بررسی ارتباط واریانت rs895819 ژن MicroRNA-27a در بیماران مبتلا به سل ریوی در مقایسه با افراد سالم در جمعیتی از شهر زاهدان در سال 1402: یک مطالعه مورد- شاهدی

Association effect of variant rs895819 of MicroRNA-27a gene in patients with Risk of pulmonary tuberculosis compared to healthy humans in a population of Zahedan city in 1402: A Case-Control Study.


چاپ صفحه
پژوهان
صفحه نخست سامانه
مجری و همکاران
مجری و همکاران
اطلاعات تفضیلی
اطلاعات تفضیلی
دانلود
دانلود
علوم پزشکی زاهدان
علوم پزشکی زاهدان

مجریان: مهدی مجیدپور

کلمات کلیدی: MicroRNA-27a, pulmonary tuberculosis

اطلاعات کلی طرح
hide/show

کد طرح 11189
عنوان فارسی طرح بررسی ارتباط واریانت rs895819 ژن MicroRNA-27a در بیماران مبتلا به سل ریوی در مقایسه با افراد سالم در جمعیتی از شهر زاهدان در سال 1402: یک مطالعه مورد- شاهدی
عنوان لاتین طرح Association effect of variant rs895819 of MicroRNA-27a gene in patients with Risk of pulmonary tuberculosis compared to healthy humans in a population of Zahedan city in 1402: A Case-Control Study.
نوع طرح بنیادی-کاربردی
محل اجرای طرح مدیریت توسعه فناوری سلامت
رسته مطالعاتی مطالعه مورد/شاهد(Case/control)(مطالعه کمی)
دانشکده/مرکز دانشکده پزشکی زاهدان
زمان اجرا -روز 360

اطلاعات مجری و همکاران
hide/show

نام و نام‌خانوادگی سمت در طرح نوع همکاری درجه‌تحصیلی پست الکترونیک
مهدی مجیدپورمجریتدوین طرحکارشناسی ارشدMahdimjidpour@gmail.com
حسین شهریاریهمکاربررسی آزمایشگاهی نمونه هادکترای تخصصی hosseinshahriari1971@gmail.com
ابراهیم علیجانیهمکارمشاور تخصصیدکترای تخصصی ebrahimalijani@yahoo.com
شهریار نیکوئیهمکارجمع آوری نمونه هاپزشکی عمومی shahriyarnikoie@gmail.com
محبوبه ثابتی اکبرآبادهمکارانجام PCRدکترای تخصصی mahboobesabeti1379@gmail.com
سپهر قاسمیهمکارانجام PCRکارشناسیsepehrghasemii@yahoo.com

اطلاعات تفضیلی
hide/show

عنوان متن
خلاصه طرح به فارسی

ما در این طرح با کد ثبتی 11189 به بررسی ارتباط واریانت rs895819 ژن MicroRNA-27a در بیماران مبتلا به سل ریوی در مقایسه با افراد سالم در جمعیتی از شهر زاهدان در سال 1402: یک مطالعه مورد- شاهدی و تجزیه و تحلیل In Silico. می پردازیم. در این طرح بعد از کسب مجوز اخلاقی از کمیته اخلاق دانشگاه علوم پزشکی زاهدان و دریافت رضایت نامه از بیماران وگروه کنترل، از کلیه افرادی که در مطالعه ما وارد شده اند به میزان تعیین شده در پروپوزال به جهت استخراج DNA، خون گیری می شود و DNA افراد به روش salting out استخراج شده و سپس با استفاده از پرایمرهای اختصاصی طراحی شده به کمک روش PCR ناحیه پلی مورفیک مد نظر تکثیر می گردد. در مرحله بعد با روش ژل الکتروفورز، محصول، روی ژل آگارز 2 درصد لود و تفکیک صورت می گیرد. در انتها به کمک دستگاه ژل داک خوانش می گردد. دیتای حاصله در نرم افزار SPSS V27 وارد و آنالیز می شود.

خلاصه طرح به لاتین

In this project with registration code 11189, we investigated the association of rs895819 variant of MicroRNA-27a gene in patients with pulmonary tuberculosis compared to healthy people in a population of Zahedan city in 1402: a case-control study and in silico analysis. we pay In this plan, after obtaining ethical permission from the Ethics Committee of Zahedan University of Medical Sciences and receiving consent from the patients and the control group, blood will be taken from all the people included in our study in the amount determined in the proposal for DNA extraction. The DNA of individuals is extracted by salting out method and then amplified using specific designed primers with the help of PCR method of the desired polymorphic region. In the next step, the product is loaded and separated on a 2% agarose gel by gel electrophoresis. At the end, it is read with the help of gel doc device. The resulting data is entered and analyzed in SPSS V27 software.

