18 در مرکز ناحیه HLA III و ژن DRA در انتهای تلومری منطقه II قرار دارد، جایگاه مهمی در HLA اشغال کرده و در پیوستگی عدم تعادل با لوکوس های خاص HLA است (23،24).

علاوه بر بیان شدن بر روی سلول‌های غددی و اپی تلیال پانکراس در ریه (25)، Notch4 عمدتا در ماکروفاژهای بالغ بیان می‌شود که باسیل را به طور مستقیم در خود فرو می‌برد و اولین دفاع از ایمنی ذاتی را آغاز می‌کند (26). مطالعه اخیر نشان داد که گیرنده Notch4  یک عامل محافظتی مهم در برابر پاسخ التهابی ایمنی ذاتی به اوزن در ریه بود. (25) علاوه بر این، مشخص شده‌است که Notch4  نقش محافظتی در واکنش التهابی به عفونت سل دارد (‏27). در کل، با توجه به حفاظت ژنتیکی Notch4  و موقعیت سلولی خاص آن و پاسخ‌های ایمنی به آن، ممکن است Notch4 نقش مهمی در بیماری‌های عفونی ریه از جمله سل ایفا کند. تعداد مطالعات در مورد انواع Notch4  و ارتباط آن‌ها با استعداد ابتلا به بیماری در حال افزایش است و شامل مطالعات در مورد سرطان کبد (28)، خود ایمنی و بیماری‌های عفونی است. (29)

1. مطالعه Zheng و همکارانش در سال 2018 با عنوان شناسایی ارتباط ژنتیکی وسیع دو مکان خطر ابتلا به سل را در چینی‌های هان منتشر کردند که ​​​​​​آن ها یک مطالعه چند مرحله‌ای در سطح ژنوم بر روی ۲۹۴۹ بیمار سل ریوی و ۵۰۹۰ کنترل سالم (‏۸۳۳ مورد و ۱۲۲۰ کنترل در سطح ژنوم) ‏از جمعیت چینی‌های هان انجام دادند. آن ها دو مکان خطر کشف کردند: 14q24.3 (rs12437118, P_combined = 1.72 × 10⁻¹¹ OR = 1.277, ESRRB) و (rs6114027, P_combined = 2.37 × 10⁻¹¹, OR = 1.339, TGM6). علاوه بر این، آن ها مشخص کردند که آلل خطر rs6114027 مربوط به کاهش رونوشت‌های TGM6 در PBMCs از بیماران سل ریوی و بیماری شدیدتر سل ریوی است. علاوه بر این، آن ها متوجه شدند که موش‌های دارای نقص tgm6 بیشتر مستعد عفونت با مایکوباکتریوم توبرکلوزیس هستند. نتایج آن ها دیدگاه‌های جدیدی را در مورد علل ژنتیکی سل ارائه می‌دهد (30). ​

۲. مطالعه Zhang و همکارانش در سال 2020  با عنوان یک جهش بد Notch4 مرتبط با استعداد ابتلا به سل در جمعیت چین، منتشر شد که در مجموع ۹۰۰ بیمار مبتلا به سل و ۱۵۳۴ فرد سالم به عنوان کنترل به ترتیب در بیمارستان غرب چین از ژانویه ۲۰۱۴ تا فوریه ۲۰۱۶ وارد مطالعه شدند، دوازده SNP انتخاب شده توسط کیت اختصاصی اسکن SNP 48-plex 2 با استفاده از طرح ژنوتیپ انجام شد. (rs2071277، rs2071285، rs206016، rs438475 ، rs2256594، rs429853، rs422951، rs415929، rs915895، rs443198، rs3830041 و rs375244). فراوانی alleles، ژنوتیپ‌ها و مدل‌های ژنتیکی متغیرها بین دو گروه مقایسه شدند، در حالی که تعاملات SNPSNP توسط نرم‌افزار کاهش بعد چند عاملی (‏MDR) تحلیل شدند. نسبت احتمال (‏OR) با فاصله اطمینان ۹۵ % (‏CI) محاسبه شد.  G allele rs2071277 از Notch4 با کاهش خطر ابتلا به سل همراه بود (‏OR 0.844; 95% CI 0.748–0.954, p = .006).G allele rs422951 از Notch4 با کاهش خطر ابتلا به سل مرتبط بود (‏OR 0.818; 95% CI 0.703–0.950, p = .008). این یافته‌ها با نتایج حاصل از مدل غالب و مدل افزایشی سازگار بودند. فراوانی آلل، ژنوتیپ و مدل ژنتیکی برای سایر SNP ها در دو گروه مشابه بود (‏همه p بزرگتر از 0.05). یک هاپلوتیپ (‏GTG) متشکل از rs2071277، rs2071285 و rs206016 با خطر سل همراه بود (p = .011). نتایج نشان داد مطالعه آن ها اولین مطالعه‌ای است که نشان می‌دهد انواع مختلف G allele از rs2071277 و rs422951 در Notch4 حساسیت به بیماری سل در یک جمعیت چینی تاثیر می‌گذارند و نشان می‌دهد که علامت دهی Notch4 در پاتوژنز بیماری سل دخالت دارد. مطالعات بیشتر با تایید کارکردی درک ما از نقش سیگنال دهی Notch4 را اصلاح کرده و راه‌های جدیدی برای مداخله درمانی فراهم می‌کند (31). ​

۳. مطالعه Zhang و همکارانش در سال 2018 با عنوان اهمیت تنوع ژنتیکی مشترک TLR2 در فنوتیپ بالینی و خطر بیماری سل در یک جمعیت غربی چین منتشر شد که در مجموع ۱۱۰۹ فرد (‏۶۳۴ بیمار مبتلا به سل و ۴۷۵ فرد سالم) با استفاده از یک کیت TM اسکن SNP 2x48-Plex SNP به صورت دلخواه برای rs3804099، rs3804100 و rs76112010 ژنوتیپ شدند. تجزیه و تحلیل آماری بین ۳ SNP منتخب و خطر و فنوتیپ سل در این مطالعه انجام شد. مقدار قابل‌توجهی از SNP در رابطه با استعداد ابتلا به عفونت سل و فنوتیپ بالینی مورد تحقیق بیشتر قرار گرفتند. ​هیچ کدام از سه جایگاه ژنتیکی (‏rs3804099، rs3804100 و rs76112010) ‏تفاوت آماری قابل توجهی را بین تمام موارد سل و افراد سالم در ژنوتیپ، فراوانی آلل ها و مدل‌های ژنتیکی نشان ندادند (‏همه p بیشتر از ۰.۰۵)‏. مقایسه آماری درمان مجدد موارد سل و کنترل سالم یا موارد اولیه نشان داد که rs3804099 به طور قابل‌توجهی با افزایش خطر ابتلا به سل در جمعیت غرب چین در ارتباط است. در مورد فراوانی ژنوتیپ‌ها، زیر گروه‌های گروه درمان مجدد سل در مقایسه با گروه کنترل سالم و درمان مجدد سل در مقایسه با گروه تحلیل اولیه سل به ترتیب p = 0.041 و p = 0.002 را نشان دادند. برای مدل مغلوب، زیر گروه درمان مجدد گروه سل در مقابل گروه کنترل سالم و درمان مجدد گروه سل در مقابل گروه سل اولیه به ترتیب p = 0.028 و P = 0.002 پس از اصلاح بونفرونی را نشان دادند. علاوه بر این، تجزیه و تحلیل ژنوتیپ‌های rs76112010 در رابطه با فنوتیپ بالینی سل فعال با استفاده از مدل غالب نشان داد که به شدت با پارامترهای خونی مختلف ارتباط دارد (اریتروسیت P = 0.043، هموگلوبین P = 0.047، هماتوکریت P = 0.027). نتایج نشان داد مطالعه آن ها، جوامع قابل‌توجهی از rs3804099 را با حساسیت به سل در تحلیل زیر گروه درمان مجدد سل نشان داد. مطالعه آن ها پیشنهاد کرد که تنوع ژنتیکی مشترک TLR2 ممکن است بر توسعه سل و فنوتیپ بیماری در جمعیت غربی چین تاثیر بگذارد(32). ​