بيان مسئله تحقيق/اهمیت پژوهش

سل یک بیماری عفونیست که به وسیله mycobacterium tuberculosis (MTB ) ایجاد می­شود. این بیماری یکی از شایع ترین عفونت های انسانی و یک چالش بزرگ سلامت جوامع انسانیست که نشانه های کمی برای کاهش از آن دیده می­شود(1). این باکتری با آلوده کردن بیش از یک سوم جمعیت جهان و حدود 10 میلیون ابتلا و 1.4 مرگ ومیر در سال 2019 به عنوان یک مشکل جهانی شناخته می­شود.(2)

این بیماری معمولا ریه ها را درگیر می­کند(3) اما میتواند موجب آلودگی سایر ارگانهای بدن شامل گره های لنفی، پرده های مننژ استخوان و.... نیز بشود(4). در حال حاضر نزدیک 25 درصد بیماران سراسر جهان مبتلا به سل نهفته هستند، اگرچه بیماران دارای سل نهفته هیچ علامت بالینی ندارند اما 5-10 درصد آنان ممکن است  به سل فعال مبتلا و تبدیل به منبع جدید عفونت بشوند.(3)

علائم بیماری بسته به ارگان درگیر و شدت بیماری می­تواند متفاوت باشد. پس از ورود باسیل سل به ریه در نوع درگیری ریوی 3 حالت مورد انتظار است، پاکسازی باکتری از بدن، ابتلا بدون علائم یا بیماری نهفته و سل فعال. در نوع فعال سل ریوی علائم بالینی از جمله سرفه، تب، از دست دادن وزن و عرق شبانه مشهود هستند.(5)

این بیماری علی رغم گستردگی و سرایت بالا قابل پیشگیری و البته درمان است. البته در برخی موارد باکتری نسبت به دارو های خط اول درمان شامل ایزونیازید و ریفامپین مقاوم بوده و به همین دلیل از دارو های خط دوم شامل آمیکاسین، کاپرومایسینو فلور و کوئینولوز  استفاده می­شود، همچنین برخی سویه ها دارای مقاومت دارویی گسترده بوده درمانشان سخت تر از موارد دیگر می­باشد همچنین درمان های دیگری با شیوه های جدید انتقال دارو نیز مورد بررسی هستند(6).

بیماری های عفونی موجودیت های چند عاملی هستند که علاوه بر پاتوژن عوامل ژنتیکی و غیر ژنتیکی هم در آنها نقش دارد. در مورد عوامل ژنتیکی مثال های واضحی از جمله عفونت ناشی از مالاریا در افراد مبتلا به هموگلوبینوپاتی(هتروژن) و افراد سالم است که پاتوژن توانایی ایجاد بیماری مؤثر در افراد مبتلا به هموگلوبینوپاتی(هتروژن) را ندارد.(7) از جمله عوامل ژتیکی مؤثر در ابتلا یا پیشگیری از عفونت miRNA ها هستند. miRNA ها میتوانند در دفاع بدن علیه ویروس ها، قارچ ها و باکتری ها نقش داشته باشند. از جمله این موارد میتوان به نقش این RNA ها دراتوفاژی، آپوپتوزیس، التهاب و... اشاره کرد.

تحقیقات انجام شده درباره عوامل ژنتیکی مؤثر دربیماری سل نشان داده است که ژن آنتی­ژن های گلبول های سفید(HLA ) به مانند ژن های غیر آنتی ژنی از جمله SCLC11A1 ، VDR ، ASAP1 ، ژن های کد کننده سایتو کاین ها و ژن های کد کننده شناساگرهای الگو نقش قابل توجهی در تعیین حساسیت میزبان  نسبت به عفونت با باسیل مایکوباکتریوم توبرکلوزیس دارند(8).

 

MiRNAها، RNAهای غیر کدکننده کوچکی با طول حدود 22 نوکلئوتید هستند که در تنظیم فعالیت های سلولی و غالبا در تنظیم بیان ژن پس از رونویسی نقش دارند. در چندین بیماری انسانی الگو تغییر یافته بیان miRNAها تشخیص داده شده است(3). مایکو باکتریوم توبرکلوزیس با دستکاری miRNA ها به عنوان تنظیم کننده های سلولی شرایط ر برای بقای خود فراهم می­کند.(2) در سلول های (موش و ماکروفاژ) آلوده به سل فعال نیز بیان افزایش یافته miRNA27 قابل مشاهده می­باشد. هدف miRNA27 جایگاهER ناقل کلسیم( CACNA2D3 ) می­باشد. هدف قرار دادن این ناقل منجر به کاهش سیگنالینگ یون کلسیم شده و در نتیجه آن شکل گیری اتوفاگوزوم مهار و بقای درون سلولی باسیل مایکوباکتریوم توبرکلوزیس افزایش میابد. موش های فاقد miRNA27 که با آنتاگومیر miRNA27 درمان شده اند مقاومت بیشتری نسبت به عفونت با مایکوباکتریوم توبرکلوزیس نشان می­ دهند.(9)

MiRNA27a دو پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی مهم دارد، rs895819 و rs11671784 ، که علی­رغم وجود جهش های نزدیک به هم در نتیجه تقریبا متضاد یکدیگر عمل می­کنند. پلی مورفیسم rs895819 در جایگاه 40 نسبت نوکلئوتید آغازین اتفاق افتاده و موجب افزایش تولید miRNA27a بالغ شده و بیان اهداف خود را کاهش می­دهد. این امر موجب تغییر(افزایش) استعداد افراد در ابتلا به چند سرطان از جمله سرطان پستان، سرطان معده و... خواهد شد(10). با توجه به تاثیر این پلی مورفیسم در افزایش تولید miRNA27a بالغ و اثر این miRNA در مهار فعالیت انتقال دهنده کلسیم و اختلال در سیگنالینگ به وسیله کلسیم و مهار اتوفاژی، این پلی مورفیسم افراد را مستعد ابتلا به سل ریوی فعال می­کند.

SNP، معمول‌ترین نوع گوناگونی ژنتیکی بین انسان‌هاست. این پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی ممکن است در دنباله ی کدشونده در ژن‌ها و یا مناطق غیر کدکننده در ژن‌ها اتفاق بیفتند. rs895819در ژن MicroRNA-27a قراردارد و یک   Non Coding Transcript Variantاست. SNP هایی که در نواحی کدکننده پروتئین نیستند ممکن است بر اسپلایسینگ ژنی[1]، اتصال فاکتور رونویسی[2]، تخریب RNA پیام رسان یا توالی RNA غیرکدکننده تأثیر بگذارند.  فراوانی آللی جزئی (Minor Allele Frequency) یا MAF به فرکانس آلل پایین‌تر اشاره دارد (نسبت دومین آلل رایج از بین دو آلل در یک مکان ژنتیکی و در یک جمعیت) و می‌تواند بر اساس جمعیت متفاوت باشد.MAF این SNP بر اساس پروژه 1000Genomes برابر است با C=0.3638 (1822/5008, 1000G). جایگاه SNPانتخاب شده دارای MAF بالاتر از 0.05 (5%) بوده یعنی خاصیت پلی مورفیسم دارد و نیز دارای اهمیت بالینی می­باشد یعنی با ریسک خیلی از بیماری­ها در ارتباط بوده است.

با توجه به شیوع نسبتاً بالای بیماری سل­، بر آن شدیم تا میزان شیوع پلی­مورفیسم­ تک نوکلئوتیدی احتمالی rs895819 را در ژن MicroRNA-27a در جمعیتی از افراد سالم و بیماران مراجعه کننده به بیمارستان­ بوعلی شهر زاهدان بررسی کنیم. بدیهی است شناخت جایگاه­های ژنی موثر در بروز این بیماری، کمک شایان توجهی به روند درمان و تشخیص به موقع این اختلال مزمن تهدید کننده­ی سلامت جامعه­ در آینده خواهد نمود.

 

مروری بر مطالعات گذشته

 

  • F Liu و همکاران در سال 2018 طی مطالعه ای نشان دادند که microRNA miR-27a به وفور در بیماران سل فعال، موش‌های آلوده به مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ([3]Mtb) و ماکروفاژها بیان می‌شود. miR-27a ممکن است بقای درون سلولی Mtb را از طریق تعدیل اتوفاژی افزایش دهد. هدف  miR-27aناقل کلسیم در شبکه آندوپلاسمی (CACNA2D3) است. هدف قرار دادن این ناقل منجر به کاهش سیگنال‌های +Ca2 می‌شود، در نتیجه تشکیل اتوفاگوزوم را مهار می‌کند و بقای درون سلولی Mtb را ارتقا می‌دهد (11).

 

  • M Zhang وهمکاران درسال 2021 طی مطالعه ای ارتباط پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی microRNA (miRNA) را با خطر ابتلا به سل ریوی (PTB[4]) درجمعیتی چینی، در 168 فرد مبتلا به PTB و 251 فرد سالم بررسی نمودند. SNP های واقع در miR-27a (rs895819) ، miR-423 (rs6505162) ، miR-196a-2 (rs11614913) ، miR-146a (rs2910164) و miR-618 (rs2682818) انتخاب و سپس تعیین ژنوتیپ شدند. نتایج مطالعه ی آن ها نشان داد ژنوتیپ rs895819 با کاهش خطر PTB،  (OR = 0.45, 95% CI:0.23–0.98, P = 0.045) در میان جمعیت زن همراه است. (12)
 

[1] Gene splicing

[2] Transcription factor binding

[3] Mycobaterium tuberculosis

[4] Pulmonary TB

مشکل جاری که سیاست گزار با آن مواجه است کدام است؟
محل اول بکارگیری نتایج تحقیق
پیشنهاد اول نحوه کاربرد
روش های موجود کدامها هستند؟
منافع و مضرات روشهای موجود کدامند؟
سوالات و / یا فرضیات پژوهش

توزیع فراوانی پلی مورفیسم  rs895819ژن   MIR27Aدر افراد مبتلا به بیماری سل در مقایسه با افراد سالم متفاوت است.

هدف کلی طرح

تعیین و مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs895819  ژن MIR27A در افراد مبتلا به سل ریوی و افراد سالم در سال 1402 در شهر زاهدان.

محل دوم بکارگیری نتایج تحقیق
پیشنهاد دوم نحوه کاربرد
اهداف اختصاصی

تعیین فراوانی پلی مورفیسم rs895819 ژن MIR27A در افراد مبتلا به بیماری سل.

تعیین فراوانی پلی مورفیسم rs895819 ژن MIR27A در افراد سالم.

مقایسه فراوانی پلی مورفیسم rs895819 ژن MIR27A در افراد مبتلا به بیماری سل و افراد سالم.

چرا پیام تحقیق شما حلال مشکل جاری است؟
پیام تحقیق شما چه منافعی از نظر هزینه، کارایی و بهره وری برای مدیر دارد؟
سازمانها، مراکز و موسسات و سایر بهره برداران بالقوه دستاوردهای طرح

دانشگاه علوم پزشکی زاهدان

محل سوم بکارگیری نتایج تحقیق
اهداف كاربردی

بررسی ارتباط واریانت rs895819 ژن MicroRNA-27a در بیماران مبتلا به سل ریوی در مقایسه با افراد سالم در جمعیتی از شهر زاهدان در سال 1402: یک مطالعه مورد- شاهدی و تجزیه و تحلیل In Silico.