۴. مطالعهVerhein در سال 2015 با عنوان نقش‌های بدیع برای Notch3 و Notch4 دریافت کنندگان در بیان ژن و حساسیت به التهاب ریه در موش‌ها منتشر شد که ​​​​​​​​موش‌های نوع وحشی (‏WT)، Notch3 (‏Notch3-/-)‏، و Notch4  (‏Notch4 -/-) ‏موش‌های ضربه فنی شده در معرض ازن (‏۰.۳ ppm) یا هوای فیلتر شده به مدت ۶ – 72 ساعت قرار گرفتند. ​​​​​​​​​اوزن نسبت به کنترل‌های در معرض هوا، پروتئین مایع شستشوی برونکوآلوئولار (‏BALF)، شاخص نفوذپذیری ریه را در تمام ژنوتیپ‌ها افزایش داد، اما غلظت‌های بیشتری در Notch4-/- در مقایسه با موش‌های WT و Notch3-/- یافت شد. میانگین بیشتر تعداد نوتروفیلهای BALF در موش‌های Notch3-/- و Notch4-/- در مقایسه با موش‌های WT بعد از قرار گرفتن در معرض ازن یافت شد. بیان Tnf کل ریه به طور قابل‌توجهی بعد از ازن در موش‌های ناتیچ ۳ و Notch4-/-  افزایش یافت، و به طور قابل‌توجهی در موش‌های Notch3-/- در مقایسه با موش‌های WT بیشتر بود. تحلیل‌های آماری از ترانسکریپتوم، شبکه‌های ژنی که به طور متفاوت بین WT و موش‌های ضربه فنی شده و بعد از ازن بیان شده‌بودند را شناسایی کرد، و شامل Trim30، عضو مسیر التهابی، و Traf6، یک عضو علامت دهی التهابی بود. ​نتایج نشان داد این یافته های جدید مطابق با Notch3 و Notch4 به عنوان ژن های مستعد آسیب ریه ناشی اوزن هستند و نشان می دهد که گیرنده های شکاف از ایمنی ذاتی محافظت می کنند (33).

5. مطالعه Wu و همکاران در سال 2005 با عنوان تعیین مولکولی انتقال Notch4 در سلول‌های عروقی منتشر شد که آن ها بررسی کردند که چگونه بیان NOTCH4 در سلول‌های اندوتلیال انسان و در موش‌های تراژنی تنظیم می‌شود. پیشبرنده NOTCH4 و بخش &۵& NOTCH4 در یک الگوی تغییر هیستونی خاص سلول اندوتلیال مونتاژ شدند. تجزیه و تحلیل رونوشت‌های اولیه NOTCH4 در سلول‌های اندوتلیال ورید بندناف انسان توسط RNA فلورسنس در هیبریداسیون در محل آشکار کرد که ۳۶ % از سلول‌ها یک یا هر دو آلل NOTCH4 را رونویسی کردند. پیشبرنده NOTCH4 برای انتقال نسخه‌برداری ویژه سلول‌های اندوتلیال در سنجش ترانسفکشن کافی بود، اما برای بیان در عروق جنین‌های ترانسفکت شده موش، اینترون ۱ یا توالی‌های بالادست مورد نیاز بود. مجموعه پروتئین فعال‌کننده ویژه نوع سلولی ۱ (‏AP-1)‏، کروماتین NOTCH4 را اشغال کرده و رونویسی ویژه سلول اندوتلیال را سبب شدند. عوامل رگ زایی عروقی، AP-1 را فعال کرده و ژن NOTCH4 اندوژن را در سلول‌های HeLa از حالت سرکوب‌شده تا حالت فعال رونویسی، مجددا برنامه‌ریزی کردند. این نتایج یک مسیر AP-1- Notch4 را نشان می‌دهد، که ما پیشنهاد می‌کنیم برای انتقال سیگنال‌های آنژیوژنیک بسیار مهم است و براساس انتقال سیگنال اشتباه در سرطان تنظیم می‌شود (34).

6. مطالعه Zheng و همکاران در سال 2018 با عنوان Notch4 به طور منفی واکنش التهابی به مایکو باکتریوم سل عفونی را با استفاده از روش فعال کردن TAK1 تنظیم میکند، منتشر شد. در این مطالعه، دریافتند که موشهای دارای کمبود Notch4 در برابر عفونت سل مقاومتر هستند، با یک باکتری بسیار کمتر و تغییرات پاتولوژیک کمتری در ریهها وجود دارد. NOTCH4 تولید سیتوکینهای پیش التهابی توسط تعامل با TAK1 و مهار فعال‌سازی آن را مهار کرد. علاوه بر این، آن ها متوجه شدند که دامنه داخل سلولی کوچک ۴ از توزیع خودکار TRAF6 جلوگیری کرده و توزیع غیر معمول TRAF6 را سرکوب می‌کند. این نتایج نشان می‌دهد که NOTCH4 تنظیم‌کننده منفی واکنش التهابی ناشی از سل است و درمان با مهار کننده Notch می‌تواند به عنوان یک راهبرد درمانی جدید برای سل عمل کند (35).