پیشنهاد سوم نحوه کاربرد
تعریف واژه های تخصصی

سل: سل یک بیماری عفونی شایع، و در بسیاری از موارد مرگ ‌بار است و توسط گونه‌های مختلف مایکوباکتریا، به‌طور معمول مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ایجاد می‌شود.

پلی‌مورفیسم: اختلاف توالی بازهای DNA در افراد یا گروه­های مختلف.

پلی‌مورفیسم تک نوکلئوتیدی (single nucleotide polymorphism: SNP): به صورت یک جایگاه ژنومی تعریف می شود که در آن یک یا چند باز جایگزین با فراوانی محسوس ( بیشتر از 1% ) ظاهر می شود.

برای اجرای راه حل پیشنهادی شما چه موانع و حمایتهایی وجود دارند؟
نوع مطالعه

موردی شاهدی

محل چهارم بکارگیری نتایج تحقیق
پیشنهاد چهارم نحوه کاربرد
جامعه مورد مطالعه(معرفی مشارکت کنندگان)/ محیط پژوهش(معیارهای ورود و خروج ذکر شوند)

گروه مورد: افراد دارای بیماری سل که به تشخیص پزشک متخصص بر پایه معیار های تشخیصی به این بیماری مبتلا و به بیمارستان بوعلی شهر زاهدان مراجعه کرده­اند.

گروه شاهد: کنترل برای این مطالعه به عنوان افراد بدون سابقه قبلی سل تعریف شد که جهت آزمایشات روتین به بیمارستان بوعلی شهر زاهدان مراجعه کرده­اند.

معیار­های ورود به مطالعه : معیار تشخیصی[1] (13, 14) برای وجود بیماری سل به‌عنوان وجود حداقل یکی از موارد زیر تعریف شد:

1) یافته‌های بالینی و رادیولوژیکی مطابق با بیماری سل و اسمیر خلط مثبت[2] برای باسیل‌های اسید فست[3] یا AFB حداقل در دو نوبت جداگانه.

2) کشت مثبت خلط[4]، لاواژ برونش[5] و یا مایع پلور[6] و همچنین نمونه‌هایی از سیستم‌های عضوی غیر از ریه (ادرار[7]، مایع منی[8]، مایع مغزی نخاعی[9] و غیره) برای­M. tuberculosis .

3) شواهد پاتولوژیک بیماری سل در بیوپسی[10] (غدد لنفاوی، ریه، و غیره).

معیارهای ورود به مطالعه برای گروه کنترل عدم وجود بیماری حاد یا مزمن ریوی و سابقه منفی بیماری سل بود.

معیار­های خروج از مطالعه : بیمارانی که شواهد قطعی برای تشخیص بیماری سل ارائه نمی­دهند یا دارای یک بیماری زمینه­ای و مزمن مانند سندرم نقص ایمنی اکتسابی، سوء تغذیه و یا دیابت هستند، از مطالعه حذف خواهند شد.

 

[1] diagnostic criterion

[2] positive sputum smears

[3] acid-fast bacilli

[4] culture positivity of sputum

[5] bronchial lavage

[6] pleural fluid

[7] urine

[8] semen

[9] cerebrospinal fluid

[10] biopsy

حجم نمونه و روش محاسبه آن

حجم نمونه با فرمول کوکران برای جامعه نامحدود به طوری که در آن d=0.05 و z=1.96 بود، برحسب فراوانی های وقوع و عدم وقوع SNP بر حسب اطلاعات سایت NCBI طبق فرمول زیر تخمین زده شد:

                                                                                                            

نتایج آن برای دو جایگاه ژنتیکی ما 316 و 358 نفر برای مجموع گروه های مورد و شاهد تخمین زده شد. اما با توجه به محدودیت در جمع آوری نمونه و سقف بودجه پایان نامه برای بررسی پلی­مورفیسم تک نوکلئوتیدی افراد مبتلا به بیماری سل در زاهدان از تعداد 120 نفر خون گرفته می­شود. گروه شاهد شامل افراد سالم به تعداد 60 نفر و همچنین نمونه گروه بیماران مبتلا به سل به تعداد 60 نفر است. همچنین در مطالعات مشابه گذشته(15-21) در جمعیت شهر زاهدان مشاهده می­شود که جمعیت­های مورد مطالعه از جمعیت مد نظر ما بیشتر نبوده است.

روش نمونه گیری(نحوه تخصیص تصادفی و همسانسازی در صورت لزوم ذکر شود)

به صورت سر شماری و آسان در دسترس

روش و ابزار جمع آوري داده ها / صحت و استحکام داده ها (پرسشنامه یا فرم اطلاعاتی ضمیمه شود)

مشاهده و بررسی های آزمایشگاهی

روش اجرای طرح(با جزئیات بطور کامل شرح داده شود)

برای اجرای این طرح بعد از کسب رضایت از بیماران و گروه کنترل، از کلیه افرادی که در مطالعه وارد شده اند به میزان 5 میلی لیتر خون در لوله های CBC حاوی EDTA جمع آوری می گردد. نمونه های خون در دمای 20- درجه سانتیگراد نگه داری می شود. در مرحله بعد DNA افراد از این نمونه ها به روش salting out استخراج می شود. سپس با استفاده از پرایمرهای اختصاصی فوروارد  و ریورس خارجی و داخلی (بر اساس آلل مورد نظر)  طراحی شده به کمک روش PCR ناحیه پلی مورفیک مد نظر تکثیر می گردد. سپس در مرحله بعد به کمک روش ژل الکتروفورز افقی، محصول PCR روی ژل آگارز 2 درصد لود می شود و تفکیک صورت می گیرد. در انتها به کمک دستگاه ژل داک تصاویر مربوط به حرکت باند های DNA حاصل شده از PCR ثبت می گردد. دیتای حاصل شده از نوع ژنوتایپ افراد به طور جمعی در نرم افزار SPSS V27 وارد و آنالیز می شود.