با این حال، تا آنجا که ما می‌دانیم، نقش عملکردی Notch4  در عفونت سل نامشخص باقی مانده‌است و هیچ ارتباط ژنتیکی بین گونه‌های Notch4  و استعداد ابتلا به سل گزارش نشده است. بنابراین، با توجه به بار سنگین بیماری سل در استان سیستان و بلوچستان، هدف از این مطالعه تعیین پلی مورفیسم های rs422951 و  rs2071277 ژن Notch4 در بیماران مبتلا به سل ریوی و افراد سالم شهر زاهدان خواهد بود. درک مکانیسم‌های بیماری‌زایی ممکن است برای پیش‌گیری و درمان فردی ارزشمند باشد. ​

توزیع فراوانی ژنوتیپ rs422951  ژن Notch4 در بیماران مبتلا به سل ریوی و گروه شاهد متفاوت است.

مقایسه پلی مورفیسم های rs422951 و ژن Notch4 در بیماران مبتلا به سل ریوی و افراد سالم

1_مقایسه فراوانی ژنوتیپ rs422951 ژن NOTCH4 در افراد مبتلا به سل ریوی و افراد سالم

وزارت بهداشت درمان و آموزش پزشکی- دانشگاهها و موسسات آموزشی – مراکز درمانی دولتی و خصوصی

سل: سل (TB) یک بیماری عفونی است که توسط مایکو باکتریوم توبرکلوزیس (MTB) ایجاد می‌شود. (1).

سل ریوی: مایکو باکتریوم توبرکلوزیس در ریه مستقر شده و باعث آلودگی آن شده است.

:Notch4 عضوی از خانواده گیرنده‌های Notch و یک گیرنده فراغشایی حفاظت‌شده تکاملی است. ژن Notch4 ، که بین ژن G18 در مرکز ناحیه HLA III و ژن DRA در انتهای تلومری منطقه II قرار دارد، جایگاه مهمی در HLA اشغال کرده و در پیوستگی عدم تعادل با لوکوس های خاص HLA است (23،24).

مورد_شاهدی

معیارهای ورود به مطالعه بیماران بالغ (بالای 18 سال) مبتلا به سل ریوی بستری شده در بیمارستان بوعلی زاهدان خواهد بود و سایر معیارهای ورود شامل عدم وجود هر گونه عفونت سیستمیک یا موضعی (با یا بدون درگیری ریوی)، عدم وجود هر گونه بیماری غیر عفونی سیستمیک حاد یا مزمن (با یا بدون درگیری ریوی) و عدم وجود هر گونه نئوپلاسم تشخیص داده شده (با یا بدون درگیری ریوی)، عدم وجود بیماریهای کبدی و کلیوی. 

معیار ورود در گروه شاهد نیز سن بالای 18 سال و عدم وجود هر گونه عفونت سیستمیک یا موضعی (با یا بدون درگیری ریوی)، عدم وجود هر گونه بیماری غیر عفونی سیستمیک حاد یا مزمن (با یا بدون درگیری ریوی) و عدم وجود هر گونه نئوپلاسم تشخیص داده شده (با یا بدون درگیری ریوی) خواهد بود. عدم وجود بیماریهای کبدی و کلیوی.

حجم نمونه حداقل 150 نفر شامل کلیه بیماران مسلول ریوی تشخیص داده شده تحت درمان یا درمان شده شهرستان زاهدان در سال 1399 می باشد.به همین تعداد نیز از افراد سالم جامعه که به بیماری سل مبتلا نشده اند و سابقه هیچ گونه بیماری سیستمیک ندارند انتخاب میشوند.

نمونه گیری به صورت آسان و در دسترس می باشد.