روش تجزیه، تحليل و توصیف داده‌ها (نمونه‌اي از جدول توخالي ضميمه شود و روش هاي آماري مورد استفاده به طور كامل توضيح داده شود)(کیفی و کمی)

 

 

P value

 

Control n(%)

 

Case n(%)

Genotypes

 

 

 

 

TT

TC

CC

rs895819 T>C

 

پس از گردآوری اطلاعات لازم، یافته­ھا در نرم افزار آماری SPSS26 وارد شده و آنالیز می­شود. تعادل Hardy Weinberg در گروه کنترل برای هر سه  پلی­مورفیسم توسط آزمون chi square بررسی می­شود. سپس داده­ها با استفاده از آزمون آماری independent sample T test ، Chi square در صورت نیاز مورد تجزیه  و تحلیل قرار خواھند گرفت. ریسک ابتلا به بیماری سل ضمن محاسبه Odds Ratio و فاصله اطمینان 95­% تخمین زده می­شود. همچنین همبستگی بین پارامترھای دموگرافیک بیماران و ژنوتایپ­های پلی­مورفیسم­ھای مورد مطالعه توسط آزمون unconditional logistic regression بررسی خواھد شد. در تمامی آزمون­ها ، P<0.05 معنی دار در نظر گرفته می­شود.

ملاحظات اخلاقی

در این مطالعه کدهای 1,2,3,8,10, 11,12,13,14,15,17,19,22,25,28و31 از راهنمای عمومی اخلاق در پژوهشهای علوم پزشکی دارای آزمودنی انسانی در جمهوری اسلامی ایران به شرح زیر استفاده می شود.

هدف پژوهش ارتقاء سلامت انسان خواهد بود 2- سلامت و ایمنی فرد آزمودنی اولویت دارد 3- منافع پژوهش برای فرد آزمودنی بیشتر از خطرهای آن است 8- روش انجام پژوهش منطبق بر اصول علمی است 10- پژوهش به صورت پروپوزال ارائه می شود 11- کمیته اخلاق طرح حاضر را مورد پایش قرار می دهد 12- انتخاب آزمودنی ها از بین بیماران منصفانه خواهد بود  13- رضایت آگاهانه از افراد مورد پژوهش اخذ می شود 14- تغییر احتمالی در نحوه انجام پژوهش به اطلاع کمیته اخلاق دانشگاه خواهد رسید 15- پژوهشگر از آگاهانه بودن رضایت اخذ شده اطمینان حاصل می کند 17 پژوهشگر اطلاعات کافی را در مورد مطالعه در اختیار آزمودنی قرار خواهد داد 19- عدم شرکت در پژوهش هیچ تآثیری در میزان خدمات درمانی دریافتی توسط آزمودنی نخواهد داشت 22- از گروههای آسیب پذیر نمونه گیری انجام نمی شود 25- پژوهشگر اصول راز داری را رعایت خواهد کرد 28- نتایج پژوهش به طور صادقانه منتشر خواهد شد

همچنین کد های از  1,2,3,4,6,8,12از راهنمای ‌عمومی اخلاقی پژوهش بر روی عضو و بافت انسانی به همراه کد­های 1 و 2 از فصل چهارم (زیست بانکها) این راهنما در پژوهش فعلی رعایت می گردد.

پژوهشگر توجه دارد که نمونه خون فرد مورد استفاده، دارای منشأ انسانیاند و کرامت انسانی اقتضا میکند که جمعآوری، نگهداری، استفاده و نابودسازی آنها توأم با رعایت ملاحظات و شؤون مرتبط باشد.

از نمونه خون فرد دارای منشأ انسانی باید تنها در پژوهشی استفاده می شود که اهداف ارزشمندی را در راستای مبارزه با بیماریها و ارتقای سلامت انسانها دنبال کند.

پژوهش فعلی انجام شده بر روی نمونه خون افراد پیش از اجرا مورد تأیید کمیتهی اخلاق در پژوهش مرتبط قرار می گیرد.

رضایت آگاهانهی فرد دهندهی نمونه خون، یا جانشین قانونی او، شرط اساسی در تأیید اخلاقی هر پژوهش بر روی نمونه انسانی می باشد.

- پژوهشگر باید از اعضاء و بافتهایی که به منظور پژوهش در اختیار او قرار میگیرد استفادهی بهینه خواهد کرد.

12- در صورت کمبود نمونه خون، باید استفادههای درمانی بر استفادههای پژوهشی اولویت داده می شود.

فصل 4 از راهنمای ‌عمومی اخلاقی پژوهش بر روی عضو و بافت انسانی - زیستبانکها:

ذخیرهسازی نمونه خون با منشأ انسانی با اخذ رضایت آگاهانه صورت میگیرد. در رضایتنامه باید نحوه و مدت نگهداری و استفادههای احتمالی آتی آورده می شود.

فرد آزمودنی حق دارد هر وقت که بخواهد درخواست کند که نمونههایش از زیستبانک خارج شوند.