مشاهده و بررسی های ازمایشگاهی

این مطالعه بر روی بیماران مبتلا به سل ریوی که بر اساس علائم بالینی رادیولوژیک و کشت توسط متخصص عفونی تشخیص سل ریوی در آنها مسجل شده است انجام خواهد شد.و در گروه بیماران سل ریوی در ابتدا از کلیه بیماران مشکوک به سل ریوی (دارای علایم: سرفه همراه با خلط و کاهش وزن، هموپتزی، درد قفسه سینه، بی اشتهایی، خستگی و تعریق شبانه) اسمیر مستقیم خلط و کشت باسیل مایکوباکتریوم توبرکلوزیس (به عنوان روش استاندارد تشخیصی) انجام خواهد شد و با توجه به زمان بر بودن آماده شدن نتایج کشت، در بیمارانی که حداقل دو نمونه اسمیر خلط مثبت داشته باشند نمونه گیری خون انجام شده و بررسی پلی مورفیسم تنها در بیمارانی انجام خواهد شد که کشت مثبت هم داشته باشند. ( با توجه به شیوع بیماری کرونا و عدم بستری بیماران مبتلا به سل در حال حاضر از نمونه های خونی که قبلا از بیماران گرفته شده آزنایش انجام حواهد شد).  گروه شاهد همراهان افراد مراجعه کننده غیر مبتلا به سل که از نظر معاینات پزشکی نرمال باشند خواهد بود و دو گروه از نظر جنس همسان سازی خواهند شد.( لازم به ذکر است که این نمونه ها از قبل گرفته شده و موجود می باشد). DNA توسط روش Salting out استخراج خواهد شد. DNA استخراج شده با استفاده از پرایمرهای اختصاصی و روش PCR تکثیر خواهد شد سپس محصول واکنش با آنزیمهای محدودالاثر برش داده خواهد شد. محصول واکنش در ژل آگاروز 2 درصد با اتیدیوم بروماید رنگ امیزی گردیده بارگذاری خواهد شد و آلل و  ژنوتیپ در دو گروه مشخص خواهد شد.

اطلاعات توسط نرم افزار آماری SPSS تجزیه و تحلیل آزمون Fisher's exact و برای مقایسه پارامترهای دموگرافیک کیفی مثل جنس در دو گروه نیز از آزمون Fisher's exact و برای مقایسه پارامترهای دموگرافیک کمی مثل سن در دو گروه از آزمون t-test استفاده خواهد شد. برای مقایسه آلل و ژنوتیپ در دو گروه از خواهد شد و p کمتر از 05/0 بعنوان سطح معنی داری در نظر گرفته خواهد شد. همچنین Odds Ratio با محدوده اطمینان 95 درصد (CI 95%) نیز برای افراد دارای اختلال ژنی برای ابتلا به سل ریوی محاسبه خواهد شد.

کدهای 1، 2، 3، 8، 10، 11، 13، 15، 18، 25، 28، مصوب کمیته کشوری اخلاق در پژوهش های علوم پزشکی که در دفترچه راهنمای عمومی اخلاق در پژوهش‌های دارای آزمودنی انسانی در جمهوری اسلامی ایران، دربردارنده‌ی اصول و مقررات اخلاقی‎ مطرح  و در سال 1392 در 31 بند تصویب شده است و کدهای 1و2وو5و7و8و9و10و11و12 از راهنمای اخلاقی پژوهشهای ژنتیک پزشکی و همچنین کدهای 1، 2، 3، 4، 7 مربوط به دفترچه راهنمای اخلاقی پژوهش بر روی عضو و بافت انسانی در جمهوری اسلامی ایران و از قسمت راهنمای عمومی در این طرح رعایت می شود. تمامی بیماران تحت مطالعه آگاهانه و برای مقاصد علمی  اقدام به دادن نمونه خواهند کرد. شرکت در این طرح هیچ گونه هزینه ای برای بیماران ندارد و نام و مشخصات بیماران گزارش نخواهد شد.

محدودیت اجرایی که برای طرح حاضر قابل پیش‌بینی است، عدم همکاری بیماران می‌باشد که در صورت بروز این مسئله فرد دیگری با خصوصیات مشابه جایگزین خواهد شد

پلی مورفیسم، ژنNotch4 ، سل ریوی

Floyd, K., Glaziou, P., Zumla, A., Raviglione, M., 2018. The global tuberculosis epidemic and progress in care, prevention, and research: an overview in year 3 of the end TB era. Lancet Respir. Med. 6, 299–314.