به علاوه، کد های ذیل از دفترچه راهنمای اخلاقی پژوهش­های ژنتیک پزشکی در جمهوری اسلامی ایران در پژوهش فعلی رعایت می شوند

پژوهش فعلی بر روی آزمودنی انسانی با هدف بررسی یا تشخیص استعداد ابتلا به بیماری انجام خواهد شد (کد 1-2-)

پژوهش حاضر در بر دارنده اهداف بهنژادی (کد 2-1)، شبیه سازی (2-2-)، تبعیض (2-3-) و نقض کرامت انسانی یا حقوق و آزادیهای بنیادین انسان (2-4) نخواهد بود. در این پژوهش رضایت آگاهانه از آزمودنی کسب خواهد شد (کد 5) و در مواردی که دادههای ژنتیک انسانی یا نمونههای بیولوژیک با هدف پژوهشی جمعآوری شده باشند، آزمودنی این اختیار را دارد که رضایت اولیهی خود را لغو کند (کد 6) و در صورت نیاز مشاورهی ژنتیکی مناسب برای آزمودنی  فراهم می شود (کد 7) و همچنین نتایج پژوهش به صورت محرمانه با اطلاع آزمودنی خواهد رسید (کد 8) و فرد آزمودنی از دسترسی به دادههای ژنتیکی خودش منع نخواهد شد ( کد 10). همچنین دادههای ژنتیک و نمونههای بیولوژیک جمعآوری شده، برای هدف دیگری که با مفاد رضایت کسب شده مغایرت دارد بهکار گرفته نخواهد شد (کد 11) و نتایج آن در اختیار جامعه قرار می گیرد (کد 13).

محدودیتهای اجرائی طرح و پیش بینی جهت حل آنها

- عدم همکاری بیمار

- مشکل تهیه مواد و امکان طولانی شدن زمان دریافت آنها

کلمات کلیدی

سل ، پلی مورفیسم ، MicroRNA-27a

فهرست منابع و مراجع

 

1.            Ahmad S. Pathogenesis, immunology, and diagnosis of latent Mycobacterium tuberculosis infection. Clin Dev Immunol. 2011;2011:814943.

2.            Kundu M, Basu J. The Role of microRNAs and Long Non-Coding RNAs in the Regulation of the Immune Response to Mycobacterium tuberculosis Infection. Frontiers in Immunology. 2021;12.

3.            Li X, Xu Y, Liao P. Diagnostic performance of microRNA-29a in active pulmonary tuberculosis: a systematic review and meta-analysis. Clinics. 2023;78:100290.

4.            Carrol ED, Clark JE, Cant AJ. Non-pulmonary tuberculosis. Paediatric Respiratory Reviews. 2001;2(2):113-9.

5.            Stein CM. Genetic epidemiology of resistance to M. tuberculosis Infection: importance of study design and recent findings. Genes & Immunity. 2023;24(3):117-23.

6.            Nair A, Greeny A, Nandan A, Sah RK, Jose A, Dyawanapelly S, et al. Advanced drug delivery and therapeutic strategies for tuberculosis treatment. Journal of Nanobiotechnology. 2023;21(1):414.

7.            Schmidt A, Groh AM, Frick JS, Vehreschild M, Ludwig KU. Genetic Predisposition and the Variable Course of Infectious Diseases. Dtsch Arztebl Int. 2022;119(8):117-23.

8.            Hu W, Xu K. Research progress on genetic control of host susceptibility to tuberculosis. Zhejiang Da Xue Xue Bao Yi Xue Ban. 2022;51(6):679-90.

9.            Liu F, Chen J, Wang P, Li H, Zhou Y, Liu H, et al. MicroRNA-27a controls the intracellular survival of Mycobacterium tuberculosis by regulating calcium-associated autophagy. Nat Commun. 2018;9(1):4295.

10.          Shankaran ZS, Walter CEJ, Prakash N, Ramachandiran K, C GPD, Johnson T. Investigating the role of microRNA-27a gene polymorphisms and its interactive effect with risk factors in gastrointestinal cancers. Heliyon. 2020;6(3).

11.          Liu F, Chen J, Wang P, Li H, Zhou Y, Liu H, et al. MicroRNA-27a controls the intracellular survival of Mycobacterium tuberculosis by regulating calcium-associated autophagy. 2018;9(1):4295.

12.          Zhang M, Liu Z, Zhu Y, Chen S, Chen B, Wang XJE, et al. Associations of genetic variants of miRNA coding regions with pulmonary tuberculosis risk in China. 2021;149:e208.

13.          Stegen G, Jones K, Kaplan P. Criteria for guidance in the diagnosis of tuberculosis. Pediatrics. 1969;43(2):260-3.

14.          Toledo A, Katz F, Montiel J, Rico F. Criterios de diagnóstico en tuberculosis infantil. Rev Mex Pediatr. 1979;46:239-43.

15.          Kouhpayeh H, Hashemi M, Hashemi S, Moazeni-Roodi A, Naderi M, Sharifi-Mood B, et al. R620W functional polymorphism of protein tyrosine phosphatase non-receptor type 22 is not associated with pulmonary tuberculosis in Zahedan, southeast Iran. Genet Mol Res. 2012;11(2):1075-81.

16.          Naderi M, Hashemi M, Pourmontaseri Z, Eskandari-Nasab E, Bahari G, Taheri M. TIRAP rs8177374 gene polymorphism increased the risk of pulmonary tuberculosis in Zahedan, southeast Iran. Asian Pacific journal of tropical medicine. 2014;7(6):451-5.

17.          Hashemi M, Sharifi-Mood B, Nezamdoost M, Moazeni-Roodi A, Naderi M, Kouhpayeh H, et al. Functional polymorphism of interferon-gamma (IFN-gamma) gene+ 874T/A polymorphism is associated with pulmonary tuberculosis in Zahedan, Southeast Iran. Prague Med Rep. 2011;112(1):38-43.

18.          Naderi M, Hashemi M, Hazire-Yazdi L, Taheri M, Moazeni-Roodi A, Eskandari-Nasab E, et al. Association between toll-like receptor2 Arg677Trp and 597T/C gene polymorphisms and pulmonary tuberculosis in Zahedan, Southeast Iran. The Brazilian Journal of Infectious Diseases. 2013;17(5):516-20.

19.          Taheri M, Hashemi-Shahri S, Hamzehnejadi M, Naderi M, Moazeni-Roodi A, Bahari G, et al. Lack of association between interleukin-18-607 C/A gene polymorphism and pulmonary tuberculosis in Zahedan, Southeast Iran. Prague Med Rep. 2012;113(1):16-22.

20.          Hashemi M, Sharifi-Mood B, Rasouli A, Amininia S, Naderi M, Taheri M. Macrophage migration inhibitory factor-173 G/C polymorphism is associated with an increased risk of pulmonary tuberculosis in Zahedan, Southeast Iran. EXCLI journal. 2015;14:117.

21.          Naderi M, Hashemi M, Amininia S. Association of TAP1 and TAP2 gene polymorphisms with susceptibility to pulmonary tuberculosis. Iranian Journal of Allergy, Asthma and Immunology. 2016:62-8.

 

معرفی پژوهش/ اهداف پژوهش
(عین عبارت هدف پروپوزال را کپی نکنید. بلکه با جملاتی که برای مردم قابل فهم باشد (برای سواد حدود پنجم ابتدایی )هدف را برای شرکت کنندگان توضیح دهید.) در تمام این متن در صورتیکه شرکت کننده کودک یا فرد فاقد ظرفیت تصمیم گیری است باید مواردیکه منظور از "من"، فرد شرکت کننده بوده است به "کودک" یا "فرد تحت سرپرستی من" اصلاح شود و مواردیکه منظور از "من"، رضایت دهنده است به من به عنوان "ولی" یا "قیم قانونی" اصلاح شود.

در مطالعه فعلی، ارتباط وقوع یک واریانت ژنی بر فراوانی سل ریوی به تفکیک مورد ارزیابی قرار می گیرد. بدیهی است شناخت این جایگاه ژنی می تواند به افزایش درک پژوهشگران از مکانیسم های مولکولی دخیل در بروز این بیماری کمک کند.

خون گیری
(آیا طرح شما نیاز به خونگیری دارد یا خیر)

از هر بیمار در طی این طرح تحقیقاتی حدود 5 سی سی خونگیری بعمل آمده و نمونه ها درون لوله های CBC دارای ماده ضد انعقاد EDTA (2 سی سی) و لوله های لخته (3 سی سی) جمع آوری می شوند.

نحوه همکاری/ مزایا ی طرح
(در این بخش برای شرکت کنندگان به زبان ساده توضیح دهید که: چه مداخله ای بر روی آنها صورت میگیرد. چه اقدامات پاراکلینیکی بر روی آنها انجام میشود. چه نمونه ای و با چه حجمی از آنها میگیرید در این مدت چند نوبت مراجعه باید داشته باشند و به چه فواصلی چه اقداماتی را در پیگیری آنها انجام میدهید. (حتی میتوانید سود بالقوه ای که شرکت کنندگان میتوانند از شرکت در این پژوهش ببرند بنویسید. این سود میتواند شرح احتمال درمان یا تشخیص بهتر بیماریشان، دریافت خدمات سلامت رایگان و یا پرداخت مشوق مالی در ازای جبران همکاریشان باشد)

مزایا این طرح ویژه مخاطبین آن یعنی پژوهشگران حوزه درمان اختلالات ایمونولوژیک است و به پیشرفت بینش جامعه علمی نسبت به شناخت علت های بروز و پیشرفت اختلال مورد نظر کمک می کند.

عوارض جانبی
(منظور عوارض و میزان احتمال بروز آنها در این مطالعه است)

اجرای این پژوهش هیچگونه خطر یا عوارض جانبی برای افراد انتخاب شده برای مطالعه ندارد.

جبران عوارض احتمالی
(برای آنکه شرکت کننده بتواند ارزیابی مناسبی از سود و زیان شرکت در پژوهش شما داشته باشد لازم است بتواند سود و زیان مداخلات معمول و مداخلات این پژوهش را مقایسه کند. به عنوان مثال میزان موفقیت و میزان عوارض هریک را مقایسه کند.) - او باید بداند كه اگر در حين و بعد از انجام پژوهش هم هر مشكلي اعم از جسمي و روحي به علت شرکت در اين پژوهش برایش پيش آمد درمان عوارض، و هزينه‌هاي آن و غرامت مربوطه بر عهده مجري خواهد بود.

در طی اجرای این طرح هرگونه عوارض احتمالی توسط مجری اول طرح جبران می گردد.

هزینه های مربوط به انجام طرح تحقیقاتی
(تمام مداخلات پژوهشی باید برای بیمار رایگان باشد و بیمار بداند شامل چه مواردی هستند. )

تمامی هزینه های مربوط به اجرای این طرح از بودجه پژوهشی دانشگاه پرداخت می شود.