Geneva, 2018. Global tuberculosis report 2018. World Health Organanization. http:// www.who.int/tb/publications_report/en.

2019) WHOfnTaAhweinffeihJ.

Maher D. Raviglione M. Global Epidemiology of Tuberculosis. Clinics in Chest Medicine. 2005;26(2):167-82.

Cantini, F., Nannini, C., Niccoli, L., Iannone, F., Delogu, G., Garlaschi, G., Sanduzzi, A., Matucci, A., Prignano, F., Conversano, M., Goletti, D., 2015. Guidance for the management of patients with latent tuberculosis infection requiring biologic therapy in rheumatology and dermatology clinical practice. Autoimmun. Rev. 14, 503–509.

Abel, L., Fellay, J., Haas, D.W., Schurr, E., Srikrishna, G., Urbanowski, M., Chaturvedi, N., Srinivasan, S., Johnson, D.H., Bishai, W.R., 2018. Genetics of human susceptibility to active and latent tuberculosis: present knowledge and future perspectives. Lancet Infect. Dis. 18, e64–e75.

Kondratieva, T., Azhikina, T., Nikonenko, B., Kaprelyants, A., Apt, A., 2014. Latent tuberculosis infection: what we know about its genetic control? Tuberculosis (Edinb) 94, 462–468.

Picard, C., Fieschi, C., Altare, F., Al-Jumaah, S., Al-Hajjar, S., Feinberg, J., Dupuis, S., Soudais, C., Al-Mohsen, I.Z., Genin, E., Lammas, D., Kumararatne, D.S., Leclerc, T., Rafii, A., Frayha, H., Murugasu, B., Wah, L.B., Sinniah, R., Loubser, M., Okamoto, E., Al-Ghonaium, A., Tufenkeji, H., Abel, L., Casanova, J.L., 2002. Inherited interleukin12 deficiency: IL12B genotype and clinical phenotype of 13 patients from six kindreds. Am. J. Hum. Genet. 70, 336–348.

Tong, X., Chen, L., Liu, S., Yan, Z., Peng, S., Zhang, Y., Fan, H., 2015. Polymorphisms in HLA-DRB1 gene and the risk of tuberculosis: a meta-analysis of 31 studies. Lung 193, 309–318.

Lee, Y.H., Song, G.G., 2015. Vitamin D receptor gene FokI, TaqI, BsmI, and ApaI polymorphisms and susceptibility to pulmonary tuberculosis: a meta-analysis. Genetics and molecular research : GMR 14, 9118–9129.

Zhang, J., Zhao, Z., Zhong, H., Wu, L., Zhou, W., Peng, W., Hu, X., Song, J., Liu, T., Wu, Q., Bai, H., Zhou, Y., Chen, X., Chen, J., Lu, X., Ying, B., 2018. Importance of common TLR2 genetic variants on clinical phenotypes and risk in tuberculosis disease in a Western Chinese population. Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases 60, 173–180.

Shamsi, M., Zolfaghari, M.R., Farnia, P., 2016. Association of IFN-gamma and P2X7 receptor gene polymorphisms in susceptibility to tuberculosis among Iranian patients. Acta Microbiol. Immunol. Hung. 63, 93–101.

Sobota, R.S., Stein, C.M., Kodaman, N., Scheinfeldt, L.B., Maro, I., Wieland-Alter, W., Igo Jr., R.P., Magohe, A., Malone, L.L., Chervenak, K., Hall, N.B., Modongo, C., Zetola, N., Matee, M., Joloba, M., Froment, A., Nyambo, T.B., Moore, J.H., Scott, W.K., Lahey, T., Boom, W.H., von Reyn, C.F., Tishkoff, S.A., Sirugo, G., Williams, S.M., 2016. A locus at 5q33.3 confers resistance to tuberculosis in highly susceptible individuals. Am. J. Hum. Genet. 98, 514–524.

Zheng, R., Li, Z., He, F., Liu, H., Chen, J., Chen, J., Xie, X., Zhou, J., Chen, H., Wu, X., Wu, J., Chen, B., Liu, Y., Cui, H., Fan, L., Sha, W., Liu, Y., Wang, J., Huang, X., Zhang, L., Xu, F., Wang, J., Feng, Y., Qin, L., Yang, H., Liu, Z., Cui, Z., Liu, F., Chen, X., Gao, S., Sun, S., Shi, Y., Ge, B., 2018a. Genome-wide association study identifies two risk loci for tuberculosis in Han Chinese. Nat. Commun. 9, 4072.