روش های جایگزین
در صورت عدم تمایل به شرکت در مطالعه چه روش های درمانی برای بیمار ارائه خواهد شد

برای اجرای کامل این طرح روش های جایگزین برای اتمام مناسب کار توسط مجری طرح طراحی می شود.

محرمانه بودن
بیمار باید بداندکه دست اندر كاران اين پژوهش، كليه اطلاعات مربوط به او را نزد خود به صورت محرمانه نگه‌داشته و فقط اجازه دارند نتايج كلي و گروهي اين پژوهش را بدون ذکر نام و مشخصات بیمار منتشر كنند. و كميته اخلاق در پژوهش با هدف نظارت بر رعایت حقوق وی مي‌تواند به اطلاعات ایشان دسترسي داشته باشد.

اجرای این طرح به صورت مورد شاهدی است و هیچ گونه اطلاعات هویتی اعم از نام و مشخصات فردی و خانوادگی از آن ها ثبت نمی شود

پاسخگویی به پرسش ها
در این بخش نام و اطلاعات دسترسی فردی از عوامل پژوهش را که بتواند اطلاعات صحیح و کافی در اختیار شرکت کنندگان قرار دهند و در مورد عوارض و نگرانیها راهنمایی لازم را ارائه دهند ذکر شود

با توجه به ماهیت طرح به هرگونه سوال تا جای ممکن پاسخ داده خواهد شد.

حق نپذیرفتن یا انصراف
بیمار باید بداند که شرکت اودر اين پژوهش کاملاً داوطلبانه است و مجبور به شرکت در اين پژوهش نيست و در صورت عدم شرکت از مراقبت‌هاي معمول تشخيصي و درماني محروم نخواهد شد او باید بداند كه حتي پس از موافقت با شركت در پژوهش مي‌تواند هر وقت كه بخواهد، پس از اطلاع به مجري، از پژوهش خارج شود و خروج اواز پژوهش باعث محرومیت از دریافت خدمات درمانی معمول برای اونخواهد شد.

تمامی افراد انتخاب شده برای گروه های سالم و بیمار حق نپذیرفتن و انصراف را در هر مرحله از اجرای پروژه خواهند داشت.

رضایت
او باید بداند که اگر اشکال يا اعتراضي نسبت به دست اندركاران يا روند پژوهش دارد مي تواند با كميته اخلاق در پژوهش دانشگاه تماس گرفته و مشکل خود را به صورت شفاهي يا كتبي مطرح نمايد. در انتهای فرم قید گردد : اينجانب موارد فوق‌الذکر را خواندم و فهميدم و بر اساس آن رضايت آگاهانه خود را براي شركت در اين پژوهش اعلام مي‌کنم. اينجانب ……………… خود را ملزم به اجراي تعهدات مربوط به مجري در مفاد فوق دانسته و متعهد مي‌گردم در تأمين حقوق و ايمني شركت كننده در اين پژوهش تلاش نمايم

توضیحات حضوری مجری یا همکاران طرح بابت موافقت بیمار در جهت شرکت در این مطالعه اعلان می شود. و پس از موافقت شفاهی بیمار یک نسخه از این فرم به وی  داده شده و فرصت خواندن آن را دارد.

تخصص
عنوان پیام پژوهشی ( حداکثر 20 کلمه)
پیام کلیدی (حداکثر 80 کلمه)
متن پیام پژوهشی ( حداکثر240 کلمه)
اهمیت موضوع(50 کلمه)
مهمترین نتایج طرح به زبان غیر تخصصی(70 کلمه)
موارد کاربرد نتایج طرح (80 کلمه)
تأثیرات و کاربردها
محدودیت‌های شواهد چه بودند؟
آیا این خبر می‌تواند از نظر اجتماعی، سیاسی، فرهنگی، بهداشتی، ارزش های دینی و قوانین سازمان غذا و دارو، تبعاتی داشته‌باشد؟
در صورتی که این طرح منتج به مقاله شده است لینک مقاله درج شود
منابع و مراجع : حداکثر چهار مرجع اصلی استفاده شده در طرح تحقیقاتی مورد نظر را ذکر نمایید
پرسشنامه یا فرم اطلاعاتی

پرسشنامه طرح تحقیقاتی بر روی بیماران مبتلا به سل

 

نام و نام خانوادگی:

شماره تماس:                                                         گروه:             سالم                                 بیمار 

 

 

                                      توضیحات : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . .

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  .

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  . . . . . . . . . .

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  . . . . . . . . . .

 

 

جنس (Sex) :        مرد                   زن

 

سن (Age)  :        کمتر از 20        30-21          40-31          41-50         51-60         بیشتر از 60

 

قومیت (Ethnicity) :               فارس                   بلوچ □                 افغان □

 

بدخیمی (Malignancy) :          بله                   خیر

 

سیگاری (Smoking) :                 بله                    خیر

 

بیماری­های مزمن (Chronic Illness) :  No □  دیابت  انسداد ریوی مزمن (COPD)   فشار خون  بیماری ریوی   

 

سابقه خانوادگی سل (Family History of Pulmonary Tuberculosis) :                           بله            خیر

 

سابقه خانوادگی بیماری­های خودایمنی (Family history of Autoimmune Diseases) :         بله            خیر

 

 

 

 


پیوست ها
hide/show

نام فایل تاریخ درج فایل اندازه فایل دانلود