Etna, M.P., Giacomini, E., Severa, M., Coccia, E.M., 2014. Pro- and anti-inflammatory cytokines in tuberculosis: a two-edged sword in TB pathogenesis. Semin. Immunol. 26, 543–551.

Dorhoi, A., Kaufmann, S.H., 2016. Pathology and immune reactivity: understanding multidimensionality in pulmonary tuberculosis. Semin. Immunopathol. 38, 153–166.

Miele, L., 2006. Notch signaling. Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research 12, 1074–1079.

Radtke, F., MacDonald, H.R., Tacchini-Cottier, F., 2013. Regulation of innate and adaptive immunity by notch. Nat. Rev. Immunol. 13, 427–437.

Takebe, N., Nguyen, D., Yang, S.X., 2014. Targeting notch signaling pathway in cancer: clinical development advances and challenges. Pharmacol. Ther. 141, 140–149.

Agrawal, V., Jaiswal, M.K., Pamarthy, S., Katara, G.K., Kulshrestha, A., Gilman-Sachs, A., Hirsch, E., Beaman, K.D., 2016. Role of notch signaling during lipopolysaccharideinduced preterm labor. J. Leukoc. Biol. 100, 261–274.

Jaiswal, M.K., Agrawal, V., Pamarthy, S., Katara, G.K., Kulshrestha, A., Gilman-Sachs, A., Beaman, K.D., Hirsch, E., 2015. Notch Signaling in inflammation-induced preterm labor. Sci. Rep. 5, 15221.

Hussain, M., Xu, C., Ahmad, M., Yang, Y., Lu, M., Wu, X., Tang, L., Wu, X., 2017. Notch Signaling: linking embryonic lung development and asthmatic airway Remodeling. Mol. Pharmacol. 92, 676–693.

Auffray, C., Gayon, R., Benraiss, A., Martin, N., Laurendeau, I., Garaud, J., Lucas, B., Boitard, C., Krief, P., 2006. An 8-bp deletion in mNOTCH4 intron 10 leads to its retention in mRNA and to synthesis of a truncated protein. Exp. Cell Res. 312, 233–244.

Sinkus, M.L., Adams, C.E., Logel, J., Freedman, R., Leonard, S., 2013. Expression of immune genes on chromosome 6p21.3-22.1 in schizophrenia. Brain Behav. Immun. 32, 51–62.

Verhein, K.C., McCaw, Z., Gladwell, W., Trivedi, S., Bushel, P.R., Kleeberger, S.R., 2015. Novel roles for Notch3 and Notch4 receptors in gene expression and susceptibility to ozone-induced lung inflammation in mice. Environ. Health Perspect. 123, 799–805.

Ehebauer, M., Hayward, P., Arias, A.M., 2006. Notch, a universal arbiter of cell fate decisions. Science (New York, N.Y.). 314. pp. 1414–1415.

Zheng, R., Liu, H., Zhou, Y., Yan, D., Chen, J., Ma, D., Feng, Y., Qin, L., Liu, F., Huang, X., Wang, J., Ge, B., 2018b. Notch4 negatively regulates the inflammatory response to mycobacterium tuberculosis infection by inhibiting TAK1 activation. J. Infect. Dis. 218, 312–323. J

Yu, T., Han, C., Zhu, G., Liao, X., Qin, W., Yang, C., Liu, Z., Su, H., Liu, X., Yu, L., Liu, Z., Lu, S., Chen, Z., Liang, Y., Huang, J., Qin, X., Gui, Y., Li, J., Peng, T., 2017. Prognostic value of notch receptors in postsurgical patients with hepatitis B virus-related hepatocellular carcinoma. Cancer medicine 6, 1587–1600.

Huang, J., Yoshimura, S., Isobe, N., Matsushita, T., Yonekawa, T., Sato, S., Yamasaki, R., Kira, J., 2013. A NOTCH4 missense mutation confers resistance to multiple sclerosis in Japanese. Multiple sclerosis (Houndmills, Basingstoke, England) 19, 1696–1703.

Zheng R, Li Z, He F, et al. Genome-wide association study identifies two risk loci for tuberculosis in Han Chinese. Nat Commun. 2018;9(1):4072. Published 2018 Oct 4. doi:10.1038/s41467-018-06539-w

Zhang J, Jiao L, Bai H, et al. A Notch4 missense mutation is associated with susceptibility to tuberculosis in Chinese population. Infect Genet Evol. 2020;78:104145. doi:10.1016/j.meegid.2019.104145

Zhang J, Zhao Z, Zhong H, et al. Importance of common TLR2 genetic variants on clinical phenotypes and risk in tuberculosis disease in a Western Chinese population. Infect Genet Evol. 2018;60:173-180. doi:10.1016/j.meegid.2018.02.031

Verhein KC, McCaw Z, Gladwell W, Trivedi S, Bushel PR, Kleeberger SR. Novel Roles for Notch3 and Notch4 Receptors in Gene Expression and Susceptibility to Ozone-Induced Lung Inflammation in Mice. Environ Health Perspect. 2015;123(8):799-805. doi:10.1289/ehp.1408852

Wu J, Iwata F, Grass JA, et al. Molecular determinants of NOTCH4 transcription in vascular endothelium. Mol Cell Biol. 2005;25(4):1458-1474. doi:10.1128/MCB.25.4.1458-1474.2005​

Zheng R, Liu H, Zhou Y, et al. Notch4 Negatively Regulates the Inflammatory Response to Mycobacterium tuberculosis Infection by Inhibiting TAK1 Activation. J Infect Dis. 2018;218(2):312-323. doi:10.1093/infdis/jix636

بررسی پلی مورفیسم های rs422951 و rs2071277 ژن Notch4 در بیماران مبتلا به سل ریوی و افراد سالم شهر زاهدان

نمونه گیری وتخلیص DNA  از خون تام و انجام PCR

این تحقیق اگر چه فایده فوری نخواهد داشت اما بعلت بررسی استعداد ابتلا به بیماری سل ریوی برای سایر افراد جامعه مفید خواهد بود.

در این طرح بغیر از خونگیری که توسط پرسنل مجرب صورت میگیرد،نمونه ای از بیمار گرفته نمیشود.تنها عارضه جانبی ممکن در زمان خونگیری خواهد بود که با توجه به خبره بودن پرسنل،بعید بنظر میرسد.

جبران عوارض احتمالی بر عهده پژوهشگران خواهد بود.

کلیه هزینه های تشخیصی به عهده مجریان طرح خواهد بود و بیمار هزینه ای را پرداخت نخواهد کرد.

در این قسمت باید شرح داده شود که در صورت عدم پذیرش روش انتخابی پژوهشگر، بیمار از چه روشهای درمانی یا تشخیصی دیگرتوسط پژوهشگر می تواند استفاده نماید

نتایج آزمایشها و روشهای به کار رفته به اطلاع بیمار خواهد رسید و این نتایج بصورت کاملاً محرمانه و صرفاً جهت مقاصد پژوهش به کار خواهد رفت و هویت بیماری وی در چارچوب قانون و جامعه و خانواده محرمانه خواهد ماند

دکتر محسن طاهری

زاهدان- پردیس دانشگاه علوم پزشکی- دانشکده پزشکی- گروه ژنتیک

تلفن: 09151431350

شرکت من در مطالعه کاملاً اختیاری است و آزاد خواهم بود که از شرکت در مطالعه امتناع نموده یا هر زمان  که مایل بودم بدون آنکه تغییری در نحوه رفتار پزشک درمانگر یا نحوه درمان و مراقبت از بیماری اینجانب ایجاد شود از پژوهش مذکور خارج شوم.

با توجه به اطلاعات موجود در این فرم و توضیحات حضوری مجری یا همکاران طرح موافقت خود را با شرکت در این مطالعه اعلان می نمایم. یک نسخه از این فرم به من داده شده و فرصت خواندن آن را داشته ام.

فرم اطلاعاتی پایان نامه: بررسی پلی مورفیسم های rs422951و  ژن Notch4 در بیماران مبتلا به سل ریوی و افراد سالم شهر زاهدان

فرم شماره:

سن(سال):

جنس(مرد/زن):

پلی مورفیسم rs422951 ژن NOTCH4 (CC، CG، GG):

بیماری سل (وجود دارد/ ندارد)